1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Định danh vùng gene 16s dna chủng vi khuẩn lam có khả năng gây độc tố ở hồ dầu tiếng

66 3 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 66
Dung lượng 1,91 MB

Nội dung

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ TP HỒ CHÍ MINH ĐỒ ÁN TỐT NGHIỆP ĐỊNH DANH VÙNG GENE 16S DNA CHỦNG VI KHUẨN LAM CÓ KHẢ NĂNG GÂY ĐỘC TỐ Ở HỒ DẦU TIẾNG Ngành: Công Nghệ Sinh Học Chuyên ngành: Công Nghệ Sinh Học Giảng viên hướng dẫn : TS Hoàng Quốc Khánh HVCH Ngô Đức Duy Sinh viên thực MSSV: 1311101028 : Khưu Văn Quang Lớp: 13DSH06 TP Hồ Chí Minh, 2017 LỜI CAM ĐOAN Người thực đề tài xin cam đoan nội dung đồ án tốt nghiệp người thực đề tài làm Viện Sinh Học Nhiệt Đới TP.HCM, hướng dẫn TS.Hồng Quốc Khánh HVCH.Ngơ Đức Duy Các số liệu kết nghiên cứu đồ án trung thực, không chép từ báo cáo công bố trước Nội dung luận văn có tham khảo sử dụng tài liệu, thông tin đăng tải tác phẩm, tạp chí khoa học trang web theo danh mục tài liệu đồ án Nếu sai người thực đề tài xin chịu hoàn toàn trách nhiệm kỷ luật khoa nhà trường đề Sinh viên thực Khưu Văn Quang LỜI CẢM ƠN Trong thời gian làm đồ án tốt nghiệp Viện Sinh Học Nhiệt Đới TPHCM, hướng dẫn tận tình Thầy Cơ, anh chị bạn, em hoàn thành tốt báo cáo Em xin chân thành cảm ơn đến: Thầy Ngô Đức Duy phòng vi sinh ứng dụng, Viện Sinh Học Nhiệt Đới TPHCM tận tình hướng dẫn, bảo giúp đỡ em suốt thời gian thực đồ án tốt nghiệp Thầy Hoàng Quốc Khánh thầy Nguyễn Hồng Dũng phịng vi sinh ứng dụng, Viện Sinh Học Nhiệt Đới TPHCM giúp đỡ tạo điều kiện cho em làm đồ án tốt nghiệp đây, nhiệt tình hướng dẫn hỗ trợ để em thực tốt đồ án tốt nghiệp Chị Lê Quỳnh Loan bên cạnh giúp đỡ, chia kiến thức, kinh nghiệm tất anh chị, bạn nghiên cứu phòng Vi Sinh, Viện Sinh Học Nhiệt Đới TP.HCM nhiệt tình giúp đỡ dạy cho em nhiều điều suốt trình nghiên cứu Tồn thể Thầy Cơ khoa CNSH-TP-MT trường Đại Học Cơng Nghệ Thành Phố Hồ Chí Minh người tận tâm dạy dỗ truyền đạt kiến thức cho em ngày hôm Các bạn lớp 13SH06 quan tâm, giúp đỡ chia thứ với suốt quãng đường thời sinh viên Cuối cùng, xin cảm ơn Ba Mẹ ni nấng, chăm sóc, dạy dỗ cho ăn học thành người có ích cho xã hội Sinh Viên Thực Hiện Khưu Văn Quang MỤC LỤC MỤC LỤC DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT DANH MỤC HÌNH ẢNH DANH MỤC CÁC BẢNG MỞ ĐẦU…………………………………………………… …………………1 CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan tin sinh học 1.1.1 Sự đời tin sinh học .5 1.1.2 Khái niệm Tin sinh học .5 1.1.3 Vai trò xu hướng phát triển tin sinh học 1.1.4 Cây phát sinh loài 1.1.5 Công cụ cách tiến hành 1.1.6 Đánh giá kết 1.2 Tổng quan định danh sinh học phân tử .8 1.2.1 Các phương pháp ly trích thu nhận DNA tổng số 1.2.2 Phương pháp PCR ứng dụng 11 1.3 Tổng quan vi khuẩn lam 13 1.3.1 Giới thiệu vi khuẩn lam 13 1.3.2 Hình thái cấu trúc tế bào 14 1.3.3 Phân loại vi khuẩn lam .15 1.3.4 Hiện tượng nở hoa vi khuẩn lam 16 1.3.5 Độc tố microcystins 17 1.3.6 Hai hợp chất gây mùi hôi geosmin 2-methylisoborneol 20 1.3.7 Tình hình nghiên cứu vi khuẩn lam độc tố vi khuẩn lam 21 CHƢƠNG 2: VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 25 2.1 Thời gian địa điểm 25 i 2.2 Vật liệu, thiết bị hóa chất 25 2.2.1 Dụng cụ thiết bị 25 2.2.2 Nguồn mẫu 25 2.2.3 Hóa chất 25 2.3 Phương pháp thu mẫu 27 2.3.1 Phương pháp phân lập 27 2.3.2 Phương pháp nuôi tăng sinh khối thu sinh khối vi khuẩn lam .27 2.3.3 Định danh chủng vi khuẩn lam sinh học phân tử .28 Thành phần chu trình nhiệt phản ứng PCR: 32 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN 35 3.1 Kết ly trích thu nhận DNA gene hình thái vi khuẩn lam 35 3.2 Kết đo nồng độ DNA gene sau ly trích thu nhận 36 3.3 Kết khuếch đại đoạn gen 16S DNA kỹ thuật PCR 37 3.3.1 PCR với cặp mồi CYA371F, 373R 37 3.3.2 PCR với cặp mồi CYA-F, CYA-R .38 3.4 Kết tinh sản phẩm PCR chủng vi khuẩn lam .39 3.5 Kết giải trình tự vùng gen 16S DNA chủng vi khuẩn lam 39 3.5.1 Mẫu (chủng Microsystis) 39 3.5.2 Mẫu 10 (chủng Anabaena) 40 3.5.3 Mẫu 29 (chủng Cylindropermopsis) 40 3.5.4 Mẫu 31(chủng plantothrix) 41 3.6 Kết so sánh trình tự gen ngân hàng NCBI xây dựng phát sinh loài 41 CHƢƠNG 4: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 44 4.1 Kết luận 44 4.2 Đề nghị 45 TÀI LIỆU THAM KHẢO 46 PHỤ LỤC ii DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT DNA Deoxyribo Nucleic Axit RNA Ribonucleic Acid EDTA Ethylene diamine tetraacetic acid NCBI National Center for Biotechnology Information PCR Polymerase chain reaction UV Ultraviolet TAE Tris acetate ethylenediaminetetraacetic acid MCs Microcystins MIB Methylisoborneol ITB Institute of Tropical Biology CTAB Cetyl Trimetyl Ammonium Bromide Cs Cộng SDS Sodium dodecyl sulfate Bp Base pairs UV Ultra violet iii DANH MỤC HÌNH ẢNH DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình 1.1 Vi khuẩn lam nở hoa Hồ Dầu Tiếng 17 Hình 1.2 Cấu trúc hóa học loại độc tố microcystins thường gặp 18 Hình 1.3 Cấu trúc hóa học Geosmin 2-methylisoborneol MIB 21 Hình 2.1 Sinh khối vi khuẩn lam 28 Hình 2.2 Quy trình phản ứng PCR 31 Hình 3.1 Kết thu nhận DNA gene vi khuẩn lam gồm chủng gel agarose 1,5 35 Hình 3.2 Kết điện di gel agarose sản phẩm PCR với cặp mồi CYA371F, 373R 37 Hình 3.3 Kết điện di gel agarose sản phẩm PCR với cặp mồi CYA-F, CYA-R 38 Hình 3.4 Kết điện di gel agarose chủng vi khuẩn lam sau tinh 39 Hình 3.5 Cây phát sinh lồi dựa phân tích trình tự vùng gene 16S DNA chủng Microcystis, Anabaena, Plantothrix, Cylindropermopsis với vi khuẩn lam ngân hàng NCBI…………… ………………………………………….……42 iv DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 2.1 Chu trình nhiệt cặp mồi CYA371F 373R 32 Bảng 2.2.Chu trình nhiệt cặp mồi CYA-F CYA-R .33 Bảng 3.1 Kết đo nồng độ DNA gene sau thu nhận 36 v Đồ Án Tốt Nghiệp MỞ ĐẦU Tính cấp thiết đề tài Việc gia tăng dân số, phát triển ngành công nghiệp, nông nghiệp làm gia tăng nguồn dinh dưỡng (chủ yếu ni tơ phốt pho) đáng kể vào thủy vực Ô nhiễm dinh dưỡng diễn ngày quan trọng thủy vực sông, hồ, đầm nuôi trồng thủy sản kèm với tượng nở hoa nước mà thực chất phát triển mạnh mẽ quần xã thực vật chủ yếu vi khuẩn lam (VKL) Vi khuẩn lam sinh vật xuất trái đất cách hàng tỷ năm tồn ngày Cùng với vi tảo, vi khuẩn lam đóng vai trị quan trọng sinh thái thủy vực cung cấp nguồn lượng sơ cấp cho chuỗi thức ăn thủy vực, đồng thời giải phóng lượng oxy vào khơng khí thơng qua q trình quang hợp Tuy nhiên, bên cạnh đóng góp tích cực tượng tăng trưởng bùng phát hay gọi nở hoa vi khuẩn lam gây nhiều ảnh hưởng xấu lên chất lượng môi trường nước, tài nguyên thủy sản cân hệ sinh thái Trong số lồi nhóm vi sinh có khả sản sinh độc tố Ở nước ta, vi khuẩn lam sinh độc độc tố chúng thường xuất thủy vực nước Chúng có khả sản sinh loại độc tố neurotoxin (độc tố thần kinh) hepatotoxin (độc tố gan) Độc tố nhóm vi sinh tác động nguy hiểm tới sinh vật thủy sinh sức khỏe người Do Tổ chức Y tế giới (WHO) quy định nồng độ giới hạn nước uống không vượt µg/L Ngồi số chủng cịn sinh hợp chất gây mùi hôi nước Ở Việt Nam ô nhiễm môi trường nước mà chủ yếu ô nhiễm chất hữu cơ, chất dinh dưỡng, kéo theo bùng nổ thực vật nổi, có tảo độc diễn phổ biến tác động hoạt động người lưu vực sông, hồ Tại hồ hồ Ba Bể, hồ Tây, hồ hoàn Kiếm, hồ Dầu Tiếng, hồ Trị An, hồ Núi Cốc Đồ Án Tốt Nghiệp quan sát thấy diện vi khuẩn lam độc chủ yếu loài thuộc Microcystis, Anabaena, Plantothrix, Cylindropermopsis Hồ Dầu Tiếng hồ chứa nước nhân tạo có chức ngăn lũ, cấp nước sinh hoạt, tưới tiêu, rửa mặn, cải thiện chất lượng nước nuôi trồng thủy sản Là nguồn cung cấp trực tiếp gián tiếp nước sinh hoạt tưới tiêu cho hàng triệu dân Tây Ninh, Bình Dương TP.Hồ Chí Minh Hiện nay, nghiên cứu cho thấy thành phần vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng đa dạng tượng nở hoa vấn đề quan trọng mang tính cấp bách Vi khuẩn lam nở hoa độc tố chúng sinh gây ảnh hưởng lớn tới sinh vật thủy sinh, động vật sống xung quanh hồ sức khỏe người Phần lớn nghiên cứu nước ta tập trung vào đánh giá đa dạng nhóm vi sinh thủy vực, đặc điểm hình thái nghiên cứu độc tính thực vật động vật thủy sinh Chưa có nhiều nghiên cứu tập trung định danh vùng gene 16S DNA chủng vi khuẩn lam Và đề tài khảo sát diện chủng vi khuẩn lam có khả gây độc tố hồ Dầu Tiếng Mục đích nghiên cứu Mục đích đề tài định danh vùng gene 16S DNA chủng vi khuẩn lam có khả gây độc tố Hồ Dầu Tiếng Nhiệm vụ nghiên cứu Phân lập số loài vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Định danh vi khuẩn lam tới chi dựa theo hình thái học sinh học phân tử Khảo sát diện có mặt chủ yếu loài vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Phƣơng pháp nghiên cứu Phương pháp thu mẫu, phân lập mẫu nuôi tăng sinh khối, thu sinh khối vi khuẩn lam Đồ Án Tốt Nghiệp CHƢƠNG 4: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 4.1 Kết luận Sau so sánh mẫu phân lập định danh vùng gene 16S DNA chủng vi khuẩn lam: Microcystis, Anabaena, Cylindrospermopsis, Plantothrix hồ Dầu Tiếng với chủng vi khuẩn lam ngân hàng NCBI cho kết luận sau: - Mẫu có mối quan hệ gần với chủng Sphaerocavum brasiliense CCIBt3094, Microcystis aeruginosa LMECYA 147, Microcystis ichthyoblabe VN461, Microcystis panniformis Microcystis smithii CHAB1459 với mức độ gene tương đồng 99% - Mẫu 10 có mối quan hệ gần với loài Dolichospermum circinale Anabaena ucrainica CHAB1431 với mức độ gene tương đồng 99%, cịn với lồi Sphaerospermopsis kisseleviana CHAB332 với mức độ gene tương đồng 98% - Mẫu 29 có mối quan hệ gần với loài Cylindrospermopsis catemaco CHAB148, Cylindrospermopsis raciborskii CHAB1351, Raphidiopsis mediterranea 07-04 Raphidiopsis curvata CHAB3413 với mức độ gene tương đồng 99% - Mẫu 31 có mối quan hệ gần với loài Planktothricoides raciborskii T1-6-2 với mức độ gene tương đồng 99%, với Phormidium cf aerugineo-coeruleum, Oscillatoriales cyanobacterium Alignment_Isolate4 Lyngbya hieronymusii N-929 với mức độ gene tương đồng 93% Dựa nghiên cứu trước đề tài nghiên cứu cho thấy diện chủng vi khuẩn lam có khả gây độc tố diện hồ Dầu Tiếng Định danh nhóm vi khuẩn lam So sánh hai cặp mồi CYA371F, 373R CYA-F, CYA-R dùng trog khuếch đại đoạn gene chủng 44 Đồ Án Tốt Nghiệp 4.2 Đề nghị Qua q trình nghiên cứu tìm hiểu thơng tin từ nghiên cứu nước giới loài vi khuẩn lam định danh ngồi chủng vi khuẩn lam cịn có chủng khác như: Gloeotrichia, Desmonostoc Arthronema Vì thời gian cịn hạn chế nên có nhiều phương pháp quy trình mà đồ án chưa tiến hành thử nghiệm hết được, cần có nghiên cứu sau:  Cần xác định mức độ diện nhóm vi khuẩn lam gây bệnh, nhằm có biện phát hạn chế phát triển chúng nguồn nước cấp sinh hoạt cho người dân  Khảo sát khả gây bệnh chủng vi khuẩn lam phân lập  Khảo sát khả gây độc tố chủng 45 Đồ Án Tốt Nghiệp TÀI LIỆU THAM KHẢO  Tiếng việt [1] Dương Đức Tiến, 1996 Phân loại vi khuẩn lam Việt Nam NXB Nơng nghiệp Hà Nội [2] Dương Thị Hồng Oanh, Vũ Ngọc Út Nguyễn Thị Kim Liên, 2011 Nghiên cứu khả xử lý nước thải tảo Spirulina platensis Kỷ yếu Hội nghị Khoa học Thủy sản lần IV Trường Đại học Cần Thơ, trang 15-27 [3] Đào Thanh Sơn, Bùi Bá Trung Đỗ Hồng Lan Chi, 2013 Đa dạng sinh học vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Hội nghị khoa học toàn quốc sinh thái tài nguyên sinh vật lần V Nxb Nông nghiệp, trang 660-665 [4] Đặng Ngọc Thanh, Hồ Thanh Hải, Dương Đức Tiến, Mai Đình Yên, 2002 Thủy sinh học thủy vực nước nội địa Việt Nam Nxb Khoa học Kỹ thuật, 399 trang [5] Nguyễn Lân Dũng, Nguyễn Đình Quyến Phạm Văn Ty, 2007 Vi sinh vật học Nxb Giáo dục, 519 trang [6] Đặng Đình Kim, Dương Thị Thủy 2014 Vi khuẩn lam độc nước Khoa học tự nhiên công nghệ, Hà Nội [7] Đào Thanh Sơn, Trần Trúc Ly, Phạm Thanh Lưu 2013 Nguy ngộ độc độc tố vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Tạp chí STINFO số 1&2: 52-53 [8] Đào Thanh Sơn, Lê Thái Hằng, Phạm Thanh Lưu 2013 Ảnh hưởng độc tố vi khuẩn lam từ hồ Dầu Tiếng Tạp chí STINFO số 7: 28-36 [9] Trần Cẩm Xô (chủ biên), Nguyễn Thị Lan (2005), Cơ sở di truyền công nghệ gen, Nhà xuất khoa học kỹ thuật Hà Nội  Tiếng nƣớc [10] Baxevanis, A.D and Ouellette, B.F.F., eds., Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, third edition Wiley, 2005 ISBN 0-471-47878-4 46 Đồ Án Tốt Nghiệp [11] Claverie, J.M and C Notredame, Bioinformatics for Dummies Wiley, 2003 ISBN 0-7645-1696-5 [12] World Health Organization (WHO), 1996 Guidelines for drinking water quality Volume World Health Organization, Geneva [13] Komárek J., Anagnostidis K., 2005 Cyanoprokaryota Teil: Oscillatoriales In Büdel, B., Gärtner, G., Krienitz, L., Schagerl, M (Eds): Süβwasserflora von Mitteleuropa 19/2: 1-759 Gustav Fischer Verlag Jena [14] Komárek J & Anagnostidis K 1999 Susswasserflora von Mitteleuropa,Cyanoprokaryota Teil: Chroococcales Gustav Fischer Verlag Jena 548p [15] Chorus I., J Bartram, 1999 Toxic cyanobacteria in water: A guide to their public health consequences, monitoring and management Published on behalf of WHO, Spon Press, London, 416 pp [16] Dao, T S., G Cronberg, J Nimptsch, L C Do-Hong, C Wiegand, 2010 Toxic cyanobacteria from Tri An Reservoir, Vietnam Nova Hedwigia, 90: 433–448 [17] Sivonen K., Niemela S I., Niemi R M., Lepisto L., Luoma T H & Rasanenl L A 1988 Toxic cyanobacteria (blue-green algae) in Finnish fresh and coastal waters Hydrobiologi 190: 267-275 [18] Suvi Suurnakki, Gonzalo V Gomez-Saez, Anne Rantala-Ylinen, Jouni Jokela, David P Fewer, Kaarina Sivonen 2014 Identification of geosmin and 2-methylisoborneol in cyanobacteria and molecular detection methods for the producers of these compounds Water research 68: 56-66 [19] Thanh-Luu Pham, Thanh-Son Dao, Kazuya Shimizu, Do-Hong Lan-Chi and Motoo Utsumi 2015 Isolation and characterization of microcystinproducing cyanobacteria from Dau Tieng Reservoir, Vietnam Nova Hedwigia 101: 1–2, 3–20 47 Đồ Án Tốt Nghiệp [20] Thanh-Luu Pham, Thanh-Son Dao, Ngoc-Dang Tran, Jorge Nimptsch, Claudia Wiegand and Utsumi Motoo 2016 Influence of environmental factors on cyanobacterial biomass and microcystin concentration in the Dau Tieng Reservoir, a tropical eutrophic water body in Vietnam Ann Limnol - Int J Lim (2016) 1–12 [21] Thanh-Son Dao, Jorge Nimptsch and Claudia Wiegand 2016 Dynamics of cyanobacteria and cyanobacterial toxins and their correlation with environmental parameters in Tri An Reservoir, Vietnam Journal of Water and Health 14.4: 699-712 [22] Duy T N., Paul K S Lam, Glen R Shaw, Des W Connell 2000 Toxicology and risk assessment of freshwater cyanobacterial (bluegreen algal) toxins in water, Rev Environ Contam Toxicol 163: 113 –186 [23] Ena Urbach, Deborah L Robertson, Sallie W Chisholm 1992 Multiple evolutionary origins of prochlorophytes within the cyanobacteria radiation Nature Publishing Group 355: 1-4 [24] Kitching IJ, Forey PL., Humphries CJ., Williams DM 1998 Clasdistics, the theory and practice of parsimony analysis Oxford University Press 228pp Occurrence of the toxic cyanobacterium (blue-green alga) Microcystis aeruginosa in Central China Arch Hydrobiol 114: 21-30 [25] Page, R.D.M., Holmes, E.C 1998 Molecular Evolution Blackwell Publishing 346pp [26] Salemi M., Vandamme A-M 2006 The phylogenetic handbook, a practical approach to DNA and protein phylogeny Cambridge University Press 398pp [27] Ye SQ 2008 Bioinformatics: A Practical Approach CRC Press, Taylor & Francis Group Amber Hotto, Mike Satchwell, Gregory Boyer 2005 Seasonal Production and Molecular Characterization of Microcystins in Oneida Lake, New York, USA Environ Toxicol 20: 243–248.Carmichael, W.W., Yu, M J., He, Z.R, He, J.W and Yu, J-L 1988 48 Đồ Án Tốt Nghiệp [28] Friedrich Jüttner, Susan B Watson 2007 Biochemical and Ecological Control of Geosmin and 2-Methylisoborneol in Source Waters Appl Environ Microbiol 73: 4395-4406 [29] Olga Savichtcheva, Didier Debroas, Rainer Kurmayer, Clement Villar, Jean Philippe Jenny, Fabien Arnaud, Marie Elodie Perga, and Isabelle Domaizon 2011 Quantitative PCR Enumeration of Total/Toxic Planktothrix rubescens and Total Cyanobacteria in Preserved DNA Isolated from Lake Sediments Appl Environ Microbiol Vol 77, No 24: 8744–8753.6 [30] Amber Hotto, Mike Satchwell, Gregory Boyer 2005 Seasonal Production and Molecular Characterization of Microcystins in Oneida Lake, New York, USA Environ Toxicol 20: 243–24 [31] Kurmayer, R., G Christiansen, and I Chorus 2003 The abundance of microcystin-producing genotypes correlates positively with colony size in Microcystis and determines its microcystin net production in Lake Wannsee Appl Environ Microbiol 69:787–795 [32] Cronberg G., H Annadotter, 2006 Manual on aquatic cyanobacteria: A photo guide and a synopsis of their toxicology Kerteminde Tryk A/S, 106 pp [33] Zhou J et al (1996) DNA recovery from soils of diverse composition, Applied and Environmental Microbiology, 62 (2), 316 – 322 [34] Jara C et al (2008) Analysis of several methods for the extration of high quality DNA from acetic acid bacteria in wine and vinegar for characterization by PCR-based methods, International Journal of Food Microbiology, 128 (2), 336 - 341 [35] Zhu H, Qu F, Zhu LH Isolation of genomic DNAs from plants, fungi and bacteria using benzyl chloride Nucleic Acids Res 1993; 21(22), 5279-80 [36] Haruta S (2002) Construction of a stable microbial community with high cellulose – degradation ability, Appl Microbiol Biotechnol, 59 (4), 529 – 534 [37] Tomoyukihori, Shin Haura, Yohiyuki Ueno, Masaharuishii, Yasuo Igarashi (2006) Direct comparinson 49 of singlesstand conformation Đồ Án Tốt Nghiệp polymorphism (SSCP) and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) to characterize a microbial community on the basis of 16S RNA gene fragment, Journal of Microbiological Methods, 66, 165 – 169 [38] Friedrich Jüttner, Susan B Watson 2007 Biochemical and Ecological Control of Geosmin and 2-Methylisoborneol in Source Waters Appl Environ Microbiol 73: 4395-4406  Tài liệu từ Internet [1] https://voer.edu.vn/c/vi-khuan-lam/9b2ffb8d/6b311bf8 [2] https://vi.wikipedia.org/wiki/Tin_sinh_h%E1%BB%8Dc [3]http://tailieu.vn/doc/bai-giang-tin-sinh-hoc-chuong-1-ths-nguyen-thanhluan-1672608.html 50 Đồ Án Tốt Nghiệp PHỤ LỤC A Hình ảnh trang thiết bị phục vụ nghiên cứu Máy li tâm lạnh MIKRO 220R Nguồn EC105 Bể điện di QS-710 Hộp đèn soi UV Uvintec Máy PCR sprint thermo Cycler Đồ Án Tốt Nghiệp B Kết so sánh trình tự 16S DNA loài vi khuẩn lam với ngân hàng gene NCBI Kết so sánh mẫu với chủng Microcystis aeruginosa LMECYA 147 trình tự đoạn gene 16S DNA Score Expect Identities Gaps Strand 1602 bits (867) 0.0 884/891(99%) 6/891(0%) Plus/Plus Query AATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGGGAGGAAGGTCTTT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 277 AATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGGGAGGAAGGTCTTT 336 Query 61 GGATTGTAAACCTCTTTTCTCAAGGAAGAAGTTCTGACGGTACTTGAGGAATCAGCCTCG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 337 GGATTGTAAACCTCTTTTCTCAAGGAAGAAGTTCTGACGGTACTTGAGGAATCAGCCTCG 396 Query 121 GCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGGGAGGCAAGCGTTATCCGGAATTATT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 397 GCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGGGAGGCAAGCGTTATCCGGAATTATT 456 Query 181 GGGCGTAAAGCGTCCGCAGGTGGTCAGCCAAGTCTGCCGTCAAATCAGGTTGCTTAACGA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 457 GGGCGTAAAGCGTCCGCAGGTGGTCAGCCAAGTCTGCCGTCAAATCAGGTTGCTTAACGA 516 Query 241 CCTAAAGGCGGTGGAAACTGGCAGACTAGAGATCAGTAGGGGTAGCAGGAATTCCCAGTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 517 CCTAAAGGCGGTGGAAACTGGCAGACTAGAGATCAGTAGGGGTAGCAGGAATTCCCAGTG 576 Query 301 TAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTGGGAAGAACATCGGTGGCGAAAGCGTGCTACTGGGCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 577 TAGCGGTGAAATGCGTAGAGATTGGGAAGAACATCGGTGGCGAAAGCGTGCTACTGGGCT 636 Query 361 GTATCTGACACTCAGGGACGAAAGCTAGGGGAGCGAAAGGGATTAGATACCCCTGTAGTC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 637 GTATCTGACACTCAGGGACGAAAGCTAGGGGAGCGAAAGGGATTAGATACCCCTGTAGTC 696 Query 421 CTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGCGTGGCTTGTATCGACCCGAGCCGTGCCGAAGCTA 480 Đồ Án Tốt Nghiệp |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 697 CTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGCGTGGCTTGTATCGACCCGAGCCGTGCCGAAGCTA 756 Query 481 ACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGGAATTGAC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 757 ACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGGAATTGAC 816 Query 541 GGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 817 GGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC 876 Query 601 CAAGACTTGACATGTCGCGAACCCTGGTGAAAGCTAGGGGTGCCTTCGGGAGCGCGAACA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 877 CAAGACTTGACATGTCGCGAACCCTGGTGAAAGCTAGGGGTGCCTTCGGGAGCGCGAACA 936 Query 661 CAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGGTTAAGTCCCGCAAC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 937 CAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT-GGGTTAAGTCCCGCAAC 995 Query 721 GAGCGCAACCCCTCGTTCTTAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGGGGACTCTAAGGAGACTGC 780 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 996 GAGCGCAA-CCCTCGTTCTTAGTTGCCAGCATTAAGTT GGGGACTCTAAGGAGACTGC 1052 Query 781 CGGTGACAAACCCGGAGGAAGGTGGGGGATGACGTCAAGTCAGCATGCCCCTTACGTCTT 840 |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1053 CGGTGACAAA-CCGGAGGAAGGT-GGGGATGACGTCAAGTCAGCATGCCCCTTACGTCTT Query 841 GGGCGACACACGTACTACAATAGTCGGGACAAAGGGCAGCGAACTCGCGAG 1110 891 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1111 GGGCGACACACGTACTACAATGGTCGGGACAAAGGGCAGCGAACTCGCGAG 1161 Kết so sánh mẫu 10 với chủng Anabaena ucrainica CHAB1431 trình tự đoạn gene 16S DNA Score Expect Identities Gaps Strand 1624 bits (879) 0.0 899/907(99%) 8/907(0%) Plus/Plus Đồ Án Tốt Nghiệp Query GGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAATACCGCGTG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 222 GGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAATACCGCGTG 281 Query 61 AGGGAGGAAGGCTCTTGGGTTGTAAACCTCTTTTCTCAGGGAAGaaaaaaaTGACGGTAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 282 AGGGAGGAAGGCTCTTGGGTTGTAAACCTCTTTTCTCAGGGAAGAAAAAAATGACGGTAC 341 Query 121 CTGAGGAATAAGCATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGATGCAAG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 342 CTGAGGAATAAGCATCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGATGCAAG 401 Query 181 CGTTATCCGGAATGATTGGGCGTAAAGGGTCCGCAGGTGGCATTGAAAGTCTGCTGTTAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 402 CGTTATCCGGAATGATTGGGCGTAAAGGGTCCGCAGGTGGCATTGAAAGTCTGCTGTTAA 461 Query 241 AGAGTTTGGCTCAACCAAATAAAAGCAGTGGAAACTACAAAGCTAGAGTTTGGTCGGGGC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 462 AGAGTTTGGCTCAACCAAATAAAAGCAGTGGAAACTACAAAGCTAGAGTTTGGTCGGGGC 521 Query 301 AGAGGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCAGGAAGAACACCAGTGGCGA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 522 AGAGGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCAGGAAGAACACCAGTGGCGA 581 Query 361 AGGCGCTCTGCTAGGCCGAGACTGACACTGAGGGACGAAAGCTAGGGGAGCGAATGGGAT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 582 AGGCGCTCTGCTAGGCCGAGACTGACACTGAGGGACGAAAGCTAGGGGAGCGAATGGGAT 641 Query 421 TAGATACCCCAGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGCGTAGCTCGTATCGACCC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 642 TAGATACCCCAGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGCGTAGCTCGTATCGACCC 701 Query 481 GAGCTGTGCCGGAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGCAGGCAACTGTGA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 702 GAGCTGTGCCGGAGCTAACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGCAGGCAACTGTGA 761 Query 541 AACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGATGC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 762 AACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGATGC 821 Đồ Án Tốt Nghiệp Query 601 AACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATGTCACGAATTCTGTGGAAACATAGGAGTGC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 822 AACGCGAAGAACCTTACCAAGGCTTGACATGTCACGAATTCTGTGGAAACATAGGAGTGC 881 Query 661 CTTAGGGAGCGTGAACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTG 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 882 CTTAGGGAGCGTGAACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTG 941 Query 721 GGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCGTTTTTTAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGGCA 780 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 942 GGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCG-TTTTTAGTTGCCAGCATTAAGTT-GGGCA 999 Query 781 CTCTAGAGAGACTGCCGGGTGACAAACCGGAGGAAGGGTGTGGGGATGACGTCAAGTCAG 840 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1000 CTCTAGAGAGACTGCC-GGTGACAAACCGGAGGAAG -GTGGGGATGACGTCAAGTCAG 1055 Query 841 CATGCCCCCTTTACGTCTTGGGCTACACACGTACTACAATGCTACGGACAAAGGGCAGCT 900 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1056 CATGCCCC TTACGTCTTGGGCTACACACGTACTACAATGCTACGGACAAAGGGCAGCT Query 901 ACACAGC 1113 907 ||||||| Sbjct 1114 ACACAGC 1120 Kết so sánh mẫu 29 với chủng Cylindrospermopsis catemaco CHAB148 trình tự đoạn gene 16S DNA Score Expect Identities Gaps Strand 1615 bits (874) 0.0 887/892(99%) 5/892(0%) Plus/Plus Query AATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAATACCGCGTGAGGGAGGAAGGCTCTT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 321 AATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCAATACCGCGTGAGGGAGGAAGGCTCTT 380 Query 61 GGGTCGTAAACCTCTTTTCTCAAGGAAGAAGAAAGTGACGGTACTTGAGGAATAAGCATC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 381 GGGTCGTAAACCTCTTTTCTCAAGGAAGAAGAAAGTGACGGTACTTGAGGAATAAGCATC 440 Đồ Án Tốt Nghiệp Query 121 GGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGATGCAAGCGTTATCCGGAATGAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 441 GGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGATGCAAGCGTTATCCGGAATGAT 500 Query 181 TGGGCGTAAAGGGTCTGCAGGTGGAACTGAAAGTCTGCTGTTAAAGAGTTTGGCTTAACC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 501 TGGGCGTAAAGGGTCTGCAGGTGGAACTGAAAGTCTGCTGTTAAAGAGTTTGGCTTAACC 560 Query 241 AAATAAAAGCGGTGGAAACTACAGAACTAGAGTGTGGTAGGGGCAAAAGGAATTCCTGGT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 561 AAATAAAAGCGGTGGAAACTACAGAACTAGAGTGTGGTAGGGGCAAAAGGAATTCCTGGT 620 Query 301 GTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCAGGAAGAACACCGGTGGCGAAAGCGTTTTGCTAGAC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 621 GTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCAGGAAGAACACCGGTGGCGAAAGCGTTTTGCTAGAC 680 Query 361 CATAACTGACACTGAGGGACGAAAGCTAGGGGAGCGAATGGGATTAGATACCCCAGTAGT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 681 CATAACTGACACTGAGGGACGAAAGCTAGGGGAGCGAATGGGATTAGATACCCCAGTAGT 740 Query 421 CCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGCGTGGCTTGTATCGACCCGAGCCGTGCCGGAGCT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 741 CCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGCGTGGCTTGTATCGACCCGAGCCGTGCCGGAGCT 800 Query 481 AACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGGAATTGA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 801 AACGCGTTAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGGAATTGA 860 Query 541 CGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 861 CGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTA 920 Query 601 CCAAGACTTGACATCCTGCGAATCCTGGTGAAAGCTGGGAGTGCCTTAGGGAGCGCAGAG 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 921 CCAAGACTTGACATCCTGCGAATCCTGGTGAAAGCTGGGAGTGCCTTAGGGAGCGCAGAG 980 Query 661 ACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAAC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 981 ACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAAC 1040 Đồ Án Tốt Nghiệp Query 721 GAGCGCAACCCTCGTTTTTTAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCG 780 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1041 GAGCGCAACCCTCG-TTTTTAGTTGCCAGCATTAAGTTGGGCACTCTAGAGAGACTGCCG 1099 Query 781 GTGACAAACCGGAGGAACGGTGAGGATGACGTCAAGTCAGCATGCCCCCTTACGTCTTGG 840 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1100 GTGACAAACCGGAGGAA-GGTGAGGATGACGTCAAGTCAGCATG-CCCCTTACGTCTTGG Query 841 GCTACCACACGTACTACAATGCTACGGACAGAGGGCAGCGAGCCAGGGTATG 1157 892 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1158 GCTA-CACACGTACTACAATGCTACGGACAGAGGGCAGCGAGCCAGGG-ATG 1207 Kết so sánh mẫu 31 với chủng Planktothricoides raciborskii T1-6-2 trình tự đoạn gene 16S DNA Score Expect Identities Gaps Strand 1443 bits (781) 0.0 804/815(99%) 1/815(0%) Plus/Plus Query CCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAAAGATCGGGAAGAACACCAGTGGCGAAAGCGCTCTA 61 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 549 CCCGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCGGGAAGAACACCAGTGGCGAAAGCGCTCTA 608 Query 62 CTGGACTGCAACTGACACTCAGGGACGAAAGCTAGGGGAACGAATGGGATTAAATACCCC 121 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct 609 CTGGACTGCAACTGACACTCAGGGACGAAAGCTAGGGGAGCGAATGGGATTAGATACCCC 668 Query 122 AGTAATCCTAACCGTAAACGATGGATACTAAGTGTTGTCTGTATCGACCCAGACAGTGCC 181 |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 669 AGTAGTCCTAGCCGTAAACGATGGATACTAGGTGTTGTCTGTATCGACCCAGACAGTGCC 728 Query 182 CCAGCTAACGCGATAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGG 241 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 729 GCAGCTAACGCGATAAGTATCCCGCCTGGGGAGTACGCACGCAAGTGTGAAACTCAAAGG 788 Query 242 AATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAATATGTGGTTTAATTCCATGCAACGCGAAAA 301 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 789 AATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGTATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAAA 848 Đồ Án Tốt Nghiệp Query 302 ACCTTACCAGGGCTTGACATGTCCCGAACCTCGCTGAAAGGTGAGGGTGCCTTCGGGAGC 361 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 ACCTTACCAGGGCTTGACATGTCGCGAACCTCGCTGAAAGGTGAGGGTGCCTTCGGGAGC 908 Query 362 GCGAACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC 421 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GCGAACACAGGTGGTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCC 968 Query 422 CGCAACGAGCGCAACCCTCGTTCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAGGGAGAC 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 CGCAACGAGCGCAACCCTCGTTCTTAGTTGCCATCATTCAGTTGGGCACTCTAGGGAGAC 1028 Query 482 TGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTACGTCC 541 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 TGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGCCCCTTACGTCC 1088 Query 542 TGGGCTACACACGTACTACAATGGGTGGGACAAAGGGCAGCGAACTCGCAAGAGCCAGCT 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 TGGGCTACACACGTACTACAATGGGTGGGACAAAGGGCAGCGAACTCGCAAGAGCCAGCT 1148 Query 602 AATCCCATAAACCCATCCTCAGTTCAGATTGCTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGGAGG 661 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 AATCCCATAAACCCATCCTCAGTTCAGATTGCTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGGAGG 1208 Query 662 AATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACGTTTCCCGGGCCTTGTACAC 721 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1209 AATCGCTAGTAATCGCAGGTCAGCATACTGCGGTGAATACG-TTCCCGGGCCTTGTACAC 1267 Query 722 ACCGCCCGTCACACCATGGAAGTTGGCCATGCCCGAAGTCATTACTCTAACCCCTCGGGG 781 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1268 ACCGCCCGTCACACCATGGAAGTTGGCCATGCCCGAAGTCATTACTCTAACCCCTCGGGG Query 782 AGGAGGATGCCGAAGGCAGGGCTGATGACTGGGGT 816 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1328 AGGAGGATGCCGAAGGCAGGGCTGATGACTGGGGT 1362 1327 ... trung định danh vùng gene 16S DNA chủng vi khuẩn lam Và đề tài khảo sát diện chủng vi khuẩn lam có khả gây độc tố hồ Dầu Tiếng Mục đích nghiên cứu Mục đích đề tài định danh vùng gene 16S DNA chủng. .. chủng vi khuẩn lam có khả gây độc tố Hồ Dầu Tiếng Nhiệm vụ nghiên cứu Phân lập số loài vi khuẩn lam hồ Dầu Tiếng Định danh vi khuẩn lam tới chi dựa theo hình thái học sinh học phân tử Khảo sát... 20 Đồ Án Tốt Nghiệp 1.3.7 Tình hình nghiên cứu vi khuẩn lam độc tố vi khuẩn lam 1.3.7.1 Tình hình nghiên cứu vi khuẩn lam độc tố vi khuẩn lam giới Tình hình nghiên cứu vi khuẩn lam độc tố chúng

Ngày đăng: 04/03/2021, 19:05

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
[2] Dương Thị Hoàng Oanh, Vũ Ngọc Út và Nguyễn Thị Kim Liên, 2011. Nghiên cứu khả năng xử lý nước thải của tảo Spirulina platensis. Kỷ yếu Hội nghị Khoa học Thủy sản lần IV. Trường Đại học Cần Thơ, trang 15-27 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nghiên cứu khả năng xử lý nước thải của tảo Spirulina platensis
[3] Đào Thanh Sơn, Bùi Bá Trung và Đỗ Hồng Lan Chi, 2013. Đa dạng sinh học vi khuẩn lam ở hồ Dầu Tiếng. Hội nghị khoa học toàn quốc về sinh thái và tài nguyên sinh vật lần V. Nxb Nông nghiệp, trang 660-665 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Đa dạng sinh học vi khuẩn lam ở hồ Dầu Tiếng
Nhà XB: Nxb Nông nghiệp
[4] Đặng Ngọc Thanh, Hồ Thanh Hải, Dương Đức Tiến, và Mai Đình Yên, 2002. Thủy sinh học ở các thủy vực nước ngọt nội địa Việt Nam. Nxb Khoa học và Kỹ thuật, 399 trang Sách, tạp chí
Tiêu đề: Thủy sinh học ở các thủy vực nước ngọt nội địa Việt Nam
Nhà XB: Nxb Khoa học và Kỹ thuật
[5] Nguyễn Lân Dũng, Nguyễn Đình Quyến và Phạm Văn Ty, 2007. Vi sinh vật học. Nxb Giáo dục, 519 trang Sách, tạp chí
Tiêu đề: Vi sinh vật học
Nhà XB: Nxb Giáo dục
[6] Đặng Đình Kim, Dương Thị Thủy. 2014. Vi khuẩn lam độc nước ngọt. Khoa học tự nhiên và công nghệ, Hà Nội Sách, tạp chí
Tiêu đề: Vi khuẩn lam độc nước ngọt
[7] Đào Thanh Sơn, Trần Trúc Ly, Phạm Thanh Lưu. 2013. Nguy cơ ngộ độc bởi độc tố vi khuẩn lam ở hồ Dầu Tiếng. Tạp chí STINFO số 1&2: 52-53 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nguy cơ ngộ độc bởi độc tố vi khuẩn lam ở hồ Dầu Tiếng
[8] Đào Thanh Sơn, Lê Thái Hằng, Phạm Thanh Lưu. 2013. Ảnh hưởng của độc tố vi khuẩn lam từ hồ Dầu Tiếng. Tạp chí STINFO số 7: 28-36 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Ảnh hưởng của độc tố vi khuẩn lam từ hồ Dầu Tiếng. Tạp chí STINFO
[9] Trần Cẩm Xô (chủ biên), Nguyễn Thị Lan (2005), Cơ sở di truyền và công nghệ gen, Nhà xuất bản khoa học và kỹ thuật Hà Nội. Tiếng nước ngoài Sách, tạp chí
Tiêu đề: Cơ sở di truyền và công nghệ gen
Tác giả: Trần Cẩm Xô (chủ biên), Nguyễn Thị Lan
Nhà XB: Nhà xuất bản khoa học và kỹ thuật Hà Nội.  Tiếng nước ngoài
Năm: 2005
[10] Baxevanis, A.D. and Ouellette, B.F.F., eds., Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, third edition. Wiley, 2005. ISBN 0-471-47878-4 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins
[11] Claverie, J.M. and C. Notredame, Bioinformatics for Dummies. Wiley, 2003. ISBN 0-7645-1696-5 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Bioinformatics for Dummies
[12] World Health Organization (WHO), 1996. Guidelines for drinking water quality. Volume 2. World Health Organization, Geneva Sách, tạp chí
Tiêu đề: Guidelines for drinking water quality
[13] Komárek J., Anagnostidis K., 2005. Cyanoprokaryota 1. Teil: Oscillatoriales. In Bỹdel, B., Gọrtner, G., Krienitz, L., Schagerl, M. (Eds):Süβwasserflora von Mitteleuropa. 19/2: 1-759. Gustav Fischer Verlag Jena Sách, tạp chí
Tiêu đề: Teil: "Oscillatoriales. In Bỹdel, B., Gọrtner, G., Krienitz, L., Schagerl, M. (Eds): Süβwasserflora von Mitteleuropa
[14] Komárek J. & Anagnostidis K. 1999. Susswasserflora von Mitteleuropa,Cyanoprokaryota. 1. Teil: Chroococcales. Gustav Fischer Verlag Jena. 548p Sách, tạp chí
Tiêu đề: Susswasserflora von Mitteleuropa,Cyanoprokaryota. 1. Teil: Chroococcales
[15] Chorus I., J. Bartram, 1999. Toxic cyanobacteria in water: A guide to their public health consequences, monitoring and management. Published on behalf of WHO, Spon Press, London, 416 pp Sách, tạp chí
Tiêu đề: Toxic cyanobacteria in water: A guide to their public health consequences, monitoring and management
[16] Dao, T. S., G. Cronberg, J. Nimptsch, L. C. Do-Hong, C. Wiegand, 2010. Toxic cyanobacteria from Tri An Reservoir, Vietnam. Nova Hedwigia, 90:433–448 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Toxic cyanobacteria from Tri An Reservoir, Vietnam
[17] Sivonen K., Niemela S. I., Niemi R. M., Lepisto L., Luoma T. H. & Rasanenl L. A.. 1988. Toxic cyanobacteria (blue-green algae) in Finnish fresh and coastal waters. Hydrobiologi 190: 267-275 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Toxic cyanobacteria (blue-green algae) in Finnish fresh and coastal waters
[18] Suvi Suurnakki, Gonzalo V. Gomez-Saez, Anne Rantala-Ylinen, Jouni Jokela, David P. Fewer, Kaarina Sivonen. 2014. Identification of geosmin and 2-methylisoborneol in cyanobacteria and molecular detection methods for the producers of these compounds. Water research 68: 56-66 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Identification of geosmin and 2-methylisoborneol in cyanobacteria and molecular detection methods for the producers of these compounds
[19] Thanh-Luu Pham, Thanh-Son Dao, Kazuya Shimizu, Do-Hong Lan-Chi and Motoo Utsumi. 2015. Isolation and characterization of microcystin- producing cyanobacteria from Dau Tieng Reservoir, Vietnam. Nova Hedwigia 101: 1–2, 3–20 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Isolation and characterization of microcystin-producing cyanobacteria from Dau Tieng Reservoir, Vietnam
[20] Thanh-Luu Pham, Thanh-Son Dao, Ngoc-Dang Tran, Jorge Nimptsch, Claudia Wiegand and Utsumi Motoo. 2016. Influence of environmental factors on cyanobacterial biomass and microcystin concentration in the Dau Tieng Reservoir, a tropical eutrophic water body in Vietnam. Ann. Limnol. - Int. J.Lim. 0 (2016) 1–12 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Influence of environmental factors on cyanobacterial biomass and microcystin concentration in the Dau Tieng Reservoir, a tropical eutrophic water body in Vietnam. Ann. Limnol
[21] Thanh-Son Dao, Jorge Nimptsch and Claudia Wiegand. 2016. Dynamics of cyanobacteria and cyanobacterial toxins and their correlation with environmental parameters in Tri An Reservoir, Vietnam. Journal of Water and Health 14.4: 699-712 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Dynamics of cyanobacteria and cyanobacterial toxins and their correlation with environmental parameters in Tri An Reservoir, Vietnam

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w