| Tài liệu tham khảo |
Loại |
Chi tiết |
| 1. Carpenter, B., Nehmé, R., Warne, T., Leslie, A. G. W. & Tate, C. G. Structure of the adenosine A2A receptor bound to an engineered G protein. Nature 1–15 (2016).doi:10.1038/nature18966 |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Nature |
| Tác giả: |
Carpenter, B., Nehmé, R., Warne, T., Leslie, A. G. W. & Tate, C. G. Structure of the adenosine A2A receptor bound to an engineered G protein. Nature 1–15 |
| Năm: |
2016 |
|
| 2. Katritch, V., Cherezov, V. & Stevens, R. C. Structure-function of the G protein- coupled receptor superfamily. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 53, 531–56 (2013) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol |
|
| 5. Velazquez-Campoy, A. et al. in Current Protocols in Cell Biology 17.8.1-17.8.24 (John Wiley & Sons, Inc., 2004). doi:10.1002/0471143030.cb1708s23 |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
et al." in "Current Protocols in Cell Biology |
|
| 6. Schuck, P. USE OF SURFACE PLASMON RESONANCE TO PROBE THE EQUILIBRIUM AND DYNAMIC ASPECTS OF INTERACTIONS BETWEEN BIOLOGICAL MACROMOLECULES. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 26, 541–566 (1997) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
USE OF SURFACE PLASMON RESONANCE TO PROBE THE EQUILIBRIUM AND DYNAMIC ASPECTS OF INTERACTIONS BETWEEN BIOLOGICAL MACROMOLECULES |
| Tác giả: |
P. Schuck |
| Nhà XB: |
Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. |
| Năm: |
1997 |
|
| 7. Gauthier, T. D., Shane, E. C., Guerin, W. F., Seitz, W. R. & Grant, C. L. Fluorescence quenching method for determining equilibrium constants for polycyclic aromatic hydrocarbons binding to dissolved humic materials. Environ. Sci. Technol. 20, 1162–1166 (1986) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Environ. Sci. Technol |
|
| 8. Hulme, E. C. & Trevethick, M. A. Ligand binding assays at equilibrium: validation and interpretation. Br. J. Pharmacol. 161, 1219–1237 (2010) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Br. J. Pharmacol |
|
| 9. Pollard, T. D. A guide to simple and informative binding assays. Mol. Biol. Cell 21, 4061–7 (2010) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
A guide to simple and informative binding assays |
| Tác giả: |
Pollard, T. D |
| Nhà XB: |
Mol. Biol. Cell |
| Năm: |
2010 |
|
| 10. Lelièvre, T., Rousset, M. & Stoltz, G. Free Energy Computations . (Imperial College Press, 2010). doi:10.1615/AtoZ.f.free_energy |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Free Energy Computations |
|
| 11. Kirkwood, J. G. Statistical mechanics of fluid mixtures. J. Chem. Phys. 3, 300–313 (1935) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Statistical mechanics of fluid mixtures |
| Tác giả: |
Kirkwood, J. G |
| Nhà XB: |
J. Chem. Phys. |
| Năm: |
1935 |
|
| 12. Zwanzig, R. Nonlinear generalized Langevin equations. J. Stat. Phys. 9, 215–220 |
Sách, tạp chí |
|
| 13. Kumar, S., Rosenberg, J. M., Bouzida, D., Swendsen, R. H. & Kollman, P. A. THE weighted histogram analysis method for free-energy calculations on biomolecules. I |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
THE weighted histogram analysis method for free-energy calculations on biomolecules |
| Tác giả: |
Kumar, S., Rosenberg, J. M., Bouzida, D., Swendsen, R. H., Kollman, P. A |
|
| 14. Jarzynski, C. Nonequilibrium Equality for Free Energy Differences. Phys. Rev. Lett.78, 2690–2693 (1997) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Nonequilibrium Equality for Free Energy Differences |
| Tác giả: |
Jarzynski, C |
| Nhà XB: |
Phys. Rev. Lett. |
| Năm: |
1997 |
|
| 15. Laio, A. & Parrinello, M. Escaping free-energy minima. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.99, 12562–12566 (2002) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Escaping free-energy minima |
| Tác giả: |
A. Laio, M. Parrinello |
| Nhà XB: |
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. |
| Năm: |
2002 |
|
| 16. Wang, F. & Landau, D. P. Efficient, multiple-range random walk algorithm to calculate the density of states. Phys. Rev. Lett. 86, 2050–2053 (2001) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Efficient, multiple-range random walk algorithm to calculate the density of states |
| Tác giả: |
Wang, F., Landau, D. P |
| Nhà XB: |
Phys. Rev. Lett. |
| Năm: |
2001 |
|
| 17. Christ, C. D., Mark, A. E. & van Gunsteren, W. F. Basic ingredients of free energy calculations: A review. J. Comput. Chem. 31, NA-NA (2009) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Basic ingredients of free energy calculations: A review |
| Tác giả: |
C. D. Christ, A. E. Mark, W. F. van Gunsteren |
| Nhà XB: |
J. Comput. Chem. |
| Năm: |
2009 |
|
| 18. Hornak, V. et al. Comparison of multiple amber force fields and development of improved protein backbone parameters. Proteins: Structure, Function and Genetics 65, 712–725 (2006) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
et al." Comparison of multiple amber force fields and development of improved protein backbone parameters. "Proteins: Structure, Function and Genetics |
|
| 19. Oostenbrink, C., Villa, A., Mark, A. E. & Van Gunsteren, W. F. A biomolecular force field based on the free enthalpy of hydration and solvation: The GROMOS force-field parameter sets 53A5 and 53A6. J. Comput. Chem. 25, 1656–1676 (2004) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
A biomolecular force field based on the free enthalpy of hydration and solvation: The GROMOS force-field parameter sets 53A5 and 53A6 |
| Tác giả: |
Oostenbrink, C., Villa, A., Mark, A. E., Van Gunsteren, W. F |
| Nhà XB: |
J. Comput. Chem. |
| Năm: |
2004 |
|
| 20. Huang, J. et al. CHARMM36m: an improved force field for folded and intrinsically disordered proteins. Nat Meth 14, 71–73 (2017) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
CHARMM36m: an improved force field for folded and intrinsically disordered proteins |
| Tác giả: |
Huang, J |
| Nhà XB: |
Nat Meth |
| Năm: |
2017 |
|
| 21. William L. Jorgensen, *, David S. Maxwell, and & Tirado-Rives, J. Development and Testing of the OPLS All-Atom Force Field on Conformational Energetics and |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Development and Testing of the OPLS All-Atom Force Field on Conformational Energetics |
| Tác giả: |
William L. Jorgensen, David S. Maxwell, Tirado-Rives, J |
|
| 22. Ramírez, C. L., Martí, M. A. & Roitberg, A. E. in Methods in Enzymology 578, 123–143 (2016) |
Sách, tạp chí |
| Tiêu đề: |
Methods in Enzymology |
|