1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn

73 7 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Tiêu đề Sàng Lọc Và Định Danh Các Chủng Vi Khuẩn Quang Hợp Có Khả Năng Hấp Thu Muối Và Định Hướng Ứng Dụng Giảm Nhiễm Mặn
Tác giả Châu Thị Thùy Linh
Người hướng dẫn TS. Hoàng Quốc Khánh, HVCH. Ngô Đức Duy
Trường học Trường Đại Học Công Nghệ TP. Hồ Chí Minh
Chuyên ngành Công Nghệ Sinh Học
Thể loại Đồ Án Tốt Nghiệp
Năm xuất bản 2018
Thành phố TP. Hồ Chí Minh
Định dạng
Số trang 73
Dung lượng 3,86 MB

Nội dung

Ngày đăng: 11/07/2021, 17:46

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
[1] Bùi Đoàn Phượng Linh, Hồng Hải Nhi, Hoàng Phương Thảo, Nguyễn Thanh Tú (2014), “Bài giảng Vi khuẩn quang hợp và cố định nito”. Trường đại học Đồng Nai Sách, tạp chí
Tiêu đề: “Bài giảng Vi khuẩn quang hợp và cố định nito”
Tác giả: Bùi Đoàn Phượng Linh, Hồng Hải Nhi, Hoàng Phương Thảo, Nguyễn Thanh Tú
Năm: 2014
[2] Mỵ Trần Hương Trà và cộng sự (2015), “Nghiên cứu nhân nuôi và sử dụng vi khuẩn Rhodobacter để xử lý chất hữu cơ và sulfide trong nước”. Trường đại học Sài Gòn.Tài liệu tiếng anh Sách, tạp chí
Tiêu đề: “Nghiên cứu nhân nuôi và sử dụng vi khuẩn Rhodobacter để xử lý chất hữu cơ và sulfide trong nước”
Tác giả: Mỵ Trần Hương Trà và cộng sự
Năm: 2015
[3] Coenye T, Vandamme P (November 2003). “Intragenomic heterogeneity between multiple 16S ribosomal RNA operons in sequenced bacterial genomes”. FEMS Microbiology Letters. 228 (1): 45 – 9. PMID 14612235.doi:10.1016/S0378 - 1097 (03)00717-1 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Intragenomic heterogeneity between multiple 16S ribosomal RNA operons in sequenced bacterial genomes
[4] El-Dessouky, H.T. and H.M. Ettouney, 2002 “Fundamentals of salt water desalination”. Elsevier Sách, tạp chí
Tiêu đề: Fundamentals of salt water desalination”
[5] Ellis, R.A., C.C. Goertemiller, and D.L. Stetson, 1977 Significance of extensive /`leaky/' cell junctions in the avian salt gland. Nature, 268(5620): p. 555-556 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Significance of extensive /`leaky/' cell junctions in the avian salt gland
[6] Flowers, T.J. and T.D. Colmer, 2015 Plant salt tolerance: adaptations in halophytes. Annals of botany, 115(3): p. 327-331 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Plant salt tolerance: adaptations in halophytes
[7] Hall, J.E., 2010 “Guyton and Hall Textbook of Medical Physiology”. Elsevier Health Sciences Sách, tạp chí
Tiêu đề: Guyton and Hall Textbook of Medical Physiology”
[8] Handwerk, Brian (May 6, 2005) Egypt’s “King Tut Curse” Caused by Tomb Toxins_National Geographic Sách, tạp chí
Tiêu đề: King Tut Curse
[9] Hildebrandt, J.-P., 2001 Coping with excess salt: adaptive functions of extrarenalosmoregulatory organs in vertebrates. Zoology, 104(3–4): p. 209-220. (19) [10] Hunter, C.N., Daldal, F., Thurnauer, M.C., Beatty, J.Th. (Eds.) (2009). “The Purple Sách, tạp chí
Tiêu đề: Coping with excess salt: adaptive functions of extrarenalosmoregulatory organs in vertebrates". Zoology, 104(3–4): p. 209-220. (19) [10] Hunter, C.N., Daldal, F., Thurnauer, M.C., Beatty, J.Th. (Eds.) (2009)
Tác giả: Hildebrandt, J.-P., 2001 Coping with excess salt: adaptive functions of extrarenalosmoregulatory organs in vertebrates. Zoology, 104(3–4): p. 209-220. (19) [10] Hunter, C.N., Daldal, F., Thurnauer, M.C., Beatty, J.Th. (Eds.)
Năm: 2009
[11] Jaime M. Amezaga, Anna Amtmann*, Catherine A. Biggs, Tom Bond, Catherine J. Gandy, Annegret Honsbein, Esther Karunakaran, Linda Lawton, Mary Ann Madsen, Konstantinos Minas, and Michael R. Templeton (2014) “Biodesalination: A Case Study for Applications of Photosynthetic Bacteria in Water Treatment” (3) Sách, tạp chí
Tiêu đề: “Biodesalination: A Case Study for Applications of Photosynthetic Bacteria in Water Treatment”
[12] Jay ZJ, Inskeep WP (July 2015). “The distribution, diversity, and importance of 16S rRNA gene introns in the order Thermoproteales”. Biology Direct. 10 (35):35. PMC 4496867. PMID 26156036.doi: 10.1186/s13062-015-0065-6 Sách, tạp chí
Tiêu đề: The distribution, diversity, and importance of 16S rRNA gene introns in the order Thermoproteales
[13] Kei Sasaki, Yuichiro Hosokawa, Kenji Takeno, Ken Sasaki (2017). “Removal of Sodium from Seawater Medium Using Photosynthetic Bacteria”, 6, 133-143 Sách, tạp chí
Tiêu đề: “Removal of Sodium from Seawater Medium Using Photosynthetic Bacteria”
Tác giả: Kei Sasaki, Yuichiro Hosokawa, Kenji Takeno, Ken Sasaki
Năm: 2017
[14] Kim, K., E. Seo, S.-K. Chang, T.J. Park, and S.J. Lee, 2016 Novel water filtration of saline water in the outermost layer of mangrove roots. Scientific Reports, 6: p. 20426 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Novel water filtration of saline water in the outermost layer of mangrove roots
[15] Krishnamurthy, P., P.A. Jyothi-Prakash, L.I.N. Qin, J.I.E. He, Q. Lin, C.-S. Loh, and P.P. Kumar, 2014 Role of root hydrophobic barriers in salt exclusion of a mangrove plant Avicennia officinalis. Plant, Cell & Environment, 37(7): p. 1656-1671 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Role of root hydrophobic barriers in salt exclusion of a mangrove plant Avicennia officinalis
[16] Manousaki, E. and N. Kalogerakis, 2010 Halophytes Present New Opportunities in Phytoremediation of Heavy Metals and Saline Soils. Industrial & Engineering Chemistry Research, 50(2): p. 656-660. (12) Sách, tạp chí
Tiêu đề: Halophytes Present New Opportunities in Phytoremediation of Heavy Metals and Saline Soils
[17] Maribel L. Dionisio-Sese!, Satoshi Tobita (2000). “Effects of salinity on sodium content and photosynthetic responses of rice seedlings differing in salt tolerance” , pp. 54- 58 Sách, tạp chí
Tiêu đề: “Effects of salinity on sodium content and photosynthetic responses of rice seedlings differing in salt tolerance”
Tác giả: Maribel L. Dionisio-Sese!, Satoshi Tobita
Năm: 2000
[18] Mitra, A., 2013 Sensitivity of mangrove ecosystem to changing climate. Berlin: Springer Sách, tạp chí
Tiêu đề: Sensitivity of mangrove ecosystem to changing climate
[20] Narong Wongkantrakorn, Yukari Sunohara and Hiroshi Matsumoto (2009). “Mechanism of growth amelioration of NaCl-stressed rice (Oryza sativa L.) by d- aminolevulinic acid”, 89–95 Sách, tạp chí
Tiêu đề: “Mechanism of growth amelioration of NaCl-stressed rice (Oryza sativa L.) by d-aminolevulinic acid”
Tác giả: Narong Wongkantrakorn, Yukari Sunohara and Hiroshi Matsumoto
Năm: 2009
[22] Schmidt-Nielsen, K., 1997 Animal Physiology: Adaptation and Environment. Cambridge University Press Sách, tạp chí
Tiêu đề: Animal Physiology: Adaptation and Environment
[23] Shabala, S., A. Moreno, Y. Hariadi, A. Mackay, Y. Tian, and J. Bose. Halophytes: what makes them special? Revealing ionic mechanisms of salinity tolerance. in XVIII International Botanical Congress. 2011 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Halophytes: "what makes them special? Revealing ionic mechanisms of salinity tolerance". in "XVIII International Botanical Congress

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Hình 1.1. Cơ chế dung nạp muối trong thực vật: sự hình thành tinh thể trên lá của - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 1.1. Cơ chế dung nạp muối trong thực vật: sự hình thành tinh thể trên lá của (Trang 22)
Hình 1.2. Giải thích nguyên nhân sự hấp thu Na+ thông qua hệ thống bơm ion màng (Halorhodopsin) do tác động của ánh sáng là đặc trưng của Cl-. - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 1.2. Giải thích nguyên nhân sự hấp thu Na+ thông qua hệ thống bơm ion màng (Halorhodopsin) do tác động của ánh sáng là đặc trưng của Cl- (Trang 23)
Bảng 1.1 Các tính chất của vi khuẩn quang hợp [28] - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Bảng 1.1 Các tính chất của vi khuẩn quang hợp [28] (Trang 25)
Bảng 1.2. Các trình tự gene đoạn mồi 16S rRNA - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Bảng 1.2. Các trình tự gene đoạn mồi 16S rRNA (Trang 29)
Hình thái: - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình th ái: (Trang 33)
Hình 2.1. Mô phỏng vệ tinh khu vực lấy mẫu, xã Hựu Thạnh thuộc huyện Đức Hòa nằm ở vị trì 10o 90’23” vĩ độ Bắc, 106o41’85” Kinh độ Đông - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 2.1. Mô phỏng vệ tinh khu vực lấy mẫu, xã Hựu Thạnh thuộc huyện Đức Hòa nằm ở vị trì 10o 90’23” vĩ độ Bắc, 106o41’85” Kinh độ Đông (Trang 34)
Hình 2.2. Một góc bản đồ Liên tiểu khu 104 – xã Viên An Đông, rừng phòng hộ Nhưng Miên và vị trí lấy mẫu - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 2.2. Một góc bản đồ Liên tiểu khu 104 – xã Viên An Đông, rừng phòng hộ Nhưng Miên và vị trí lấy mẫu (Trang 35)
Hình 2.3. Chu trình phản ứng PCR 16S rRNA - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 2.3. Chu trình phản ứng PCR 16S rRNA (Trang 39)
Bảng 3.1. Giá trị pH của các mẫu tăng sinh thành công ở tỉnh Long An và tỉnh Cà Mau - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Bảng 3.1. Giá trị pH của các mẫu tăng sinh thành công ở tỉnh Long An và tỉnh Cà Mau (Trang 40)
CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
3 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU (Trang 40)
Từ bảng 3.1 cho thấy mẫu nước ruộng ở Long An có pH 3–4 đã ảnh hưởng đến khả năng phát triển của nhóm vi khuẩn quang hợp, chỉ có 7 mẫu chuyển dần sang đỏ sau 20 ngày trong số 22 mẫu thu được, tỉ lệ 31,8% - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
b ảng 3.1 cho thấy mẫu nước ruộng ở Long An có pH 3–4 đã ảnh hưởng đến khả năng phát triển của nhóm vi khuẩn quang hợp, chỉ có 7 mẫu chuyển dần sang đỏ sau 20 ngày trong số 22 mẫu thu được, tỉ lệ 31,8% (Trang 41)
3.1 Kết quả tăng sinh của vi khuẩn - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
3.1 Kết quả tăng sinh của vi khuẩn (Trang 41)
Hình 3.1. Kết quả tăng sinh mẫu RL19 và mẫu RL6. - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.1. Kết quả tăng sinh mẫu RL19 và mẫu RL6 (Trang 42)
Bảng 3.2. Các chủng vi khuẩn đã phân lập được - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Bảng 3.2. Các chủng vi khuẩn đã phân lập được (Trang 43)
Hình 3.2. Kết quả phân lập sau 7 ngày trên môi trường thạch BIM của chủng CM24 (hình trái) và kết quả làm thuần của chủng CM24 đang chuyển dần sang đỏ sau 5 – 7 ngày (hình - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.2. Kết quả phân lập sau 7 ngày trên môi trường thạch BIM của chủng CM24 (hình trái) và kết quả làm thuần của chủng CM24 đang chuyển dần sang đỏ sau 5 – 7 ngày (hình (Trang 45)
Hình 3.3. Kết quả phân lập trên môi trường thạch BIM của một số chủng vi khuẩn. - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.3. Kết quả phân lập trên môi trường thạch BIM của một số chủng vi khuẩn (Trang 45)
Bảng 3.3. Kết quả nhuộm Gram của các chủng - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Bảng 3.3. Kết quả nhuộm Gram của các chủng (Trang 46)
Hình 3.4. Hình thái tế bào của một số chủng trong nhóm vi khuẩn quang hợp phân lập được dưới vật kính 100X - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.4. Hình thái tế bào của một số chủng trong nhóm vi khuẩn quang hợp phân lập được dưới vật kính 100X (Trang 47)
Hình 3.6. Chủng RL8.1 phát tốt ở mọi nồng độ nhưng ở nồng độ muối 10, 15, 20‰ có sự phát triển cao hơn hẳn, giá trị OD 660 ở nồng độ 10‰ đạt 0,824 sau 7 ngày khảo sát - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.6. Chủng RL8.1 phát tốt ở mọi nồng độ nhưng ở nồng độ muối 10, 15, 20‰ có sự phát triển cao hơn hẳn, giá trị OD 660 ở nồng độ 10‰ đạt 0,824 sau 7 ngày khảo sát (Trang 49)
Hình 3.5. Chủng RL1 có thể phát triển ở mọi nồng độ muối. Nhưng ở nồng độ muối 20 ‰ thì sự phát triển vượt trội hơn ở các nồng độ muối khác, giá trị OD660 đạt 0,504 sau - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.5. Chủng RL1 có thể phát triển ở mọi nồng độ muối. Nhưng ở nồng độ muối 20 ‰ thì sự phát triển vượt trội hơn ở các nồng độ muối khác, giá trị OD660 đạt 0,504 sau (Trang 49)
Hình 3.8. Chủng 24.1 phát triển tốt ở mọi nồng đồ muối, chúng phát triển ổn định và tốt nhất, ờ nồng độ 5‰ giá trị OD 660 đạt 0,868, nồng độ 20% giá trị OD660 đạt 0,585 sau 7 - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.8. Chủng 24.1 phát triển tốt ở mọi nồng đồ muối, chúng phát triển ổn định và tốt nhất, ờ nồng độ 5‰ giá trị OD 660 đạt 0,868, nồng độ 20% giá trị OD660 đạt 0,585 sau 7 (Trang 50)
Hình 3.7. Chủng 34.3 phát triển tốt ở mọi nồng độ, chúng phát triển tốt nhất ở nồng độ muối 5‰, giá trị OD 660 đạt 0,666 sau 4 ngày và ở nồng độ muối 20% , giá trị OD660 đạt - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.7. Chủng 34.3 phát triển tốt ở mọi nồng độ, chúng phát triển tốt nhất ở nồng độ muối 5‰, giá trị OD 660 đạt 0,666 sau 4 ngày và ở nồng độ muối 20% , giá trị OD660 đạt (Trang 50)
Bảng 3.4. Giá trị OD660nm của các chủng ở độ mặn 20‰ sau 7 ngày. - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Bảng 3.4. Giá trị OD660nm của các chủng ở độ mặn 20‰ sau 7 ngày (Trang 51)
Bảng 3.5. Giá trị OD660 và mật độ tế bào (cfu/ml) của các chủng vi khuẩn sau 48 giờ. STT Ký hiệu chủng Độ hấp thụ (OD 660) - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Bảng 3.5. Giá trị OD660 và mật độ tế bào (cfu/ml) của các chủng vi khuẩn sau 48 giờ. STT Ký hiệu chủng Độ hấp thụ (OD 660) (Trang 52)
Hình 3.9. Nồng độ muối của các chủng vi khuẩn (‰) sau khi kiểm tra. - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.9. Nồng độ muối của các chủng vi khuẩn (‰) sau khi kiểm tra (Trang 53)
Từ hình 3.9, cho thấy kết quả ly trích bộ gen DNA của 3 chủng RL1.2, CM24.1 và CM34.3 đều tốt - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
h ình 3.9, cho thấy kết quả ly trích bộ gen DNA của 3 chủng RL1.2, CM24.1 và CM34.3 đều tốt (Trang 54)
Hình 3.12. Kết quả nhân bộ gene DNA trên gel agarose 1% sau khi tinh sạch. - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.12. Kết quả nhân bộ gene DNA trên gel agarose 1% sau khi tinh sạch (Trang 55)
Hình 3.11. Kết quả nhân bộ gene DNA trên gel agarose 1% - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.11. Kết quả nhân bộ gene DNA trên gel agarose 1% (Trang 55)
Hình 3.13. Cây phát sinh loài dựa trên phân tích trình tự vùng gen 16S rRNA của chủng RL1.2, CM34.3 và CM24.1 với một số chủng khác trên ngân hàng gen NCBI - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
Hình 3.13. Cây phát sinh loài dựa trên phân tích trình tự vùng gen 16S rRNA của chủng RL1.2, CM34.3 và CM24.1 với một số chủng khác trên ngân hàng gen NCBI (Trang 59)
PHỤ LỤC C: Một số hình ảnh thu mẫu thực tế - Sàng lọc và định danh các chủng vi khuẩn quang hợp có khả năng hấp thụ muối và định hướng ứng dụng giảm nhiễm mặn
t số hình ảnh thu mẫu thực tế (Trang 73)

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w