Xác định kiểu gen của đa hình XRCC1 Arg399Gln được thực hiện bằng kỹ thuật PCR - RFLP và được xác nhận bằng kỹ thuật giải trình tự DNA. Kết quả cho thấy tỉ lệ phân bố các kiểu gen Gln/Gln, Arg/Gln, Arg/Arg ở nhóm bệnh lần lượt là 12,8%, 39,2%, 48,0% và ở nhóm chứng lần lượt là 5,6%, 36,0%, 58,4%.
TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC MỐI LIÊN QUAN GIỮA ĐA HÌNH NUCLEOTIDE ĐƠN XRCC1 ARG399GLN VỚI NGUY CƠ MẮC LUPUS BAN ĐỎ HỆ THỐNG Trần Tiến Đạt1, Trần Vân Khánh1, Tạ Thành Văn1, Nghiêm Trung Dũng2, Trần Huy Thịnh1, Trường Đại học Y Hà Nội, 2Bệnh viện Bạch Mai Nhiều chứng cho thấy tổn thương DNA có liên quan đến phát triển bệnh lupus ban đỏ hệ thống (SLE) XRCC1 protein đóng vai trò quan trọng chế sửa chữa cắt bỏ base (BER) Do đó, chúng tơi tập trung vào đa hình Arg399Gln gen XRCC1 tính nhạy cảm với SLE DNA tách chiết từ máu ngoại vi 125 bệnh nhân SLE 125 người khỏe mạnh Xác định kiểu gen đa hình XRCC1 Arg399Gln thực kỹ thuật PCR - RFLP xác nhận kỹ thuật giải trình tự DNA Kết cho thấy tỉ lệ phân bố kiểu gen Gln/Gln, Arg/Gln, Arg/Arg nhóm bệnh 12,8%, 39,2%, 48,0% nhóm chứng 5,6%, 36,0%, 58,4% Tỉ lệ alen Gln nhóm bệnh 32,4%, nhóm chứng 23,6% Tỷ suất chênh (OR) bệnh nhân SLE có kiểu gen Gln/Gln so với Arg/Gln Arg/Arg 2,47 (95%CI = 0,98 - 6,24; p = 0,049) OR alen 399Gln bệnh nhân SLE 1,55 (95% CI = 1,05 - 2,30, p = 0,029) Nghiên cứu xác nhận đa hình XRCC1 Arg399Gln làm tăng nguy mắc SLE Từ khóa: Lupus ban đỏ hệ thống, XRCC1, Arg399Gln, đa hình I ĐẶT VẤN ĐỀ Lupus ban đỏ hệ thống (SLE – Systemic Lupus Erythematosus) bệnh lý mơ liên kết có tổn thương nhiều quan hệ thống miễn dịch thể bị rối loạn, đặc trưng có mặt kháng thể kháng nhân nhiều tự kháng thể khác Tỷ lệ mắc SLE khác tùy theo nghiên giảm hệ thống sửa chữa DNA bệnh nhân SLE dẫn đến tích tụ đứt gãy DNA [4] Sự tích tụ đoạn DNA đứt gãy kết hợp với protein nhân tế bào hình thành kháng nguyên miễn dịch, gây sản sinh kháng thể đáp ứng tự miễn người nhạy cảm [5] cứu tác giả giới, từ 14 - 172 XRCC1 protein quan ca/100.000 dân [1] Bệnh chủ yếu gặp nữ trọng có vai trò quan trọng giới, đặc biệt độ tuổi sinh đẻ, tỷ lệ mắc bệnh đường sửa chữa cắt bỏ base (BER – Base nữ/nam 9/1 [2] Mặc dù sinh bệnh học excision repair) [6] Protein chịu trách SLE đến chưa hoàn toàn rõ ràng, nhiệm cho việc sửa chữa hiệu tổn bệnh có liên quan đến yếu tố di thương DNA gây oxy hoạt động, xạ truyền, hormon môi trường [3] ion hóa chất alkyl hóa [7] Mặc dù Một số nghiên cứu suy Địa liên hệ: Trần Huy Thịnh, Bộ mơn Hóa sinh, Trường Đại học Y Hà Nội XRCC1 khơng thể hoạt động enzym, có chức tương tác để điều phối hoạt động protein enzym khác máy BER, bao gồm: glycosylase, Email: tranhuythinh@hmu.edu.vn endonuclease (APE1), DNA polymerase β, Ngày nhận: 18/9/2018 ligase Poly (ADP-ribose) Polymerases Ngày chấp thuận: 11/10/2018 (PARP1 PARP2) [7; 8] 16 TCNCYH 115 (6) - 2018 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Gen XRCC1 có vị trí nằm nhiễm sắc thể 19q13.31 có 17 exon Mặc dù có 300 SNPs mô tả gen XRCC1, ba SNPs thường xuyên nghiên cứu là: Arg194Trp, Arg280His Arg399Gln [9] Trên giới có nhiều nghiên cứu cho thấy có mối liên quan SNP Arg399Gln gen XRCC1 với nguy mắc SLE bệnh tự miễn khác ung thư, tiền sử gia đình khơng có người mắc SLE Phương pháp 2.1 Thiết kế nghiên cứu: nghiên cứu bệnh – chứng Áp dụng cơng thức tính cỡ mẫu WHO nghiên cứu bệnh – chứng [13]: số bệnh ung thư Tuy nhiên, chủng tộc người khác nhau, nhà khoa học n = Z12−α /2 {1/ [p (1 − p )] + 1/ [p (1 − p )]} 1 [ln(1 − ε )] thu kết trái chiều [3; 10 - 12] 2 Việc xác định đa hình giúp tầm Dựa vào nghiên cứu Warchol T [3] lấy sốt SLE đối tượng có yếu tố nguy tỷ lệ cá thể mang alen Gln nhóm bệnh cơ, giúp bệnh nhân chẩn đốn sớm, p1 = 0,63 nhóm chứng p2 = 0,52 Lấy điều trị kịp thời, giảm biến chứng độ xác tương đối ε = 0,3, α = 0,05 tính cải thiện tiên lượng bệnh cỡ mẫu tối thiểu n = 123 đối tượng Tại Việt Nam chưa có nhiều nghiên cứu gen XRCC1 nói chung, SNP Arg399Gln bệnh nhân SLE nói riêng Do nghiên cứu thực nhằm mục đích xác định đa hình nucleotide đơn Arg399Gln gen XRCC1 bệnh nhân SLE tìm hiểu mối liên quan SNP với nguy mắc SLE nhóm Thực tế lựa chọn 125 bệnh nhân 125 người khỏe mạnh đạt đủ tiêu chí yêu cầu nghiên cứu 2.3 Thời gian địa điểm Nghiên cứu thực Trung tâm Nghiên cứu Gen - Protein, Trường Đại Học Y Hà Nội từ tháng 10/2017 đến tháng 8/2018 2.4 Quy trình kỹ thuật II ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP Đối tượng - Nhóm bệnh: 125 bệnh nhân SLE chẩn đoán điều trị Khoa Thận - Tiết niệu Bệnh viện Bạch Mai từ tháng 01/2014 đến tháng 02/2017 Lựa chọn bệnh nhân nam 2.4.1 Thu thập mẫu Lấy ml máu tĩnh mạch chống đông EDTA từ bệnh nhân nhóm chứng 2.4.2 Tách chiết DNA DNA từ máu toàn phần tách chiết theo Kit Promega nữ chẩn đoán xác định SLE theo tiêu Đo nồng độ độ tinh DNA chuẩn SLICC 2012, loại trừ bệnh nhân máy Nanodrop 2000c Nếu OD260nm/OD280nm = nhỏ 15 tuổi, không đủ thơng tin hồ 1,8 - 2,0 DNA coi tinh sơ bệnh án - Nhóm chứng: 125 người tình nguyện, xác định khỏe mạnh thơng qua đợt khám sức khỏe định kỳ, không mắc SLE, TCNCYH 115 (6) - 2018 2.4.3 Xác định kiểu gen kỹ thuật PCR – RFLP Khuếch đại vùng gen chứa SNP Arg399Gln gen XRCC1 kỹ thuật 17 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC PCR, cặp mồi sử dụng theo nghiên cứu Warchol T [3]: Mồi xuôi: 5’- ACC TTG TGC TTT CTC TGT GTC - 3’ Mồi ngược: 5’ - TAG TCT GCT GGC TCT GGG CT - 3’ NG_033799 gen XRCC1 GeneBank Xử lý phân tích số liệu Sử dụng phần mềm SPSS 22.0 để phân tích thống kê So sánh tỷ lệ dùng kiểm định χ2, tỷ suất chênh OR khoảng tin cậy 95% CI Các biến định lượng kiểm định phân Phản ứng PCR tiến hành với thể tích phối chuẩn Kolmogorov - Smirnov test 10 µl gồm: µl GoTaq Green Master Mix 2X, So sánh giá trị trung bình nhóm 0,2 µl mồi xi, 0,2 µl mồi ngược, µl DNA, T-student test (phân phối chuẩn) Mann- 3,6 µl H2O Chu trình nhiệt 94ºC - phút, 37 Whitney test (không theo phân phối chuẩn) chu kỳ (94ºC - 30s, 55ºC - 30s, 72ºC - 40s), So sánh giá trị trung bình nhóm 72ºC - phút, sản phẩm bảo quản ANOVA test (phân phối chuẩn) Kruskal 15ºC Wallis test (không theo phân phối chuẩn) Sản phẩm PCR điện di kiểm tra gel agarose 1,5%, sau ủ với enzym giới hạn NciI 37ºC - 16 Sản phẩm cắt enzym sau điện di gel agarose 2% để xác định kiểu gen Kiểm định có ý nghĩa thống kê p < 0,05 Đạo đức nghiên cứu Nghiên cứu tuân thủ chặt chẽ đạo đức nghiên cứu Y học Các đối tượng tham gia nghiên cứu hoàn toàn tự nguyện có Alen 399 Arg chứa trình tự nhận biết quyền rút lui khỏi nghiên cứu không muốn enzym NciI (CC↓SGG) bị cắt thành tham gia Các thông tin cá nhân đối tượng đoạn 378 bp 131bp Ở alen 399 Gln, nghiên cứu đảm bảo bí mật nucleotide G bị thay nucleotide A, làm trình tự nhận biết enzym nên khơng bị cắt giữ ngun kích thước 509 bp 2.4.4 Kỹ thuật giải trình tự gen Kỹ thuật giải trình tự gen tiến hành số mẫu nhằm đối chiếu kiểm tra lại kiểu gen thu từ kỹ thuật PCR – RFLP III KẾT QUẢ Đặc điểm chung nhóm nghiên cứu Kết cho thấy SLE chủ yếu gặp nữ với tỷ lệ nữ/nam = 8,6/1 Khơng có khác biệt có ý nghĩa thống kê độ tuổi trung bình Sản phẩm PCR sau tinh giải tỷ lệ giới tính nhóm bệnh nhóm trình tự trực tiếp máy ABI-3100 theo chứng Điều cho thấy nhóm bệnh phương pháp Sanger phân tích nhóm chứng lựa chọn tương đồng phần mềm CLC Main Workbench Kết tuổi giới, phù hợp với nghiên giải trình tự so sánh với trình tự chuẩn cứu bệnh – chứng (bảng 1) 18 TCNCYH 115 (6) - 2018 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Bảng Đặc điểm chung nhóm nghiên cứu Đặc điểm Nhóm bệnh (n = 125) Nhóm chứng (n = 125) p 30,14 ± 9,34 32,86 ± 11,20 0,071 X ± SD Tuổi Min – max Giới 15 58 15 66 n % n % Nữ 112 89,6 113 90,4 Nam 13 10,4 12 9,6 0,833 Kết phân tích kiểu gen đa hình Arg399Gln Sản phẩm PCR xử lý enzym cắt giới hạn NciI Sản phẩm cắt enzym sau điện di gel agarose 2% thu kết sau: M PCR (+) P101 P102 P103 P104 P105 P106 P107 P108 P109 - 509 bp 378 bp 131 bp Hình Hình ảnh điện di sản phẩm cắt enzym số mẫu bệnh M: Marker 100 bp; PCR: Sản phẩm PCR; (+): Đối chứng dương kiểu gen Arg/Arg; Kiểu gen Arg/Arg có vạch (mẫu P101, P102, P103, P106, P107, P108); Kiểu gen Arg/Gln có vạch (mẫu P104, P109); kiểu gen Gln/Gln có vạch (mẫu P105) Kết PCR – RFLP kiểu gen tương ứng kiểm tra lại kỹ thuật giải trình tự gen Hình Kết giải trình tự sản phẩm PCR tương ứng với kiểu gen XRCC1 bệnh nhân lupus ban đỏ hệ thống TCNCYH 115 (6) - 2018 19 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Kết hình cho thấy codon 399 gen XRCC1, nucleotide G cho ba mã hóa CGG, mã hóa cho acid amin Arg; nucleotide A cho ba mã hóa CAG, mã hóa cho acid amin Gln Kết giải trình tự gen bệnh nhân P101, P104, P105 hoàn toàn trùng khớp với kết PCR - RFLP Tiến hành kỹ thuật PCR - RFLP 125 mẫu bệnh 125 mẫu chứng, kết trình bày bảng 2: Bảng Đa hình nucleotide đơn Arg399Gln gen XRCC1 nhóm bệnh nhân SLE nhóm chứng Đa hình thái kiểu gen alen Nhóm bệnh Nhóm chứng (n = 125) (n = 125) p OR (95%CI) n % n % Arg/Arg 60 48,0 73 58,4 Arg/Gln 49 39,2 45 36,0 0,296 1,32 (0,78 - 2,25) Gln/Gln 16 12,8 5,6 0,030 2,78 (1,07 - 7,20) Tổ Arg/Arg + Arg/Gln 109 87,2 118 94,4 hợp Gln/Gln 16 12,8 5,6 kiểu Arg/Arg 60 48,0 73 58,4 gen Arg/Gln + Gln/Gln 65 52,0 52 41,6 Arg 169 67,6 191 76,4 Gln 81 32,4 59 23,6 Kiểu gen Alen 1,0 1,0 0,049 2,47 (0,98 - 6,24) 1,0 0,099 1,52 (0,92 - 2,51) 1,0 0,029 1,55 (1,05 - 2,30) Người mang kiểu gen Gln/Gln có nguy mắc SLE cao gấp 2,78 lần người mang kiểu gen Arg/Arg (p = 0,03) Người mang kiểu gen Gln/Gln có nguy mắc SLE cao gấp 2,47 lần người mang kiểu gen Arg/Gln Gln/Gln (p = 0,049) Tỷ lệ alen Gln nhóm bệnh cao so với nhóm chứng (p = 0,029), với OR = 1,55 nghĩa nguy phát triển bệnh SLE tăng lên 1,55 lần cho alen Gln Bảng Tuổi khởi phát bệnh trung bình bệnh nhân SLE phân bố kiểu gen XRCC1 SNP Arg399Gln Đa hình thái kiểu gen Kiểu gen n Tuổi khởi phát bệnh (năm) ± SD Arg/Arg 60 29,29 ± 9,45 Arg/Gln 49 28,99 ± 10,51 Gln/Gln 16 27,05 ± 7,96 p 0,671 Bệnh nhân mang kiểu gen Gln/Gln có tuổi khởi phát bệnh trung bình nhỏ nhất, sau đến Arg/Gln lớn Arg/Arg Tuy nhiên, khác biệt khơng có ý nghĩa thống kê (Kruskal Wallis test, p > 0,05) 20 TCNCYH 115 (6) - 2018 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC IV BÀN LUẬN biết đến có mối liên quan đến phát XRCC1 protein đóng vai trò quan trọng chế sửa chữa cắt bỏ base (BER), có chức tương tác để điều phối hoạt động protein enzym khác máy BER, giúp cho việc sửa chữa có hiệu tổn thương DNA gây tác động oxy hóa, xạ ion hóa alkyl hóa [6; 7] Arg399Gln SNP nghiên cứu nhiều gen XRCC1, triển nhiều bệnh ung thư bệnh tự miễn Nghiên cứu sử dụng kỹ thuật PCR - RFLP, đối chiếu kiểm tra kỹ thuật giải trình tự cho kết đáng tin cậy Tỷ lệ kiểu gen Gln/Gln, Arg/Gln nhóm chứng nghiên cứu chúng tơi 5,6% 36%, tỷ lệ alen Gln 23,6% phù hợp với sở liệu ENSEMBL (7/2018) dân tộc Đông Á (bảng 4) Bảng Tỷ lệ kiểu gen alen số dân tộc giới Dân tộc Tỷ lệ kiểu gen Tỷ lệ alen Gln Gln/Gln Arg/Gln Châu Phi 0,8% 20,6% 11,0% Đông Á 5,8% 36,7% 23,5% Châu Mỹ 9,8% 42,9% 31,3% Nam Á 12,3% 44,2% 34,4% Châu Âu 13,3% 46,5% 36,6% Từ bảng thấy tỷ lệ kiểu gen Warchol T cộng (2012) nghiên cứu alen đa hình Arg399Gln khác nhau, tùy thuộc chủng tộc vùng địa lý dân số Ba Lan với 265 mẫu bệnh SLE 360 mẫu chứng cho kết OR kiểu Tìm hiểu mối liên quan đa hình với khả mắc SLE, kết cho thấy người gen Gln/Gln so với Arg/Gln Arg/Arg 1,55 OR kiểu gen Gln/Gln Arg/Gln mang kiểu gen Gln/Gln có nguy mắc SLE cao gấp 2,47 lần người mang kiểu gen Arg/ so với kiểu gen Arg/Arg 1,55 OR alen Gln 1,41 [3] Gln Arg/Arg Tỷ lệ alen Gln nhóm Lin Y.J cộng (2009) nghiên cứu bệnh cao so với nhóm chứng, với OR = 1,55 nghĩa nguy phát triển bệnh SLE dân số Đài Loan Trung Quốc với 172 mẫu bệnh SLE, 160 mẫu chứng cho kết kiểu tăng lên 1,55 lần cho alen Gln Tuổi khởi phát bệnh trung bình tương ứng với kiểu gen dị hợp tử Arg/Gln yếu tố nguy với OR = 1,80, nhiên tần số Alen không khác gen so sánh, nhiên khác biệt khơng có ý nghĩa thống kê biệt nhóm [10] Tuy nhiên, nghiên cứu Salimi S (2014) Kết tương đối phù hợp Đông Nam Iran lại cho thấy nguy mắc với nhiều nghiên cứu cho alen 399Gln yếu tố nguy phát triển bệnh SLE thấp cá thể có kiểu gen Gln/ Gln Arg/Gln so với người có kiểu SLE gen Arg/Arg với tương ứng OR = 0,73 OR TCNCYH 115 (6) - 2018 21 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC = 0,44 (p = 0,001) Ngoài ra, tần số alen thuyết đa hình Arg399Gln ảnh Gln thấp đáng kể bệnh nhân SLE OR = 0,7 (p = 0,02) [11] hưởng đến khả sửa chữa DNA Phân tích cộng gộp Zhang M.Y ảnh hưởng tới khả tương tác công (2018) từ nghiên cứu giới XRCC1 với protein khác đường với 773 mẫu bệnh SLE 909 mẫu chứng BER cho kết khơng tìm thấy khác biệt có ý nghĩa thống kê tỷ lệ mắc SLE kiểu cách thay đổi cấu trúc miền BRCT1 V KẾT LUẬN gen alen Sau phân tầng theo Tỉ lệ phân bố kiểu gen Gln/Gln, Arg/ sắc tộc, mối quan hệ đáng kể đa hình Gln, Arg/Arg nhóm bệnh 12,8%, Arg399Gln SLE người Da trắng người 39,2%, 48,0% nhóm chứng châu Á quan sát Những phát 5,6%, 36,0%, 58,4% Tỉ lệ alen Gln nhóm gợi ý alen 399 Gln yếu bệnh 32,4%, nhóm chứng 23,6% tố nguy mắc SLE người châu Á (Gln so với Arg: OR = 1,40, 95%CI = 1,14 - 1,73, alen Gln yếu tố bảo vệ người Da trắng (Gln so với Arg: OR = 0,77, 95%CI = 0,63 - 0,94, Gln so với Arg/Gln+Arg/Arg: OR = 0,73, 95%CI = 0,55 - 0,95) Lý giải đa hình gen lại đóng vai trò khác nhóm dân tộc khác nhau, tác Người mang kiểu gen Gln/Gln có nguy mắc SLE cao gấp 2,47 lần kiểu gen Arg/Gln Arg/Arg (p = 0,049) Tỷ lệ alen Gln nhóm bệnh cao so với nhóm chứng (p = 0,029), với OR = 1,55 nghĩa nguy phát triển bệnh SLE tăng lên 1,55 lần cho alen Gln Lời cảm ơn giả cho rằng, bệnh tự miễn phức tạp đa yếu tố, gây tương tác yếu tố di truyền môi trường Tương tác môi trường gen quần thể khác không giống nhau, phần bị ảnh hưởng nguồn gốc mơi trường khác [12] Tính đa hình Arg399Gln nằm trung tâm miền BRCT1 protein XRCC1, liên quan đến chức PARP1, PARP2 APE1 [14] Monaco S cộng (2007) kỹ thuật động học phân tử thay acid amin Arg thành Gln vị trí codon 399 tạo thay đổi quan trọng cấu trúc miền BRCT1, bao gồm cấu trúc bậc II nếp gấp β, đặc biệt cấu trúc xoắn α đóng vai trò Nhóm nghiên cứu xin trân trọng gửi lời cảm ơn tới khoa Thận Tiết niệu - Bệnh viện Bạch Mai; Trung tâm Nghiên cứu Gen Protein, Trường Đại học Y Hà Nội hỗ trợ tạo điều kiện giúp đỡ trình nghiên cứu TÀI LIỆU THAM KHẢO Wallace D.J (2014) Lupus: the essential clinician’s guide, Oxford University Press, Oxford; New York Boodhoo K.D., Liu S., and Zuo X (2016) Impact of sex disparities on the clinical manifestations in patients with systemic lupus erythematosus: A systematic review and meta quan trọng tương tác protein- -analysis Medicine, 95(29), e4272 Warchoł T., Mostowska A., Lianeri protein [15] Những kết hỗ trợ cho giả M et al (2012) XRCC1 Arg399Gln Gene 22 TCNCYH 115 (6) - 2018 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Polymorphism and the Risk of Systemic Lupus gene XRCC1 and associations with systemic Erythematosus in the Polish Population DNA lupus erythematosus risk in the Taiwanese and Cell Biology, 31(1), 50 - 56 Han Chinese population Lupus, 18(14), 1246 –1251 Herrick A.L., Rafferty J.A., Margison G.P (1995) DNA repair deficiency in systemic lupus erythematosus; cause or consequence of disease and implications for management Arg399Gln and Arg194Trp Polymorphisms Lupus, 4(6), 423 - 424 and Risk of Systemic Lupus Erythematosus in Lee K.J., Dong X., Wang J et al (2002) Identification of Human Autoantibodies to the an Iranian Population: A Pilot Study BioMed DNA Ligase IV/XRCC4 Complex and Mapping of an Autoimmune Epitope to a Potential Regulatory Region The Journal of Immunology, 169(6), 3413 - 3421 Hung R.J (2005) Genetic Polymorphisms in the Base Excision Repair Pathway and Cancer Risk: A HuGE Review American 11 Salimi S., Mohammadoo-khorasani M., Tabatabai E et al (2014) XRCC1 Research International, 2014, – 12 Zhang M.Y., Yang X.K., Lv T.T et al (2018) Meta-analysis of associations between XRCC1 gene polymorphisms and susceptibility to systemic lupus erythematosus and rheumatoid arthritis International Journal of Rheumatic Diseases, 21(1), 179 - 185 13 Lwanga S.K and Lemeshow S Journal of Epidemiology, 162(10), 925 - 942 Caldecott K.W (2003) XRCC1 and DNA strand break repair DNA Repair (Amst), studies: a practical manual, World Health 2(9), 955 - 969 Organization, Geneva (1991) Sample size determination in health Lindahl T and Wood R.D (1999) 14 Vidal A.E (2001) XRCC1 coordinates Quality control by DNA repair Science, 286 (5446), 1897 - 1905 the initial and late stages of DNA abasic site De Azevedo Silva Sandrin-Garcia P et al Lupus Erythematosus: Susceptibility Genes EMBO Journal, 20(22), 6530- 6539 J., Addobbati C., (2014) Systemic Old and New versus Clinical Manifestations Current Genomics, 15(1), 52 - 65 10 Lin Y.J., Wan L., Huang C.M et al (2009) Polymorphisms in the DNA repair repair through protein-protein interactions The 15 Monaco R., Rosal R., Dolan M.A et al (2007) Conformational effects of a common codon 399 polymorphism on the BRCT1 domain of the XRCC1 protein Protein J, 26 (8), 541 - 546 Summary ASSOCIATION BETWEEN XRCC1 ARG399GLN SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM AND RISK OF SYSTEMIC LUPUS RYTHEMATOSUS Evidence suggests that DNA damage is implicated in the development of systemic lupus erythematosus (SLE) XRCC1 is one of the proteins that plays a vital role in the BER pathway The focus of this study was on the association of the XRCC1 Arg399Gln polymorphism with the incidence of SLE Genomic DNA was extracted from the peripheral blood of 125 SLE patients and 125 healthy controls Genotyping of the XRCC1 Arg399Gln polymorphism was performed by PCR TCNCYH 115 (6) - 2018 23 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC – RFLP and confirmed by DNA sequencing In the SLE group, the genotypic frequencies were 12.8% Gln/Gln, 39.2% Arg/Gln, 48.0% Arg/Arg The genotypic frequencies in the control group were 5.6% Gln/Gln, 36.0% Arg/Gln and 58.4% Arg/Arg The frequency of the allele Gln in SLE patients is 32.4%, whereas the frequency in the control group is 23.6% The odds ratio (OR) for SLE patients with the Gln/Gln versus Arg/Gln or Arg/Arg genotypes was 2.47 (95%CI = 0.98 6.24; p = 0.049) The OR for the 399Gln allele in patients with SLE was 1.55 (95% CI = 1.05 2.30, p = 0.029) Our study shows that the XRCC1 Arg399Gln polymorphism may increase the risk of developing SLE Key words: Systemic lupus erythematosus, XRCC1, Arg399Gln, polymorphism 24 TCNCYH 115 (6) - 2018 ... XRCC1 nói chung, SNP Arg399Gln bệnh nhân SLE nói riêng Do nghiên cứu thực nhằm mục đích xác định đa hình nucleotide đơn Arg399Gln gen XRCC1 bệnh nhân SLE tìm hiểu mối liên quan SNP với nguy mắc. .. gen Hình Kết giải trình tự sản phẩm PCR tương ứng với kiểu gen XRCC1 bệnh nhân lupus ban đỏ hệ thống TCNCYH 115 (6) - 2018 19 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Kết hình cho thấy codon 399 gen XRCC1, nucleotide. .. nghiên cứu alen đa hình Arg399Gln khác nhau, tùy thuộc chủng tộc vùng địa lý dân số Ba Lan với 265 mẫu bệnh SLE 360 mẫu chứng cho kết OR kiểu Tìm hiểu mối liên quan đa hình với khả mắc SLE, kết