1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana

147 3 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Tiêu đề Nghiên Cứu Vai Trò Của Gen AtXRN4 Và tasiRNA-ARF Trong Điều Kiện Nhiệt Độ Cao Và Hạn Ở Cây Arabidopsis Thaliana
Tác giả Nguyễn Hải Anh
Người hướng dẫn GS. TS. Motoaki Seki, PGS. TS. Nguyễn Văn Đồng
Trường học Viện Khoa Học Nông Nghiệp Việt Nam
Chuyên ngành Công Nghệ Sinh Học
Thể loại luận án
Năm xuất bản 2017
Thành phố Hà Nội
Định dạng
Số trang 147
Dung lượng 17,32 MB

Nội dung

Mục tiêu nghiên cứu của đề tài là xác định vai trò của cơ chế điều hoà sau phiên mã theo chiều 5’-3’ do hoạt động của enzyme AtXRN4 trong việc điều khiển mức độ biểu hiện gen ở điều kiện thường và điều kiện nhiệt độ cao trên đối tượng cây mô hình Arabidopsis. Xác định vai trò của cơ chế điều hoà sau phiên mã do hoạt động của tasiRNA-ARF trong việc hình thành và phát triển cấu trúc hoa Arabidopsis khi bị tác động bởi điều kiện hạn.

Ngày đăng: 11/07/2021, 11:06

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
1. ALLEN, E., XIE, Z., GUSTAFSON, A. M. & CARRINGTON, J. C. 2005. microRNA-directed phasing during trans-acting siRNA biogenesis in plants. Cell, 121, 207-21 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Cell
2. ALLMANG, C., PETFALSKI, E., PODTELEJNIKOV, A., MANN, M., TOLLERVEY, D. & MITCHELL, P. 1999. The yeast exosome and human PM-Scl are related complexes of 3' --> 5' exonucleases. Genes Dev, 13, 2148-58 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Genes Dev
4. ARIF, M. A., FRANK, W. & KHRAIWESH, B. 2013. Role of RNA interference (RNAi) in the Moss Physcomitrella patens. Int J Mol Sci, 14, 1516-40 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Int J Mol Sci
5. BANIWAL, S. K., BHARTI, K., CHAN, K. Y., FAUTH, M., GANGULI, A., KOTAK, S., MISHRA, S. K., NOVER, L., PORT, M., SCHARF, K.- D., TRIPP, J., WEBER, C., ZIELINSKI, D. & KOSKULL-DệRING, P.Heat stress response in plants: a complex game with chaperones and more than twenty heat stress transcription factors. J Biosci, 29, 471-487 Sách, tạp chí
Tiêu đề: J Biosci
6. BANIWAL, S. K., BHARTI, K., CHAN, K. Y., FAUTH, M., GANGULI, A., KOTAK, S., MISHRA, S. K., NOVER, L., PORT, M., SCHARF, K.D., TRIPP, J., WEBER, C., ZIELINSKI, D. & VON KOSKULL- DORING, P. 2004. Heat stress response in plants: a complex game with chaperones and more than twenty heat stress transcription factors. J Biosci, 29, 471-87 Sách, tạp chí
Tiêu đề: J Biosci
7. BORGES, F. & MARTIENSSEN, R. A. 2015. The expanding world of small RNAs in plants. Nat Rev Mol Cell Biol, 16 (12), 727-41 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nat Rev Mol Cell Biol
8. BOYER, J. S. 1982. Plant productivity and environment. Science (New York, N.Y.), 218(4571), 443-48 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Science (New York, N.Y.)
9. BOWMAN, J. L., SMYTH, D. R. & MEYEROWITZ, E. M. 1989. Genes directing flower development in Arabidopsis. Plant Cell, 1, 37-52 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Plant Cell
10. BUHLER, M., STEINER, S., MOHN, F., PAILLUSSON, A. & MUHLEMANN, O. 2006. EJC-independent degradation of nonsense immunoglobulin-mu mRNA depends on 3' UTR length. Nat Struct Mol Biol, 13, 462-64 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nat Struct Mol Biol
11. BROGNA, S. & WEN, J. 2009. Nonsense-mediated mRNA decay (NMD) mechanisms. Nat Struct Mol Biol, 16, 107-113 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nat Struct Mol Biol
12. BROWN, C. E. & SACHS, A. B. 1998. Poly(A) tail length control in Saccharomyces cerevisiae occurs by message-specific deadenylation. Mol Cell Biol, 18, 6548-59 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Mol Cell Biol
13. CAO, D. & PARKER, R. 2003. Computational modeling and experimental analysis of nonsense-mediated decay in yeast. Cell, 113, 533-45 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Cell
14. CHANG, Y. F., IMAM, J. S. & WILKINSON, M. F. 2007. The nonsense- mediated decay RNA surveillance pathway. Annu Rev Biochem, 76, 51-74 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Annu Rev Biochem
15. CHARNG, Y. Y., LIU, H. C., LIU, N. Y., CHI, W. T., WANG, C. N., CHANG, S. H. & WANG, T. T. 2007. A heat-inducible transcription factor, HsfA2, is required for extension of acquired thermotolerance in Arabidopsis. Plant Physiol, 143, 251-62 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Plant Physiol
16. CHEKANOVA, J. A., DUTKO, J. A., MIAN, I. S. & BELOSTOTSKY, D. A. 2002. Arabidopsis thaliana exosome subunit AtRrp4p is a hydrolytic 3'-->5' exonuclease containing S1 and KH RNA-binding domains. Nucleic Acids Res, 30, 695-700 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nucleic Acids Res
18. CHEKANOVA, J. A., SHAW, R. J., WILLS, M. A. & BELOSTOTSKY, D. A. 2000. Poly(A) tail-dependent exonuclease AtRrp41p from Arabidopsis thaliana rescues 5.8 S rRNA processing and mRNA decay defects of the yeast ski6 mutant and is found in an exosome-sized complex in plant and yeast cells. J Biol Chem, 275, 33158-66 Sách, tạp chí
Tiêu đề: J Biol Chem
19. CHEN, C. Y. & SHYU, A. B. 2003. Rapid deadenylation triggered by a nonsense codon precedes decay of the RNA body in a mammalian cytoplasmic nonsense-mediated decay pathway. Mol Cell Biol, 23, 4805- 13 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Mol Cell Biol
20. CHENG, M. C., LIAO, P. M., KUO, W. W. & LIN, T. P. 2013. The Arabidopsis ETHYLENE RESPONSE FACTOR1 regulates abiotic stress- responsive gene expression by binding to different cis-acting elements in response to different stress signals. Plant Physiol, 162, 1566-82 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Plant Physiol
21. CHENG, Y., DAI, X. & ZHAO, Y. 2007. Auxin synthesized by the YUCCA flavin monooxygenases is essential for embryogenesis and leaf formation in Arabidopsis. Plant Cell, 19, 2430-9 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Plant Cell
22. CHIBA, Y. & GREEN, P. J. 2009. mRNA Degradation Machinery in Plants. J Plant Bio, 52, 114-24 Sách, tạp chí
Tiêu đề: J Plant Bio

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Hình 1.1. Mức độ biến đổi của nhiệt độ trung bình bề mặt trái đất. (A) Mức - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.1. Mức độ biến đổi của nhiệt độ trung bình bề mặt trái đất. (A) Mức (Trang 22)
Hình 1.3. Tình hình khan hiếm nước ngọt trên thế giới (FAO, 2007) - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.3. Tình hình khan hiếm nước ngọt trên thế giới (FAO, 2007) (Trang 24)
Hình 1.4. Tác động của hạn hán đến (A) quá trình sinh trưởng của thực vật (B) quá trình quang hợp của thực vật - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.4. Tác động của hạn hán đến (A) quá trình sinh trưởng của thực vật (B) quá trình quang hợp của thực vật (Trang 27)
Hình 1.5. Cơ chế đáp ứng các yếu tố bất thuận phi sinh học thông qua các HSF và HSP.  - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.5. Cơ chế đáp ứng các yếu tố bất thuận phi sinh học thông qua các HSF và HSP. (Trang 29)
Hình 1.6. Cơ chế đáp ứng điều kiện hạn ở thực vật - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.6. Cơ chế đáp ứng điều kiện hạn ở thực vật (Trang 31)
Hình 1.7. Các chu trình phân rã mRNA cơ bản ở sinh vật đa bào. - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.7. Các chu trình phân rã mRNA cơ bản ở sinh vật đa bào (Trang 32)
Hình 1.8. Chu trình phân rã mRNA theo cơ chế kiểm soát NMD - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.8. Chu trình phân rã mRNA theo cơ chế kiểm soát NMD (Trang 41)
Hình 1.9. Chu trình phân rã RNA theo các cơ chế NGD (A) và NSD (B) - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.9. Chu trình phân rã RNA theo các cơ chế NGD (A) và NSD (B) (Trang 42)
Hình 1.10. Phân loại RNA. RNA được phân thành hai nhóm chính: nhóm mã hoá và nhóm không mã hoá  - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.10. Phân loại RNA. RNA được phân thành hai nhóm chính: nhóm mã hoá và nhóm không mã hoá (Trang 43)
Hình 1.11. Quá trình sinh tổng hợp và hoạt động của miRNA - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.11. Quá trình sinh tổng hợp và hoạt động của miRNA (Trang 46)
Hình 1.12. Cơ chế sinh tổng hợp và vai trò của các siRNA. Enzyme Pol II - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.12. Cơ chế sinh tổng hợp và vai trò của các siRNA. Enzyme Pol II (Trang 49)
Hình 1.13. Quá trình sinh tổng hợp và hoạt động của tasiRNA - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.13. Quá trình sinh tổng hợp và hoạt động của tasiRNA (Trang 51)
Hình 1.14. Mô hình thể hiện cơ chế phân rã các trình tự mRNA đầu 3’ là - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.14. Mô hình thể hiện cơ chế phân rã các trình tự mRNA đầu 3’ là (Trang 53)
Hình 1.16. Vai trò của enzyme AtXRN4 trong điều hoà đáp ứng Ethylene. - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.16. Vai trò của enzyme AtXRN4 trong điều hoà đáp ứng Ethylene (Trang 57)
Hình 1.17. Sơ đồ miêu tả vai trò của tasiRNA-ARF trong việc điều hoà số - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 1.17. Sơ đồ miêu tả vai trò của tasiRNA-ARF trong việc điều hoà số (Trang 61)
Bảng 2.1. Các cặp mồi RT-qPCR sử dụng trong nghiên cứu vai trò của gen - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Bảng 2.1. Các cặp mồi RT-qPCR sử dụng trong nghiên cứu vai trò của gen (Trang 72)
đến hình thành cấu trúc hoa Arabidopsis trong điều kiện chịu hạn - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
n hình thành cấu trúc hoa Arabidopsis trong điều kiện chịu hạn (Trang 73)
Hình 3.2. Đột biến ở gen AtXRN4 làm giảm tỷ lệ sống sót của cây - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.2. Đột biến ở gen AtXRN4 làm giảm tỷ lệ sống sót của cây (Trang 81)
Hình 3.3. Đột biến ở gen AtXRN4 làm tăng khả năng làm mát ở - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.3. Đột biến ở gen AtXRN4 làm tăng khả năng làm mát ở (Trang 83)
Hình 3.4. Đột biến ở gen AtXRN4 làm tăng khả năng thoát hơi nước ở - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.4. Đột biến ở gen AtXRN4 làm tăng khả năng thoát hơi nước ở (Trang 85)
Hình 3.5. Đột biến gen AtXRN4 làm thay đổi kích thước khí khổng ở - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.5. Đột biến gen AtXRN4 làm thay đổi kích thước khí khổng ở (Trang 87)
Bảng 3.2. Danh sách các gen thuộc nhóm “đáp ứng với nhiệt dộ” (GO:0009408) tăng mức độ biểu hiện trên dòng đột biến - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Bảng 3.2. Danh sách các gen thuộc nhóm “đáp ứng với nhiệt dộ” (GO:0009408) tăng mức độ biểu hiện trên dòng đột biến (Trang 100)
Hình 3.7. So sánh mức độ biểu hiện của một số gen liên quan đến khả năng chịu nhiệt độ  cao  giữa  (A)  cây đột  biến atxrn4-3  và  cây  WT  và  (B)  cây đột  biến  - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.7. So sánh mức độ biểu hiện của một số gen liên quan đến khả năng chịu nhiệt độ cao giữa (A) cây đột biến atxrn4-3 và cây WT và (B) cây đột biến (Trang 103)
Hình 3.8. mRNA của hai gen HSFA2 và ERF1 làm ục tiêu trực tiếp để phân rã - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.8. mRNA của hai gen HSFA2 và ERF1 làm ục tiêu trực tiếp để phân rã (Trang 107)
Hình 3.9. Enzyme AtXRN4 đóng vai trò phân rã mRNA của HSFA2 khi cây - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.9. Enzyme AtXRN4 đóng vai trò phân rã mRNA của HSFA2 khi cây (Trang 110)
Hình 3.10. Đột biến ở gen HSFA2 làm mất đi khả năng chịu nhiệt độ cao và khả - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.10. Đột biến ở gen HSFA2 làm mất đi khả năng chịu nhiệt độ cao và khả (Trang 112)
Hình 3.12. Đột biến gen RDR6 làm thay đổi tương quan chiều dài giữa nhị và - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.12. Đột biến gen RDR6 làm thay đổi tương quan chiều dài giữa nhị và (Trang 119)
Hình 3.13. Quá trình làm câm gen bằng tasiRNA-ARF đóng vai trò quan trọng - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.13. Quá trình làm câm gen bằng tasiRNA-ARF đóng vai trò quan trọng (Trang 122)
Hình 3.14. Kết quả phân tích hệ gen ở nụ hoa của cây WT và cây đột biến rdr6 - Luận án Tiến sĩ Nông nghiệp: Nghiên cứu vai trò của gen AtXRN4 và tasiRNA-ARF trong điều kiện nhiệt độ cao và hạn ở cây Arabidopsis Thaliana
Hình 3.14. Kết quả phân tích hệ gen ở nụ hoa của cây WT và cây đột biến rdr6 (Trang 125)

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w