1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Tính kháng thuốc oseltamivir của vi rút cúm a lưu hành tại miền bắc việt nam, 2001 – 2012

182 84 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 182
Dung lượng 13,69 MB

Nội dung

i BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - HỒNG VŨ MAI PHƯƠNG TÍNH KHÁNG THUỐC OSELTAMIVIR CỦA VIRUT CÚM A LƯU HÀNH TẠI MIỀN BẮC VIỆT NAM, 2001 – 2012 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC HÀ NỘI – 2014 22 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - HỒNG VŨ MAI PHƯƠNG TÍNH KHÁNG THUỐC OSELTAMIVIR CỦA VIRUT CÚM A LƯU HÀNH TẠI MIỀN BẮC VIỆT NAM, 2001 – 2012 Chuyên ngành: Vi sinh Y học Mã số : 62.72.01.15 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: GS.TS Đặng Đức Anh PGS.TS Lê Thị Quỳnh Mai HÀ NỘI – 2014 33 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi Các số liệu, kết luận văn trung thực chưa cơng bố cơng trình khác NGHIÊN CỨU SINH Hoàng Vũ Mai Phương 44 LỜI CẢM ƠN Để hồn thành luận văn này, tơi xin trân trọng cảm ơn:  Khoa Đào tạo Quản lý khoa học, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung Ương  Ban Giám đốc, Ban Chủ nhiệm Khoa Virút, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung Ương Đã tạo điều khiện tốt nhất, giúp đỡ tơi suốt q trình học tập nghiên cứu Tôi xin gửi lời cảm ơn đặc biệt đến GS.TS Đặng Đức Anh, người tạo điều kiện cho đến với chuyên ngành vi rút, cho tơi lời khun hữu ích, động viên lòng nhiệt tình suốt q trình nghiên cứu hồn thành luận văn Tơi xin gửi lòng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Lê Thị Quỳnh Mai, người tận tnh dìu dắt giúp đỡ tơi từ ngày bước chân vào lĩnh vực vi rút học, truyền đạt kinh nghiệm quý báu ln khuyến khích tơi bước phía trước, tiếp cận với kiến thức nâng cao mở rộng để tơi hồn thành luận văn Tơi xin trân trọng cảm ơn TS Nguyễn Lê Khánh Hằng, Ths Nguyễn Cơ Thạch, Ths Lê Thị Thanh, CN Phạm Thị Hiền bạn đồng nghiệp cơng tác Phòng thí nghiệm Cúm - Khoa Vi rút - Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung Ương nhiệt tình giúp đỡ ủng hộ tơi suốt q trình hồn thành luận văn Tôi xin chân thành cảm ơn tài trợ Trung tâm Cúm thuộc Viện sức khỏe Hàn Quốc (KNIH )trong suốt q trình nghiên cứu Tơi xin chân thành cảm ơn TS Mendi Jamsran, TS Aeron Hurt, chuyên viên Tổ chức Y tế Thế giới, cho hỗ trợ kỹ thuật ban đầu nghiên cứu Tơi xin gửi tặng Gia đình, bạn bè người thân gia đình hết lòng giúp đỡ, động viên đường nghiệp khoa học để đạt thành ngày hôm Hà nội, ngày 22 tháng 10 năm 2013 55 HOÀNG VŨ MAI PHƯƠNG 66 MỤC LỤC Trang phụ bìa i Lời cam đoan ii Lời cảm ơn iii Mục lục iv Chữ viết tắt vii Danh mục bảng viii Danh mục hình, biểu đồ, sơ đồ ix ĐẶT VẤN ĐỀ CHƯƠNG I – TỔNG QUAN 1.1 Vi rút cúm A 1.1.1 Cấu tạo chung hệ gen vi rút cúm A 1.1.2 Cơ chế nhân lên vi rút cúm A 11 1.1.3 Thay đổi nhỏ thay đổi lớn hệ gen vi rút cúm A 13 1.1.4 Sự trao đổi tch hợp hệ gen vi rút cúm A 15 1.1.5 Khả gây bệnh vi rút cúm 16 1.1.6 Tiến hóa vi rút cúm A 17 1.2 Phòng điều trị cúm A 18 1.2.1 Văc xin phòng cúm 18 1.2.2 Thuốc điều trị vi rút cúm A 20 1.2.3 Các thuốc kháng vi rút 23 1.3 Tình hình kháng thuốc vi rút cúm A với thuốc kháng vi rút 25 1.3.1 Tình hình kháng thuốc vi rút cúm với thuốc amantadine 25 77 1.3.2 Tình hình kháng thuốc vi rút cúm với thuốc oseltamivir 26 1.4 Kỹ thuật áp dụng q trình xác định tính kháng thuốc vi rút cúm A 27 66 1.4.1 Nguyên nhân tượng kháng thuốc 27 1.4.2 Các kỹ thuật áp dụng giám sát kháng thuốc thông qua thay đổi vật liệu di truyền vi rút cúm 28 1.4.3 Kỹ thuật xác định mức độ kháng oseltamivir dựa hoạt động neuraminidase 32 1.4.4 Giám sát kháng thuốc vi rút cúm 34 CHƯƠNG II - ĐỐI TƯỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 37 2.1 Đối tượng nghiên cứu 37 2.2 Phương pháp nghiên cứu 37 2.3 Vật liệu kỹ thuật xét nghiệm 38 2.3.1 Vật liệu 38 2.3.2 Kỹ thuật xét nghiệm 42 2.4 Phân tích số liệu 51 CHƯƠNG III – KẾT QUẢ 53 3.1 Các vi rút cúm A thu thập giai đoạn từ 2001 – 2012 53 3.2 Xác định giá trị IC50 ngưỡng phân típ vi rút cúm A 54 3.3 Sự tương tác oseltamivir với vi rút cúm A 60 3.4 Vị trí đột biến protein NA chủng cúm A liên quan đến kháng thuốc oseltamivir 65 3.5 Tỉ lệ chủng vi rút cúm A kháng oseltamivir miền Bắc Việt Nam, 2001-2012 69 3.6 Sự tương đồng gen HA NA vi rút cúm A có biểu giảm độ nhạy oseltamivir với vi rút phân típ lưu hành giai đoạn 77 nghiên cứu 72 88 CHƯƠNG IV – BÀN LUẬN 86 4.1 Sự lưu hành vi rút cúm A khoảng thời gian nghiên cứu 86 4.2 Mức độ tỉ lệ vi rút cúm A giảm độ nhạy cảm với oseltamivir thông qua giá trị ức chế 50% (IC50) 88 4.3 Sự liên quan đột biến gen NAvới trình kháng thuốc oseltamivir chủng cúm A lưu hành miền Bắc Việt Nam 94 4.4 Sự liên quan mặt di truyền học chủng vi rút A mang gen đột biến vi rút cúm A lưu hành thời gian 98 KẾT LUẬN 101 KIẾN NGHỊ 103 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH CỦA TÁC GIẢ ĐÃ CƠNG BỐ CĨ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC the Sensitivity of Influenza A (H5N1) Viruses to Oseltamivir" Antmicrobial Agents and Chemotherapy, 50(11), pp 3809–3815 87 Reddy D (2010), "Responding to pandemic (H1N1) 2009 influenza: the role of oseltamivir" J Antmicrob Chemother, 65(Suppl 2), pp ii35–40 88 Ronaghi M (2011), "Pyrosequencing Sheds Light on DNA Sequencing" Genome Res., 11, pp 3-11 89 Saito R., et al (2007), "High prevalence of amantadine-resistance influenza a (H3N2) in six prefectures, Japan, in the 2005-2006 season" J Med Virol, 79(10), pp 1569-76 90 Samaan, G., M McPherson, and J Partridge (2013), "A review of the evidence to support influenza vaccine introducton in countries and areas of WHO's Western Pacific Region" PLoS One, 8(7), pp e70003 91 Samuel B Graitcer, L G., Laurie Kamimoto, Saumil Doshi et al., (2011), "Characteristcs of Patents with Oseltamivir- Resistant Pandemic (H1N1) 2009, United States" Emerging Infectious Diseases, 17(2), pp 255 92 Sandbulte M R., et al (2011), "Discordant antgenic drift of neuraminidase and hemagglutinin in H1N1 and H3N2 influenza viruses" Proc Natl Acad Sci U S A, 108(51), pp 20748-53 93 Sanger F., C A R (1975), "A rapid method for determining sequences in DNA by primed synthesis with DNA polymerase" Journal of Molecular Biology, 94(3), pp 441-446 94 Shih C., A., Hsiao T., Ho M., LiW., (2007), "Simultaneous amino acid substitutions at antgenic sites drive influenza A hemagglutinin evolution" PNAS, 105(15), pp 6283-6288 95 Sims L D., E T M., Liu K K., et.al (2003), "Avian influenza in Hong Kong 1997-2002" Avian Diseases, 47(3), pp 832-838 96 Sleeman, K., et al (2013), "R292K substtuton and drug susceptibility of influenza A(H7N9) viruses" Emerg Infect Dis, 19(9), pp 1521-4 97 Smith D J., et al (2004), "Mapping the antigenic and genetc evolution of influenza virus" Science, 305(5682), pp 371-6 98 Smith G J., et al (2009), "Origins and evolutonary genomics of the 2009 swine-origin H1N1 influenza A epidemic" Nature, 459(7250), pp 1122-5 99 Subbarao EK, L W., Murphy BR (1993), "A single amino acid in the PB2 gene of influenza A virus is a determinant of host range" J Virol., 67(4), pp 1761-1764 100 Suki Man-Yan Lee, H.-L Y (2012), "Targetng the host or the virus Current and novel concepts for antviral approaches against influenza virus infecton" Antviral Research, 96, pp 391-404 101 Suzuki Y., S R., Sato I., Zaraket H., Nishikawa M., Tamura T., Dapat C., Caperig-Dapat I., Baranovich T., Suzuki T., Suzuki H., (2011), "Identfication of oseltamivir resistance among pandemic and seasonal influenza A (H1N1) viruses by an His275Tyr genotyping assay using the cycling probe method" J.Clin.Microbiol., 49(1), pp 125-130 102 Takano R, K M., Igarashi M, Le QM, Sekijima M, Ito K, Takada A, Kawaoka Y., (2013), "Molecular mechanisms underlying oseltamivir resistance mediated by an I117V substtuton in the neuraminidase of subtype H5N1 avian influenza A viruses" J Infect Dis., 207(1), pp 89-97 103 Tamura D., M K., Yamazaki M., Fujino M., et al., (2009), "OseltamivirResistant Infuenza A Viruses Circulatng in Japan" J Clin Microbiol., 47(5), pp 1424-1427 104 Tashiro M., et al (2009), "Surveillance for neuraminidase-inhibitor-resistant influenza viruses in Japan, 1996-2007" Antvir Ther, 14(6), pp 751-61 105 Tong S., et al (2012), "A distnct lineage of influenza A virus from bats" Proc Natl Acad Sci U S A, 109(11), pp 4269-74 106 Vuong D C., Hoang V M P., Nguyen L K H., et al (2012), "The genetc match between vaccine strains and circulatng seasonal influenza A viruses in Vietnam, 2001–2009" Influenza and Other Respiratory Viruses, DOI:10.1111/irv.12038 107 Wallace R G., et al (2007), "A statstical phylogeography of influenza A H5N1" Proc Natl Acad Sci U S A, 104(11), pp 4473-8 108 Walter M B., I M., Pamela K Y., Frances MD G., Adolfo G., Noelia M., Daniel R P., Ana S G.-R., Brent S S (2013), "Influenza A(H1N1)pdm09 virus infecton in marine mammals in California" Emerging Microbes and Infections, 2(e40), pp doi:10.1038 109 Wang M., Q J., Liu Y., Vavricka C J., Wu Y., Li Q., Gao F G., (2011), "Influenza A Virus N5 Neuraminidase Has an Extended 150-Cavity " Journal of Virology, 85(16), pp 8431-8435 110 WHO (2009), "Influenza A(H1N1) virus resistance to oseltamivir 2008/2009 influenza season, northern hemisphere" 111 WHO (2011), "Manual for the laboratory diagnosis and virological surveillance of influenza" pp 103-114 112 WHO (2012), "Laboratory methodologies for testng the antviral susceptbility of influenza viruses: Neuraminidase inhibitor (NAI) Genotyping: molecular-based assays" 113 WHO (2012), "Laboratory methodologies for testng the antviral susceptbility of influenza viruses: Neuraminidase inhibitor (NAI) Phenotyping: neuraminidase inhibition assays" 114 WHO (2012), "Weekly epidemiological record" 39(87), pp 369-380 115 WHO (2013), Cumulatve number of confrmed human cases for avian influenza A(H5N1) reported to WHO, 2003-2013 h ttp://www.who.in t/influ enza/human_animal_interface/EN_ GIP_20130426 C umulatveNumberH5 N1 cases.pdf 116 WHO (2013), Number of confrmed human cases of avian influenza A(H7N9) reported to WHO h ttp://www.who.in t/influ enza/human_animal_interface/influenza_h7n9/06 _R eportWebH7N9Number.pd f 117 WHO (2013), Vaccines http://www.who.int/influen za/vaccines/en / 118 Wright P F., N G., Kawaoka Y.,, (2007), Orthomyxoviridae, in Field's Virology,5th David M Knipe, P.M.H., Editor, Lippincot Williams & Wilkins: Philadelphia pp 1713-1716 119 Yang J., L Y., Huang Y., Su C., Lo J , Ho Y., Yao C., Hsu L., Wu H., Liu M., (2011), "Reassortment and Mutations Associated with Emergence and Spread of Oseltamivir-Resistant Seasonal Influenza A/H1N1 Viruses in 2005–2009" PLoS ONE, 6(3), pp e18177 120 Yi P L., X X., Wharton A S., Martn R S., et al., (2013), "Evolution of the receptor binding properties of theinfluenza A(H3N2) hemagglutinin" PNAS, 110(7), pp 2677-2683 121 Zambon, M (2011), "Assessment of the burden of influenza in children" Lancet, 378(9807), pp 1897-8 122 Zambon M., P C., (2009), Influenza, in Clinical Virology,6th al., A.J.Z.e., Editor, John Wiley&Sons: Sussex 123 Zhao D., L L., Li Y., Jiang Y., Liu L, et al., (2012), "Phylogenetc and Pathogenic Analyses of Avian Influenza A H5N1 Viruses Isolated from Poultry in Vietnam" PLoS ONE, 7(11), pp e50959 doi:10.1371 PHỤ LỤC 1 Hình ảnh minh họa bước thực thử nghiệm ức chế neuraminidase 1.1 Xác định độ hoạt động neuraminidase 1.1.1 Hoạt động neuraminidase qua máy đọc Victor X2 1.1.2 Biểu đồ thể hoạt động neuraminidase mức độ pha loãng vi rút cúm 1.2 Thử nghiệm ức chế neuraminidase 1.2.1 Kết ban đầu qua máy đọc Victor X2 1.2.2 Giá trị IC50 phân vi rút cúm A thông thường A/H1N1pdm09 A/H3N2 A/H5N1 (nM) (nM) (nM) 0.37 0.34 1.3 0.19 0.05 0.13 0.08 0.18 1.2 0.24 0.01 0.3 0.02 0.01 0.56 0.1 0.25 0.94 0.13 0.52 0.79 0.09 0.31 2.36 0.06 0.11 4.55 10 0.12 0.08 1.75 11 0.09 0.07 4.16 12 0.12 0.18 1.83 13 0.11 0.17 7.27 14 0.06 0.04 7.3 15 0.29 0.04 3.41 16 0.45 0.24 8.98 17 0.05 0.02 2.65 18 0.32 0.05 6.3 19 0.16 0.07 0.45 20 0.29 0.35 3.65 21 0.08 0.99 2.01 22 0.12 0.02 23 0.15 0.07 24 0.07 0.59 25 0.14 0.27 26 0.18 0.04 27 0.21 0.22 28 0.1 0.24 29 0.12 0.53 30 0.17 0.39 31 0.12 0.18 32 0.1 0.31 33 1.51 0.02 34 0.17 0.20 35 0.09 0.03 1.2.3 Biểu đồ thể mức độ kháng thuốc vi rút phần mềm JASPR St A/H1N1 (nM) 0.16 0.37 0.24 0.35 0.21 0.34 0.4 0.16 0.31 0.2 0.48 1.03 0.25 0.4 0.26 0.33 0.45 0.45 0.12 0.13 0.33 0.64 0.25 0.96 1.18 1.03 1.35 A/H1N1 A/H1N1pdm09 A/H3N2 A/H5N1 Chủng chứng Các vị trí đột biến protein NA chủng A/H1N1, A/H1N1pdm09 A/H5N1 xác định sau giải trình tự gen chủng vi rút nghiên cứu Vi-rút cúm A/H1N1 Tên chủng 2008 2009 Đột biến protein NA (Vị trí axit amin*) Q137K Y156H I223V S247G H275Y A/Vietnam/TX285/08 - - - -  A/Vietnam/TB289/08 - - - -   A/Vietnam/TX200/08 - - - - A/Vietnam/TX233/08 - - - -    A/Vietnam/BT241/08 - - - - A/Vietnam/LS324/08 - - - -     A/Vietnam/32036/09 - - - -   A/Vietnam/E197/09 - - - -   A/Vietnam/Q271/09 - - - -   A/Vietnam/31808/09 - - - -   A/Vietnam/34381/09 - - - - A/Vietnam/N116/09 - - - -     Vi rút cúm A/H1N1pdm09 Đột biến protein NA (Vị trí axit amin*) Tên chủng A/Vietnam/32023/09 2009 2011 I223K S247N - - -  -    - A/Vietnam/32043/09 - - - A/Vietnam/32047/09 - - - H275Y Q313K I223M vàI427T - A/Vietnam/32060/09 - - - A/Vietnam/32067/09 - - -     A/Vietnam/32081/09 - - -   - - A/Vietnam/32085/09 - - -   A/Vietnam/33419/09 - - -   - A/Vietnam/36530/11 - - -   - Vi rút cúm A/H5N1 Tên chủng Đột biến protein NA (Vị trí axit amin*) 2003 2004 2005 2007 2008 2009 2010 I117V Q136L V149A D199G S247N H275Y N295S A/Vietnam/UT3030/03 - - - - - - - A/Vietnam/1203/04 - - - - - - - A/Vietnam/1194/04 - - - - - - - A/Vietnam/3062/04 - - - - - - - A/Vietnam/JP178/04 - - - - - - - A/Vietnam/JP14/05 - - - - - - - A/Vietnam/JP4207/05 - - - - - - - A/VietNam/HN30408/05 - - - - -  - A/Vietnam/HN31203/07 - - - - - - - A/Vietnam/HN31209/07  - - - - - - A/Vietnam/HN31242/07 - - - - - - - A/Vietnam/HN31244/07 - - - - - - - A/Vietnam/HN31312/07 - - - - - - - A/Vietnam/HN31323/07 - - - - - - - A/Vietnam/HN31239/07 - - - - - - - A/Vietnam/HN31388/07 - - - - - - - A/Vietnam/HN31394/08 - - - - - - - A/Vietnam/HN31412/08  - - - - - - A/Vietnam/HN31432M/08 - - - - - - - A/Vietnam/HN31413/08  - - - - - - A/Vietnam/HN31461/08 - - - - - - - A/Vietnam/HN31641/09 - - - - - - - A/Vietnam/HN31604/09 - - - - - - - A/Vietnam/HN31633/09 - - - - - - - A/Vietnam/HN31673/09 - - - - - - - A/Vietnam/HN36250/10 - - - - - - - A/Vietnam/HN36282/10 - - - - - - - A/Vietnam/HN36285/10 - - - - - - - Mã số trình tự gen mã hóa HA NA chủng vi rút cúm A/H1N1, A/H1N1pdm09 A/H5N1 Ngân hàng liệu DNA NCBI (National Center for Biotechnology Informaton – US National Library of Medicine) 3.1 Mã số trình tự gen mã hóa HA NA chủng vi rút cúm A/H1N1 STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 31 32 33 Tên chủng A/HaNoi/2017/2001 A/HaNoi/2143/2001 A/HaNoi/2253/2001 A/HaNoi/2476/2001 A/HaNoi/2480/2001 A/HaNoi/2532/2001 A/HaNoi/2546/2002 A/HaNoi/2704/2002 A/HaNoi/ARI36/2003 A/HaNoi/BM857/2003 A/HaNoi/BM862/2003 A/HaNoi/BM870/2003 A/HaNoi/BM893/2003 A/HaNoi/BM898/2003 A/HaNoi/BM902/2003 A/HaNoi/BM910/2003 A/HaNoi/BM945/2003 A/HaNoi/BM949/2003 A/HaNoi/BM959/2003 A/HaNoi/BT241/2008 A/HaNoi/HN1004/2003 A/HaNoi/HN1017/2003 A/HaNoi/HN1024/2003 A/HaNoi/HN337/2003 A/HaNoi/Q421/2006 A/HaNoi/Q555/2006 A/HaNoi/Q580/2006 A/HaNoi/Q591/2006 A/HaNoi/N229/2008 A/HaNoi/TX200/2008 A/HaNoi/TX233/2008 Mã số đăng ký Gen HA Gen NA CY103972 CY103974 CY104686 CY104688 CY103980 CY103982 CY103988 CY103990 CY104694 CY104696 CY103996 CY103998 CY104004 CY104006 CY104012 CY104014 CY104702 CY104704 CY105222 CY105224 CY105230 CY105232 CY104710 CY104712 CY104718 CY104720 CY104020 CY104022 CY104726 CY104728 CY104734 CY104736 CY104742 CY104744 CY104028 CY104030 CY104750 CY104752 CY104870 CY104872 CY104036 CY104038 CY104758 CY104760 CY104044 CY104046 CY104766 CY104768 CY105118 CY105120 CY104838 CY104840 CY104846 CY104848 CY104284 CY104286 CY104292 CY104294 CY105134 CY105136 CY105142 CY105144 3.2 Mã số trình tự gen mã hóa HA NA chủng vi rút cúm A/H1N1pdm09 STT Tên chủng 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 31 32 33 A/Viet Nam/001-1020/2009 A/Viet Nam/001-1424/2009 A/Viet Nam/001-1716/2009 A/Viet Nam/001-1880/2009 A/Viet Nam/001-1889/2009 A/Viet Nam/001-1890/2009 A/Viet Nam/11032002/2009 A/Viet Nam/11032006/2009 A/Viet Nam/11032010/2009 A/Viet Nam/11032011/2009 A/Viet Nam/11032016/2009 A/Viet Nam/11032017/2009 A/Viet Nam/11032021/2009 A/Viet Nam/12032001/2009 A/Viet Nam/12032005/2009 A/Viet Nam/13032001/2009 A/Viet Nam/13032002/2009 A/Viet Nam/13032008/2009 A/Viet Nam/13032009/2009 A/Viet Nam/13032011/2009 A/Viet Nam/13032015/2009 A/Viet Nam/13032016/2009 A/Viet Nam/13032019/2009 A/Viet Nam/13032030/2009 A/Viet Nam/811/2009 A/Viet Nam/817/2009 A/Viet Nam/818/2009 A/Viet Nam/823/2009 A/Viet Nam/835/2009 A/Viet Nam/841/2009 A/Viet Nam/850/2009 Mã số đăng ký Gen HA Gen NA CY128467 CY128469 CY128435 CY128437 CY128443 CY128445 CY128451 CY128453 CY128459 CY128461 CY128064 CY128066 CY128371 CY128050 CY128379 CY128381 CY128387 CY128389 CY128054 CY128056 CY128395 CY128397 CY128403 CY128405 CY128411 CY128413 CY128419 CY128421 CY128427 CY128429 CY128131 CY128133 CY128139 CY128141 CY128147 CY128149 CY128155 CY128157 CY128163 CY128165 CY128171 CY128173 CY128179 CY128181 CY128187 CY128189 CY128195 CY128197 CY128467 CY128085 CY128435 CY128077 CY128443 CY128093 CY128451 CY128109 CY128459 CY128101 CY128064 CY128125 CY128371 CY128117 3.3 Mã số trình tự gen mã hóa HA NA chủng vi rút cúm A/H5N1 STT Tên chủng Mã số đăng ký Gen HA Gen NA A/Vietnam/UT3028/2003 HM114449 HM114451 A/Vietnam/UT3030/2003 HM114465 HM114467 A/Vietnam/UT3035/2003 HM114473 HM114475 A/Viet Nam/1203/2004 EF541403 EF541467 A/Viet Nam/3046/2004 AY651335 AY651446 A/Viet Nam/JP178/2004 EF456795 EF456796 A/Vietnam/1194/2004 EF541402 EF541466 A/Vietnam/UT30259/2004 HM114513 HM114515 A/Vietnam/UT3040/2004 HM114481 HM114483 10 A/Vietnam/UT3062/2004 HM114505 HM114507 11 A/Viet Nam/HN30408/2005 EF456803 EF456804 12 A/Viet Nam/JP14/2005 EF456799 EF456801 13 A/Viet Nam/JP4207/2005 EF456798 EF456800 14 A/Vietnam/UT30850/2005 HM114537 HM114539 15 A/Viet Nam/HN31242/2007 EU294369 EU294372 16 A/Vietnam/HN31244/2007 HQ215515 HQ215516 17 A/Vietnam/HN31388M1/2007 HM114585 HM114587 18 A/Vietnam/UT31203A/2007 HM114545 HM114547 19 A/Vietnam/UT31239/2007 HM114553 HM114555 20 A/Vietnam/UT31244II/2007 HM114561 HM114563 21 A/Vietnam/UT31312II/2007 HM114577 HM114579 22 A/Vietnam/HN31432M/2008 HM114617 HM114619 23 A/Vietnam/UT31394II/2008 HM114593 HM114595 24 A/Vietnam/UT31412II/2008 HM114601 25 A/Vietnam/UT31413II/2008 HM114609 HM114611 PHỤ LỤC Hình ảnh làm việc phòng thí nghiệm ATSH cấp Hình ảnh làm việc phòng thí nghiệm ATSH cấp ... NA chủng cúm A liên quan đến kháng thuốc oseltamivir 65 3.5 Tỉ lệ chủng vi rút cúm A kháng oseltamivir miền Bắc Vi t Nam, 2001- 2012 69 3.6 Sự tương đồng gen HA NA vi rút. .. Tình hình kháng thuốc vi rút cúm A với thuốc kháng vi rút 25 1.3.1 Tình hình kháng thuốc vi rút cúm với thuốc amantadine 25 77 1.3.2 Tình hình kháng thuốc vi rút cúm với thuốc oseltamivir 26... BỘ Y TẾ VI N VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - HỒNG VŨ MAI PHƯƠNG TÍNH KHÁNG THUỐC OSELTAMIVIR C A VIRUT CÚM A LƯU HÀNH TẠI MIỀN BẮC VI T NAM, 2001 – 2012 Chuyên ngành: Vi sinh

Ngày đăng: 27/02/2019, 12:43

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
9. Bai G. R., et al. (2009), "Amantadine- and oseltamivir-resistant variants of influenza A viruses in Thailand". Biochem Biophys Res Commun, 390(3), pp. 897-901 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Amantadine- and oseltamivir-resistant variants ofinfluenza A viruses in Thailand
Tác giả: Bai G. R., et al
Năm: 2009
10. Bao R. J. , H. K. T., Piscitelli E. A., et. al. (2011), "Reverse-transcripton polymerase chain reacton/pyrosequencing to characterize neuraminidase H275 residue of influenza A 2009 H1N1 virus for rapid and specific detecton of the viral oseltamivir resistance marker in a clinical laboratory". Diagnostc Microbiology and Infectious Disease, 71, pp. 396- 402 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Reverse-transcriptonpolymerase chain reacton/pyrosequencing to characterizeneuraminidase H275 residue of influenza A 2009 H1N1 virus for rapidand specific detecton of the viral oseltamivir resistance marker in a clinicallaboratory
Tác giả: Bao R. J. , H. K. T., Piscitelli E. A., et. al
Năm: 2011
11. Baranovich T, S. R., Suzuki Y, Zaraket H, Dapat C, Caperig-Dapat I, Oguma T, Shabana II, Saito T, Suzuki H. (2010), "Emergence of H274Y oseltamivir- resistant A(H1N1) influenza viruses in Japan during the 2008-2009 season". J Clin Virol., 47(1), pp. 23-28 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Emergence of H274Y oseltamivir-resistant A(H1N1) influenza viruses in Japan during the 2008-2009season
Tác giả: Baranovich T, S. R., Suzuki Y, Zaraket H, Dapat C, Caperig-Dapat I, Oguma T, Shabana II, Saito T, Suzuki H
Năm: 2010
12. Barr I. G., C. L., Komadina N, Lee RT, Lin RT, Deng Y, Caldwell N, Shaw R, Maurer-Stroh S.,. (2010), "A new pandemic influenza A(H1N1) genetc variant predominated in the winter 2010 influenza season in Australia, New Zealand and Singapore". Euro Surveill., 15(42), pp. pii=19692 Sách, tạp chí
Tiêu đề: A new pandemic influenza A(H1N1) genetcvariant predominated in the winter 2010 influenza season in Australia, NewZealand and Singapore
Tác giả: Barr I. G., C. L., Komadina N, Lee RT, Lin RT, Deng Y, Caldwell N, Shaw R, Maurer-Stroh S
Năm: 2010
13. Baz M., A. Y., McDonald J., Boivin G.,. (2006), "Characterizaton of Multidrug-Resistant Infuenza A/H3N2 Viruses Shed during 1 Year by an Immunocompromised Child". Clinical Infectious Diseases, 43, pp. 1555–1561 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Characterizaton ofMultidrug-Resistant Infuenza A/H3N2 Viruses Shed during 1 Year by anImmunocompromised Child
Tác giả: Baz M., A. Y., McDonald J., Boivin G
Năm: 2006
14. Bloom D. J., G. I. L., Baltmore D.,. (2010), "Permissive Secondary Mutatons Enable the Evolution of Influenza Oseltamivir Resistance".Science, 328, pp. 1272 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Permissive SecondaryMutatons Enable the Evolution of Influenza Oseltamivir Resistance
Tác giả: Bloom D. J., G. I. L., Baltmore D
Năm: 2010
15. Boivin S., C. S., Ruigrok W. H. R., Hart J. D.,. (2010), "Influenza A Virus Polymerase: Structural Insights into Replicaton and Host Adaptaton Mechanisms". J Biol Chem., 285(37), pp. 28411-28417 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Influenza A VirusPolymerase: Structural Insights into Replicaton and Host AdaptatonMechanisms
Tác giả: Boivin S., C. S., Ruigrok W. H. R., Hart J. D
Năm: 2010
17. Bolotn S., R. A. V., Eshaghi A., De Lima C., Lombos E., Chong-King E., Burtona L., Mazzullia T., Drews S.J.,. (2009), "Development of a novel real- tme reverse-transcriptase PCR method for the detecton of H275Y positve infuenza A H1N1 isolates". Journal of Virological Methods, 158, pp. 190- 194 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Development of a novel real-tme reverse-transcriptase PCR method for the detecton of H275Y positveinfuenza A H1N1 isolates
Tác giả: Bolotn S., R. A. V., Eshaghi A., De Lima C., Lombos E., Chong-King E., Burtona L., Mazzullia T., Drews S.J
Năm: 2009
18. Boriskin YS, L. I., Pécheur EI, Polyak SJ. (2008), "Arbidol: a broad- spectrum antviral compound that blocks viral fusion". Curr Med Chem, 15(10), pp. 997-1005 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Arbidol: a broad-spectrum antviral compound that blocks viral fusion
Tác giả: Boriskin YS, L. I., Pécheur EI, Polyak SJ
Năm: 2008
19. Bouvier N. M., P. P. (2008), "The biology of influenza viruses". Vaccine, 26 Suppl 4, pp. D49-53 Sách, tạp chí
Tiêu đề: The biology of influenza viruses
Tác giả: Bouvier N. M., P. P
Năm: 2008
20. Buchholz U., B. S., Duwe S., Schweiger B., an der Heiden M., Reinhardt B., Buda S.,. (2010), "Household transmissibility and other characteristcs of seasonal oseltamivir-resistant influenza A(H1N1) viruses, Germany, 2007- 8". Euro Surveill., 15(6), pp. pii=19483 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Household transmissibility and other characteristcs ofseasonal oseltamivir-resistant influenza A(H1N1) viruses, Germany, 2007-8
Tác giả: Buchholz U., B. S., Duwe S., Schweiger B., an der Heiden M., Reinhardt B., Buda S
Năm: 2010
22. Chen H., C. C. L., Tai H., Zhao P., Chan J. F.W. , Cheng V. C., Chan K., Yuen K., . (2009), "Oseltamivir-Resistant Influenza A Pandemic (H1N1)2009 Virus, Hong Kong, China". Emerging Infectious Diseases, 15(12), pp.1970-1972 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Oseltamivir-Resistant Influenza A Pandemic (H1N1)2009 Virus, Hong Kong, China
Tác giả: Chen H., C. C. L., Tai H., Zhao P., Chan J. F.W. , Cheng V. C., Chan K., Yuen K
Năm: 2009
23. Dawood S. F., J. S., Lindstrom S., Garten R., Uyeki M. T.,. (2009),"Emergence of a Novel Swine-Origin Influenza A (H1N1) Virus in Humans". N Engl J Med, 360, pp. 2605-2615 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Emergence of a Novel Swine-Origin Influenza A (H1N1) Virus inHumans
Tác giả: Dawood S. F., J. S., Lindstrom S., Garten R., Uyeki M. T
Năm: 2009
25. Deyde V. M., et al. (2009), "Pyrosequencing as a tool to detect molecular markers of resistance to neuraminidase inhibitors in seasonal influenza A viruses". Antiviral Res, 81(1), pp. 16-24 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Pyrosequencing as a tool to detect molecularmarkers of resistance to neuraminidase inhibitors in seasonal influenzaA viruses
Tác giả: Deyde V. M., et al
Năm: 2009
26. Deyde V. M., et al. (2010), "Detecton of molecular markers of drug resistance in 2009 pandemic influenza A (H1N1) viruses by pyrosequencing". Antmicrob Agents Chemother, 54(3), pp. 1102-10 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Detecton of molecular markers of drugresistance in 2009 pandemic influenza A (H1N1) viruses bypyrosequencing
Tác giả: Deyde V. M., et al
Năm: 2010
27. Dharan J. N., B. S. E., Fiore A. et. al,. (2010), "Influenza antviral prescribing practces during the 2007–08 and 2008–09 influenza seasons in the seting of increased resistance to oseltamivir among circulatng influenza viruses". Antiviral Research, 88, pp. 182-186 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Influenza antviralprescribing practces during the 2007–08 and 2008–09 influenza seasonsin the seting of increased resistance to oseltamivir among circulatnginfluenza viruses
Tác giả: Dharan J. N., B. S. E., Fiore A. et. al
Năm: 2010
28. Dutkowski R. (2010), "Oseltamivir in seasonal influenza: cumulatve experience in low- and high-risk patents". J Antimicrob Chemother, 65 Suppl 2, pp. ii11-ii24 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Oseltamivir in seasonal influenza: cumulatveexperience in low- and high-risk patents
Tác giả: Dutkowski R
Năm: 2010
29. Furuse Y., et al. (2009), "Evolution of the M gene of the influenza A virus in diferent host species: large-scale sequence analysis". Virol J, 6, pp. 67 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Evolution of the M gene of the influenza A virus indiferent host species: large-scale sequence analysis
Tác giả: Furuse Y., et al
Năm: 2009
30. Garten, R. J., et al. (2009), "Antgenic and genetc characteristics of swine- origin 2009 A(H1N1) influenza viruses circulating in humans". Science, 325(5937), pp. 197-201 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Antgenic and genetc characteristics of swine-origin 2009 A(H1N1) influenza viruses circulating in humans
Tác giả: Garten, R. J., et al
Năm: 2009
31. Greenwood D., F. R., Davey P., Wilcox M.,, (2007), Antmicrobial Chemotherapy, in Antimicrobial Chemotherapy,Fifth David Greenwood, R.F., Peter Davey, Editor, Oxford University Press: Oxford. pp. 105 - 107 Sách, tạp chí
Tiêu đề: AntmicrobialChemotherapy
Tác giả: Greenwood D., F. R., Davey P., Wilcox M
Năm: 2007

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w