Tìm kiếm một số hợp chất thiên nhiên có tác dụng hạ đường huyết hướng điều trị tiểu đường tuýp 2 sử dụng phương pháp in silico

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI KHOA Y DƢỢC SINH VIÊN: PHẠM THỊ THU UYÊN ********** ĐỀ TÀI TÌM KIẾM HỢP CHẤT THIÊN NHIÊN CÓ TÁC DỤNG HẠ ĐƢỜNG HUYẾT HƢỚNG ĐIỀU TRỊ TIỂU ĐƢỜNG TUÝP SỬ DỤNG PHƢƠNG PHÁP IN SILICO KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC NGÀNH DƢỢC SĨ HÀ NỘI - 2020 ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI KHOA Y DƢỢC Người thực hiện: LờiPHẠM cảm ơn THỊ THU UYÊN Đầu tiên, xin bày tỏ ********** lòng biết ơn sâu sắc chân thành tới người thầy – TS Phạm Thế Hải, người thầy ân cần quan tâm, động viên, tận tình hướng dẫn, bảo cho tơi từ bước chập chững đường nghiên cứu khoa học suốt quãng thời gian thực khóa luận ĐỀ TÀI Tơi xin chân thành cảm ơn Ths Hà Thị Thanh Hương công tác Khoa Y Dược, Trường Đại học Quốc gia Hà Nội, người giúp đỡ tơi nhiều q trình nhận thực hiệnHỢP đề tài CHẤT THIÊN NHIÊN CÓ TÁC TÌM KIẾM Tơi cũngHẠ xin cảm ơn Lê Thị Thu Hường dẫn dắt ĐIỀU DỤNG ĐƢỜNG HUYẾT HƢỚNG TRỊ bước thực khóa luận TIỂU ĐƢỜNG TP SỬ DỤNG PHƢƠNG PHÁP Tôi xin cảm ơn người bạn nhóm nghiên cứu mình, em Lại Đức Anh hỗ trợ suốt thời gian qua IN SILICO Tôi vô biết ơn xin chân thành cảm ơn, thầy cô môn DượcKHÓA liệu vàLUẬN dược học cổ truyền, ĐẠI thầy HỌC Phịng đào DƢỢC tạo & CTHSSV, TỐT NGHIỆP NGÀNH SĨ thầy cô Hội đồng chấm Khóa luận tốt nghiệp nhiệt tình, tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ tơi q trình thực khóa luận Khóa: QH tơi - 2015Y Cuối cùng, xin dành biết ơn sâu sắc tới bố mẹ tất người thân gia đình ln bên u thương, ủng hộ để tơi có ngày Người hướng dẫn: TS PHẠM THẾ HẢI hôm nay! ThS HÀ THỊ THANH HƢƠNG Hà Nội, ngày 10, tháng 5, năm 2020 Phạm Thị Thu Uyên HÀ NỘI - 2020 Lời cảm ơn Đầu tiên, tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc chân thành tới người thầy – TS Phạm Thế Hải, người thầy ân cần quan tâm, động viên, tận tình hướng dẫn, bảo cho từ bước chập chững đường nghiên cứu khoa học suốt qng thời gian tơi thực khóa luận Tơi xin chân thành cảm ơn Ths Hà Thị Thanh Hương công tác Khoa Y Dược, Trường Đại học Quốc gia Hà Nội, người giúp đỡ nhiều q trình nhận thực đề tài Tơi xin cảm ơn cô Lê Thị Thu Hường dẫn dắt bước thực khóa luận Tơi xin cảm ơn người bạn nhóm nghiên cứu mình, em Lại Đức Anh hỗ trợ suốt thời gian qua Tôi vô biết ơn xin chân thành cảm ơn, thầy cô môn Dược liệu dược học cổ truyền, thầy cô Phòng đào tạo & CTHSSV, thầy Hội đồng chấm Khóa luận tốt nghiệp nhiệt tình, tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ tơi q trình thực khóa luận Cuối cùng, xin dành biết ơn sâu sắc tới bố mẹ tất người thân gia đình ln bên u thương, ủng hộ để tơi có ngày hơm nay! Hà Nội, ngày 10, tháng 6, năm 2020 Phạm Thị Thu Uyên i DANH MỤC KÝ HIỆU VIẾT TẮT ALX Alloxan CSDL Cơ sở liệu CVD Bệnh tim mạch DPP4 Dipeptidyl peptidase-4 ĐTĐ Đái tháo đường IC50 Nồng độ ức chế 50% IDF Liên đoàn Đái tháo đường Thế giới GIP Peptide insulinotropic phụ thuộc glucose GLP-1 Peptide giống glucagon GLUT2 Vận chuyển glucose loại HbA1c Huyết sắc tố glycosyl hóa LADA Latent Autoimmune Diabetes of Adulthood PPARγ Thụ thể kích hoạt peroxisome proliferator γ (Peroxisome proliferatoractivated receptors gamma) QSAR Mơ hình liên quan cấu trúc tác dụng RMSD Root mean square deviation (Độ lệch quân phương) ROS Loại oxy phản ứng ii SGLT2 Protein đồng vận chuyển glucose ( Sodium-glucose cotransporter-2) SMILES Simplified Molecular Input Line Entry Specification STZ Streptozotocin TrS Tập huấn luyện (Training set) TS Tập kiểm tra (Test set) TSPT Tham số phân tử TZD Thiazolidinedione iii MỤC LỤC DANH MỤC KÝ HIỆU VIẾT TẮT ii DANH MỤC CÁC BẢNG vi DANH MỤC CÁC HÌNH VẼ vii ĐẶT VẤN ĐỀ viii CHƢƠNG TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan bệnh đái tháo đường 1.1.1 Khái niệm 1.1.2 Phân loại 1.1.3 Các liệu pháp cho ĐTĐ tuýp 1.2 Mơ hình in silico nghiên cứu phát triển thuốc 1.3 Đại cương QSAR 10 1.4 Kỹ thuật Protein docking 12 CHƢƠNG NGUYÊN LIỆU, THIẾT BỊ, NỘI DUNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 14 2.1 Nguyên liệu 14 2.1.1 Dữ liệu chất có hoạt tính dùng để xây dựng mơ hình QSAR 14 2.1.2 Dữ liệu chất có hoạt tính dùng để xây dựng mơ hình phân biệt 15 2.1.3 Cơ sở liệu dùng để sàng lọc hoạt tính 15 2.1.4 Cấu trúc tinh thể protein dùng nghiên cứu Docking 15 2.2 Thiết bị, phần mềm 16 2.3 Nội dung nghiên cứu 17 2.4 Phương pháp nghiên cứu 17 2.4.1 Xây dựng mơ hình QSAR dự đốn hoạt tính đích ĐTĐ chọn 18 2.4.2 Sàng lọc in silico hợp chất thiên nhiên hướng tác dụng đích ĐTĐ tuýp 2: PPARγ SGLT2 22 2.4.3 Mô protein docking 23 CHƢƠNG KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN 25 3.1 Kết nghiên cứu 25 3.1.1 Kết xây dựng hai mô hình QSAR phần mềm MobyDigs cho phép tìm kiếm hợp chất có tác dụng sinh học đích phân tử PPARγ SGLT2 hướng điều trị ĐTĐ tuýp 25 3.1.2 Kết sàng lọc số hợp chất thiên nhiên có tác dụng điều trị tiểu đường tuýp sử dụng hai mơ hình QSAR xây dựng 25 iv 3.1.3 Kết kiểm tra tác dụng hợp chất sàng lọc qua mô hình in vivo 27 3.2 Bàn luận 28 3.2.1 Đánh giá kết xây dựng hai mô hình QSAR phần mềm MobyDigs cho phép tìm kiếm hợp chất có tác dụng sinh học đích phân tử PPARγ SGLT2 hướng điều trị ĐTĐ tuýp 28 3.2.2 Về hợp chất sàng lọc theo hai mơ hình QSAR xây dựng 33 3.2.3 Đánh giá lại tác dụng hợp chất sàng lọc qua mơ hình máy tính in vivo 35 KẾT LUẬN 39 KIẾN NGHỊ 39 TÀI LIỆU THAM KHẢO 40 v DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Các liệu pháp điều trị ĐTĐ phép sử dụng Bảng 2.1 Các phần mềm tính tham số phân tử thông dụng 19 Bảng 3.1 Các hợp chất có tác dựng đồng thời đích phân tử PPARγ SGLT2 26 Bảng 3.2 Các hợp chất dự đoán có hoạt tính in vivo 28 Bảng 3.3 Kết đánh giá nội đánh ngoại mơ hình QSAR 30 Bảng 3.4: Bảng ý nghĩa tham số phân tử mơ hình QSAR đích PPARγ 31 Bảng 3.5: Bảng ý nghĩa tham số phân tử mô hình QSAR đích SGLT2 32 Bảng 3.6 Giá trị Score hợp chất Docking đích phân tử 33 Bảng 3.7 Kết Docking hợp chất sàng lọc đích PPARγ 35 Bảng 3.8 Kết Docking hợp chất sàng lọc đích SGLT2 36 Bảng 3.9 Một số thông tin hợp chất thu sau trình sàng lọc 37 vi DANH MỤC CÁC HÌNH VẼ Hình 1.1 Q trình nghiên cứu phát triển thuốc Hình 2.1 Cấu trúc khung chất chủ vận PPARγ sở liệu 14 Hình 2.2 Cấu trúc 3D thụ thể kích hoạt peroxisome proliferator-γ 15 Hình 2.3 Cấu trúc 3D Protein đồng vận chuyển natri - glucose 16 Hình 2.4 Quá trình nghiên cứu đề tài tìm kiếm hợp chất hợp chất thiên nhiên có tác dụng đích điều trị ĐTĐ tuýp (PPARγ SGLT2) theo mơ hình in silico in vivo 18 Hình 3.1 Khả kích thích thực tế so với số liệu tính tốn tập liệu chất kích hoạt PPARγ 29 Hình 3.2 Khả ức chế thực tế so với số liệu tính tốn tập liệu chất ức chế SGLT2 29 vii ĐẶT VẤN ĐỀ Thống kê từ liên đoàn Đái tháo đường Quốc tế (International Diabetes Federation) năm 2015 cho thấy, ước tính có khoảng 415 triệu người (nằm độ tuổi từ 20-79) mắc bệnh đái tháo đường (ĐTĐ) triệu ca tử vong tổng số 111 nước nghiên cứu [38] Khoảng 75% người mắc chết tiểu đường đến từ nước có thu nhập thấp trung bình Trong bệnh đái tháo đường tuýp chiếm 90% trường hợp mắc Số ca mắc tỷ lệ mắc bệnh tiểu đường tăng đặn vài thập kỷ qua Các liệu pháp ngăn ngừa điều trị có hiệu quả, nhiên cịn nhiều hạn chế như: sử dụng Biguanide gây vấn đề tiêu hóa, Sulfonylureas gây hạ đường huyết, tăng nguy mắc bệnh tim mạch Mặt khác chi phí trực tiếp cần thiết cho việc theo dõi lâu dài bệnh tiểu đường biến chứng gánh nặng đáng kể kinh tế quốc gia Người ta ước tính 12% chi phí chăm sóc sức khỏe tồn cầu chi cho bệnh tiểu đường tỷ lệ mắc toàn giới dự kiến tăng từ 8.8% năm 2015 lên 10,4% vào năm 2040 Gánh nặng kinh tế toàn cầu bệnh dự kiến tăng vọt [38] Do đó, cần phải đầu tư vào nghiên cứu liệu pháp điều trị quản lý bệnh tiểu đường Nhiều nhóm thuốc hướng điều trị ĐTĐ tuýp phát triển đưa vào sử dụng rộng rãi như: insulin, nhóm thuốc biguanid, thiazolidinedione (TZD), sulfonylurea, meglitinide, chất ức chế α-glucosidase hay dipeptidyl peptidase-4 (DPP4), chất đồng vận thụ thể GLP-1 chất tương tự amylin Chúng hoạt động chủ yếu theo chế giảm hấp thu glucose đường ruột kích thích tế bào β đảo tuỵ Trong thuốc phát triển, nhiều hoạt chất tìm thấy thơng qua q trình thiết kế sàng lọc hợp lý với hỗ trợ mơ hình máy tính (in silico), đặc biệt mơ hình liên quan định lượng cấu trúc tác dụng (QSAR) Các mơ hình in silico có lợi so với mơ hình thực nghiệm truyền thống thời gian chi phí vận hành Hiện mơ hình in silico trở thành phần tách rời dự án nghiên cứu phát triển thuốc mới, chúng sử dụng giai đoạn sàng lọc thư viện hoá học lớn nhằm tìm kiếm hợp chất tiềm cho nghiên cứu thực nghiệm [29] Nghiên cứu khoa học thực vật chiến lược thay hiệu để tìm tác nhân trị liệu Ví dụ, 1,1-dimethylbiguanide, hoạt chất thuốc metformin trị đái tháo đường tiếng, có nguồn gốc từ guanidine - hợp chất hạ huyết áp phát từ lilac Pháp, Galega officinalis [5] Một số loại viii F08[O-F] Tần số O - F khoảng cách tôpô Cặp nguyên tử 2D Bảng 3.5: Bảng ý nghĩa tham số phân tử mơ hình QSAR đích SGLT2 TSPT Miêu tả Block Eig09_EA(bo) Giá trị riêng n từ giá trị cạnh kề trọng số theo thứ tự từ trài sang Chỉ số cạnh kề Eig14_AEA(ed) giá trị riêng n 14 từ thời điểm tăng cường trọng số theo mức độ cạnh Chỉ số cạnh kề C-015 = CH2 Các mảnh trung tâm nguyên tử NaaaC Số nguyên tử loại aaaC Chỉ số nhà nước điện tử B08[O-O] Sự diện / vắng mặt O - O khoảng cách tôpô Cặp nguyên tử 2D B10[N-S] Sự diện / vắng mặt N - S khoảng cách tôpô 10 Cặp nguyên tử 2D F03[C-N] Tần số C - N khoảng cách tôpô Cặp nguyên tử 2D F03[C-O] Tần số C - O khoảng cách tôpô Cặp nguyên tử 2D 32 Cả hai mơ hình QSAR có tham gia biến, đa số tham số phân tử 2D Điều chứng tỏ thông tin cấu trúc 2D cấu tử quan trọng, định hoạt tính sinh học đích PPARγ SGLT2 Các tham số có hệ số dương cho thấy khả tăng cường ức chế chúng mơ hình QSAR đích SGLT2 giảm khả ức chế đích PPARγ ngược lại Ví dụ B10[N-S] nhận giá trị có mặt khơng có mặt khoảng cách nguyên tử Nitơ lưu huỳnh 10 liên kết (C-C) Hệ số B10[N-S] mang dấu ( ) giá trị làm tăng hoạt tính ức chế SGLT2 Như mơ hình thỏa mãn tiêu chí đánh giá OECD, ứng dụng mơ hình để ứng dụng vào dự đốn hoạt tính sinh học hợp chất thiết kế 3.2.2 Về hợp chất sàng lọc theo hai mơ hình QSAR xây dựng Sau sàng lọc 758 hợp chất qua hai mơ hình QSAR ta thu 21 hợp chất đồng thời cho tác dụng sinh học tốt hai đích phân tử SGLT2 PPARγ Các hợp chất kiểm tra khả tương thích với đích phân tử phương pháp Docking Bảng 3.6 cho thấy giá trị Score tốt 21 chất Giá trị Score nhỏ cho thấy hợp chất liên kết với đích phân tử tốt (Giá trị Score tỷ lệ thuận với mức lượng) Bảng 3.6 Giá trị Score hợp chất Docking đích phân tử STT Tên hợp chất Score_PPARγ Score_SGLT2 7-Hydroxyflavanone -28.304497 -13.782391 Bidwillol A -26.602739 -18.380028 Eriosematin A -24.655264 -16.340944 5,7-Dihydroxyflavone -24.191191 -17.371319 ', 5-Dihydroxyflavone -23.509462 -19.971991 33 Alpinetin -21.740055 -16.575804 7-hydroxy-3- (4hydroxybenzyl) chroman -21.654575 -15.959196 (S) -2- (4-Hydroxy-3- (3metylbut-2-en-1-yl) phenyl) chroman-7-ol -21.549046 -15.284402 5,7-Dihydroxyflavanone -21.394835 -15.549281 10 7-Hydroxyflavone -21.281286 -15.393044 11 Pinocembrin -20.828037 -15.559644 12 Demethylvestit -20.539910 -15.696916 13 Hydrangenol -19.050920 -14.720184 14 7,3'-Dihydroxy-4'methoxyflavan -18.971605 -15.281397 15 Kazinol U -18.850159 -13.896033 16 7,4'-Dihydroxyflavone -17.567076 -18.333696 17 Equol -15.793626 -14.496695 18 Liquiritigenin -15.516144 -17.611387 19 Dihydrodaidzein -15.200110 -17.221327 20 Sanggenone D -13.047223 -4.739414 34 21 Sanggenon C -11.740144 -5.450112 3.2.3 Đánh giá lại tác dụng hợp chất sàng lọc qua mơ hình máy tính in vivo Qua kết Docking nhận thấy 7-Hydroxyflavanone có khả liên kết với protein PPARγ tốt ', 5-Dihydroxyflavone có khả gắn đích SGLT2 tốt Bảng 3.7 Kết Docking hợp chất sàng lọc đích PPARγ 7-Hydroxyflavanone - PPARγ 4',5-Dihydroxyflavone - PPARγ 35 7-Hydroxyflavone - PPARγ Dihydrodaidzein - PPARγ Bảng 3.8 Kết Docking hợp chất sàng lọc đích SGLT2 7-Hydroxyflavanone - SGLT2 4',5-Dihydroxyflavone - SGLT2 7-Hydroxyflavone -SGLT2 Dihydrodaidzein - SGLT2 Một số thông tin hợp chất tài liệu y văn: 36 Bảng 3.9 Một số thông tin hợp chất thu sau trình sàng lọc Tên hợp chất Dược liệu Các hoạt tính nghiên cứu chứa hợp chất TLTK Zuccagnia puncata Cav (Fabace ae) Điều trị nhiễm trùng đường hô hấp [61] Spatholobus Suberectus Ức chế proteasome 20S [49] 4',5Dihydroxyflavone Dracaena cochinchinen sis ', 5-Dihydroxyflavone chất ức chế men đậu nành LOX-1 men α-Glucosidase, với Ki 102,6 M LOX-1 đậu nành IC50 66 μM men αglucosidase [40, 43] 7-Hydroxyflavone Acacia farnesiana 7-Hydroxyflavone chất ức chế [58, 63] mạnh CYP1A1 với giá trị Ki 0,015 M thể tính chọn lọc cao gấp lần CYP1A1 so với CYP1A2 Nó có đặc tính chống oxy hóa, chống viêm chống tăng sinh tuyệt vời, đóng vai trò chất bảo vệ tiềm điều trị bệnh nhân nhiễm EV71 mạn tính.7-Hydroxyflavone bảo vệ tế bào thận khỏi độc tế bào liên quan đến NIC thông qua ERK / Nrf2 / Đường dẫn HO-1; ức chế viêm LPS 7Hydroxyflavanone 37 gây thông qua việc làm giảm sản xuất NO, PGE2, TNF-α IL6 Dihydrodaidzein Glycine max Dihydrodaidzein chất chuyển hóa estrogen hoạt động daidzein [18, 19, 28, 53] Nó có liên quan đến nguy mắc bệnh ĐTĐ thấp người, có tác dụng giãn mạch vòng động mạch chủ chuột bị lập mức μg / ml Nó kích thích tăng trưởng phụ thuộc thụ thể estrogen tế bào MCF-7 ung thư vú nồng độ micromol Dihydrodaidzein sản xuất chuyển hóa daidzein vi khuẩn đại tràng chuyển hóa thành hợp chất hoạt tính sinh học khác nhau, bao gồm solol Từ thông tin cho thấy, nghiên cứu khả điều trị ĐTĐ hợp chất cịn (chỉ có Dihydrodaidzein có số nghiên cứu) Đặc biệt tac dụng hai đích SGLT2 PPARγ chưa nghiên cứu Bên cạnh đó, dược liệu chứa hợp chất phổ biến, tiềm phát triển nguồn dược liệu lớn Đây kết mà tử khóa luận phát triển tiếp 38 KẾT LUẬN Sau thời gian nghiên cứu, đề tài đạt mục tiêu đề có số kết luận sau: Đã xây dựng quy trình sàng lọc theo phương pháp in silico cho phép tìm kiếm hợp chất có tác dụng đồng thời đích PPARγ SGLT2 Quy trình sàng lọc gồm bước sau: - Xây dựng thư viện liệu hợp chất tính tốn tham số phân tử - Xây dựng mơ hình QSAR hợp chất có tác dụng ức chế SGLT2 mơ hình QSAR hợp chất có tác dụng hoạt hóa PPARγ - Xây dựng mơ hình QSAR thể mối tương quan cấu trúc tác dụng in vivo - Tiến hành sàng lọc tìm kiếm hợp chất tự nhiên có hoạt tính sinh học đồng thời hai đích SGLT2 PPARγ - Nghiên cứu Docking để đánh giá mức độ tương tác với trung tâm hoạt động đích tác dụng chất sàng lọc - Đánh giá lại chất sàng lọc mơ hình QSAR thể mối tương quan cấu trúc tác dụng in vivo để tìm kiếm hợp chất tự nhiên có khả cao có tác dụng điều trị bệnh ĐTĐ mơ hình in vivo Đã sàng lọc hợp chất tiềm từ sở liệu hợp chất thiên nhiên, gợi ý cho trình nghiên cứu thực nghiệm phát triển thuốc tương lai KIẾN NGHỊ Bên cạnh kết đạt được, để tiếp tục phát triển kết nghiên cứu khóa luận đồng thời tăng tính ứng dụng nghiên cứu, em xin đưa đề xuất sau: Phát triển phương pháp để ứng dụng vào mơ hình bệnh tật phức tạp khác Tiến hành nghiên cứu thực nghiệm hoạt tính đích hợp chất sàng lọc mơ hình in vivo thực tế 39 TÀI LIỆU THAM KHẢO Tiếng Việt Bộ Y Tế ( 2017), Hướng dẫn chẩn đoán điều trị đái tháo đường típ 2, BYT Hồng Văn Qn (2017), Kết hợp phương pháp protein docking qsar xây dựng mô hình tương quan định lượng cấu trúc - hoạt tính ức chế enzym histone deacetylase ii (hdac2) số dẫn xuất acid hydroxamic tổng hợp, Hoàng Văn Quân, ĐH Dược Hà Nội Antuna-Puente B, B Feve, S Fellahi and J-P Bastard (2008), "Adipokines: the missing link between insulin resistance and obesity", Diabetes & metabolism, 34(1), 2-11 Bailey CJ and C Day (2004), "Metformin: its botanical background", Practical Diabetes International, 21(3), 115-117 Baskin Igor I., Vladimir A Palyulin and Nikolai S Zefirov (2008), "Neural networks in building QSAR models", Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 458,137-158 Berk Richard A (2003), "The formalities of multiple regression", Regression Analysis: A Constructive Critique 103-110 Bibi Shabana, Saima Kalsoom and Hamid Rashid (2013), "In Silico Approach for Lead Identification and Optimization Of Antidiabetic Compounds", IOSR Journal of Pharmacy and Biological Sciences (IOSR-JPBS), 3, 36-46 Briones Rowena M, Ajit K Sarmah and Lokesh P Padhye (2016), "A global perspective on the use, occurrence, fate and effects of anti-diabetic drug metformin in natural and engineered ecosystems", Environmental Pollution, 219, 1007-1020 10 Campbell R Keith and John R White (2008), "More Choces Than Ever Before", The Diabetes Educator, 34(3), 518-534 11 Cantarelli Elisa, Antonio Citro, Simona Marzorati, Raffaella Melzi, Marina Scavini and Lorenzo Piemonti (2013), "Murine animal models for preclinical islet transplantation: no model fits all (research purposes)", Islets, 5(2), 79-86 12 Cefalo Chiara Maria Assunta, Francesca Cinti, Simona Moffa, Flavia Impronta, Gian Pio Sorice, Teresa Mezza, Alfredo Pontecorvi and Andrea Giaccari (2019), "Sotagliflozin, the first dual SGLT inhibitor: current outlook and perspectives", Cardiovascular diabetology, 18(1), 20 13 Chatzigeorgiou Antonios, Antonios Halapas, Konstantinos Kalafatakis and Elli Kamper (2009), "The use of animal models in the study of diabetes mellitus", In Vivo, 23(2), 245-258 14 Chiasson Jean-Louis, Robert G Josse, Ramon Gomis, Markolf Hanefeld, Avraham Karasik, Markku Laakso and STOP-NIDDM Trial Research Group (2002), "Acarbose for prevention of type diabetes mellitus: the STOPNIDDM randomised trial", The Lancet, 359(9323), 2072-2077 15 Davidson Jaime A, Erika B Parente and Jorge L Gross (2008), "Incretin mimetics and dipeptidyl peptidase-4 inhibitors: innovative treatment therapies for type diabetes", Arquivos Brasileiros de Endocrinologia & Metabologia, 52(6), 1039-1049 16 Diamant Michaela and Robert J Heine (2003), "Thiazolidinediones in type diabetes mellitus", Drugs, 63(13), 1373-1406 17 Dias DA Urban S, Roessner U (2012), " A Historical Overview of Natural Products in Drug Discovery ", Metabolites, 2(2), 303-336 18 Ding M., A A Franke, B A Rosner, E Giovannucci, R M van Dam, S S Tworoger, F B Hu and Q Sun (2015), "Urinary isoflavonoids and risk of type diabetes: a prospective investigation in US women", Br J Nutr, 114(10), 1694-1701 19 Ding M., A Pan, J E Manson, W C Willett, V Malik, B Rosner, E Giovannucci, F B Hu and Q Sun (2016), "Consumption of soy foods and isoflavones and risk of type diabetes: a pooled analysis of three US cohorts", Eur J Clin Nutr, 70(12), 1381-1387 20 Draznin Boris and Sol Epstein (2011), Oxford American handbook of endocrinology and diabetes, Oxford University Press, 21 E.M de Haas and et al (2011), "Internal and external validation of the longterm QSARs for neutral organics to fish from ECOSAR", SAR and QSAR in Environmental Research, 22, 545–559 22 Haffner Steven M (1998), "Epidemiology of Type Diabetes: Risk Factors", Diabetes Care, 21(Supplement 3), C3-C6 23 Hsia Daniel S, Owen Grove and William T Cefalu (2017), "An update on SGLT2 inhibitors for the treatment of diabetes mellitus", Current opinion in endocrinology, diabetes, and obesity, 24(1), 73 25 Kawano Kazuya, Tsukasa Hirashima, Shigehito Mori, Yuichi Saitoh, Masao Kurosumi and Takashi Natori (1992), "Spontaneous long-term hyperglycemic rat with diabetic complications: Otsuka Long-Evans Tokushima Fatty (OLETF) strain", Diabetes, 41(11), 1422-1428 26 King Aileen JF (2012), "The use of animal models in diabetes research", British journal of pharmacology, 166(3), 877-894 27 Kitchen Douglas B, Hélène Decornez, John R Furr and Jürgen Bajorath (2004), "Docking and scoring in virtual screening for drug discovery: methods and applications", Nature reviews Drug discovery, 3(11), 935-949 28 Kobayashi S., M Shinohara, T Nagai and Y Konishi (2013), "Transport mechanisms for soy isoflavones and microbial metabolites dihydrogenistein and dihydrodaidzein across monolayers and membranes", Biosci Biotechnol Biochem, 77(11), 2210-2217 29 Lankatillake Chintha, Tien Huynh and Daniel A Dias (2019), "Understanding glycaemic control and current approaches for screening antidiabetic natural products from evidence-based medicinal plants", Plant Methods, 15(1), 105 31 Lenzen Sigurd (2008), "The mechanisms of alloxan-and streptozotocin-induced diabetes", Diabetologia, 51(2), 216-226 32 Loke Yoon K, Sonal Singh and Curt D Furberg (2009), "Long-term use of thiazolidinediones and fractures in type diabetes: a meta-analysis", Cmaj, 180(1), 32-39 33 Madiraju Anila K, Yang Qiu, Rachel J Perry, Yasmeen Rahimi, Xian-Man Zhang, Dongyan Zhang, João-Paulo G Camporez, Gary W Cline, Gina M Butrico and Bruce E Kemp (2018), "Metformin inhibits gluconeogenesis via a redox-dependent mechanism in vivo", Nature medicine, 24(9), 1384-1394 34 Mayer John P, Faming Zhang and Richard D DiMarchi (2007), "Insulin structure and function", Peptide Science: Original Research on Biomolecules, 88(5), 687-713 35 Melzi R, F Sanvito, A Mercalli, K Andralojc, E Bonifacio and L Piemonti (2008), "Intrahepatic islet transplant in the mouse: functional and morphological characterization", Cell transplantation, 17(12), 1361-1370 36 Musso Giovanni, Roberto Gambino, Maurizio Cassader and Elena Paschetta (2019), "Efficacy and safety of dual SGLT 1/2 inhibitor sotagliflozin in type diabetes: meta-analysis of randomised controlled trials", bmj, 365, l1328 37 Nanjan MJ, Manal Mohammed, BR Prashantha Kumar and MJN Chandrasekar (2018), "Thiazolidinediones as antidiabetic agents: A critical review", Bioorganic chemistry, 77, 548-567 38 Ogurtsova K., J D da Rocha Fernandes, Y Huang, U Linnenkamp, L Guariguata, N H Cho, D Cavan, J E Shaw and L E Makaroff (2017), "IDF Diabetes Atlas: Global estimates for the prevalence of diabetes for 2015 and 2040", Diabetes Research and Clinical Practice, 128, 40-50 39 Pataky Mark W, Carmen S Yu, Yilin Nie, Edward B Arias, Manak Singh, Christopher L Mendias, Robert J Ploutz-Snyder and Gregory D Cartee (2019), "Skeletal muscle fiber type-selective effects of acute exercise on insulinstimulated glucose uptake in insulin-resistant, high-fat-fed rats", American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism, 316(5), E695-E706 40 Proenỗa C., M Freitas, D Ribeiro, E F T Oliveira, J L C Sousa, S M Tomé, M J Ramos, A M S Silva, P A Fernandes and E Fernandes (2017), "α-Glucosidase inhibition by flavonoids: an in vitro and in silico structureactivity relationship study", J Enzyme Inhib Med Chem, 32(1), 1216-1228 41 Radenković Miroslav, Marko Stojanović and Milica Prostran (2016), "Experimental diabetes induced by alloxan and streptozotocin: The current state of the art", Journal of pharmacological and toxicological methods, 78, 13-31 42 Ramakrishnan Parthasarathi Alok Dhawan (2018), In Vitro Toxicology, 43 Ribeiro D., M Freitas, S M Tomé, A M Silva, G Porto, E J Cabrita, M M Marques and E Fernandes (2014), "Inhibition of LOX by flavonoids: a structure-activity relationship study", Eur J Med Chem, 72, 137-145 44 Rieg Timo and Volker Vallon (2018), "Development of SGLT1 and SGLT2 inhibitors", Diabetologia, 61(10), 2079-2086 45 Saltiel Alan R and C Ronald Kahn (2001), "Insulin signalling and the regulation of glucose and lipid metabolism", Nature, 414(6865), 799-806 46 Samuel Varman T and Gerald I Shulman (2012), "Mechanisms for insulin resistance: common threads and missing links", Cell, 148(5), 852-871 47 Seino Yutaka, Mitsuo Fukushima and Daisuke Yabe (2010), "GIP and GLP‐1, the two incretin hormones: similarities and differences", Journal of diabetes investigation, 1(1‐2), 8-23 48 Shafrir Eleazar (2007), Animal models of diabetes: frontiers in research, Animal Models of Diabetes: Frontiers in Research, 289 49 Shim S H (2011), "20S proteasome inhibitory activity of flavonoids isolated from Spatholobus suberectus", Phytother Res, 25(4), 615-618 50 Shoichet Brian K, Susan L McGovern, Binqing Wei and John J Irwin (2002), "Lead discovery using molecular docking", Current opinion in chemical biology, 6(4), 439-446 51 Swinnen Sanne G, Joost B Hoekstra and J Hans DeVries (2009), "Insulin therapy for type diabetes", Diabetes Care, 32(suppl 2), S253-S259 52 T Reinehr (2013), "Type diabetes mellitus in children and adolescents", World J Diabetes, 4(6), 270-281 53 Tamura M., S Hori and H Nakagawa (2011), "Dihydrodaidzein-producing Clostridium-like intestinal bacterium, strain TM-40, affects in vitro metabolism of daidzein by fecal microbiota of human male equol producer and nonproducers", Biosci Microflora, 30(3), 65-71 54 Tang Chunlei, Xiaoyun Zhu, Dandan Huang, Xin Zan, Baowei Yang, Ying Li, Xiaoyong Du, Hai Qian and Wenlong Huang (2012), "A specific pharmacophore model of sodium-dependent glucose co-transporter (SGLT2) inhibitors", Journal of Molecular Modeling, 18(6), 2795-2804 55 Todeschini R and Consonni V (2000), Handbook of Molecular Descriptors 1st, Federal Republic of Germany 56 Tremblay Mark Stephen, Rachel Christine Colley, Travis John Saunders, Genevieve Nissa Healy and Neville Owen (2010), "Physiological and health implications of a sedentary lifestyle", Applied Physiology, Nutrition, and Metabolism, 35(6), 725-740 57 Vaag Allan and Søren S Lund (2007), "Non-obese patients with type diabetes and prediabetic subjects: distinct phenotypes requiring special diabetes treatment and (or) prevention?", Applied physiology, nutrition, and metabolism, 32(5), 912-920 58 Wang J., H Su, T Zhang, J Du, S Cui, F Yang and Q Jin (2014), "Inhibition of Enterovirus 71 replication by 7-hydroxyflavone and diisopropyl-flavon7-yl Phosphate", PLoS One, 9(3), e92565 59 Wanner Christoph and Nikolaus Marx (2018), "SGLT2 inhibitors: the future for treatment of type diabetes mellitus and other chronic diseases", Diabetologia, 61(10), 2134-2139 60 WHO WHO (2016), "Global report on diabetes", World Health Organization, 61 Zampini I C., J Villena, S Salva, M Herrera, M I Isla and S Alvarez (2012), "Potentiality of standardized extract and isolated flavonoids from Zuccagnia punctata for the treatment of respiratory infections by Streptococcus pneumoniae: in vitro and in vivo studies", J Ethnopharmacol, 140(2), 287-292 62 Zhang Rui, Yang Yao, Yingping Wang and Guixing Ren (2011), "Antidiabetic activity of isoquercetin in diabetic KK-A y mice", Nutrition & Metabolism, 8(1), 85 63 Zhang T., J Du, L Liu, X Chen, F Yang and Q Jin (2012), "Inhibitory effects and underlying mechanism of 7-hydroxyflavone phosphate ester in HeLa cells", PLoS One, 7(5), e36652 64 Al-Najjar Belal O., Habibah A Wahab, Tengku Sifzizul Tengku Muhammad, Alexander Chong Shu-Chien, Nur Adelina Ahmad Noruddin and Mutasem O Taha (2011), "Discovery of new nanomolar peroxisome proliferator-activated receptor γ activators via elaborate ligand-based modeling", Eur J Med Chem, 46(6), 2513-2529 65 Gee Veronica M W., Fiona S L Wong, Lalitha Ramachandran, Gautam Sethi, Alan Prem Kumar and Chun Wei Yap (2014), "Identification of novel peroxisome proliferator-activated receptor-gamma (PPARγ) agonists using molecular modeling method", J Comput Aided Mol Des, 28(11), 1143-1151 66 Khanna Smriti, M E Sobhia and Prasad V Bharatam (2005), "Additivity of Molecular Fields:  CoMFA Study on Dual Activators of PPARα and PPARγ", J Med Chem, 48(8), 3015-3025 67 Kirchner LA (1997), "The prediction of skin permeability by using physicochemical data", ATLA, 25(359-370 68 Qingqing Wang, Imam Mustapha Umar, Yida Zhang and Wang Fudi (2017), "Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma (PPARγ) as a Target for Concurrent Management of Diabetes and Obesity-Related Cancer", Curr Pharm Des, 23(25), 3677-3688 69 Rangwala Shamina M., Ben Rhoades, Jennifer S Shapiro, A Sophie Rich, Jason K Kim, Gerald I Shulman, Klaus H Kaestner and Mitchell A Lazar (2003), "Genetic Modulation of PPARγ Phosphorylation Regulates Insulin Sensitivity", Developmental Cell, 5(4), 657-663 ... phép tìm kiếm hợp chất có tác dụng sinh học đích phân tử PPARγ SGLT2 hướng điều trị ĐTĐ tuýp 25 3.1 .2 Kết sàng lọc số hợp chất thiên nhiên có tác dụng điều trị tiểu đường tuýp sử dụng. .. QSAR cho phép tìm kiếm hợp chất có tác dụng sinh học đích phân tử PPARγ SGLT2 hướng điều trị ĐTĐ tuýp 2 Sàng lọc số hợp chất thiên nhiên có tác dụng điều trị tiểu đường tuýp sử dụng hai mơ hình... thành thuốc điều trị ĐTĐ tuýp 2, tiến hành đề tài ? ?Tìm kiếm số hợp chất thiên nhiên có tác dụng hạ đường huyết hướng điều trị tiểu đường tuýp sử dụng phương pháp in silico? ?? với mục tiêu sau: