Đây là khâu luôn làm chậm tiến độ của dự án vì việc giải phóng mặt bằng liên quan đến nhiều cấp và liên quan đến dân, nếu không được giải quyết ổn thoả, việc làm nhà di rời dân hoặc việc đền bù không thoả đáng không phù hợp với nguyện vọng của dân thì rất khó có thể giải phóng được mặt bằng.Khâu này có thể làm cho dự án chậm lại đến vài tháng hoặc gần năm. Hiện nay, công tác giải phóng mặt bằng ở hầu hết các địa phương trong giai đoạn này rất chậm trễ và phức tạp. Như Dự án Thuỷ lợi Nậm Ngam- Pú Nhi nhân dân không cho triển khai công việc khảo sát địa hình địa chất, gây cản trở đến công việc, làm công việc bị chậm tiến độ một tuần, dự định từ ngày 7/9/2007 đến 23/10/2007 sẽ khảo sát xong địa hình, địa chất nhưng phải đến ngày 14/9/2007 mới thực hiện được và đến ngày 30/10/2007 mới thực hiện xong. Rồi dự án Hồ chưa nước Suối Mỡ tỉnh Bắc Giang công tác giải phóng mặt bằng chậm do địa phương chưa lập xong phương án đền bù GPMB
Nguyên nhân chính của vấn đề này là: - Nguyên nhân khách quan:
+ Các đơn giá đền bù so với đơn giá thị trường có sự chênh lệch lớn dẫn đến việc thu hồi đất gặp nhiều khó khăn, nhiều hộ gia đình không chịu di dời vì chưa được đền bù thoả đáng
+ Ý thức người dân chưa tốt: nhiều hộ gia đình cố tình gây khó khăn trong việc nhận kinh phí đền bù.
+ Trách nhiệm của chính quyền địa phương: Một số địa phương còn chưa thực sự quan tâm đến công tác đền bù GPMB, hội đồng GPMB chủ yếu thực hiện công việc điều tra và lập phương án đền bù còn thực tế việc giải quyết đền bù như thế nào đều giao phó cho chủ đầu tư giải quyết với các hộ dân, chính vì vậy nên hiệu quả chưa cao, tiến độ bị chậm
+ Thủ tục hành chính còn rườm rà, vẫn còn hiện tượng quan liêu, trì trệ trong việc giải quyết các thủ tục. Hơn nữa lại có sự tham gia của nhiều ngành, nhiều cấp nên rất mất thời gian để đi đến thống nhất ý kiến
+ Ngoài ra còn hiện tượng không phù hợp giữa kế hoạch đã được phê duyệt và giai đoạn thực tế đã phát sinh thêm những văn bản pháp lý mới dẫn đến phải chỉnh sửa cho phù hợp nên bị chậm về thời gian dự án
+ Do tư vấn thiết kế chậm, cung cấp số liệu về diện tích mất đất chậm.... - Nguyên nhân chủ quan của Ban:
+ Công tác cập nhật thông tin, tài liệu các địa phương để phục vụ cho công tác giải phóng mặt bằng còn chưa đáp ứng được yêu cầu
+ Do năng lực giám sát của cán bộ
+ Chưa có sự phối hợp linh hoạt với chính quyền địa phương để giải quyết các vấn đề liên quan