Đăng ký
  1. Trang chủ
  2. » Giáo Dục - Đào Tạo

Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock

12 64 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

HDAC8 được xem là mục tiêu để phát triển các hoạt chất tác động trúng đích để chữa trị các bệnh liên quan đến HDAC8 trong tương lai, và việc phân tích những bất lợi của các cấu [r]

Ngày đăng: 27/01/2021, 16:50

Xem thêm:

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Hình 1: Cấu trúc chromatin và hoạt động phiên mã: (a) Enzyme HATs xúc tác cho quá trình acetyl hoá cho phép kích hoạt phiên mã; (b) Enzyme HDACs xúc tác quá trình deacetyl hoá dẫn đến ức chế - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 1 Cấu trúc chromatin và hoạt động phiên mã: (a) Enzyme HATs xúc tác cho quá trình acetyl hoá cho phép kích hoạt phiên mã; (b) Enzyme HDACs xúc tác quá trình deacetyl hoá dẫn đến ức chế (Trang 2)
Hình 2: Vorinostat (SAHA): a) Cấu trúc 2D của vorinostat; b) Cấu trúc hoạt động ức chế chung HDAC của vorinostat - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 2 Vorinostat (SAHA): a) Cấu trúc 2D của vorinostat; b) Cấu trúc hoạt động ức chế chung HDAC của vorinostat (Trang 3)
Bảng 1: Các loại HDAC8 ở người được kết tinh với các chất ức chế thông dụng trên kho dữ liệu Protein data bank - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Bảng 1 Các loại HDAC8 ở người được kết tinh với các chất ức chế thông dụng trên kho dữ liệu Protein data bank (Trang 3)
Hình 4: Enzyme HDAC8 mã 1T67 và ion Zn2+ - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 4 Enzyme HDAC8 mã 1T67 và ion Zn2+ (Trang 4)
Hình 3: Cấu trúc 3D ligand volinostat 2.2 Chuẩn bị enzyme - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 3 Cấu trúc 3D ligand volinostat 2.2 Chuẩn bị enzyme (Trang 4)
Hình 5: Quy trình docking phân tử sử dụng kết hợp AutoDock Vina và AutoDock 3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 5 Quy trình docking phân tử sử dụng kết hợp AutoDock Vina và AutoDock 3 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN (Trang 5)
Hình 6: (a) Kết quả tệp đầu ra docking mù bằng Autodock Vina; (b) Mô phỏng 9 ligand (đỏ, cam, vàng, lục, lam, chàm, tím, xám, xanh lơ) của kết quả docking mù và vùng tương tác trên enzyme; (c) - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 6 (a) Kết quả tệp đầu ra docking mù bằng Autodock Vina; (b) Mô phỏng 9 ligand (đỏ, cam, vàng, lục, lam, chàm, tím, xám, xanh lơ) của kết quả docking mù và vùng tương tác trên enzyme; (c) (Trang 6)
Hình 7: Tương tác của MS-344 với enzyme HDAC8 (1T67): (a) Các tương tác chính của MS-344 với các amino acid His143 (lục), Tyr100 (lam), Tyr306 (tím) và tạo phức với ion Zn2+ ; (b) Hình dạng túi - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 7 Tương tác của MS-344 với enzyme HDAC8 (1T67): (a) Các tương tác chính của MS-344 với các amino acid His143 (lục), Tyr100 (lam), Tyr306 (tím) và tạo phức với ion Zn2+ ; (b) Hình dạng túi (Trang 6)
Hình 8: Tương tác vorinostat trên enzyme HDAC8 (1T69): (a) Tương tác chính của vorinostat với amino acid Tyr306 (tím) và tạo phức với ion Zn2+; (b) Hình dạng túi liên kết của vorinostat trên - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 8 Tương tác vorinostat trên enzyme HDAC8 (1T69): (a) Tương tác chính của vorinostat với amino acid Tyr306 (tím) và tạo phức với ion Zn2+; (b) Hình dạng túi liên kết của vorinostat trên (Trang 7)
Hình 9: Kết quả docking vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock được hiển thị dưới dạng 3D, tương tác mạnh với các amino acid Phe207 (lam), Gly151 (cam), Met274 (lục), Asp178 (đỏ), - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 9 Kết quả docking vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock được hiển thị dưới dạng 3D, tương tác mạnh với các amino acid Phe207 (lam), Gly151 (cam), Met274 (lục), Asp178 (đỏ), (Trang 8)
Hình 10: Kết quả docking vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock, hiển thị các tương tác dưới dạng 2D - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 10 Kết quả docking vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock, hiển thị các tương tác dưới dạng 2D (Trang 8)
Hình 11: Vorinostat trên enzyme HDAC8 (1T67) dạng đặc khít: (a) Ligand vorinostat chui vào enzyme tương tác với tâm hoạt động; (b) Ảnh cắt ngang bên trong enzyme cho thấy ligand tương tác - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 11 Vorinostat trên enzyme HDAC8 (1T67) dạng đặc khít: (a) Ligand vorinostat chui vào enzyme tương tác với tâm hoạt động; (b) Ảnh cắt ngang bên trong enzyme cho thấy ligand tương tác (Trang 9)
Hình 12: Hình dạng túi liên kết của vorinostat trên enzyme HDAC8 (1T67) - Nghiên cứu tương tác của vorinostat với enzyme HDAC8 (1T67) bằng Autodock
Hình 12 Hình dạng túi liên kết của vorinostat trên enzyme HDAC8 (1T67) (Trang 9)

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w