Hoa đậu tƣơng nhỏ, không có hƣơng vị, hoa hình dạng cánh bƣớm có kích thƣớc từ 6-7mm, mọc thành chùm 2-5 hoa ở nách lá. Hoa đậu tƣơng có hai màu tím và trắng, tƣơng quan chặt với màu sắc thân, giống có thân màu xành thì hoa màu trắng, giống có thân màu tím thì hoa cũng có màu tím. Đậu tƣơng là cây tự thụ phấn, tỷ lệ giao phấn rất thấp do cấu trúc của hoa là thụ phấn trƣớc khi hoa nở.
Quả đậu tƣơng thuộc loại quả giáp, bao bên ngoài quả là một lớp lông, màu sắc lông trắng hay vàng tùy thuộc vào mỗi giống, số quả/cây thay đổi tùy giống, thời vụ và điều kiện canh tác, chỉ tiêu này tƣơng quan chặt chẽ với năng suất. Màu sắc quả biến động từ vàng nhạt, vàng nâu, nâu, nâu vàng, nâu xám đến nâu đen. Ví dụ vàng nâu: AU10; nâu đen: AU19, AU24; nâu: AU22, AU23; nâu xám; AU16, D23, D25,…
Hạt đậu tƣơng có màu sắc, hình dạng và kích thƣớc khác nhau tùy thuộc vào giống. Màu sắc hạt biến động từ vàng sáng, vàng nhạt, vàng, đến vàng đậm tùy giống, những giống hạt có màu vàng sáng nhƣ AU25; những giống vàng nhạt: AU10, AU14, AU24; còn lại là vàng và vàng đậm.
* Về màu sắc rốn hạt
Rốn hạt của các giống khác nhau thì có màu sắc và hình dạng khác nhau, biểu hiện đặc trƣng của các giống, là chỉ tiêu cảm quan đánh giá sự ƣa chuộng của ngƣời tiêu dùng.
đậu tƣơng có màu vàng sáng và rốn màu nhạt (vì những hạt có màu vàng sáng khi ép dầu cho màu đẹp và giảm thiểu công đoạn khử màu xấu khi ép dầu), vì vậy trong công tác chọn giống, ngƣời ta thƣờng chú trọng chọn tạo những dòng có vỏ hạt và rốn hạt có màu sáng để xuất khẩu (Sổ tay nhà nhập khẩu đậu tƣơng Hoa Kỳ, 1997) [17].