Luận án được nghiên cứu với mục tiêu nhằm đánh giá khả năng lai tự nhiên giữa Yến đảo với Yến nhà, tạo cơ sở khoa học cho đề xuất các biện pháp bảo tồn quần thể Yến đảo. Nghiên cứu một số đặc điểm sinh học, sinh thái của Yến nhà, kết hợp với các nghiên cứu đa dạng di truyền tạo cơ sở khoa học để phát triển bền vững, hiệu quả nghề nuôi chim yến ở nước ta.
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT - HỒ THỊ LOAN ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA LOÀI CHIM YẾN Aerodramus fuciphagus Ở VIỆT NAM VÀ MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC SINH THÁI CỦA CHIM YẾN LÀM TỔ TRONG NHÀ Chuyên ngành: Động vật học Mã số: 42 01 03 TÓM TẮT LUẬN ÁN TIẾN SỸ SINH HỌC Hà Nội, 2018 Cơng trình hồn thành tại: Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật - Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam Người hướng dẫn khoa học 1: TS Đặng Tất Thế Người hướng dẫn khoa học 2: PGS TS Nguyễn Lân Hùng Sơn Phản biện 1: PGS TS Lê Đình Thủy Phản biện 2: PGS TS Nguyễn Huy Hoàng Phản biện 3: PGS TS Đồng Thanh Hải Luận án bảo vệ trước Hội đồng đánh giá luận án tiến sĩ cấp Viện, họp Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật - Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam vào hồi … ’, ngày … tháng…… năm 2018 Có thể tìm hiểu luận án tại: - Thư viện Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật - Thư viện Quốc gia Việt Nam MỞ ĐẦU Tính cấp thiết đề tài Loài chim Yến tổ trắng (Aerodramus fuciphagus, Thunberg, 1812, họ Apodidae, Apodiformes) phân bố khu vực Đông Nam Á, đảo Hải Nam (Trung Quốc), đảo Nicobar Adaman (Ấn Độ) Trong tự nhiên, nhiều quần thể Yến tổ trắng làm tổ hang đảo (Yến đảo) đất liền Những năm cuối kỷ 19 đầu kỷ 20, số nước Indonesia, Malaysia Thái Lan, xuất nhiều quần thể Yến tổ trắng làm tổ nhà cơng trình xây dựng đất liền (Yến nhà) Do tổ Yến định giá cao thị trường, nên người ta xây dựng nhà yến, dùng nhiều biện pháp kỹ thuật để dụ chúng đến sinh sống nhằm khai thác tổ đạt hiệu kinh tế cao, Ở Việt Nam, trước có quần đàn Yến đảo làm tổ lâu đời hang động tự nhiên đảo ven biển thuộc tỉnh từ Quảng Bình đến thành phố Vũng Tàu, năm 2003 xuất khoảng 2.000 Yến nhà đến sinh sống 10 nhà thuộc bảy thành phố Tuy Yến nhà xuất nuôi phát triển nhanh, đến có 2.000 nhà yến trải dài hầu hết tỉnh ven biển từ Hải Phòng đến Cà Mau Việc xuất quần đàn Yến nhà đặt nhiều thách thức việc bảo tồn nguồn gen sinh tồn, phát triển quần thể Yến đảo lâu đời nước ta Vì Yến đảo Yến nhà có sai khác khơng nhiều hình thái di truyền, xếp vào hai phân lồi lồi Aerodramus fuciphagus, chúng cạnh tranh thức ăn, vùng hoạt động , đặc biệt chúng có khả giao phối với nhau, tạo lai, làm thay đổi đặc điểm di truyền thích nghi lâu đời với môi trường địa quần thể Yến đảo nước ta Sự xuất quần thể Yến nhà nước ta đặt số vấn đề vị trí phân loại, nguồn gốc địa lý trước di cư đến nước ta, đặc điểm sinh học, sinh thái sinh sống môi trường Yến đảo, …, đặc biệt chúng có khả hỗn giao với quần thể Yến đảo hay khơng? Tìm hiểu giải số vấn đề tạo sở khoa học cho việc phát triển bền vững, hiệu nghề nuôi Yến nhà bảo tồn tính độc đáo nguồn gen quần thể Yến đảo địa Để góp phần tìm hiểu giải số vấn đề nêu trên, tiến hành đề tài nghiên cứu: “Đa dạng di truyền loài Chim yến Aerodramus fuciphagus Việt Nam số đặc điểm sinh học, sinh thái Chim yến làm tổ nhà” Mục tiêu nghiên cứu Khảo sát, so sánh, đánh giá đa dạng hình thái di truyền quần thể Yến đảo Yến nhà Việt Nam, nhằm xác định vị trí phân loại chúng nguồn gốc địa lý Yến nhà Đánh giá khả lai tự nhiên Yến đảo với Yến nhà, tạo sở khoa học cho đề xuất biện pháp bảo tồn quần thể Yến đảo Nghiên cứu số đặc điểm sinh học, sinh thái Yến nhà, kết hợp với nghiên cứu đa dạng di truyền tạo sở khoa học để phát triển bền vững, hiệu nghề nuôi chim yến nước ta Nội dung nghiên cứu Thu thập mẫu Yến đảo Yến nhà, phân loại mẫu cho nghiên cứu hình thái, phân tích di truyền lai Yến nhà Yến đảo Thiết kế thực kỹ thuật nghiên cứu di truyền, sinh học, sinh thái thực địa phòng thí nghiệm 2 So sánh đặc điểm hình thái, phân tích mối quan hệ phát sinh chủng loại Yến đảo Yến nhà sở số liệu di truyền, nhằm đánh giá đa dạng di truyền phân hóa quần thể Yến đảo, Yến nhà Phân tích mối quan hệ phát sinh chủng loại Yến đảo Yến nhà với quần thể chim yến có quan hệ gần gũi khác, nhằm xác định vị trí phân loại chúng nguồn gốc địa lý Yến nhà Việt Nam Đánh giá lai tự nhiên quần thể Yến đảo Yến nhà sở phân tích số liệu hình thái di truyền Nghiên cứu số đặc điểm sinh học, sinh thái Yến nhà tập tính kiếm ăn, tập tính sinh sản (làm tổ, đẻ trứng, ni con), âm dội âm xã hội Yến nhà Ý nghĩa luận án Ý nghĩa khoa học: Luận án tiến hành nghiên cứu có hệ thống đặc điểm hình thái mối quan hệ di truyền quần thể chim yến thuộc loài Aerodramus fuciphagus Việt Nam vùng phân bố loài, để giải câu hỏi phân loại Yến đảo Yến nhà, nguồn gốc quần đàn Yến nhà, đồng thời cung cấp số dẫn liệu sinh học Yến nhà Lần đầu tiên, luận án xác định số liệu di truyền Yến đảo Yến nhà, phân tích, đánh giá đa dạng di truyền chúng đặc biệt ghi nhận lai hai quần thể Yến đảo Yến nhà Ý nghĩa thực tiễn: Đề tài cung cấp nhiều số liệu di truyền quần đàn Yến đảo Yến nhà, đánh giá khả lai tạp chúng số đặc điểm sinh học, sinh thái Yến nhà, tạo sở khoa học để đưa biện pháp bảo tồn quần thể Yến đảo sống tự nhiên phát triển bền vững, hiệu đàn Yến nhà Những đóng góp luận án Luận án xây dựng sở liệu di truyền, trình tự ADN số gen ty thể gen nhân từ nhiều mẫu quần thể Yến đảo Yến nhà nước ta Kết hợp phân tích đặc điểm hình thái di truyền quần thể Yến đảo Yến nhà để giải vấn đề vị trí phân loại, đồng thời đánh giá đa dạng di truyền chúng Các phân tích tạo sở khoa học để xác định Yến đảo Yến nhà hai phân loài riêng biệt (Aerodramus fuciphagus germani A f amechanus), Yến nhà có tạp giao với quần thể chim yến có khác biệt lớn di truyền Lần sử dụng kết hợp đặc điểm hình thái, thị di truyền phân tử ADN để ghi nhận Yến đảo di trú vào quần đàn Yến nhà, chưa gặp trường hợp ngược lại Kết phân tích di truyền cho thấy Yến nhà quần thể lai tạp trước di trú vào Việt Nam Luận án cung cấp thông tin tập tính sinh sản, kiếm ăn, âm dội, âm xã hội Yến nhà Đã phát triển số kỹ thuật phân tử PCR-RFLP, PCR đặc hiệu gen giới tính để để định danh xác định giới tính chim yến CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tình hình nghiên cứu chim yến giới 1.1.1 Về vấn đề phân loại chim yến Còn tồn nhiều vấn đề phân loại chim yến nhiều bậc phân loại giống Aerodramus, chúng có nhiều đặc điểm tương đồng, có nhiều biến dị hình thái Lồi chim Yến tổ trắng (Aerodramus fuciphagus) cơng nhận có nhiều phân lồi, có nhiều điểm chưa thống nhất, nên danh pháp khoa học phân lồi có nhiều thay đổi Chantler et al., 1999 ghi nhận Chim yến tổ trắng có phân lồi - A f vestitus, A f dammermani, A f micans, A f fuciphagus, A f perplexus A f germani, A f amechanus A f inexpectatus, Cranbrook et al (2013) xếp phân loài A f germani A f amechanus vào loài với tên loài A germani 1.1.2 Nghiên cứu di truyền Do đặc điểm hình thái khơng đủ để phân loại chim yến, nên nhiều tác giả phân tích phát sinh chủng loại dựa tiến hóa trình tự ADN (các gen Cytb, 12S rRNA Fib7), kết hợp với đặc điểm sinh học, sinh thái, khả sử dụng âm dội, để giải vị trí phân loại nhiều giống, loài Họ Yến, có giống lồi Yến tổ trắng Aerodramus fuciphagus Sự xuất mở rộng đàn Yến nhà đặt câu hỏi nguồn gốc tự nhiên đặc điểm sinh học, sinh thái di truyền chúng Các nghiên cứu giới chưa xác định chắn nguồn gốc hình thành đàn Yến nhà, ghi nhận nhiều biến dị hình thái đặc điểm di truyền thể quần đàn Yến nhà hình thành từ nhiều quần thể tự nhiên có khác biệt lớn di truyền 1.1.3 Nghiên cứu đặc điểm sinh học, sinh thái Chim yến tự nhiên sinh sản theo mùa có thay đổi lớn phụ thuộc vào điều kiện khí hậu vùng, thời tiết năm, chúng thường có khoảng thời gian ngừng sinh sản Yến nhà làm tổ quanh năm, nhiên theo tự nhiên, tỷ lệ làm tổ sinh đẻ cao nhiều theo mùa sinh sản Chim yến sử dụng âm dội để định vị vật cản, dò đường, tìm tổ bong tối âm xã hội để giao tiếp, tần số âm chúng phát doa động từ 1.6 - 9.76 kHz, ngưỡng nghe người Âm dội âm xã hội đặc trưng lồi đặc điểm có giá trị cao phân loại học 1.2 Nghiên cứu chim yến Việt Nam 1.2.1 Về vấn đề phân loại Có nhiều thay đổi, chủ yếu thay đổi danh pháp khoa học loài phân loài theo thay đổi nghiên cứu giới 1.2.2 Nghiên cứu di truyền Phân tích phả hệ trình tự ADN thuộc Hệ gen ty thể (gen Cytb) ghi nhận Yến nhà Yến đảo nước ta 02 phân loài khác nhau, việc định danh Yến nhà thuộc phân lồi chưa thống chúng từ nơi khác di trú vào Việt Nam 1.2.3 Nghiên cứu đặc điểm sinh học, sinh thái Yến đảo Việt Nam sống thành đàn lớn, chúng bắt đầu làm tổ vào tháng 12 hàng năm, thời gian làm tổ đàn khoảng tháng Trong mùa sinh sản, Yến đảo làm tổ lần không bị khai thác tổ, làm tổ nhiều lần bị khai thác tổ, ngưng làm tổ từ cuối tháng đến tháng 11 Yến đảo đẻ trứng lứa vào khoảng tháng tháng 7, đàn đẻ trứng tập trung khoảng tuần Yến nhà làm tổ quanh năm, từ tháng 10 đến tháng 12 chúng làm tổ tháng khác không đẻ trứng vào thời gian Tập tính kiếm ăn Chim yến kiếm ăn với đàn đông, sau tách thành đàn nhỏ, thời gian rời nơi kiếm ăn trở phụ thuộc lớn vào nhiệt độ môi trường Điều kiện nhiệt độ, độ ẩm, ánh sáng Nhiệt độ hang Yến đảo tỉnh Khánh Hòa biến đổi biên độ từ 19 0C - 340C, độ ẩm trung bình dao động lớn, từ 65 % 90 %, cường độ ánh sáng nhỏ 50 lux 1.3 Hiện tượng lai tự nhiên Sử dụng thị di truyền Hệ gen ty thể Hệ gen nhân, nghiên cứu giới ghi nhận số loài chim kết lai loài sẻ Passer italiae kết lai loài P domesticus P hispaniolensis, Ở Việt Nam ghi nhận lồi Gà lơi lam mào đen (Lophura imperial) lai lồi Gà lơi trắng (L nycthemera) gà lôi lam mào trắng (L edwardsi) Mặc dù ghi nhận mẫu lai loài A lowi A maximus, nghiên cứu lai thị di truyền chim yến gần khơng có CHƯƠNG ĐỊA ĐIỂM, THỜI GIAN VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 2.1.1 Thời gian Nghiên cứu tiến hành từ năm 2012 đến năm 2017, thực đợt khảo sát Yến nhà, đợt khảo sát kéo dài 10 ngày 2.1.2 Địa điểm Thu mẫu Yến đảo đảo thuộc tỉnh Quảng Nam, Bình Định, Khánh Hòa nhà đảo tỉnh Bình Định, thu mẫu Yến nhà TP Hải Phòng, tỉnh Thanh Hóa, Quảng Nam, Bình Định, Khánh Hòa, Phú n, Bình Dương, TP Hồ Chí Minh, Kiên Giang Thực nghiên cứu di truyền Phòng Hệ thống học phân tử Di truyền bảo tồn, Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật Nghiên cứu sinh học, sinh thái Yến nhà thực sở nuôi yến tỉnh Khánh Hòa Quảng Nam 2.2 Phương pháp nghiên cứu 2.2.1 Thu mẫu Mẫu cho nghiên cứu hình thái Bắt thả 30 cá thể Yến nhà TP Nha Trang, gồm mẫu có ký hiệu từ NKH1 đến NKH30, 30 cá thể Yến đảo có ký hiệu từ DKH1 đến DKH30 để quan sát đặc điểm hình thái Mẫu cho nghiên cứu di truyền Thu lông cánh từ cá thể Yến đảo Yến nhà bắt thả nêu mẫu vật đánh số kí hiệu theo địa điểm thu mẫu bảo quản ethanol 96%, giữ nhiệt độ -20°C phòng thí nghiệm Lựa chọn 107 mẫu (50 mẫu Yến đảo, 57 mẫu Yến nhà), đại diện cho quần đàn khác để phân tích trình tự gen Cytb, 95 mẫu (49 mẫu Yến đảo, 46 mẫu Yến nhà) để phân tích trình tự gen CHD1Z, sử dụng 03 mẫu (DBD3, NBD3, NBD2) để khảo sát gen MCR1 2.2.2 Phương pháp nghiên cứu hình thái học Đo kích thước phận thể chim yến theo Võ Quý (1975) 2.2.3 Phương pháp nghiên cứu ADN Đã tự thiết kế sử dụng số cặp mồi dùng kỹ thuật PCR để nhân gen đích phục vụ nghiên cứu, bao gồm gen nhân gen ty thể Giải trình tự gen đích sử dụng hóa chất qui trình kèm theo Phân tích số liệu di truyền, xây dựng phát sinh chủng loại, sử dụng phần mềm chuyên dụng Microsoft Excel 2010, BLAST, Modeltest v3.7, DnaSP 5.10.01 MEGA 6.0.6, PAUP v4.0, MrBayes v3.1.2 22 /30 mẫu có lơng hơng màu xám đậm, nên khơng thuộc phân lồi A f germani A f vestitus, khó xác định chúng thuộc phân loài 3.2 Đặc điểm di truyền Đã giải trình tự ADN phần gen Cytb từ 50 mẫu Yến đảo 57 mẫu Yến nhà gen CHD1Z từ 49 mẫu Yến đảo 46 mẫu Yến nhà 3.2.1 Sự đa dạng di truyền Yến đảo Yến nhà Yến đảo: Các trình tự Yến đảo có tương đồng lớn, ghi nhận 06 vị trí có biến đổi nucleotide gen Cytb tạo thành 05 Hap ký hiệu từ HapD1 - HapD5 Trong 05 Hap Yến đảo HapD2 phổ biến nhất, với 45 trình tự phân bố tất quần đàn Yến đảo, Hap khác có 1- trình tự 49 trình tự gen CHD1Z giống hồn tồn Yến nhà: Có 20 vị trí biến đổi nucleotide tạo thành 11 Hap (từ HapN1 - HapN11) 02 trình tự NKH5 NKH22 tạo thành HapN1 HapN2 riêng biệt, với 07 biến đổi đặc trưng so với Hap lại 55 trình tự lại có biến đổi nucleotide tạo thành 09 Hap từ HapN3 - HapD11 tạo thành nhóm HapNa (gồm HapN3; 4; 5; 9; 10; 11) nhóm HapNb (gồm HapN6 -Hap8), nhóm có 03 vị trí biến đổi đặc trưng Sự phân bố số lượng trình tự Hap khơng đều, số trình tự Hap3-11 17, 1, 10, 7, 8, 3, 2, 1, Mỗi quần đàn Yến nhà có vài Hap Tp Hồ Chí Minh có Hap, Bình Dương - Hap, Kiên Giang - Hap, Bình Định - Hap, Hải Phòng – Hap Khánh Hòa - Hap, khơng có Hap đặc trưng rõ ràng cho quần đàn riêng biệt, mà Hap ghi nhận đan xen 10 quần đàn HapN3 có quần đàn, HapN6 quần đàn, HapN11 quần đàn HapN7 03 quần đàn Chỉ số đa dạng haplotype (Hd) đa dạng nucleotide (π) chung quần đàn Yến đảo thấp, đạt giá trị tương ứng từ 0- 0,24 0- 0,00082 Chỉ số đa dạng haplotype quần đàn Yến nhà cao, tương ứng từ 0,667 - 1,00 từ 0,0011 - 0,055, thể đa dạng di truyền cao phổ biến tất quần đàn Chỉ số đa dạng haplotype cao phản ánh quần đàn Yến nhà hình thành từ nhiều quần thể có khác biệt cấu trúc di truyền, đa dạng nucleotide thấp cho thấy mối quan hệ di truyền gần gũi quần đàn Yến nhà Ở quần đàn Yến nhà ghi nhận phân tán Hap nhiều quần đàn, chứng tỏ cá thể quần thể di cư đến nhiều quần đàn Yến nhà 3.2.2 Khoảng cách di truyền Khoảng cách di truyền sở phân tích gen Cytb quần đàn Yến đảo Yến nhà trình bày bảng 3.10 Bảng 3.10 Khoảng cách di truyền quần đàn chim yến DKH DBD DQN NKH NPY NBD NDN NHP NKG NKH NSG DKH DBD 0,001 DQN 0,000 0,001 NKH 0,019 0,020 0,019 NPY 0,018 0,019 0,018 0,005 NBD 0,021 0,022 0,021 0,005 0,007 NDN 0,021 0,021 0,021 0,004 0,006 0,002 NHP 0,020 0,021 0,020 0,007 0,002 0,008 0,007 NKG 0,020 0,021 0,020 0,006 0,003 0,006 0,005 0,003 NSG 0,020 0,021 0,020 0,004 0,004 0,003 0,002 0,006 0,005 NTH 0,020 0,021 0,020 0,004 0,005 0,002 0,001 0,007 0,005 0,002 NQN 0,019 0,020 0,019 0,004 0,002 0,004 0,003 0,004 0,004 0,003 11 0,002 Từ kết tính tốn giá trị khoảng cách di truyền bảng 3.9 cho thấy: Giá trị khoảng cách di truyền quần đàn Yến đảo nhỏ, từ 0% đến 0,1% Trong đó, giá trị khoảng cách di truyền quần đàn Yến đảo Quảng Nam Khánh Hòa 0%, quần đàn Yến đảo Bình Định Quảng Nam, Khánh Hòa 0,1% Sự phân hóa di truyền quần đàn Yến đảo nhỏ trao đổi di truyền thường xuyên quần đàn Giá trị khoảng cách di truyền quần đàn Yến nhà từ 0,1% đến 0,8%, khoảng cách di truyền lớn ghi nhận quần đàn Yến nhà Hải Phòng với quần đàn Yến nhà Bình Định đạt giá trị 0,8% nhỏ ghi nhận quần đàn Yến nhà Bình Dương với quần đàn Yến nhà Thanh Hóa, với giá trị 0,1% Còn quần đàn khác có khoảng cách di truyền từ 0,2% đến 0,7% Từ kết cho thấy quần đàn Yến nhà có mối quan hệ di truyền gần gũi Các nghiên cứu trước sở phân tích gen Cytb giống Aerodramus cho sai khác di truyền phân loài vào khoảng 2% quần thể phân loài mức khoảng 0,5% (Price et al., 2004) Căn vào tiêu chuẩn này, đánh giá mối quan hệ di truyền quần thể Yến đảo Yến nhà sau: Giá trị khoảng cách di truyền tất quần đàn Yến đảo quần đàn Yến nhà từ 1,8% đến 2,1%, cho thấy chúng có mức độ sai khác di truyền mức hai phân loài tách biệt Giá trị khoảng cách di truyền lớn quần đàn Yến đảo tới 0,1%, thể chúng nằm giới hạn phân loài 12 Giá trị khoảng cách di truyền quần đàn Yến nhà từ 0,1% đến 0,8%, cho thấy sai khác di truyền nằm giới hạn phân loài Sự biến đổi di truyền Hap thuộc nhóm Yến đảo Yến nhà có mức độ sai khác ủng hộ cho đánh giá mối quan hệ di truyền nêu Kết tính tốn khoảng cách di truyền Hap trình tự thuộc nhóm Yến đảo Yến nhà trình bày bảng 3.11 Bảng 3.11 Khoảng cách di truyền Hap trình tự Yến đảo Yến nhà HapD1 HapD2 HapD3 HapD4 HapD5 HapN1 HapN2 HapN3 HapD1 HapD2 0,005 HapD3 0,007 0,002 HapD4 0,007 0,002 0,003 HapD5 0,005 0,003 0,005 0,005 HapN1 0,005 0,000 0,002 0,002 HapN2 0,005 0,007 0,008 0,008 0,003 0,007 HapN3 0,022 0,020 0,022 0,022 0,020 0,020 0,020 HapN4 0,024 0,022 0,024 0,024 0,022 0,022 0,022 0,002 HapN5 0,024 0,022 0,024 0,024 0,022 0,022 0,022 0,002 HapN6 0,020 0,018 0,020 0,020 0,018 0,018 0,018 0,005 HapN7 0,022 0,020 0,022 0,022 0,020 0,020 0,020 0,007 HapN8 0,018 0,017 0,018 0,018 0,017 0,017 0,017 0,007 HapN9 0,024 0,022 0,024 0,024 0,022 0,022 0,022 0,002 HapN10 0,022 0,020 0,022 0,022 0,020 0,020 0,020 0,003 HapN11 0,024 0,022 0,024 0,024 0,022 0,022 0,022 0,002 HapN4 HapN5 HapN6 HapN7 HapN8 HapN9 HapN10 HapN11 0,003 HapN4 HapN5 0,003 HapN6 0,007 HapN7 0,008 0,008 0,002 HapN8 0,008 0,008 0,002 0,003 0,003 0,007 0,008 0,008 0,010 0,007 0,005 0,008 0,008 0,003 HapN9 0,003 0,007 HapN10 0,005 0,005 0,008 HapN11 0,003 0,003 0,007 13 0,002 Từ bảng 3.11 cho thấy: Sự phân hóa di truyền quần đàn Yến đảo nhỏ, thể chúng nằm giới hạn phân loài Giá trị khoảng cách di truyền Hap Yến nhà dao động từ 0.2% đến 2,2% cho thấy tồn hai phân loài quần đàn Yến nhà HapN1 HapN2 có khoảng cách di truyền với Hap Yến đảo (từ HapD1- HapD5) từ 0% đến 0,8%, cho thấy Hap thuộc phân lồi nhóm Yến đảo Vì vậy, Yến đảo quần thể tự nhiên có quan hệ gần gũi với Yến đảo xuất quần đàn Yến nhà nước ta Giá trị khoảng cách di truyền nhóm HapNa nhóm HapNb Yến nhà từ 0,7% - 1,0%, cho thấy sai khác di truyền hai nhóm HapNa HapNb mức độ phân lồi, chúng có nguồn gốc từ hai quần thể tự nhiên có khác biệt di truyền lớn 3.2.3 Quan hệ phát sinh chủng loại Yến đảo Yến nhà Việt Nam Cây phát sinh chủng loại ML với thông số kiểm tra tổng hợp từ phương pháp ME, MP, ML, BI xây dựng theo mơ hình HKY cho Hap Yến nhà Yến đảo Việt Nam thể hình 3.4 14 Hình 3.4 Cây phát sinh chủng loại ML Số gốc nhánh giá trị kiểm tra phương pháp ME, MP ML BI Hình ảnh phát sinh chủng loại cho thấy 02 nhóm Yến nhà Yến đảo tạo thành nhánh lớn phân hóa rõ ràng, nhánh Yến đảo có xuất mẫu Yến nhà Điều phù hợp với phân tích, đánh giá đa dạng hình thái di truyền Yến nhà Yến đảo phần Phân tích, đánh giá hình thái di truyền hai nhóm Yến đảo Yến nhà cho thấy quần đàn Yến nhà tỉnh Quảng Nam, Bình Định, Bình Dương, TP Hồ Chí Minh, Phú n, Thanh Hóa, Hải Phòng Khánh Hòa khơng bắt nguồn từ quần đàn Yến đảo Quảng Nam, Bình Định Khánh Hòa, việc ghi nhận 02 mẫu Yến nhà thuộc phân loài Yến đảo Yến đảo quần thể giống Yến đảo Việt Nam phát tán vào quần đàn Yến nhà nước ta 3.2.4 Vị trí phân loại nguồn gốc Yến nhà Việt Nam Đã xây dựng phát sinh chủng loại từ trình tự nghiên cứu (16 Haplotype gen Cytb nêu cắt ngắn chuyển sang ký hiệu tương ứng từ A.f.D1.VN đến A.f.D5.VN cho mẫu Yến đảo từ A.f.N1.VN đến A.f.N11.VN cho mẫu Yến nhà) trình tự tham khảo tương đồng từ quần thể khác loài Chim yến tổ trắng (Aerodramus fuciphagus) Thái Lan, Malaysia (hình 3.5) 15 A.f.N8.VN 77 A.f.N7.VN A.f.N.7.TL (Thái Lan) 97 56 A.f.N6.VN A.f.N 2.TL (Thái Lan) 62 A.f.N5.VN A.f.N1.TL (Vịnh Thái Lan) A.f.N11.VN A.f N4.VN A.f N3.VN A.f.N5.TL ( Vịnh Thái Lan) 62 A.f 4.ML (Terengganu Malaysia) A.f.1.ML (Terengganu Malaysia) A.f.3.ML (Johor, Malaysia) A.f.2 ML (Borneo Malaysia) A.f.N9.VN A.f.N10.VN 73 46 88 57 A.f.D1.VN A.f.ger.ML (Sabah Malaysia) A.f.D5.VN 43 A.f.N2.VN A.f.D2.VN A.f.N1.VN A.f.D3.VN A.f.D4.VN A.f.ves2.ML (Malaysia) 99 A.f.ves6.ML (Malaysia) A.f.ves1.ML (Malaysia) 0.00 Hình 3.5 Cây phát sinh chủng loại xây dựng từ Haplotype gen Cytb từ Yến nhà Yến đảo Việt Nam Haplotype tương đồng số quần thể Yến tổ trắng tham khảo Số gốc nhánh giá trị bootstrap với 1000 lần thử Ba trình tự phân loài A f vestitus tạo thành nhánh tách biệt cho thấy: Mặc dù ghi nhận 04 mẫu Yến nhà (NKH7; 10; 17; 30) có lơng hơng màu xám đen giống phân lồi A f vestitus, cấu trúc di truyền mẫu Yến nhà lại khơng thuộc phân lồi A f vestitus Do đó, mặt quan hệ di truyền khơng ghi 16 nhận phân loài A f vestitus quần đàn chim yến Việt Nam Các trình tự thuộc Hap Chim yến Việt Nam trình tự tham khảo tập trung 02 nhánh lớn, với mức độ phân hóa sâu, thể thuộc 02 phân lồi phân biệt Nhánh gồm trình tự từ A.f.D1.VN đến A.f.D5.VN, 02 trình tự A.f.N1.VN A.f.N2.VN trình tự thuộc phân lồi A f germani có ký hiệu A.f.ger.ML, cho thấy Yến đảo Việt Nam có quan hệ gần gũi với phân lồi nhiều tài liệu xếp Yến đảo Việt Nam thuộc phân loài A f germani Nhánh gồm Hap nhóm Yến nhà (HapN3.VNHapN11.VN), phân hóa xen kẽ với trình tự tham khảo từ quần đàn Chim yến tổ trắng Thái Lan Malaysia phân hóa rõ ràng Sự phân hóa phức tạp nhánh thể cá thể phân loài thuộc nhiều quần thể có khác biệt di truyền lớn Trong quần thể chim yến Malaysia tương đối đồng (nằm nhánh phụ), quần thể chim yến Vịnh Thái Lan lại pha trộn với quần thể Malaysia Các mẫu Yến nhà Việt Nam có mặt hầu hết nhánh phụ nhánh 2, thể chúng có nguồn gốc di cư chủ yếu từ khu vực Thái lan sang Việt Nam Về phân loại quần thể nhánh 2: Nhiều tác giả cho Chim yến tổ trắng có với phân lồi, có phân lồi A f amechanus ghi nhận phía Nam bán đảo Malaysia Do Hap mẫu Yến nhà Việt Nam mẫu chim yến tham khảo Malaysia Thái Lan có vị trí phát sinh với trình tự có mã hiệu KJ67139, thu mẫu bang Terengganu, Johor, phía Nam bán đảo Malaysia, nơi ghi nhận có phân bố phân lồi A f 17 amechanus (Oberholser, 1912) Ngồi Hap tương đồng 100% với trình tự có mã hiệu Genbank AY135631, thu mẫu Borneo, Malaysia Frank et al (2014) ghi nhận trình tự có mã hiệu Genbank AY135631 vị trí với trình tự có mã hiệu Genbank EU594263 EU594264, thuộc phân loài A f amechanus thu Selangor, Malaysia Vì vậy, mẫu với mẫu thu nghiên cứu quần đàn Yến nhà tỉnh Bình Định, Khánh Hòa, Bình Dương, Quảng Nam, Thanh Hóa, Hải Phòng, TP Hồ Chí Minh, Phú n Kiên Giang thuộc phân loài Aerodramus fuciphagus amechanus (Oberholser, 1912) Tuy nhiên, nghiên cứu chúng tôi, số tác giả khác, cho thấy quần thể Yến nhà A f amechanus bị tạp giao với phân lồi khác chúng rời khỏi mơi trường tự nhiên đến sinh sống nhà yến 3.3 Hiện tượng lai tự nhiên Yến đảo Yến nhà Sử dụng kết hợp đặc điểm màu lông hông, gen Cytb gen CHD1Z để nghiên cứu lai tự nhiên Yến nhà Yến đảo, cho kết quả: Các quần đàn Yến đảo: Các mẫu Yến đảo đồng hình thái di truyền Chúng định danh gen Cytb thuộc phân loài A f germani, có kiểu gen liên kết với giới tính CHD1Z ZCAC Khơng tìm đặc điểm hình thái di truyền đặc trưng cho Yến nhà xuất mẫu Yến đảo, vậy, nhận xét Yến nhà khơng có xu hướng di trú vào quần đàn Yến đảo nước ta Các quần đàn Yến nhà: Có kiểu màu lơng hơng thuộc 03 phân lồi định danh gen Cytb ghi nhận phân loài A f amechanus A f germani Xác định 03 kiểu gen liên kết với 18 giới tính CHD1Z ZCAC, ZCGT, ZTAC Yến nhà tổ hợp theo cặp 03 kiểu gen hình thành kiểu gen ZTAC ZCGT , ZCAC, ZCGT , ZCAC ZCGT (hình 3.7), chưa ghi nhận tổ hợp hai gen ZCAC, ZTAC để hình thành nên kiểu gen ZCACZTAC A B TAC CGT Hình 3.7 Vị trí nucleotde mang kiểu gen Z CAC CGT gen Z Z Z (A) kiểu (B) Trong 46 mẫu quần đàn Yến nhà gồm: 22 mẫu, gồm mẫu có lơng hơng màu xám đen, 15 mẫu l ông hông màu xám đậm mẫu không xác đị nh màu l ông hông, đị nh danh gen Cytb mẫu thuộc phân loài A f amechanus mang kiểu gen ZCGT , kiểu gen khơng có mẫu Yến đảo 03 mẫu, 02 mẫu NKH5 NQN18 có lơng hơng màu xám nhạt định danh gen Cytb thuộc phân lồi A f germani, có kiểu gen liên kết với nhiễm sắc thể giới tính Z ZCAC, thị chúng Yến đảo, chứng cho thấy di trú Yến đảo vào nhà yến Đặc biệt, mẫu Yến nhà non NQN20 định danh gen Cytb thuộc phân loài A f germani có kiểu gen liên kết với nhiễm sắc thể giới tính Z ZCACZCGT Có thể thấy mẫu nhận kiểu gen ZCAC từ chim yến mẹ từ quần đàn Yến đảo kiểu gen ZCGT từ chim 19 yến bố thuộc phân loài A f amechanus Do có giao phối chim yến mái thuộc phân loài A f germani với chim yến trống thuộc phân loài A f amechanus Ngoài ra, mẫu NKH9 có lơng hơng màu xám nhạt, định danh gen Cytb thuộc phân loài A f amechanus mang kiểu gen liên kết với nhiễm sắc thể giới tính Z ZCACZCGT, nên thấy có giao phối Chim yến bố thuộc phân loài A f germani chim yến Hình 3.8 Màu lơng hơng mẹ thuộc phân loài A f mẫu NKH9 amechanus Có thể nhận định Yến đảo di trú vào nhà yến giao phối với Yến nhà, tạo mẫu NQN20 NKH9 mẫu lai hai phân loài A f germani A f amechanus Việc ghi nhận Tỷ lệ cao kiểu gen ZCAC quần thể Yến nhà cho thấy xu hướng chim trống phân loài A f germani di trú vào quần thể yến nhà Do có khả Yến nhà nước ta quần thể hỗn giao trước chúng di trú tới, nên có nhiều biểu hình thái di truyền trung gian đan xen vài phân loài quần đàn Yến nhà, dẫn tới nhiều ý kiến khác phân loại học chúng 3.4 Một số đặc điểm sinh học, sinh thái Yến nhà 3.4.1 Tập tính sinh sản Theo dõi nhà yến khơng thu tổ cho thấy mùa sinh sản Yến nhà kéo dài từ tháng - tháng 9, trùng với mùa sinh sản Yến 20 đảo, chúng làm tổ lần đẻ trứng lần rải rác mùa sinh sản, đẻ nhiều vào tháng tháng Mặc dù làm tổ vào tháng 10 - 12, Yến nhà ngừng đẻ trứng vào tháng Một chu kỳ sinh sản Yến nhà gồm hoạt động thời gian sau: Làm tổ khoảng 30 - 51 ngày, đẻ ấp trứng 2-7 ngày, ấp đến nở từ 22 - 27 ngày từ nở đến bay khoảng 43 - 55 ngày Tổ trứng Yến nhà ban đầu có màu trắng, ấp chuyển sang màu trắng ngà Chân tổ, mép tổ Yến nhà mỏng xốp tổ Yến đảo Chim non nở lơng, màu hồng nhạt, da nhăn nheo, chân hồng nhạt, móng khỏe Sau 10 ngày có gai ống lông cánh đuôi, mầm lông cổ xuất hiện, lông vùng đầu, lưng, đuôi dày lên, màu đen rõ rệt Sau 20 ngày xuất đầy đủ bút lông cánh sơ cấp, thứ cấp, vai, lưng, hông đuôi xuất đầy đủ, chim bắt đầu đu bám tổ Sau 30 ngày, Yến nhà non bắt đầu đeo bám lên mép tổ thả người ngoài, vỗ cánh để tập bay Sau gần 50 ngày lơng cánh sơ cấp 8, lơng hồn chỉnh, Chim yến rời nhà kiếm ăn Chim yến nở chưa mớm mồi, sau khoảng ngày chim bắt đầu chim bố mẹ cho ăn Số lần chim non mớm mồi tăng lên ngày cao theo tuổi chúng, tức theo phát triển chim non nhiều chim non từ 40 - 45 ngày tuổi, đạt lần mớm mồi/ ngày Hiệu sinh sản Yến nhà quan sát nhà yến: Nhà không khai thác tổ Yến sinh đẻ lứa/ năm nhà có khai thác tổ Yến sinh đẻ lứa Hiệu sinh sản Yến nhà cao lứa đẻ 65% thấp lứa đẻ thứ - 31,3% khơng có khai thác tổ, có khai thác tổ hiệu sinh sản giảm 21 60% Phần lớn Yến không đủ lượng cho lứa sinh sản thứ 2, nên tỷ lệ chim tham gia đẻ trứng lứa giảm thấp, làm hiệu sinh sản giảm nhiều so với lứa sinh sản 3.4.2 Đặc điểm giới tính quần đàn Yến nhà Chúng thiết kế mồi PCR (PCR primer) có mã hiệu AIF, với 02 mồi PCR tham khảo có ký hiệu 2550F 2781R, để xét nghiệm xác định giới tính chim yến kỹ thuật PCR Kết xét nghiệm giới tính đàn Yến nhà tỉnh Quảng Nam cho thấy tỷ lệ chim yến mái 55%, cao chim yến trống (45%) 3.4.3 Tập tính kiếm mồi Chim yến thường bắt đầu rời nhà kiếm ăn đồng thời trời vừa sáng trở nhà vào buổi chiều muộn, trở rải rác trong khoảng - 2h trước trời tối Trong thời gian ấp trứng nuôi con, Yến bố mẹ thường luân phiên quay tổ để ấp trứng nuôi chim non 3.4.4 Nhiệt độ, độ ẩm ánh sáng nhà yến Theo dõi nhiệt độ, độ ẩm ánh sáng nhà yến cho thấy nhà ni yến có nhiệt độ từ từ 270C - 310C, độ ẩm khoảng 81% - 84%, ánh sáng giảm dần từ - Lux, theo không gian từ lỗ vào nhà yến, đến phòng đảo lượn phòng làm tổ Với nhiệt độ, độ ẩm ánh sáng ghi nhận nhà yến Việt Nam, cho điều kiện phù hợp với sinh trưởng phát triển Yến nhà 3.4.5 Âm dội âm xã hội Yến nhà Yến nhà không sử dụng âm dội ánh sáng nhìn được, thị giác chúng tốt Yến nhà sử dụng âm dội đơn âm dội kép để định vị vật thể, âm dội có nhiều nhịp, nhịp từ 1- âm tiết, tần số âm từ 3,8 kHz tới 8,7 kHz Âm xã hội có từ 13 - 20 âm tiết, âm tiết kéo dài khoảng 6,0 ms ± 0,5, khoảng thời gian kêu 22 15,6 ms ± 0,6, âm có tần số từ 4,5 kHz ± 0,2 đến 8,9 kHz ± 0,2 Âm định vị âm xã hội Yến nhà có tần số tương đồng, tần số âm định vị đa dạng âm xã hội, âm lượng lại nhỏ KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ KẾT LUẬN Quần đàn Yến đảo có đặc điểm hình thái lơng hơng màu xám nhạt đồng nhất, Yến nhà có ba màu lơng hơng gồm màu xám nhạt (13,3%), màu xám đen (13,3%) màu xám đậm (73,3%) Quần thể Yến nhà có đa dạng di truyền cao so với quần thể Yến đảo, với số lượng kiểu gen (haplotype gen Cytb thuộc hệ gen ty thể) tương ứng 09 05 haplotype kiểu alen (gen CHD1Z) tương ứng 03 01 alen Chỉ số đa dạng nucleotide haplotype Yến nhà cao nhiều so với Yến đảo Đặc điểm hình thái màu lơng hơng có tương quan thấp với đặc điểm di truyền Yến đảo Yến nhà có khác biệt di truyền mức phân lồi Các quần đàn Yến đảo có khoảng cách di truyền thấp, quần đàn Yến nhà lại có khoảng cách di truyền cao pha trộn từ nhiều quần thể có khác biệt lớn di truyền Yến đảo Việt Nam thuộc phân loài Aerodramus fuciphagus germani (Oustalet, 1876) Yến nhà thuộc phân loài A f amechanus (Oberholer, 1912), có tượng bị lai tạp với số quần thể phân loài khác Quần thể Yến nhà Việt Nam hình thành di trú từ quần thể Chim yến Malaysia qua Thái Lan tới nước ta Đã ghi nhận tượng Yến đảo Việt Nam di trú vào số quần đàn Yến nhà, chưa ghi nhận Yến nhà di trú 23 vào quần đàn Yến đảo Tỷ lệ cao kiểu gen ZCAC quần thể Yến nhà phản ánh chim trống phân loài A f germani lai với Yến nhà (A f amechanus) lai hai phân lồi xảy trước chúng di cư vào Việt Nam Yến nhà nhà làm tổ quanh năm, sinh sản rải rác, tập trung vào lứa tháng tháng Yến nhà giao phối nhà yến vào buổi tối, thời gian làm tổ khoảng 30 - 51 ngày, đẻ ấp trứng 27 ngày, ấp đến nở từ 22 - 27 ngày từ nở đến bay khoảng 43 55 ngày Hiệu sinh sản từ đạt từ 31,6 - 65% Yến nhà sử dụng âm dội đơn âm dội kép để định vị vật thể, âm dội âm xã hội có tần số khoảng từ 3,8 kHz tới 8,9 kHz Đã phát triển kỹ thuật xác định giới tính chim yến kỹ thuật PCR đơn giản, dễ ứng dụng việc lập cân giới tính tạo di đàn KIẾN NGHỊ Cần có có thêm nghiên cứu để tạo sở khoa học cho việc phân loại, định danh quần thể Chim yến Việt Nam Nghiên cứu phát triển kỹ thuật di truyền để ứng dụng vào việc khảo sát, đánh giá nguy lai tạp Yến đảo Yến nhà nước ta, đồng thời tạo sở khoa học cho việc đề biện pháp hữu hiệu nhằm bảo tồn toàn vẹn nguồn gen Yến đảo, phát triển bền vững nghề nuôi chim yến 24 ... fuciphagus Việt Nam số đặc điểm sinh học, sinh thái Chim yến làm tổ nhà Mục tiêu nghiên cứu Khảo sát, so sánh, đánh giá đa dạng hình thái di truyền quần thể Yến đảo Yến nhà Việt Nam, nhằm xác... địa lý Yến nhà Việt Nam Đánh giá lai tự nhiên quần thể Yến đảo Yến nhà sở phân tích số liệu hình thái di truyền Nghiên cứu số đặc điểm sinh học, sinh thái Yến nhà tập tính kiếm ăn, tập tính sinh. .. khác di trú vào Việt Nam 1.2.3 Nghiên cứu đặc điểm sinh học, sinh thái Yến đảo Việt Nam sống thành đàn lớn, chúng bắt đầu làm tổ vào tháng 12 hàng năm, thời gian làm tổ đàn khoảng tháng Trong