luận án tiến sĩ phân lập vi khuẩn phân giải silic trong đất và ứng dụng trong canh tác lúa ở đồng bằng sông cửu long

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ TRẦN VÕ HẢI ĐƯỜNG PHÂN LẬP VI KHUẨN PHÂN GIẢI SILIC TRONG ĐẤT VÀ ỨNG DỤNG TRONG CANH TÁC LÚA Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG LUẬN ÁN TIẾN SĨ NGÀNH CÔNG NGHỆ SINH HỌC 2021 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ TRẦN VÕ HẢI ĐƯỜNG PHÂN LẬP VI KHUẨN PHÂN GIẢI SILIC TRONG ĐẤT VÀ ỨNG DỤNG TRONG CANH TÁC LÚA Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG LUẬN ÁN TIẾN SĨ NGÀNH CÔNG NGHỆ SINH HỌC CÁN BỘ HƯỚNG DẪN Pgs Ts NGUYỄN KHỞI NGHĨA Ts NGUYỄN THỊ NGỌC TRÚC 2021 LỜI CẢM TẠ Tôi xin chân thành cảm ơn đến: Pgs Ts Nguyễn Khởi Nghĩa – người Thầy tận tâm dạy, hướng dẫn, truyền đạt kiến thức, kinh nghiệm quý báu hỗ trợ tất điều kiện cần thiết giúp tơi hồn thành luận án Ts Nguyễn Thị Ngọc Trúc giúp đỡ, hỗ trợ cho tơi có đủ điều kiện cần thiết cho việc học tập nghiên cứu sinh Ban Giám hiệu Trường Đại học Cần Thơ, Ban lãnh đạo Viện Nghiên cứu Phát triển Công nghệ Sinh học, Bộ môn Khoa học đất, Khoa Nông nghiệp, Khoa Sau Đại học Phòng Ban khác Trường Đại học Cần Thơ hỗ trợ, tạo điều kiện thuận lợi giúp tơi hồn thành luận án Ban Giám hiệu Trường Cao đẳng Kinh tế – Kỹ thuật Bạc Liêu, Ban lãnh đạo Khoa Nông nghiệp – Thủy sản, Phịng Tổ chức – Hành chính, Phịng Đào tạo, Phịng, Ban, Trung tâm khác, Q Thầy Cơ, Anh, Chị, Em đồng nghiệp Trường Cao đẳng Kinh tế – Kỹ thuật Bạc Liêu hỗ trợ, tạo điều kiện thuận lợi giúp tơi hồn thành luận án Pgs Ts Nguyễn Minh Chơn Ts Trương Thị Bích Vân kiểm tra, đôn đốc thủ tục, hồ sơ nghiên cứu sinh, giúp cho tơi có điều kiện cần thiết cho báo cáo luận án Pgs Ts Trần Nhân Dũng, Pgs Ts Nguyễn Minh Chơn Pgs Ts Trương Trọng Ngơn tận tình hướng dẫn giúp đỡ cho tơi có đủ điều kiện cần thiết cho việc tham gia học tập làm nghiên cứu sinh Viện Nghiên cứu Phát triển Công nghệ sinh học Ts Trần Thị Ngọc Sơn – người Cô tận tâm chu đáo dạy, giúp đỡ cho kiến thức nghiên cứu, làm việc điều kiện cần thiết giúp tơi hồn thành luận án Tất Q Thầy Cơ Anh Chị Em công tác Viện Nghiên cứu Phát triển Công nghệ Sinh học, Trường Đại học Cần Thơ tận tình dạy kiến thức, cách thực nghiên cứu khoa học cách làm việc giúp cho tơi có tảng cho việc thực đề tài nghiên cứu Gửi lời cảm ơn chân thành đến anh chị em nghiên cứu sinh Viện NC & PT Công nghệ Sinh học, Trường Đại học Cần Thơ (đặc biệt chị Lê Thị Xã) động viên, chia sẻ, hướng dẫn giúp đỡ thời gian thực luận án i Chân thành cảm ơn sâu sắc đến Thầy Pgs Ts Trần Văn Dũng, Thầy Ts Dương Minh Viễn, Cô Ts Đỗ Thị Xuân Cô Ts Châu Thị Anh Thy đưa ý kiến góp ý quý báu phương pháp nội dung nghiên cứu động viên nhiệt tình để tơi thực tốt luận án tiến sĩ Chị Nguyễn Thị Thu Hà, em Nguyễn Thị Kiều Oanh, em Võ Thị Ngọc Cẩm, anh Nguyễn Vũ Bằng, chị Đặng Thị Yến Nhung, Nguyễn Hoàng Kim Nương, Lâm Tử Lăng, em Nguyễn Hữu Thiện, Nguyễn Thị Kiều Anh, Đỗ Thành Luân, Lâm Tuấn Kiệt, Cao Thị Mỹ Tiên, Nguyễn Phúc Tun cán Phịng thí nghiệm sinh học đất, Bộ môn Khoa học đất, Khoa nơng nghiệp, Trường đại học Cần Thơ tận tình giúp đỡ, hướng dẫn thực thao tác kỹ thuật phịng thí nghiệm cách trình bày báo cáo nghiên cứu khoa học Gửi lời cảm ơn chân thành đến anh Nguyễn Hồng Giang, em Trần Anh Đức, anh Trần Huỳnh Khanh, chị Võ Thị Thu Trân, chị Đoàn Thị Trúc Linh, chị Lê Thị Thanh Chi, em Huỳnh Mạch Trà My cán nghiên cứu thuộc Bộ môn Khoa học đất, Khoa nông nghiệp, Trường đại học Cần Thơ tận tình giúp đỡ cơng việc liên quan đến phân tích mẫu phịng thí nghiệm thủ tục giấy tờ toán Em Đào Thị The (Học viên cao học lớp Công nghệ Sinh học K24, Trường Đại học Cần Thơ), em Võ Việt Hải Lâm Thanh Tâm (Sinh viên lớp Khoa học đất K41 A2) tận tình, chung tay, chia sẻ giúp đỡ tơi hồn thành luận án tốt nghiệp Bạn Ngô Thị Phương Thảo (Học viên cao học lớp Công nghệ Sinh học K20, Trường Đại học Cần Thơ) em học viên sinh viên thuộc lớp Nông nghiệp Sạch K39, Khoa học đất K40, K41 A1, K41 A2, Bảo vệ thực vật K41 gồm: Khúc Thành Lộc, Phan Hoàng Phúc, Nguyễn Phước Duy, Nguyễn Quốc Tịnh, Nguyễn Bá Điền, Thạch Hoài Hận, Hồ Minh Thuấn, Nguyễn Ngọc Hải, Nguyễn Hữu Thiện, Nguyễn Thị Như Ngọc, Huỳnh Như, Bạch Thị Ngọc Tuyền, Lâm Quang Phương Mai, Sơn Thị Búp Pha, Đỗ Thành Luân, Dương Trúc Mai, Trần Thị Thúy Cầm, Thị Hạnh Nguyên, Giang Yến Anh, Đoàn Vũ Luận, Nguyễn Thị Thúy Kiều, Huỳnh Hiếu Hạnh, Nguyễn Hoàng Nhi Trần Thiện Chiến tận tình giúp đỡ trình thu mẫu, xử lý mẫu, phân tích thu tiêu phịng thí nghiệm thí nghiệm nhà lưới đồng cho luận án tiến sĩ Xin chân thành cảm ơn quý Thầy Cô, anh chị em công tác Bộ môn Khoa học đất, Khoa Nông nghiệp, Trường Đại học Cần Thơ động viên, giúp đỡ trực tiếp gián tiếp để tơi hồn thành luận án tiến sĩ ii Gia đình Trương Văn Tự nơng dân ấp Long Hải, thị trấn Phước Long, huyện Phước Long, tỉnh Bạc Liêu chị Thái Thị Loan, Trưởng phịng nơng nghiệp huyện Phước Long, tỉnh Bạc Liêu tận tình giúp đỡ q trình thực nội dung thí nghiệm ngồi đồng Cuối khơng phần quan trọng, tơi xin chân thành bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến thành viên người thân gia đình gồm Ơng Bà, Cha Mẹ ruột, Cha Mẹ Vợ, Cậu Dì, Cơ Chú Bác, Các Em Anh Chị đặc biệt Vợ (Hồ Tú Quyên) Con (Trần Đường Minh) người đồng hành, sát cánh hỗ trợ tinh thần tài lúc khó khăn thời gian thực luận án để giúp vững tin thực thành công luận án tiến sĩ Xin thành thật cảm ơn! Trần Võ Hải Đường iii TÓM TẮT Silic nguyên tố dinh dưỡng mang nhiều lợi ích cho trồng giúp cứng chắc, chống đổ ngã, tăng cường tiếp nhận ánh sáng lá, kháng lại số bệnh nấm vi khuẩn, chống lại công côn trùng, giúp trồng chịu mặn, chống lại ngộ độc kim loại nặng dư thừa N, P mô thực vật Nghiên cứu thực nhằm mục tiêu phân lập số dòng vi khuẩn phân giải khoáng Si từ nhiều hệ sinh thái khác hệ vi khuẩn đường ruột trùn đất, hệ vi khuẩn phân trùn đất hệ vi khuẩn đất canh tác chuyên canh lúa, mía tre số tỉnh Đồng sông Cửu Long (ĐBSCL) để tăng cường khả chống chịu mặn lúa đất nhiễm mặn Kết cho thấy tổng cộng 387 dịng vi khuẩn có khả phân giải khống Si phân lập Trong đó, 10 dịng vi khuẩn định danh lồi Microbacterium neimengense MCM_15, Klebsiella aerogenes LCT_01, Bacillus megaterium LCT_03, Ochrobactrum ciceri TCM_39, Staphylococcus arlettae TCM_40, Citrobacter freundii RTTV_12, Micrococcus luteus RTTV_13, Agromyces ulmi PTTV_16, Rhodococcus equi PTTV_27 Olivibacter jilunii PTST_30 với độ tương đồng từ 99-100% thể khả phân giải khống Si cao Mặt khác, dịng vi khuẩn tuyển chọn gồm MCM_15, LCT_01, TCM_39, RTTV_12 PTST_30 phát triển mật số phân giải Si tốt mơi trường có pH từ 5-7, o nhiệt độ 35 C chịu độ mặn lên đến 0,5% NaCl Bên cạnh khả phân giải Si, năm dòng vi khuẩn cịn có khả cố định đạm, hòa tan lân tổng hợp IAA Mặt khác, chúng cịn có khả giúp lúa gia tăng khả chống chịu mặn, sinh trưởng sinh khối lúa trồng điều kiện mặn phịng thí nghiệm Bên cạnh đó, thí nghiệm điều kiện nhà lưới ngồi đồng cho thấy dịng vi khuẩn giúp lúa gia tăng khả chống chịu mặn, kích thích sinh trưởng suất lúa Đặc biệt, nghiệm thức bón hỗn hợp dịng vi khuẩn phân giải Si cho hiệu cao việc kích thích sinh trưởng suất lúa giúp tiết kiệm 25% lượng phân bón NPK khuyến cáo cho suất cao so với nghiệm thức đối chứng dương Từ khóa: canh tác lúa, đất nhiễm mặn, Silic, vi khuẩn đất, vi khuẩn phân giải Silic iv ABSTRACT Silicon is one of the most beneficial nutrient elements, bringing many benefits for plants in enhancement of the strength of plants to resist to the falling, light reception of leaf, bacterial and fungal caused pathogen resistance, insect attack resistance, salinity resistance, heavy metal toxicity resistance and avoiding the over uptake of N and P in plant tissue The objective of this study aimed at isolating silicate solubizing bacteria from different habitats including earthworm’s intestine, earthworm’s feces, rice soil, sugarcane soil, and bamboo soil from some selected provinces in the Mekong Delta to enhance the salinity resistance of rice and stimulate the growth and yield of rice under the salinity impact The results showed that 387 bacterial strains in total were obtained with a function in silicate mineral solubilization Among them, 10 strains identified as Microbacterium neimengense MCM_15, Klebsiella aerogenes LCT_01, Bacillus megaterium LCT_03, Ochrobactrum ciceri TCM_39, Staphylococcus arlettae TCM_40, Citrobacter freundii RTTV_12, Micrococcus luteus RTTV_13, Agromyces ulmi PTTV_16, Rhodococcus equi PTTV_27, and Olivibacter jilunii PTST_30 with a variation in similarity between 99-100% had the highest capability in silicate mineral solubilization In addition, these five selective bacteria including MCM_15, LCT_01, TCM_39, RTTV_12, and PTST_30 showed their best growth and silicate mineral solubilizing capacity under the following inoculation o conditions pH 5-7, temperature 35 C, and salinity up to 0.5% NaCl Beside that, these five bacteria also had good capacity in nitrogen fixation, phosphorus solubilization, and IAA synthesis Moreover, they were also able to enhance the salinity resistance capacity, growth, and biomass of rice when cultivated under the laboratory salinity conditions The greenhouse and field experiment indicated that these five isolates helped to enhance the resistance capacity of rice toward salinity, growth and yield promotion of rice Especially, the treatment inoculated with a mixture of these five bacterial isolates obtained the highest efficacy on rice growth and yield stimulation, and saved 25% of recommended NPK dose, but remained rice yield higher than as compared with the positive control treatment Keywords: rice cultivation, salt-affected soil, silicon, silicate solubilizing bacteria, soil bacteria v vi MỤC LỤC Trang LỜI CẢM TẠ i TÓM TẮT iv ABSTRACT v LỜI CAM ĐOAN Error! Bookmark not defined MỤC LỤC vi DANH SÁCH BẢNG x DANH SÁCH HÌNH xii DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT .xv CHƯƠNG I GIỚI THIỆU 1.1 Đặt vấn đề 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Đối tượng phạm vi nghiên cứu 1.4 Thời gian địa điểm nghiên cứu 1.5 Nội dung nghiên cứu 1.6 Đóng góp mới, ý nghĩa khoa học thực tiễn luận án CHƯƠNG II LƯỢC KHẢO TÀI LIỆU 2.1 Si đất 2.2 Vai trò Si lúa 2.3 Vai trò Si việc bảo vệ trồng điều kiện đất nhiễm mặn 2.4 Một số phương pháp đo Si hòa tan đất 2.5 Vi khuẩn phân giải Si 12 2.5.1 Nhóm vi khuẩn phân giải Si 12 2.5.2 Đặc điểm phân giải Si vi khuẩn 13 2.5.3 Các yếu tố mơi trường ảnh hưởng đến q trình phân giải Si vi khuẩn 13 2.6 Sự hấp thu, vận chuyển tích lũy Si thực vật 14 2.7 Một số đặc tính nơng học nhu cầu dinh dưỡng lúa 16 2.7.1 Một số đặc tính nơng học lúa 16 2.7.2 Nhu cầu dinh dưỡng lúa 17 2.8 Canh tác lúa Đồng sông Cửu Long điều kiện xâm nhập mặn 20 2.9 Tình hình nghiên cứu ứng dụng vi khuẩn phân giải Si trồng nước 22 2.9.1 Ngoài nước 22 2.9.2 Trong nước 24 CHƯƠNG III 27 PHƯƠNG TIỆN VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 27 vii 3.1 Thời gian địa điểm 27 3.1.1 Thời gian nghiên cứu 27 3.1.2 Địa điểm nghiên cứu 27 3.2 Phương tiện nghiên cứu 27 3.2.1 Vật liệu thí nghiệm 27 3.2.2 Các trang thiết bị hóa chất 28 3.2.3 Các môi trường sử dụng đề tài .29 3.3 Nội dung phương pháp nghiên cứu 31 3.3.1 Nội dung nghiên cứu 1: Phân lập tuyển chọn số dịng vi khuẩn có khả phân giải Si từ mẫu đất, ruột phân trùn đất số tỉnh Đồng sông Cửu Long 31 3.3.2 Nội dung nghiên cứu 2: Khảo sát mối quan hệ di truyền 10 dòng vi khuẩn phân giải Si cao 34 3.3.3 Nội dung nghiên cứu 3: Khảo sát khả cố định đạm, hòa tan lân, tổng hợp IAA số acid hữu dòng vi khuẩn tuyển chọn 35 3.3.4 Nội dung nghiên cứu 4: Đánh giá ảnh hưởng số yếu tố môi trường lên mật số khả phân giải Si dòng vi khuẩn tuyển chọn 39 3.3.5 Nội dung nghiên cứu 5: Đánh giá hiệu dòng vi khuẩn phân giải Si tuyển chọn lên khả chịu mặn lúa điều kiện phịng thí nghiệm 41 3.3.6 Nội dung nghiên cứu 6: Đánh giá hiệu năm dòng vi khuẩn phân giải Si tuyển chọn lên khả chống chịu mặn, sinh trưởng suất lúa trồng đất nhiễm mặn điều kiện nhà lưới đồng 44 3.3.7 Phân tích số liệu 52 CHƯƠNG IV 53 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 53 4.1 Nội dung nghiên cứu 1: Phân lập tuyển chọn số dịng vi khuẩn có khả phân giải Si từ mẫu đất chuyên canh lúa, mía, tre, ruột phân trùn đất số tỉnh Đồng sông Cửu Long 53 4.1.1 Kết phân lập 53 4.1.2 Đặc điểm hình thái khuẩn lạc, hình thái tế bào sinh hóa 54 dịng vi khuẩn tuyển chọn cho khả phân giải Si cao 54 4.1.3 Khả phân giải khống Si mơi trường lỏng dòng vi khuẩn phân giải Si phân lập 58 4.2 Nội dung nghiên cứu 2: Đánh giá mối quan hệ di truyền 10 dòng vi khuẩn phân giải Si cao 60 4.2.1 Định danh 10 dịng vi khuẩn có tiềm ứng dụng cao 60 viii N 60 60 200 60 60 60 60 CC CC CC CC CC C30 C45 C60 C90 C12 N N N N 0N 530 666 646 625 621 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 526 653 641 608 603 658 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 568 711 727 673 674 653 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 578 804 823 793 844 722 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 651 871 891 891 907 703 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 642 807 830 824 837 709 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 SC3 0N Pear DC Sig L1 (2- N Pear DC son Sig L2 (2- N Pear son DC Sig L3 (2- N Pear son NS 641 Sig (2- N Pear son SiT Sig T (2N Pear TL son K_ Sig Na (260 60 60 60 60 60 549 775 739 765 744 634 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 476 588 582 593 608 549 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 530 695 641 628 630 663 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 512 794 743 856 865 692 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 Pear 566 790 755 809 798 752 son ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 Pear 568 735 716 741 771 650 son ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 N Pear son Si30 Sig N (2N Pear son Si45 Sig N (2N Pear son Si60 Sig N (2N Pear son Si90 Sig N (2- N Si12 Sig 0N (2- N SSB Sig 30N (2- N Pear SSB son Sig 45N 503 544 618 649 640 605 ** ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 000 60 60 60 60 60 60 (2- N 201 CC CC CC CC CC C30 C45 C60 C90 C12 N N N N 0N 58 670 688 774 771 660 ** ** ** ** ** ** Sig .00 000 000 000 000 000 N 60 60 60 60 60 60 Pear 58 691 710 738 776 657 son 5** ** ** ** ** ** 00 000 000 000 000 000 SC3 0N Pear SSB 60N SSB Sig 90N (2- N 60 60 60 60 60 60 624 Pear 47 653 632 765 748 SSB son 5** ** ** ** ** ** 120 Sig .00 000 000 000 000 000 N (2- N 60 60 60 60 60 60 Pear 70 916 891 950 973 670 CC son Sig C SC ** ** ** ** ** 000 000 000 000 000 (2- N 60 60 60 60 60 60 Pear 57 782 789 823 834 749 son 2** ** ** ** ** ** 00 000 000 000 000 000 Sig (2- Chl 4** 00 N 60 60 60 60 60 60 Pear 66 833 835 846 857 760 son 8** ** ** ** ** ** 00 000 000 000 000 000 Sig (2- N 60 60 60 60 60 60 Pear 54 680 670 638 635 657 son 4** ** ** ** ** ** 00 000 000 000 000 000 DC Sig L (2- N 60 60 60 60 60 60 Pear 58 808 763 804 803 736 son 1** ** ** ** ** ** 00 000 000 000 000 000 SiT Sig D (2- N 60 60 60 60 60 60 Pear 57 700 715 777 786 678 8** ** ** ** ** ** Sig .00 000 000 000 000 000 N 60 60 60 60 60 60 son SSB Ghi chú: ** tương quan có ý nghĩa thống kê mức 1% (kiểm định đuôi); CCC30N, CCC45N, CCC60N, CCC90N, CCC120N_Chiều cao lúa giai đoạn 30, 45, 60, 90 120 ngày; SC30N, SC45N, SC60N SC90N_Số chồi 0,25m giai đoạn 30, 45, 60 90 ngày; Chl30N, Chl45N, Chl60N, Chl90N_Hàm lượng chlorophyll lúa giai đoạn 30, 45, + + 60 90 ngày; DCL1, DCL2, DCL3_Độ cứng lóng thân lúa 1, 3; NS_Năng suất thực tế; SiTT_Hàm lượng Si sinh khối khô; TLK_Na_Tỉ lệ K /Na sinh khối khô; SSB30N, SSB45N, SSB60N, SSB90N SSB120N_Mật số vi khuẩn phân giải Si đất giai đoạn 30, 45, 60, 90 120 ngày; Si30N, Si45N, Si60N, Si90N Si120N_Hàm lượng Si đất giai đoạn 30, 45, 60, 90 120 ngày; CCC_Chiều cao lúa trung bình giai đoạn 30, 45, 60, 90 120 ngày; SC_Số chồi 0,25m trung bình giai đoạn 30, 45, 60 90 ngày; DCL_Độ cứng lóng thân trung bình lóng 1, 2, 3; Chl_ Hàm lượng chlorophyll lúa trung bình giai đoạn 30, 45, 60 90 ngày; SSB_ Mật số vi khuẩn phân giải Si đất trung bình giai đoạn 30, 45, 60, 90 120 ngày; SiTD_ Hàm lượng Si đất trung bình giai đoạn 30, 45, 60, 90 120 ngày 202 PHỤ LỤC TRÌNH TỰ ĐOẠN GEN VÙNG 16S rRNA CỦA 10 DÒNG VI KHUẨN Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn PTST_30 có độ dài 799 bp >TCCTTGCGGTTACATGCTTTAGGTACCCCCGGCTTTCATGGCTTGA CGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCGTCATTGC TGATACGCGATTACTAGCGAATCCAACTTCACGGGGTCGAGTTGCA GACCCCGATCCGAACTGTGAGGGGCTTTCTGAGATTGGCTTCACCT CGCGGTGTCGCTGCCCTCTGTACCCCCCATTGTAGCACGTGTGTAG CCCCGGACGTAAGGGCCATGATGACTTGACGTCGTCCCCGCCTTCC TCTCTGTTTGCACAGGCAGTCTGTTTAGAGTCCCCACCTTGACGTGC TGGCAACTAAACATAGGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAA CACCTCACGGCACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTAGTTTCC TGTCCCGAAGGACCTGTCCATCTCTGGACAATTCAGTAACTTTCAA GCCCGGGTAAGGTTCCTCGCGTATCATCGAATTAAACCACATGCTC CTCCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCACCCTTGC GGGCGTACTCCCCAGGTGGAACACTTAACGCTTTCGCTTGGACGCC GACAGTCTATCGCCGACATCGAGTGTTCATCGTTTAGGGCGTGGAC TACCAGGGTATCTAATCCTGTTCGATCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG CGTCAATCGTACTTTGGTAAGCTGCCTTCGCAATCGGTGTTCTGTGG CATATCTATGCATTTCACCGCTACTTGCCACATTCCGCCTACCTCAC GTACATTCAAGC> Hình 1: Kết định danh dịng PTST_30 dựa đoạn gen 16S rRNA Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn LCT_01 có độ dài 782 bp >AAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGCTGTG ACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGTAGCATTC TGATCTACGATTACTAGCGATTCCGACTTCATGGAGTCGAGTTGCA GACTCCAATCCGGACTACGACATACTTTATGAGGTCCGCTTGCTCT CGCGAGGTCGCTTCTCTTTGTATATGCCATTGTAGCACGTGTGTAGC CCTACTCGTAAGGGCCATGATGACTTGACGTCATCCCCACCTTCCTC CAGTTTATCACTGGCAGTCTCCTTTGAGTTCCCGGCCGGACCGCTG GCAACAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAAC 203 ATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCAGA GTTCCCGAAGGCACCAAAGCATCTCTGCTAAGTTCTCTGGATGTCA AGAGTAGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAAACCACATGCT CCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCATTTGAGTTTTAACCTTG CGGCCGTACTCCCCAGGCGGTCGACTTAACGCGTTAGCTCCGGAAG CCACGCCTCAAGGGCACAACCTCCAAGTCGACATCGTTTACGGCGT GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACC TGAGCGTCAGTCTTTGTCCAGGGGGCCGCCTTCGCCACCGGTATTC CTCCAGATCTCTACGCATTTCACCGCTACACCTGGAATTCTAC> Hình 2: Kết định danh dịng LCT_01 dựa đoạn gen 16S rRNA Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn RTTV_12 có độ dài 829 bp >TGCAGTCGAACGGTAGCACAGAGCGAGCTTGCTCCTTGGGTGACG AGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGCCCGATGGAGG GGGATAACTACTGGAAACGGTAGCTAATACCGCATAACGTCGCAA GACCAAAGAGGGGGACCTTCGGGCCTCTTGCCATCGGATGTGCCCA GATGGGATTAGCTAGTAGGTGGGGTAACGGCTCACCTAGGCGACG ATCCCTAGCTGGTCTGAGAGGATGACCAGCCACACTGGAACTGAG ACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCA CAATGGGCGCAAGCCTGATGCAGCCATGCCGCGTGTATGAAGAAG GCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTCAGCGAGGAGGAAGGTGTTGTGG TTAATAACCGCAGCAATTGACGTTACTCGCAGAAGAAGCACCGGCT AACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTA ATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGCAGGCGGTCTGTCAAGTC GGATGTGAAATCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATCCGAAACTG GCAGGCTAGAGTCTTGTAGAGGGGGGTAGAATTCCAGGTGTAGCG GTGAAATGCGTAGAGATCTGGAGGAATACCGGTGGCGAAGGCGGC CCCCTGGACAAAGACTGACGCTCAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCA AACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGTCGAC 204 TTGGAGGTTGTGCCCTTGAGGCGTGGCTTCCGGAGCTAACGCGTTA AGTCGACCGCCT> Hình 3: Kết định danh dòng RTTV_12 dựa đoạn gen 16S rRNA Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn TCM_39 có độ dài 819 bp >CACATGCAAGTCGAGCGCGTAGCAATACGAGCGGCAGACGGGTG AGTAACGCGTGGGAATCTACCCATCACTAGGGAATAACTCAGGGA AACTTGTGCTAATACCCTATACGACCGAGAGGTGAAAGATTTATCG GTGATGGATGAGCCCGCGTTGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGG CCTACCAAGGCGACGATCCATAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCC ACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAG TGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCG CGTGAGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCTCTTTCACCGGTGA AGATAATGACGGTAACCGGAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGC CAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGGCTAGCGTTGTTCGGATTTAC TGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGGCTAATAAGTCAGGGGTGAAA TCCCGGGGCTCAACCCCGGAACTGCCTTTGATACTGTTAGTCTTGA GTATGGAAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCG TAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGTCC ATTACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTA GATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGTTAGCCGTTGG GGAGTTTACTCTTCGGTGGCGCAGCTAACGCATTAAACATTCCGCC TGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAGGATCGGAGACAGGTGCTGCAT GG> Hình 4: Kết định danh dòng TCM_39 dựa đoạn gen 16S rRNA Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn MCM_15 có độ dài 800 bp 205 >CATGCAAGTCGAACGGTGAAGCAGAGCTTGCTCTGTGGATCAGTG GCGAACGGGTGCGTAACACGTGAGCAACCTGCCCTGGACTCTGGG ATAAGCGCTGGAAACGGCGTCTAATACTGGATACGAGACGTGGCC GCATGGTCAACGTTTGGAAAGATTTTTTGGTTCAGGATGGGCTCGC GGCCTATCAGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGTCGAC GGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGACCGGCCACACTGGGACTGAGAC ACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACA ATGGGCGAAAGCCTGATGCAGCAACGCCGCGTGAGGGATGACGGC CTTCGGGTTGTAAACCTCTTTTAGCAAGGAAGAAGCGAAAGTGACG GTACTTGCAGAAAAAGCGCCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCG GTAATACGTAGGGCGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAG AGCTCGTAGGCGGTTTGTCGCGTCTGCTGTGAAAACTGGAGGCTCA ACCTCCAGCCTGCAGTGGGTACGGGCAGACTAGAGTGCGGTAGGG GAGATTGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGGAATGCGCAGATATCAGG AGGAACACCGATGGCGAAGGCAGATCTCTGGGCCGTAACTGACGC TGAGGAGCGAAAGGGTGGGGAGCAAACAGGCTTAGATACCCTGGT AGTCCACCCCGTAAACGTTGGGAACTAGTTGTGGGGACCATTCCAC GGTTTCCGTGACGCAGCTAACGCATTAAG> Hình 5: Kết định danh dòng MCM_15 dựa đoạn gen 16S rRNA Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn PTTV_16 có độ dài 770 bp >GACCCCGGCAGTCTCACATGAGTCCCCACCATAACGTGCTGGCAACATGCGAC GAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACG ACAACCATGCACCACCTGTAACCGAGTGTCCAAAGAGTTCCACATTTCTGCGGC GTTCTCGGTCATGTCAAGCCTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAATCC GCATGCTCCGCCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTTAGCCTTGC GGCCGTACTCCCCAGGCGGGGCGCTTAATGCGTTAGCTACGACACGGAAACCGT GGAAAGGTCCCCACATCTAGCGCCCAACGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTAT CTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAGCGTCAGTAAGTGCCCAGAG ACCTGCCTTCGCCATCGGTGTTCCTCCTGATATCTGCGCATTCCACCGCTACACC AGGAATTCCAGTCTCCCCTACACCACTCAAGTCTGCCCGTACCCACTGCAGGCTA GAGGTTGAGCCTCTAGATTTCACAGCAGACGCGACAAACCGCCTACGAGCTCTT TACGCCCAATAATTCCGGACAACGCTCGGACCCTACGTATTACCGCGGCTGCTG 206 GCACGTAGTTAGCCGGTCCTTTTTCTGCAAGTACCGTCAAGACCCCGAAGAGCC CCTTCTTCCTTACTAAAAGCGGTTTACAACCCGAAGGCCGTCATCCCGCACGCGG CGTTGCTGC> Hình 6: Kết định danh dịng PTTV_16 dựa đoạn gen 16S rRNA Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn PTTV_27 có độ dài 1174 bp >CCTCTGTACCGGCCATTGTAGCATGTGTGAAGCCCTGGACATAAGGGGCATGA TGACTTGACGTCGTCCCCACCTTCCTCCGAGTTGACCCCGGCAGTCTCCTGCGAG TCCCCGCCATTACGCGCTGGCAACACAGGACAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGAC TTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAGCCATGCACCACCTGTATAC CGACCACAAGGGGGGCCGTATCTCTACGGCTTTCCGGTATATGTCAAACCCAGG TAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAATTAATCCACATGCTCCGCCGCTTGTGCGGGC CCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTTAGCCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGGGCGC TTAATGCGTTAGCTACGGCACGGATCCCGTGGAAGGAAACCCACACCTAGCGCC CACCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTACCCACGCTT TCGCTCCTCAGCGTCAGTTACTGCCCAGAGACCCGCCTTCGCCACCGGTGTTCCT CCTGATATCTGCGCATTTCACCGCTACACCAGGAATTCCAGTCTCCCCTGCAGTA CTCAAGTCTGCCCGTATCGCCCGCAAGCTTGGGGTTGAGCCCCAAGTTTTCACGG ACGACGCGACAAACCGCCTACGAGCTCTTTACGCCCAGTAATTCCGGACAACGC TCGCACCCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTGGCCGGTGCTTCTTCT GCAGGTACCGTCACTCTCGCTTCGTCCCTGCTGAAAGAGGTTTACAACCCGAAG GCCGTCATCCCTCACGCGGCGTCGCTGCATCAGGCTTTCGCCCATTGTGCAATAT TCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCC GGTCGCCCTCTCAGGCCGGCTACCCGTCGTCGCCTTGGTAGGCCATTACCCCACC AACAAGCTGATAGGCCGCGGGCCCATCCTGCACCAGTAAACCTTTCCAACCCCC GCCATGCGACAGGAGCTCATATCCGGTATTAGACCCAGTTTCCCAGGCTTATCCC AGAGTGCAGGGCAGATCACCCACGTGTTACTCACCCGTTCGCCACTCGTGTACC CCCGAAGGGGCCTTACCGTTCGACTTGCA> Hình 7: Kết định danh dịng PTTV_27 dựa đoạn gen 16S rRNA 207 Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn RTTV_13 có độ dài 1420 bp >CGACTTAGTCCCAATCGCTGGTCCCACCTTCGACGGCTCCCCCCATAAGGGTTA GGCCACCGGCTTCGGGTGTTACCGACTTTCGTGACTTGACGGGCGGTGTGTACA AGGCCCGGGAACGTATTCACCGCAGCGTTGCTGATCTGCGATTACTAGCGACTC CGACTTCATGGGGTCGAGTTGCAGACCCCAATCCGAACTGAGACCGGCTTTTTG GGATTAGCTCCACCTCACAGTATCGCAACCCATTGTACCGGCCATTGTAGCATGC GTGAAGCCCAAGACATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCGTCCTCACCTTCCTC CGAGTTGACCCCGGCAGTCTCCCATGAGTCCCCACCATTACGTGCTGGCAACAT GGAACGAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGC TGACGACAACCATGCACCACCTGTGAACCCGCCACAAAGGGGAAACCGTATCTC TACGGCGATCGAGAACATGTCAAGCCTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCATCGAA TTAATCCGCATGCTCCGCCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTTA GCCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGGGCACTTAATGCGTTAGCTGCGGCGCGG AAACCGTGGAATGGTCCCCACACCTAGTGCCCAACGTTTACGGCATGGACTACC AGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCATGCTTTCGCTCCTCAGCGTCAGTTACAG CCCAGAGACCTGCCTTCGCCATCGGTGTTCCTCCTGATATCTGCGCATTCCACCG CTACACCAGGAATTCCAGTCTCCCCTACTGCACTCTAGTCTGCCCGTACCCACCG CAGATCCGGGGTTAAGCCCCGGACTTTCACGACAGACGCGACAAACCGCCTACG AGCTCTTTACGCCCAATAATTCCGGATAACGCTCGCACCCTACGTATTACCGCGG CTGCTGGCACGTAGTTAGCCGGTGCTTCTTCTGCAGGTACCGTCACTTTCGCTTC TTCCCTACTGAAAGAGGTTTACAACCCGAAGGCCGTCATCCCTCACGCGGCGTC GCTGCATCAGGCTTGCGCCCATTGTGCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGG AGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGGTCACCCTCTCAGGCCGGCTAC CCGTCGTCGCCTTGGTGAGCCATTACCTCACCAACAAGCTGATAGGCCGCGAGT CCATCCAAAACCGATAAATCTTTCCAACACCCACCATGCGGTAGGCGCTCCTATC CGGTATTAGACCCAGTTTCCCAGGCTTATCCCAGAGTTAAGGGCAGGTTACTCAC GTGTTACTCACCCGTTCGCCACTAATCCACCCAGCAAGCTGGGCTTCATCGTTCG ACTT> Hình 8: Kết định danh dòng RTTV_13 dựa đoạn gen 16S rRNA Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn LCT_03 có độ dài 1450 bp >CCCCAATCATCTGTCCCACCTTAGGCGGCTAGCTCCTTACGGTTACTCCACCGA CTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGG AACGTATTCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCAGCTTCATGT AGGCGAGTTGCAGCCTACAATCCGAACTGAGAATGGTTTTATGGGATTGGCTTG 208 ACCTCGCGGTCTTGCAGCCCTTTGTACCATCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAG GTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCGGTTTGTCACC GGCAGTCACCTTAGAGTGCCCAACTAAATGCTGGCAACTAAGATCAAGGGTTGC GCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATG CACCACCTGTCACTCTGTCCCCCGAAGGGGAACGCTCTATCTCTAGAGTTGTCAG AGGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCT CCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAGTCTTGCGACCGTA CTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAAGGGCGGAAACCC TCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTG TTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAGTTACAGACCAAAAAGCCGCCTT CGCCACTGGTGTTCCTCCACATCTCTACGCATTTCACCGCTACACGTGGAATTCC GCGTTTCTCTTTCCTGCATCTCAATGATTCCCCAGTTTTCCAATGACCCTCCACGG TTGAGCCGTGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACCGCCTGCGCGCGCTTTACGC CCAATAATTCCGGATAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGT AGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAGGTACCGTCAAGGTACAAGCAGTTACTCTTGT ACTTGTTCTTCCCTAACAACAGAGTTTTACGACCCGAAAGCCTTCATCACTCACG CGGCGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTC CCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGT CGGCTATGCATCGTTGCCTTGGTGAGCCGTTACCTCACCAACTAGCTAATGCACC GCGGGCCCATCTGTAAGTGATAGCCGAAACCATCTTTCAATCATCTCCCATGAA GGAGAAGATCCTATCCGGTATTAGCTTCGGTTTCCCGAAGTTATCCCAGTCTTAC AGGCAGGTTGCCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACGTCATAGAAGCAA GCTTCTAATCAGTTCGCTCGACTTGCA> Hình 9: Kết định danh dòng LCT_03 dựa đoạn gen 16S rRNA 10 Trình tự đoạn gen dịng vi khuẩn TCM_40 có độ dài 1446 bp >CCCCAATCATTTGTCCCACCCTTCGACGGCTAGCTCCATAAATGGTTACTCCAC CGGCTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGACCC GGGAACGTATTCACCGTAGCATGCTGATCTACGATTACTAGCGATTCCAGCTTCA TGTAGTCGAGTTGCAGACTACAATCCGAACTGAGAACAACTTTATGGGATTTGC ATGACCTCGCGGTTTAGCTGCCCTTTGTATTGTCCATTGTAGCACGTGTGTAGCC CAAATCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCGGTTTGTC ACCGGCAGTCAACCTAGAGTGCCCAACTAAATGCTGGCAACTAAGTTTAAGGGT TGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACC ATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCCGAAGGGGAAAGCTCTATCTCTAGAGTGGT CAAAGGATGTCAAGATTTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACAT GCTCCACCGCTTGTGCGGGTCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTC GTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAAA CCCCCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATC CTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCAGCGTCAGTTACAGACCAGAAAGTCGC 209 CTTCGCCACTGGTGTTCCTCCATATCTCTGCGCATTTCACCGCTACACATGGAAT TCCACTTTCCTCTTCTGCACTCAAGTCTCCCAGTTTCCAATGACCCTCCACGGTTG AGCCGTGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACCGCCTACGCGCGCTTTACGCCC AATAATTCCGGATAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTA GTTAGCCGTGGCTTTCTGATTAGGTACCGTCAAGACGTGCACAGTTACTTACACG TTTGTTCTTCCCTAATAACAGAGTTTTACGAGCCGAAACCCTTCATCACTCACGC GGCGTTGCTCCGTCAGGCTTTCGCCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCC CGTAGGAGTCTGGACCGTGTCTCAGTTCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTC GGCTACGTATCGTTGCCTTGGTAAGCCATTACCTTACCAACTAGCTAATACGGCG CGGGTCCATCTATAAGTGATAGCAAAACCATCTTTCACTTTAGAACCATGCGGTT CTAAATGTTATCCGGCATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGTTATTCCAGTCTTATAGG TAGGTTACCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACGTCAAAGGAGCAAGCT CCTTATCTGTTCGCTCGACTTGCA> Hình 10: Kết định danh dịng TCM_40 dựa đoạn gen 16S rRNA 210 ...BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ TRẦN VÕ HẢI ĐƯỜNG PHÂN LẬP VI KHUẨN PHÂN GIẢI SILIC TRONG ĐẤT VÀ ỨNG DỤNG TRONG CANH TÁC LÚA Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG LUẬN ÁN TIẾN SĨ NGÀNH CÔNG... nghiên cứu ? ?Phân lập vi khuẩn phân giải silic đất ứng dụng canh tác lúa Đồng sông Cửu Long? ?? thực 1.2 Mục tiêu nghiên cứu Nghiên cứu thực nhằm mục tiêu phân lập, tuyển chọn dòng vi khuẩn phân giải Si... tiêu phân lập số dịng vi khuẩn phân giải khống Si từ nhiều hệ sinh thái khác hệ vi khuẩn đường ruột trùn đất, hệ vi khuẩn phân trùn đất hệ vi khuẩn đất canh tác chuyên canh lúa, mía tre số tỉnh Đồng