1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát

58 5 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 58
Dung lượng 856,52 KB

Nội dung

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI KHOA Y DƯỢC NGUYỄN THỊ THÙY LINH TỐI ƯU QUY TRÌNH PHÂN TÍCH GEN NPHS2 TRÊN MẪU MÁU BỆNH NHÂN NHI MẮC HỘI CHỨNG THẬN HƯ TIÊN PHÁT KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC NGÀNH Y ĐA KHOA HÀ NỘI - 2018 ,V NU ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI an d Ph ar m NGUYỄN THỊ THÙY LINH ac y KHOA Y DƯỢC lo fM ed ic ine TỐI ƯU QUY TRÌNH PHÂN TÍCH GEN NPHS2 TRÊN MẪU MÁU BỆNH NHÂN NHI MẮC HỘI CHỨNG THẬN HƯ TIÊN PHÁT Sc h oo KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC NGÀNH Y ĐA KHOA Khóa: QH 2012.Y ThS BS Vũ Vân Nga HÀ NỘI - 2018 Co py rig ht @ Người hướng dẫn: ThS Phạm Thị Hồng Nhung PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU LỜI CẢM ƠN Ph ar m ac y Trước tiên, xin gửi lời cảm ơn chân thành sâu sắc tới ThS Phạm Thị Hồng Nhung – Giảng viên Khoa Y Dược – Đại học Quốc gia Hà Nội, ThS Vũ Vân Nga - Giảng viên Khoa Y Dược – Đại học Quốc gia Hà Nội, người thầy ln hướng dẫn bảo tận tình, cho tơi nhiều ý kiến nhận xét quý báu truyền đạt cho tinh thần học hỏi, làm việc nghiêm túc q trình tơi thực khóa luận an d Tôi xin chân thành cảm ơn TS Vũ Thị Thơm – Giảng viên khoa Y Dược – Đại học Quốc gia Hà Nội, người thầy tận tâm giúp đỡ tơi q trình học tập nghiên cứu, tạo điều kiện thuận lợi sẵn sàng giải đáp thắc mắc để tơi hồn thành khóa luận fM ed ic ine Để thực tốt khóa luận này, tơi trân trọng cảm ơn tài trợ Đại học Quốc gia Hà Nội cho đề tài mã số QG.16.23 Trong trình học tập, làm việc thực khóa luận, tơi nhận giúp đỡ thầy cô bạn sinh viên làm việc thực tập Phịng thí nghiệm Bộ mơn Y dược học sở – Khoa Y Dược – Đại học Quốc gia Hà Nội Tôi xin chân thành cảm ơn lo Tôi xin gửi lời cảm ơn tới Ban chủ nhiệm khoa, tồn thể thầy giáo Khoa Y dược- Đại học Quốc gia Hà Nội cho kiến thức quý báu trình học tập trường Hà Nội, ngày 29 tháng 05 năm 2018 Nguyễn Thị Thùy Linh Co py rig ht @ Sc h oo Cuối cùng, xin gửi lời cảm ơn sâu sắc tới gia đình bạn bè ln bên cạnh, động viên, khích lệ tơi lúc khó khăn q trình thực khóa luận PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU DANH MỤC KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT Base pair (Cặp bazơ nitơ) ADN Deoxyribo Nucleic Acid (Axit Deoxynucleic) dNTP Deoxynucleotide triphosphate DHPLC Denaturing high performance liquid chromatography (Sắc kí EDTA Ph ar m lỏng cao áp biến tính) ac y bp Ethylene Diamine Tetra Acetic acid (Axit ethylene diamine tetraacetic) Hội chứng thận hư HCTHTP Hội chứng thận hư tiên phát Kb kilobase (= 1000 bp) NCBI National Center for Biotechnology Information (Trung tâm ine an d HCTH ed ic Thông tin Công nghệ Sinh học Quốc gia – Mỹ) Gen mã hóa cho protein podocin NHLBI National Heart, Lung and Blood Instiute (Viện tim, phổi fM NPHS2 máu quốc gia) Optical density (Mật độ quang học) PCR Polymerase Chain Reaction (Phản ứng chuỗi polymerase) RFLP Restriction Fragment Length Polymorphism (Đa hình độ dài oo lo OD Sc h đoạn cắt giới hạn) Single nucleotide polymorphism (Đa hình đơn nucleotit) SNP @ SSCP Single strand conformation poly morphism (Phân tích đa hình cấu hình sợi đơn) Short Tandem Repeat (Các đoạn lặp ngắn) TAE Đệm Tris base/axit acetic/ EDTA UTR Untranslated region (Vùng không dịch mã) Co py rig ht STR PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU DANH MỤC CÁC BẢNG BIỂU Trang Trình tự mồi nhân dòng gen NPHS2 20 Bảng Thành phần điều kiện phản ứng PCR gen NPHS2 30 Bảng Tổng hợp SNP thuộc gen NPHS2 149 bệnh nhân 32 Bảng Các đột biến sai nghĩa thuộc gen NPHS2 nghiên cứu 33 Bảng Các đột biến vô nghĩa thuộc gen NPHS2 nghiên cứu 33 Bảng Tần số kiểu gen tần số alen SNP xuất alen đột biến 34 Co py rig ht @ Sc h oo lo fM ed ic ine an d Ph ar m ac y Bảng PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH Trang Tỉ lệ mắc hội chứng thận hư số nước Hình 1.2 Cơ chế bệnh học HCTH Hình 1.3 Gen NPHS2 protein podocin Hình 1.4 Tế bào biểu mơ có chân màng đáy cầu thận tương tác protein cấu tạo nên tế bào Hình 1.5 Các đột biến protein podocin mã hóa gen NPHS2 10 Hình 2.1 Sơ đồ thí nghiệm nghiên cứu 23 Hình 3.1 Kết điện di ADN tổng số gel agarose 0,7% 25 Hình 3.2 Kết điện di sản phẩm PCR tối ưu nhiệt độ gắn mồi exon gen NPHS2 27 Hình 3.3 Kết điện di sản phẩm PCR tối ưu nồng độ mồi exon gen NPHS2 28 Hình 3.4 Kết điện di sản phẩm PCR với nồng độ ADN khác exon gen NPHS2 29 Hình 3.5 Kết điện di sản phẩm PCR exon gen NPHS2 sau tối ưu 29 Hình 3.6 Một số kết giải trình tự gen NPHS2 31 oo lo fM ed ic ine an d Ph ar m ac y Hình 1.1 Co py rig ht @ Sc h Hình 3.7 Số lượng đột biến exon gen NPHS2 31 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN ac y DANH MỤC KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT DANH MỤC CÁC BẢNG BIỂU Ph ar m DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH ĐẶT VẤN ĐỀ CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 TỔNG QUAN VỀ HỘI CHỨNG THẬN HƯ TIÊN PHÁT an d 1.1.1 Khái niệm đặc điểm dịch tễ học 1.1.2 Cơ chế sinh bệnh học 1.1.3 Biến chứng liệu pháp corticosteroid điều trị HCTHTP ine 1.1.4 Tổng quan gen liên quan đến hội chứng thận hư tiên phát ed ic 1.2 TỔNG QUAN VỀ GEN NPHS2 1.2.1 Vị trí, cấu trúc, vai trò gen NHPS2 1.2.2 Đa hình di truyền gen NPHS2 fM 1.3 CÁC NGHIÊN CỨU VỀ ĐA HÌNH DI TRUYỀN GEN NPHS2 Ở BỆNH NHÂN MẮC HCTHTP 11 oo lo 1.4 CÁC PHƯƠNG PHÁP PHÂN TÍCH ĐA HÌNH DI TRUYỀN ĐƠN NUCLEOTIT 13 Sc h CHƯƠNG ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 18 2.1 VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU 18 2.1.1 Đối tượng nghiên cứu 18 @ 2.1.2 Hóa chất 18 2.1.3 Thiết bị 19 ht 2.1.4 Thời gian địa điểm nghiên cứu 19 py rig 2.2 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 19 2.2.1 Thu thập bảo quản mẫu sinh phẩm 20 Co 2.2.2 Tách chiết kiểm tra chất lượng ADN tổng số 20 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU 2.2.3 Nhân dòng exon gen NPHS2 PCR 21 2.2.4 Xác định kiểu gen exon gen NPHS2 giải trình tự 23 2.2.5 Xác định tần số SNP thuộc gen NPHS2 23 ac y 2.3 ĐẠO ĐỨC NGHIÊN CỨU 24 CHƯƠNG KẾT QUẢ 26 Ph ar m 3.1 TÁCH CHIẾT ADN TỔNG SỐ 26 3.2 NHÂN DÒNG EXON CỦA GEN NPHS2 BẰNG PCR 26 3.3 XÁC ĐỊNH KIỂU GEN EXON CỦA GEN NPHS2 BẰNG GIẢI TRÌNH TỰ 30 an d 3.4 TẦN SỐ ALEN CỦA CÁC ĐA HÌNH XUẤT HIỆN TRONG NGHIÊN CỨU 33 CHƯƠNG BÀN LUẬN 34 ine 4.1 VỀ TỐI ƯU HĨA QUY TRÌNH PHÂN TÍCH EXON ĐẦU CỦA GEN NPHS2 34 ed ic 4.2 VỀ PHÂN TÍCH KẾT QUẢ SNP XÁC ĐỊNH ĐƯỢC TRÊN EXON …36 fM KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 40 4.1 KẾT LUẬN 40 lo 4.2 KIẾN NGHỊ 40 oo TÀI LIỆU THAM KHẢO Co py rig ht @ Sc h PHỤ LỤC PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU ĐẶT VẤN ĐỀ Co py rig ht @ Sc h oo lo fM ed ic ine an d Ph ar m ac y Hội chứng thận hư tiên phát (HCTHTP) bệnh cầu thận mạn tính thường gặp trẻ em yếu tố nguy dẫn đến suy giảm chức thận [14, 65] Cho đến nay, phương pháp điều trị bệnh chủ yếu liệu pháp corticosteroid, thuốc ức chế miễn dịch ghép thận Theo tiêu chuẩn lâm sàng, HCTH phân loại dựa vào đáp ứng bệnh nhân với liệu pháp corticosteroid gồm hai nhóm: nhạy cảm kháng corticosteroid [14, 38] Phần lớn bệnh nhân mắc HCTHTP thường cảm thụ với liệu pháp này, nhiên việc điều trị kéo dài corticosteroid gây nhiều tác dụng phụ hội chứng Cushing, tăng huyết áp, đục thủy tinh thể, glaucoma, loãng xương, chậm phát triển thể chất [12] Bên cạnh đó, tỉ lệ không nhỏ (10 – 20% trường hợp) bệnh nhân mắc HCTHTP kháng corticosteroid có nguy cao tiến triển thành bệnh thận giai đoạn cuối [58] Nhiều trường hợp kháng corticosetorid chứng minh đột biến gen gây ảnh hưởng tới chức biệt hóa tế bào podocyte (tế bào biểu mơ có chân màng đáy cầu thận) Bệnh có tỷ lệ tái phát cao, diễn biến điều trị lâu dài tạo lo lắng, chán nản tiêu tốn nhiều tiền cho bệnh nhân gia đình người bệnh [6] Trên giới, nhiều cơng trình nghiên cứu HCTHTP thực để xác định nguyên nhân, chế biểu bệnh tính di truyền bệnh Những nghiên cứu áp dụng tiến di truyền học phân tử vài năm qua chứng minh có nhiều gen liên quan đến HCTHTP kháng corticosteroid, đột biến gen NPHS2 mã hóa cho protein podocin đóng vai trị quan trọng [49, 60] Các nhà khoa học xác định tổng cộng 89 đột biến điểm exon gen NPHS2, 56 đột biến tập trung từ exon đến exon chứng minh có liên quan chặt chẽ tới HCTHTP [41] Vì vậy, việc xác định đột biến gen NPHS2 nhằm tìm hiểu mối liên quan di truyền với đáp ứng thuốc hỗ trợ bác sĩ lâm sàng định phác đồ điều trị thích hợp cho bệnh nhân, hạn chế nhiều biến chứng thuốc giảm PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ac y ,V NU chi phí điều trị [43] Đây xu hướng tối ưu hóa điều trị theo cá thể, tích hợp xét nghiệm di truyền học phác đồ điều trị bệnh nhân Tại Việt Nam chưa có nghiên cứu đa hình thái gen NPHS2 quy trình phân tích gen Từ nhu cầu lâm sàng tính cấp thiết nghiên cứu xây dựng phương pháp chẩn đoán, điều trị bệnh nhân mắc HCTHTP, chúng tơi tiến hành đề tài “Phân tích gen Ph ar m NPHS2 mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát” Mục tiêu nghiên cứu: an d - Xây dựng quy trình phân tích đa hình di truyền nằm exon đến exon thuộc gen NPHS2 bệnh nhân nhi mắc HCTHTP Việt Nam - Xác định tần số đa hình gen NPHS2 149 bệnh nhân nhi mắc HCTHTP Việt Nam ine Nội dung nghiên cứu: Co py rig ht @ Sc h oo lo fM ed ic - Tối ưu hóa phản ứng PCR nhân dòng exon đến exon thuộc gen NPHS2 - Giải trình tự xác định đa hình gen NPHS2 - Áp dụng quy trình phân tích gen để khảo sát tần số kiểu gen tần số alen 149 bệnh nhân nhi mắc HCTHTP Việt Nam PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma Ph ar m ac y ,V NU máu toàn phần, dạng mẫu dễ thu thập sở khám chữa bệnh Việc tối ưu điều kiện có ý nghĩa quan trọng ứng dụng thực tế tiết kiệm thời gian công sức thao tác Áp dụng phân tích 149 bệnh nhân cho thấy quy trình phân tích gen chúng tơi có tính ổn định, dễ dàng lặp lại với độ xác cao Quy trình xây dựng nghiên cứu công cụ hỗ trợ nghiên cứu mối liên quan kiểu gen NPHS2 HCTH, mảng nghiên cứu cần bổ sung thêm nhiều dẫn liệu hoàn toàn chưa đánh giá Việt Nam Co py rig ht @ Sc h oo lo fM ed ic ine an d 4.2 Về phân tích kết SNP xác định exon Dựa vào kết giải trình tự kết hợp với sở liệu NCBI, xác định 251 SNP exon gen NPHS2 đột biến exon exon Trên giới, có nhiều cơng bố giải trình tự toàn exon gen NPHS2, nhiên, lần chúng tơi cơng bố giải trình tự toàn exon gen NPHS2 bệnh nhân nhi người Việt Nam mắc hội chứng thận hư tiên phát Nghiên cứu trẻ em Ai Cập mắc HCTH kháng corticosteroid khơng có tiền sử gia đình cho thấy khả liên quan số đột biến gen NPHS2 đến tiên lượng thuận lợi bệnh nhân [14] Nghiên cứu 484 bệnh nhân mắc hội chứng thận hư Nam Ấn Độ phát đột biến NPHS2 rs74315345, rs869025495, rs74315342 rs74315346, xuất nhóm kháng corticoid mà khơng xuất nhóm nhạy cảm với corticoid [15] Ở Việt Nam, khuyến nghị mở rộng thực nghiên cứu kết hợp với liệu cận lâm sàng lâm sàng HCTHTP để đánh giá mối liên quan đa hình di truyền NPHS2 đáp ứng thuốc corticoid điều trị HCTH Chúng xác định số SNP thuộc nhóm đột biến sai nghĩa vơ nghĩa Theo nhiều nghiên cứu trước giới, đột biến sai nghĩa nhóm đột biến xuất nhiều đột biến NPHS2 Trong đó, đột biến rs74315342 (tên khác c.413G>A hay p.R138Q) exon đột biến thường gặp Châu Âu [54] Axit amin arginine vị trí 138 đóng vai trị quan trọng bảo toàn cấu trúc chức podocin màng đáy cầu thận [21] Vì vậy, thay nucleotit G A dẫn đến thay glutamine cho arginine làm khả giữ lại 36 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma Co py rig ht @ Sc h oo lo fM ed ic ine an d Ph ar m ac y ,V NU nephrin tính tồn vẹn màng lọc cầu thận [37] Nghiên cứu chúng tơi tìm thấy xuất đột biến Các đột biến gen mã hóa protein podocin giữ lại mạng lưới nội chất chứng minh đột biến sai nghĩa khác như: p.P118L (c.353C> T), p.D160G (C.479A> G), p.R168S (c.502C> A), p.R168C (c.502C> T), p.R168H (C.503G> A), p.V260E (c.779T> A) [62] Mặt khác, số đột biến sai nghĩa dẫn đến đột biến podocin nhắm mục tiêu vào màng tế bào Các đột biến gây hại việc ảnh hưởng trực tiếp đến chức protein làm thay đổi đặc tính báo hiệu và/ thay đổi tương tác với protein khác màng lọc cầu thận [57] Các đột biến sai nghĩa không giới hạn vài exon cụ thể mà phân bố suốt chiều dài gen Do đó, miền chức khác podocin bị ảnh hưởng [62] Trong số đột biến sai nghĩa, đột biến công bố sở liệu giải trình tự p.V290M (C.868G> A) p.V180M (c.538G> A) với tần suất 1/13006 alen (0.008%), p.R138Q (c.413G> A) với tần số 8/13006 (0.06%), cho thường gặp đột biến sau bệnh nhân [20] Nhóm đột biến thứ hai xác định gen NPHS2 đột biến vô nghĩa Tổng hợp từ nghiên cứu trước, mười bảy đột biến vơ nghĩa mơ tả, có đột biến (p.S46X [c.137C> A], p.Q219X [c.655C> T], p.R229X [C.685C> T], p.L270X [c.809T> A]) Các đột biến khác mô tả trước là: p.Q39X (c.115C> T), p.R71X (c.211C> T), P.E87X (c.259G> T), p.W122X (c.366G> A), p.Q129X (c.385C> T) P.R138X (c.412C> T), p.Y162X (c.486C> A), p.R196X (c.586C> T) P.Q215X (c.643C> T), p.E237X (c.709G> T), p.E264X (c.790G> T) P.K289X (c.865A> T), p.R322X (c.964C> T) Xét nghiệm invitro protein đột biến p.R138X (c.412C> T) gây khả giữ lại nephrin màng đáy cầu thận [37] Mặt khác, phản ứng khuếch đại gen sinh thiết thận bệnh nhân mang đột biến p R138X (C.412C> T) phát sản phẩm chứng tỏ đột biến làm phân hủy mRNA [20, 21] Nghiên cứu Karim Bouchireb cộng (năm 2013) cập nhật đột biến gen NPHS2 liên quan đến HCTH kháng corticosteroid, đột biến thêm hay bớt nucleotit xác định bao gồm 11 đột biến chèn 37 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma Ph ar m ac y ,V NU thêm 26 đột biến xóa đoạn gen ngắn Trong số có đột biến gây lệch khung đọc Đột biến thêm nucleotit rải rác toàn chiều dài gen mã hóa podocin, nhiên, đột biến nucleotit tập trung vùng PHB đầu C-terminal Chỉ có đột biến nucleotit là: p.Pro89ArgfsX13 (c.264 265del), (p.P45RfsX54 [C.134del], p.E56GfsX43 [c.167del], p.L84WfsX15 [c.249del]) exon có ảnh hưởng đến đầu N podocin Nghiên cứu không thấy xuất đột biến này, kích thước quần thể nghiên cứu đột biến có tần số thấp đột biến liên quan đến chủng tộc địa dư mà chưa chứng minh rõ Sc h oo lo fM ed ic ine an d Ngoài đột biến thuộc exon đầu, nhiều nghiên cứu khác đột biến thuộc vùng intron đột biến mã kết thúc xác định Mười sáu đột biến làm thay đổi vị trí cắt mơ tả nghiên cứu bao gồm: 275-1G> C, 275-2A> C, 378> 1G> A, 378> 5G> A, 379-1G> C, 451 + 2T> A, 451 + 3A> T, 452-2A> C, 534 + 1G> T, 535-1G> T, 794 + 5G> T, 873 + 5G> A, 873 + 2T> A, 873> 1G> A, 874-1G> C, 874-2A> G Tuy nhiên cho nguyên nhân gây bệnh Phần lớn đột biến vị trí cắt ảnh hưởng đến intron (58% tất đột biến vị trí cắt) Đột biến p.X384QextX7 (c.1150T>C) tìm thấy gần nghiên cứu Bouchireb Trong đột biến này, thay base đơn lẻ stop codon tạo khung đọc mở dài hơn, kết tạo protein với 390 axit amin dẫn đến biểu mức podocin tế bào chân giả Vì vậy, nghiên cứu thực nghiệm tương lai cần thiết để đánh giá hậu chức đột biến đơn lẻ Co py rig ht @ Việc xác định tần số kiểu gen tần số alen đa hình di truyền xuất alen đột biến góp phần vào việc xác định SNP tiềm cho mối liên quan đa hình di truyền gen NPHS2 với HCTHTP kháng corticoid quẩn thể người Việt Nam Trong 149 bệnh nhân nghiên cứu, hai đột biến nằm exon exon 3, chúng tơi thấy có SNP có tính đa hình exon - rs1079292, rs758564490, rs3738423, rs200437667, rs12401711, rs12401708 Rs528833893; exon 5, có tính đồng hình Kết tương đồng với nghiên cứu Hasan Otukesh 38 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma Co py rig ht @ Sc h oo lo fM ed ic ine an d Ph ar m ac y ,V NU 20 bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư kháng corticoid bệnh viện Ali Asghar (Iran) nghiên cứu Maruyama exon 36 trẻ em Nhật Bản mắc HCTH kháng corticosteroid [32, 50] Trong nghiên cứu Yu năm 2005 23 bệnh nhân người Trung Quốc, có trường hợp đột biến dị hợp tử đa hình: 51G>T, 288C>T, IVS3-46C>T, IVS3-21C>T, IVS774G>C, 954T>C 1038A>G xảy với bệnh nhân nhóm đối chứng [67] Nghiên cứu HCTH kháng corticosteroid số nhóm người châu Âu cho thấy tỉ lệ xuất đột biến gen NPHS2 từ 12-19% [26, 58, 65] Ở nghiên cứu khác, đột biến gen NPHS2 phổ biến trẻ em Ai Cập mắc HCTH kháng corticosteroid khơng có tiền sử gia đình đưa khả giải thích cho tiên lượng thuận lợi bệnh nhân [16] Nghiên cứu 484 bệnh nhân mắc hội chứng thận hư Nam Ấn Độ phát đột biến gen NPHS2 G92C, P118L, R138Q D160G nhóm kháng corticoid (chiếm 18,5%) cịn nhóm nhạy cảm với corticoid khơng thấy đột biến xuất [39] Azocar M cộng phân tích gen NPHS2 34 trẻ em Chile mắc hội chứng thận hư kháng corticoid, phát bệnh nhân có đột biến (chiếm 21%) bệnh nhân dị hợp tử đột biến R229Q bệnh nhân đột biến A284V [15] Nội dung khóa luận phần thuộc nghiên cứu lớn Đây bước đầu việc xác định SNP có ý nghĩa quần thể người Việt Nam mắc HCTHTP, từ tìm hiểu mối liên quan di truyền đặc điểm lâm sàng số hóa sinh 39 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 4.1 KẾT LUẬN Từ kết đạt được, đưa số kết luận sau: Ph ar m ac y - Chúng tơi xây dựng quy trình phân tích gen cho exon đến thuộc gen NPHS2 sử dụng mẫu máu toàn phần với điều kiện tối ưu hóa cho phản ứng PCR: nhiệt độ gắn mồi 56oC, nồng độ mồi 0,3 pmol/µl nồng độ ADN khuôn khoảng 50 - 100 ng/µl an d - Áp dụng thành cơng quy trình phân tích gen 149 bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát Qua xác định 251 SNP đột biến Tần số alen SNP xuất đột biến thống kê so sánh với tần số lý thuyết theo định luật Hardy – Weinberg cho giá tri p > 0,05 4.2 KIẾN NGHỊ ed ic ine - Thực nghiên cứu đánh giá mối liên quan đa hình di truyền gen NPHS2 với đáp ứng thuốc corticosteroid điều trị hội chứng thận hư Co py rig ht @ Sc h oo lo fM - Xây dựng quy trình phân tích gen với exon cịn lại vùng khơng mã hóa protein gen NPHS2 để xác định thêm đa hình có khả ảnh hưởng đến đáp ứng thuốc corticosteroid 40 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU TÀI LIỆU THAM KHẢO 10 11 Ph ar m an d ine @ 12 ed ic fM lo oo Bệnh viện Nhi Trung Ương (2006), "Hướng dẫn chẩn đoán bệnh trẻ em" BioMedia Việt Nam Đa hình đơn nucleotide – Công cụ sử dụng di truyền học người, truy cập ngày 01 - 03-2018, trang web http://www.biomedia.vn/review/da-hinh-don-nucleotide-cong-cu-sudung-trong-di-truyen-hoc-o-nguoi.html Đinh Đoàn Long and Đỗ Lê Thăng (2008), "Phân tích gen sản phẩm gen", Cơ sở di truyền học phân tử tế bào, Nhà xuất Đại học Quốc gia Hà Nội, tr 325-355 Hà Phan Hải An (2015), "Hội chứng thận hư", Bệnh học nội khoa, tập 1, Nhà xuất Y học Hồ Huỳnh Thùy Dương (2001), Sinh học phân tử, Nhà xuất Y học Hoàng Hà Kiểm (2010), "Thận học lâm sàng", Nhà xuất Y học Khuất Hữu Thanh (1997), "Cơ sở di truyền phân tử kỹ thuật gen", Nhà xuất KHKT HN Lê Nam Trà (2009), "Hội chứng thận hư tiên phát", Bài giảng Nhi khoa, tập 2, Nhà xuất Y học Lê Thị Nhiên (2016), Nghiên cứu tính đa hình di truyền CYP2C19 bệnh nhân đặt Stent động mạch vành qua da, Luận văn Thạc sĩ Dược học, Đại học Dược Hà Nội Nguyễn Gia Khánh (2013), "Bài giảng Nhi khoa", tập Nguyễn Ngọc Sáng (1987), Nhận xét đặc điểm lâm sàng sinh học qua 52 trường hợp HCTHTP thể kháng thuốc trẻ em, Luận văn tốt nghiệp bác sĩ nội trú bệnh viện, Trường Đại học Y Hà Nội Trần Đình Long (1995), "Một số biến chứng liệu pháp corticoid điều trị hội chứng thận hư trẻ em", Tạp chí Nhi khoa, (2&3), tr 50-51 Sc h ac y Tiếng Việt ht Tiếng Anh py rig 13 Co 14 Andolino TP and Reid-Adam J (2015), "Nephrotic syndrome", Pediatrics in Review, 36(3), pp 117–126 Arbeitsgemeinschaft fur Pädiatrische Nephrologie (1988), "Short versus standard prednisone therapy for initial treatment of idiopathic nephrotic syndrome in children", Lancet, 1, pp 380 –383 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma 22 23 24 25 26 ,V NU ac y Ph ar m an d ht 27 ine 21 ed ic 20 fM 19 lo 18 oo 17 Sc h 16 Azocar M, Vega A et al (2016), "NPHS2 Mutation analysis study in children with steroid-resistant nephrotic syndrome", Rev Chil Pediatr, 87(1), pp 31-6 Bakr A Yehia S, El-Ghannam D and et al (2008), "NPHS2 mutations", Indian J Pediatr, 75, pp 135-8 Basiratnia M., Yavarian M and Torabinezhad S (2013), "NPHS2 Gene in Steroid-resistant Nephrotic Syndrome Prevalence, Clinical Course, and Mutational Spectrum in South-West Iranian Children", Iran J Kidney Dis, 7(5), pp 357-62 Berdeli A, M.S et al ( 2007), "NPHS2 (podocin) mutations in Turkish children with idiopathic nephritic syndrome", Pediatr Nephrol, 22, pp 2031-2040 Bernward Hinkes, C.V et al (2008), "Specific Podocin mutations correlate with age of onset in Steroid-Resistant Nephrotic syndrome", J Am Soc Nephrol, 19, pp 365-371 Bouchireb K, Boyer O and Gribouval O (2013), "NPHS2 mutations in steroid-resistant nephrotic syndrome: a mutation update and the associated phenotypic spectrum", Hum Mutat, 35(2), pp 178-86 Boute N, Gribouval O and Roselli S (2000), "NPHS2, encoding the glomerular protein podocin, is mutated in autosomal recessive steroidresistant nephrotic syndrome", Nat Genet, 24(4), pp 349-54 Budowle B., Adams D.E and Allen R.C (1994), "Fragment-length polymorphisms for forensic science applications", Methods in nucleic acids research, pp 181-202 Buscher AK and Weber S ( 2012), "Educational paper: the podocytopathies", Eu J Pediatr, 171 (8), pp 1151-60 Butler J.M (2001), "Biology and Technology behind STR marker", Forensic DNA Typing, Academic Press, London Caridi G, Bertelli R and Carrea A (2001), "Prevalence, genetics, and clinical features of patients carrying podocin mutations in steroidresistant nonfamilial focal segmental glomerulosclerosis", J Am Soc Nephrol, 12 (12), pp 2742-6 Caridi G, Bertelli R et al (2003), "Broadening the spectrum of diseases related to podocin mutations", J Am Soc Nephrol, 14, pp 1278‐86 Chanchlani R and Parekh RS (2016), "Ethnic differences in childhood nephrotic syndrome", Front Pediatrics, DOI: 10.3389/fped.2016.00039 Dedi Rachmadi, A.M and Leo Monners (2015), "Gene Mutation and Polymorphisms in Indonesian Chhildren with Steroid-Resistant Nephrotic Syndrome", Open Journal of Pediatrics, 5, pp 27-33 @ 15 Co py rig 28 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma 36 37 38 39 py rig ,V NU ac y Ph ar m an d ht 40 ine 35 ed ic 34 fM 33 lo 32 oo 31 Sc h 30 Dusel JA, Burdon KP and Hicks PJ (2005), "Identification of podocin (NPHS2) gene mutations in African Americans with nondiabetic endstage renal disease", Kidney Int, 68(1), pp 256-62 Eddy AA and Symons JM (2003), "Nephrotic syndrome in childhood", Lancet, 362(9384), pp 629–639 HabibR (1993), "Nephrotic syndrome in the st year of life", Inserm U, Hospital Necker – Enfant Malades, Paris, France, 7(4), pp 347353 Hasan Otukesh, B.G et al (2009), "NPHS2 Mutations in Children with Steroid-Resistant Nephrotic syndrome", Iranian Journal of Kidney Diseases, 3, pp 99-102 Hee Gyung Kang and H.I.C (2015), "Nephrotic syndrome: What’s new, what’s hot?", Korean J Pediatr 58, pp 275-282 Hee Yeon Cho, Joo Hoon Lee and Hyun Jin Choi (2008), "WT1 and NPHS2 mutations in Korean children with steroid resistant nephritic syndrome", Pediatr Nephrol, 23, pp 63-70 Hinkes B, Wiggins RC et al (2006), "Positional cloning uncovers mutations in PLCE1 responsible for a nephrotic syndrome variant that may be reversible", Nat Genet, 38, pp 1397–1405 Hinkes BG, Mucha B and ) Vlangos CN (2007), "Nephrotic syndrome in the first year of life: Two thirds of cases are caused by mutations in genes (NPHS1, NPHS2, WT1, and LAMB2)", Pediatrics, 119, pp 907–919 Huber TB, Simons M and Hartleben B (2003), "Molecular basis of the functional podocin-nephrin complex: mutations in the NPHS2 gene disrupt nephrin targeting to lipid raft microdomains", Hum Mol Genet, 15;12(24), pp 3397-405 International Study of Kidney Disease in Children (1981), Primary nephrotic syndrome in children: Clinical significance of histopathologic variants of minimal change and of diffuse mesangial hypercellularity, A Report of the International Study of Kidney Disease in Children Jaffer A, Unnisa W et al (2014), "NPHS2 mutation analysis and primary nephrotic syndrome in southern Indians", Nephrology, 19(7), pp 398-403 Joshi S, A.R et al (2013), "Genetics of steroid resistant nephritic syndrome: a review of mutation spectrum and suggested approach for genetic testing", Acta Paediatr, 102(9) Kalman Tory, Dora K Menyhard et al ( 2013), "Mutation dependent recessive inheritance of NPHS2 associated steroid resistant nephritic syndrome", Nature Genetics, 46(3), pp 299-304 @ 29 Co 41 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma 47 48 49 50 ,V NU ac y Sc h ht 54 @ 52 53 oo lo 51 Ph ar m 46 an d 45 ine 44 ed ic 43 Karle SM, Uetz B and Ronner V (2002), "Novel mutations in NPHS2 detected in both familial and sporadic steroid-resistant nephrotic syndrome", J Am Soc Nephrol, 13(2), pp 388-93 Karle SM, Uetz B et al (2002), "Novel mutations in NPHS2 detected in both familial and sporadic steroid-resistant nephrotic syndrome", J Am Soc Nephrol, 13 pp 388 –393 Kitamura A, Tsukaguchi H et al (2006), "Genetics and Clinical Features of 15 Asian Families with Steroid-Resistant Nephrotic Syndrome.", HealthNephrology Dialysis Transplantation, 21, pp 31333138 Kosskimies O, V.J et al (1982), "Long-termoutcome of primary nephrotic syndrome", Archives of Diseasein Chilhood 57, pp 544-548 Kruglyak L and Nickerson D.A (2001), "Variation is the spice of life", Nature Genetics, 27, pp 234–236 Kwok PY and Chen X (2003), "Detection of single nucleotide polymorphisms", Curr Issues Mol Biol, 5(2), pp 43-60 Lombel R M., Hodson E M and Gipson D S (2012), "Treatment of steroid-resistant nephrotic syndrome in children: new guidelaines from KDIGO", Pediatr Nephrol, 2304(8) Maddalena Gigante, Matteo Piemontese et al (2011), "Molecular and Genetic Basic of Inherited nephrotic syndrome ", International Journal of Nephrology, 2011, pp 1-15 Maruyama K, Iuima K et al (2003), "NPHS2 mutations in sporadic steroid‐resistant nephrotic syndrome in Japanese children", Pediatr Nephrol, 18, pp 412‐6 Mitra Basiratnia, M.Y et al (2013), "NPHS2 gene in Steroid resistant nephritic syndrome Prevelance, clinical course, and mutational spectrum in South West Iranian children", IJKD, 7, pp 357-362 Nelson (2000), "Nephrosis", Textbook of Pediatrics, 1129-1133 Nephrotic Syndrome: Pathophysiology, Treatment, Complications, Differential Diagnoses (2017), accessed 01 - 03-2018, from web https://www.healthdiseaseblog.com/2017/09/nephrotic-syndrometreatment-pathophysiology-complications-differential-diagnosis.html Patrick Niaudet (2004), "Podocin and Nephrotic Syndrome: Implications for the Clinician", Journal of the American society of Nephrology, 15, pp 832-834 Pereira AC, Pereira AB and Mota GF (2004), "NPHS2 R229Q functional variant is associated with microalbuminuria in the general population", Kidney Int, 65(3), pp 1026-30 Ren Q and Y.S (2011), "NPHS2 variation in children with late steroidresistant nephrotic syndrome", New York Science Journal 4, pp 30-33 fM 42 py rig 55 Co 56 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma 62 63 64 68 ,V NU ac y Co py rig ht 69 Sc h 67 @ 66 oo lo 65 Ph ar m 61 an d 60 ine 59 ed ic 58 Roselli S, Moutkine I and Gribouval O (2004), "Plasma membrane targeting of podocin through the classical exocytic pathway: effect of NPHS2 mutations", Traffic, 5(1), pp 37-44 Ruf RG, Lichtenberger A and Karle SM et al (2004), "Patients with mutations in NPHS2 (podocin) not respond to standard steroid treatment of nephrotic syndrome", J Am Soc Nephrol 15, pp 722 –732 Schumacher V, Scharer K et al (1998), "Spectrum of early onset nephrotic syndrome associated with WT1 missense mutations", Kidney Int, 53, pp 1594–1600 Severine Roselli, Imane Moutkine et al (2004), "Plasma membrane targeting of Podocin through the classical exocytic pathway: Effect of NPHS2 mutations", TRafic, 5, pp 37-44 Snustad D P and Simmons M J (2012), "The human Hapmap project", Principle of genetics, John Wiley & Sons, Inc, 414-415 Stefanie Weber, Oliver Gribouval and Ernie L (2004), "NPHS2 mutation analysis shows genetic heterogeneity of steroid-resistant nephrotic syndrome and low post-transplant recurrence", Kidney International, 66(2004), pp 571–579 Tsukaguchi H, Yager H and Dawborn J (2000), "A locus for adolescent and adult onset familial focal segmental glomerulosclerosis on chromosome 1q25-31", J Am Soc Nephrol, 11(9), pp 1674-80 A Vignal and et al (2002), "A review on SNP and other types of molecular markers and their use in animal genetics", Genetics, selection, evolution: GSE, 34(3), pp 275-305 Weber S Gribouval O, Esquivel EL and et al (2004), "NPHS2 mutation analysis shows genetic heterogeneity of steroid resistant nephritic syndrome and low post transplant recurrence", Kidney International Supplements, 66(2), pp 571-579 What are single nucleotide polymorphisms (SNPs)? , accessed 03 - 012018, from web https://ghr.nlm.nih.gov/primer/genomicresearch/snp Yu Sy Ren Q (2011), "NPHS2 variation in children with late steroidresistant nephrotic syndrome", New York Science Journal, 4(30-33) Zenker M, Tralau T et al (2004), "Congenital nephrosis, mesangial sclerosis, and distinct eye abnormalities with microcoria: An autosomal recessive syndrome", Am J Med Genet A, 130, pp 138–145 Zihua Yu, Jianping Huang et al (2005), "Mutations in NPHS2 in sporadic steroid – resistant nephrotic syndrome in Chinese children", Nephrol Dial Transplant, 20, pp 902-908 fM 57 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU PHỤ LỤC Phụ lục Quy trình tách chiết ADN tổng số sử dụng E.Z.N.A blood DNA Mini Kit Co py rig ht @ Sc h oo lo fM ed ic ine an d Ph ar m ac y Rã đông mẫu máu đá để hóa chất nhiệt độ phịng Lắc ống máu Chuyển 250 µl mẫu vào ống ly tâm vơ trùng Thêm 25 µl OB Protease Solution 250 µl BL Buffer Vortex 10 giây Ủ 65oC 10 phút Chú ý: Sau ủ phút, vortex 15 giây Thêm 260 µl Ethanol 100%, vortex 20 giây Ly tâm 1000 vòng/ phút 15 giây để đảm bảo mẫu khơng dính thành nắp ống Chèn HiBind ADN Mini Column vào Collection Tube 2ml Chuyển toàn mẫu vào cột (để pipet mức 790 µl) Ly tâm 14.000 vòng/ phút phút 10.Bỏ dịch lọc Collection Tube 11.Lắp HiBind ADN Mini Column vào Collletion Tube 2ml 12.Thêm 500 µl HBC Buffer 13.Ly tâm 14.000 vòng/ phút phút 14.Bỏ dịch lọc sử dụng lại Colletion Tube 15.Thêm 700 µl ADN Wash Buffer 16.Ly tâm phút 10.000g 17.Bỏ dịch lọc sử dụng lại Colletion Tube 18.Lặp lại bước 14 đến 16 cho bước rửa thứ với ADN Wash Buffer 19.Ly tâm HiBind ADN Mini Column 14.000 vịng/ phút phút để làm khơ cột 20.Chuyển HiBind ADN Mini Column vào ống ly tâm 2ml 21 Thêm 100 µl Elution Buffer (đã làm ấm đến 65oC) Ủ 65oC phút 22.Ly tâm 14.000 vịng/ phút phút 23.Thêm 50 µl Elution Buffer phút nhiệt độ phòng 24.Ly tâm 14.000 vòng/ phút phút 25.Thu vào bảo quản ADN -20oC PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ,V NU Phụ lục Quy trình kiểm tra chất lượng ADN thơng qua điện di Co py rig ht @ Sc h oo lo fM ed ic ine an d Ph ar m ac y Bước 1: Chuẩn bị gel agarose Pha Agarose bột đệm TAE 1X để đạt nồng độ dung dịch gel agarose 1,5% Đun lò vi sóng cho agarose tan hồn tồn, sau để nguội đến 50 – 60oC đổ vào khay điện di có cài sẵn lược để tạo giếng nhỏ Sau khoảng 30 phút, gel đông, gỡ lược đặt gel vào bể điện di tư nằm ngang Đổ đệm TAE 1X vào bể điện di ngập cách mặt gel 1- mm Bước 2: Tra mẫu ADN Mẫu ADN trộn với ADN dye 6X (chất chứa hai chất nhuộm màu khác nhau: bromophenol xanh xylene cyanol FF để theo dõi trực quan di chuyển gel điện trường, 5µl ADN mẫu 5µl ADN thang chuẩn Lambda/Hind III Marker tra vào giếng Bước 3: Chạy điện di Quá trình chạy điện di tiến hành hiệu điện 70V 60 phút ADN di chuyển từ cực âm sang cực dương Quan sát di chuyển màu để biết dừng điện di Bản gel lấy nhẹ khỏi khuôn soi ghi hình ánh sáng tử ngoại PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma A260/A280 STT OD 85,6 1,877 51 112,8 1,932 104 76,55 89,95 1,849 52 169,4 1,916 105 179,55 186 1.931 53 105,3 1,975 106 62,55 1,853 54 90,5 2,025 58,05 1,797 55 87,5 1,91 59 1,832 56 80 1,82 35,4 1,723 57 60 57,05 1,84 58 106 88 1,833 59 59,1 10 49,4 1,83 60 11 72,1 1,828 61 12 64,1 1,834 62 13 66,8 1,838 14 83,5 15 34,9 16 75,3 17 18 A260/A280 1,803 1,872 ac y OD 138,1 Ph ar m A260/A280 STT 1,843 101,0 1,796 108 58,05 1,932 109 108,5 1,869 1,862 110 97,1 1,873 1,859 111 130,35 1,873 2,017 112 61,15 2,347 89,3 1,882 113 95,65 1,838 156,5 1,854 114 77,95 2,23 51,05 1,782 115 231,05 1,876 63 202 1,852 116 65,85 2,335 1,835 64 65 1,898 117 94,4 1,855 1,776 65 164,8 1,865 118 110,75 1,819 1,848 66 82,85 119 101,4 1,829 129,7 1,837 67 353,65 1,858 120 143,6 1,859 1,814 68 95,95 2,016 121 53,2 1,921 105,9 1,827 70 128,7 122 58,65 2,026 20 65 1,86 71 94 1,891 123 71,7 1,846 21 123,9 1,892 72 78,9 1,779 124 133,4 1,849 ine ed ic fM lo oo Sc h Co py rig 19 55,7 an d 107 @ OD ht STT ,V NU Phụ lục Kết đo OD mẫu ADN PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma 1,856 73 72,25 1,899 125 140,55 23 125,7 1,852 75 151,55 1,865 126 61,65 24 65,1 1,852 76 90,6 1,872 127 49,7 25 31,7 1,761 78 166,4 1,85 128 57,8 26 160,3 1,829 79 96,65 1,91 129 93,55 27 61,35 1,771 80 110,85 1,882 28 68,55 1,876 81 67,85 1,829 29 87,2 1,91 82 149,75 1,871 30 125,2 1,886 83 95,7 31 115,9 1,905 84 68,7 32 120,9 1,914 85 90,95 33 77,4 1,972 86 34 34,65 2,126 87 35 74,95 1,949 88 36 105,3 1,903 37 282,3 38 92,45 39 157,3 40 41 1,851 ,V NU 119,3 1,819 1,807 1,806 69,25 1,976 131 89,55 1,916 132 32,95 2,175 1,935 133 77,7 1,962 1,893 134 46,1 1,851 1,839 135 128,7 1,925 163,4 1,846 136 77,85 1,91 47,3 1,87 137 121,55 1,846 83,95 1,833 138 58,2 1,836 89 66,6 1,884 139 63,25 2,014 1,866 90 146,5 1,884 141 65,3 2,047 1,938 91 126,25 1,93 143 84,45 1,868 1,862 92 71,4 2,122 144 78,55 1,861 184,9 1,883 93 103,8 1,968 145 82,95 1,86 1,942 94 95,1 2,026 146 47,9 1,86 189,3 1,908 95 60,15 2,175 147 49,8 1,89 43 126,8 1,836 96 91,55 2,064 148 34,45 1,867 44 128,1 1,911 97 155,35 1,978 149 40,35 1,758 ine ed ic fM lo oo Sc h Co py rig 42 91,55 an d 130 @ 1,849 ht Ph ar m ac y 22 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma 1,899 98 104,5 2,057 151 70,5 46 60,6 99 64,4 2,248 152 77,3 47 95,7 1,957 100 106,1 1,801 153 52,9 48 63,05 2,002 101 159,1 1,793 154 96,9 49 112,2 1,902 102 109,9 1,852 155 58,95 50 146,4 1,901 103 82,8 1,765 1,868 ,V NU 145,5 1,874 1,856 1,867 Ph ar m ac y 45 1,877 160,3 1,894 157 200,3 1,880 Co py rig ht @ Sc h oo lo fM ed ic ine an d 156 PDF Watermark Remover DEMO : Purchase from www.PDFWatermarkRemover.com to remove the waterma ... fM ed ic ine TỐI ƯU QUY TRÌNH PHÂN TÍCH GEN NPHS2 TRÊN MẪU MÁU BỆNH NHÂN NHI MẮC HỘI CHỨNG THẬN HƯ TIÊN PHÁT Sc h oo KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC NGÀNH Y ĐA KHOA Khóa: QH 2012.Y ThS BS Vũ Vân... nghiên cứu xây dựng phương pháp chẩn đoán, điều trị bệnh nhân mắc HCTHTP, tiến hành đề tài ? ?Phân tích gen Ph ar m NPHS2 mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát? ?? Mục tiêu nghiên... @ Trên giới, nhà nghiên cứu tiến hành phân tích đa hình di truyền gen NPHS2 nhóm bệnh nhân mắc hội chứng thận hư khác Năm 2000, Boute cộng lần đầu phân tích đột biến gen NPHS2 phát đột biến gen

Ngày đăng: 01/12/2021, 19:39

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
2. BioMedia Vi ệ t Nam Đa hình đơn nucleotide – Công c ụ s ử d ụ ng trong di truy ề n h ọ c ở ngườ i, truy c ậ p ngày 01 - 03-2018, t ạ i trang web http://www.biomedia.vn/review/da-hinh-don-nucleotide-cong-cu-su-dung-trong-di-truyen-hoc-o-nguoi.html Sách, tạp chí
Tiêu đề: Đa hình đơn nucleotide – Công cụ sử dụng trong di truyền học ở người
3. Đinh Đoàn Long and Đỗ Lê Thăng (2008), "Phân tích gen và sả n ph ẩ m c ủ a gen", Cơ sở di truy ề n h ọ c phân t ử và t ế bào, Nhà xu ấ t b ản Đạ i h ọ c Qu ố c gia Hà N ộ i, tr. 325-355 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Phân tích gen và sản phẩm của gen
Tác giả: Đinh Đoàn Long and Đỗ Lê Thăng
Nhà XB: Nhà xuất bản Đại học Quốc gia Hà Nội
Năm: 2008
4. Hà Phan H ả i An (2015), "H ộ i ch ứ ng th ận hư", B ệ nh h ọ c n ộ i khoa, t ậ p 1, Nhà xu ấ t b ả n Y h ọ c Sách, tạp chí
Tiêu đề: Hội chứng thận hư
Tác giả: Hà Phan H ả i An
Nhà XB: Nhà xuất bản Y học
Năm: 2015
5. H ồ Hu ỳnh Thùy Dương (2001), Sinh h ọ c phân t ử , Nhà xu ấ t b ả n Y h ọ c Sách, tạp chí
Tiêu đề: Sinh học phân tử
Tác giả: H ồ Hu ỳnh Thùy Dương
Nhà XB: Nhà xuất bản Y học
Năm: 2001
6. Hoàng Hà Ki ể m (2010), "Th ậ n h ọ c lâm sàng", Nhà xu ấ t b ả n Y h ọ c Sách, tạp chí
Tiêu đề: Thận học lâm sàng
Tác giả: Hoàng Hà Ki ể m
Nhà XB: Nhà xuất bản Y học
Năm: 2010
7. Khu ấ t H ữu Thanh (1997), "Cơ sở di truy ề n phân t ử và k ỹ thu ậ t gen", Nhà xu ấ t b ả n KHKT HN Sách, tạp chí
Tiêu đề: Cơ sở di truyền phân tử và kỹ thuật gen
Tác giả: Khu ấ t H ữu Thanh
Nhà XB: Nhà xuất bản KHKT HN
Năm: 1997
8. Lê Nam Trà (2009), "H ộ i ch ứ ng th ận hư tiên phát", Bài gi ả ng Nhi khoa, t ậ p 2, Nhà xu ấ t b ả n Y h ọ c Sách, tạp chí
Tiêu đề: Hội chứng thận hư tiên phát
Tác giả: Lê Nam Trà
Nhà XB: Nhà xuất bản Y học
Năm: 2009
9. Lê Th ị Nhiên (2016), Nghiên c ứu tính đa hình di truyề n CYP2C19 ở b ệnh nhân đặt Stent độ ng m ạ ch vành qua da, Lu ận văn Thạc sĩ Dượ c h ọc, Đạ i h ọc Dượ c Hà N ộ i Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nghiên cứu tính đa hình di truyền CYP2C19 ởbệnh nhân đặt Stent động mạch vành qua da
Tác giả: Lê Th ị Nhiên
Năm: 2016
10. Nguy ễ n Gia Khánh (2013), "Bài gi ả ng Nhi khoa", t ậ p 2 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bài giảng Nhi khoa
Tác giả: Nguy ễ n Gia Khánh
Năm: 2013
11. Nguy ễ n Ng ọ c Sáng (1987), Nhận xét về đặc điểm lâm sàng và sinh học qua 52 trườ ng h ợ p HCTHTP th ể kháng thu ố c ở tr ẻ em, Lu ận văn tố t nghi ệp bác sĩ nộ i trú b ệ nh vi ện, Trường Đạ i h ọ c Y Hà N ộ i Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nhận xét về đặc điểm lâm sàng và sinh học qua 52 trường hợp HCTHTP thể kháng thuốc ở trẻ em
Tác giả: Nguy ễ n Ng ọ c Sáng
Năm: 1987
12. Tr ần Đình Long (1995), "Mộ t s ố bi ế n ch ứ ng c ủ a li ệ u pháp corticoid trong điề u tr ị h ộ i ch ứ ng th ận hư ở tr ẻ em", T ạ p chí Nhi khoa, 4 (2&3), tr. 50-51.Ti ế ng Anh Sách, tạp chí
Tiêu đề: Một số biến chứng của liệu pháp corticoid trong điều trị hội chứng thận hư ở trẻ em
Tác giả: Tr ần Đình Long
Năm: 1995
1. B ệ nh vi ện Nhi Trung Ương (2006), "Hướ ng d ẫ n ch ẩn đoán bệ nh tr ẻ em&#34 Khác

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

SNP Single nucleotide polymorphism (Đa hình đơn nucleotit) - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
ingle nucleotide polymorphism (Đa hình đơn nucleotit) (Trang 4)
DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH (Trang 6)
Hình 1.1. Tỉ lệ mắc hội chứng thận hưở một số nước trên thế giới [27] - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 1.1. Tỉ lệ mắc hội chứng thận hưở một số nước trên thế giới [27] (Trang 12)
Hình 1.2. Cơ chế bệnh học HCTH [53] - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 1.2. Cơ chế bệnh học HCTH [53] (Trang 13)
Hình 1.3. Gen NPHS2 và protein podocin. A. Vị trí của gen NPHS2 trên nhi ễm sắc thể số 1 - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 1.3. Gen NPHS2 và protein podocin. A. Vị trí của gen NPHS2 trên nhi ễm sắc thể số 1 (Trang 16)
Hình 1.4. Tế bào biểu mô có chân trên màng đáy cầu thận và tương tác - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 1.4. Tế bào biểu mô có chân trên màng đáy cầu thận và tương tác (Trang 17)
Nhiều dạng đa hình gen NPHS2 đã được xác định, trong đó chủ yếu là các SNP (Hình 1.5) - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
hi ều dạng đa hình gen NPHS2 đã được xác định, trong đó chủ yếu là các SNP (Hình 1.5) (Trang 18)
Bảng 1. Trình tự mồi nhân dòng gen NPHS2 - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Bảng 1. Trình tự mồi nhân dòng gen NPHS2 (Trang 29)
Quy trình nghiên cứu được tóm tắt thành sơ đồ Hình 2.1.  @  - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
uy trình nghiên cứu được tóm tắt thành sơ đồ Hình 2.1. @ (Trang 31)
Hình 2.1. Sơ đồ thí nghiệm nghiên cứu - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 2.1. Sơ đồ thí nghiệm nghiên cứu (Trang 32)
Hình 3.1. Kết quả điện di ADN tổng số trên gel agarose 2%. Làn M: Lamda - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 3.1. Kết quả điện di ADN tổng số trên gel agarose 2%. Làn M: Lamda (Trang 34)
quả điện di ở hình 3.2 cho thấy băng ADN ở exo n1 hiện lên rõ nét nhất tại d ải  nhiệt  độ  gắn  mồi  từ  54,5oC  đến  66,5oC;  exon  2  từ  50,8oC  đến  58,1o C;  exon 3 t ừ 50,9oC đến 58,1oC; exon 4 từ 51,0oC đến 59,1oC; exon 5 từ 53,4oC  đến 57,3oC và  - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
qu ả điện di ở hình 3.2 cho thấy băng ADN ở exo n1 hiện lên rõ nét nhất tại d ải nhiệt độ gắn mồi từ 54,5oC đến 66,5oC; exon 2 từ 50,8oC đến 58,1o C; exon 3 t ừ 50,9oC đến 58,1oC; exon 4 từ 51,0oC đến 59,1oC; exon 5 từ 53,4oC đến 57,3oC và (Trang 35)
Hình 3.3. Kết quả điện dis ản phẩm PCR tối ưu nồng độ mồi trên 6 exon gen NPHS2. Làn M: Marker 100bp - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 3.3. Kết quả điện dis ản phẩm PCR tối ưu nồng độ mồi trên 6 exon gen NPHS2. Làn M: Marker 100bp (Trang 36)
Hình 3.4. Kết quả điện dis ản phẩm PCR với nồng độ ADN khác nhau trên 6  exon  gen  NPHS2 - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 3.4. Kết quả điện dis ản phẩm PCR với nồng độ ADN khác nhau trên 6 exon gen NPHS2 (Trang 37)
Hình 3.6. Một số kết quả giải trình tự gen NPHS2. Hình A: các kiểu gen c ủa đa hình rs3738423 - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 3.6. Một số kết quả giải trình tự gen NPHS2. Hình A: các kiểu gen c ủa đa hình rs3738423 (Trang 38)
Hình 3.7. Số lượng đột biến trên 6 exon đầu tiên của gen NPHS2 - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Hình 3.7. Số lượng đột biến trên 6 exon đầu tiên của gen NPHS2 (Trang 39)
Bảng 4. Các đột biến sai nghĩa thuộc gen NPHS2 trong nghiên cứu - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
Bảng 4. Các đột biến sai nghĩa thuộc gen NPHS2 trong nghiên cứu (Trang 40)
3.4. TẦN SỐ ALENC ỦA CÁC ĐA HÌNH XUẤT HIỆN TRONG NGHIÊN C ỨU  - Khóa luận phân tích gen NPHS2 trên mẫu máu bệnh nhân nhi mắc hội chứng thận hư tiên phát
3.4. TẦN SỐ ALENC ỦA CÁC ĐA HÌNH XUẤT HIỆN TRONG NGHIÊN C ỨU (Trang 41)

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w