Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc

Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Giới thiệu Giao hàng lắp đặt Các u cầu phòng thí nghiệm Các yêu cầu điện Bộ cấp nguồn liên tục Các lưu ý môi trường Hướng dẫn mạng máy chủ Yêu cầu xuất lưu trữ liệu Vật tư tiêu hao thiết bị Hỗ trợ kỹ thuật Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Tháng 12/2017 Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn 3 7 8 13 13 15 QUYỀN SỞ HỮU CỦA ILLUMINA Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Tài liệu nội dung thuộc quyền sở hữu Illumina, Inc công ty liên kết Illumina, Inc ("Illumina") dành cho việc sử dụng theo hợp đồng với khách hàng Illumina liên quan đến việc sử dụng (các) sản phẩm mô tả tài liệu khơng dành cho mục đích khác Tài liệu nội dung khơng sử dụng hay phân phối mục đích khác và/hoặc không truyền tải, tiết lộ hay chép hình thức khác mà khơng có cho phép trước văn Illumina Illumina không chuyển nhượng giấy phép theo sáng chế, nhãn hiệu, quyền quyền theo thông luật quyền tương tự bên thứ ba thông qua tài liệu Các hướng dẫn nêu tài liệu phải tuân thủ nghiêm ngặt rõ ràng cá nhân đào tạo phù hợp có đủ trình độ nhằm đảm bảo sử dụng an tồn cách (các) sản phẩm mô tả tài liệu Phải đọc hiểu hoàn toàn tất nội dung tài liệu trước sử dụng (các) sản phẩm VIỆC KHƠNG ĐỌC TỒN BỘ VÀ TUÂN THỦ RÕ RÀNG TẤT CẢ CÁC HƯỚNG DẪN NÊU TRONG TÀI LIỆU NÀY CÓ THỂ DẪN ĐẾN GÂY HƯ HỎNG (CÁC) SẢN PHẨM, GÂY TỔN THƯƠNG CHO CON NGƯỜI, BAO GỒM NGƯỜI DÙNG HOẶC NHỮNG NGƯỜI KHÁC VÀ GÂY THIỆT HẠI TÀI SẢN KHÁC, VÀ SẼ LÀM MẤT HIỆU LỰC BẢO HÀNH ÁP DỤNG CHO (CÁC) SẢN PHẨM ĐĨ ILLUMINA KHƠNG CHỊU BẤT KỲ TRÁCH NHIỆM NÀO PHÁT SINH TỪ VIỆC SỬ DỤNG KHÔNG ĐÚNG CÁCH (CÁC) SẢN PHẨM ĐƯỢC MÔ TẢ TRONG TÀI LIỆU NÀY (BAO GỒM CẢ CÁC BỘ PHẬN CỦA SẢN PHẨM HOẶC PHẦN MỀM) © 2017 Illumina, Inc Bảo lưu quyền Illumina, BaseSpace, iSeq, màu cam bí ngơ thiết kế kiểu dòng chảy nhãn hiệu đăng ký chờ đăng ký Illumina, Inc và/hoặc (các) công ty liên kết Illumina, Inc Hoa Kỳ và/hoặc nước khác Tất tên, logo nhãn hiệu khác tài sản chủ sỡ hữu tương ứng Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Giới thiệu Hướng dẫn cung cấp dẫn kỹ thuật hướng dẫn để chuẩn bị địa điểm cho việc lắp đặt vận hành Hệ thống giải trình tự Illumina® iSeq™ 100 u Các lưu ý giao hàng lắp đặt u Các yêu cầu khơng gian phòng thí nghiệm u Các u cầu điện u Các giới hạn môi trường u Các u cầu tính tốn u Các vật tư tiêu hao thiết bị người dùng cung cấp Các lưu ý an toàn Xem Hướng dẫn an toàn tuân thủ Hệ thống giải trình tự iSeq 100 (tài liệu số 1000000035336) để biết thông tin quan trọng lưu ý an toàn Tài nguyên khác Các trang hỗ trợ Hệ thống giải trình tự iSeq 100 trang web Illumina cung cấp thêm nhiều tài nguyên khác Những tài nguyên bao gồm sản phẩm phần mềm, đào tạo, sản phẩm tương thích tài liệu hướng dẫn duới Hãy ln kiểm tra trang hỗ trợ để cập nhật phiên Tài ngun Mơ tả Trình chọn giao thức tùy chỉnh Một thuật sĩ dùng để tạo tài liệu hướng dẫn tùy chỉnh toàn diện Tài liệu hướng dẫn soạn phù hợp với phương pháp chuẩn bị thư viện, thông số chạy phương pháp phân tích bạn Tờ hướng dẫn thiết lập iSeq 100 (tài liệu số 1000000035963) Cho biết thành phần hệ thống hướng dẫn lắp đặt thiết lập lần đầu cho thiết bị Hướng dẫn an toàn tuân thủ Hệ thống giải trình tự iSeq 100 (tài liệu số 1000000035336) Cung cấp thông tin lưu ý vận hành an toàn, tuyên bố tuân thủ, cách ghi nhãn thiết bị WiFi tích hợp Hướng dẫn tuân thủ Thiết bị đọc RFID (tài liệu số 1000000002699) Cung cấp thông tin thiết bị RFID thiết bị này, bao gồm chứng nhận tuân thủ lưu ý an toàn Hướng dẫn Hệ thống giải trình tự iSeq 100 (tài liệu số 1000000036024) Cung cấp thông tin tổng quan thiết bị quy trình kèm Nội dung tài liệu bao gồm thành phần thiết bị, thành phần thuốc thử, hướng dẫn sử dụng quy trình bảo trì khắc phục cố Giao hàng lắp đặt iSeq 100 hệ thống mà người dùng lắp đặt Hướng dẫn lắp đặt cung cấp Tờ hướng dẫn thiết lập iSeq 100 (tài liệu số 1000000035963) giao kèm thiết bị Thiết lập hệ thống Việc mở bao bì lắp đặt iSeq 100 khoảng 30 phút Lắp đặt bao gồm kết nối thiết bị với nguồn điện mạng, bật thiết bị làm theo lời nhắc hình để tiến hành kiểm tra hệ thống cấu hình phần mềm Khi hồn thành q trình cấu hình, thực lần kiểm tra hệ thống hộp thử nghiệm tế bào dòng chảy thử nghiệm Tất thành phần cần thiết cho việc lắp đặt giao thiết bị Không cần thêm dụng cụ Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Chuẩn bị khơng gian phòng thí nghiệm từ trước để bạn sẵn sàng mở bao bì lắp đặt hệ thống sau nhận hàng Nếu bạn kết nối thiết bị với lưu trữ mạng, xác định mạng trước lắp đặt GHI CHÚ Việc thêm hệ thống vào mạng thêm thời gian Để trình lắp đặt diễn thuận lợi, Illumina khuyến nghị bạn hẹn sớm với người đại diện CNTT Để biết thêm thông tin, xem Hướng dẫn mạng máy chủ trang Cấu hình hộp vận chuyển iSeq 100 thành phần giao hộp vận chuyển màu nâu Hộp chứa hộp màu trắng đựng thiết bị, hộp phụ kiện, tài liệu hướng dẫn, dây nguồn cáp Ethernet u Hộp phụ kiện: u Miếng đệm hút ẩm dự phòng u Bộ lọc khơng khí dự phòng u Hộp thử nghiệm u Tế bào dòng chảy thử nghiệm u Tài liệu hướng dẫn: u Tờ hướng dẫn thiết lập iSeq 100 (tài liệu số 1000000035963) u Hướng dẫn an tồn tn thủ Hệ thống giải trình tự iSeq 100 (tài liệu số 1000000035336) GHI CHÚ Các hướng dẫn không giao với thiết bị, có hướng dẫn hệ thống, có mạng Xem Tài nguyên khác trang Kích thước hộp Dựa vào kích thước hộp sau để xác định kế hoạch vận chuyển, thiết lập bảo quản Bảng Hộp vận chuyển màu nâu Số đo Kích thước Chiều cao 49,5 cm (19,5 in) Chiều rộng 56,3 cm (21 in) Chiều sâu 58,4 cm (23 in) Trọng lượng 21 kg (47 lbs) Bảng Hộp đựng thiết bị màu trắng Số đo Kích thước Chiều cao 35,6 cm (14 in) Chiều rộng 43,2 cm (17 in) Chiều sâu 43,2 cm (17 in) Trọng lượng 17 kg (38 lb) Các u cầu phòng thí nghiệm Dựa vào dẫn kỹ thuật yêu cầu nêu mục để bố trí khơng gian phòng thí nghiệm Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Kích thước thiết bị Số đo Kích thước thiết bị lắp đặt Chiều cao (màn hình nâng lên) 42,5 cm (16,8 in) Chiều rộng 30,5 cm (12 in) Chiều sâu 33 cm (13 in) Trọng lượng 16 kg (35 lb) Các yêu cầu vị trí đặt Đặt thiết bị đảm bảo thơng gió đầy đủ dễ dàng tiếp cận để bảo dưỡng Đảm bảo kích thước khoảng hở tối thiểu sau để tiếp cận thiết bị từ phía Tiếp cận Khoảng hở tối thiểu Hai bên Để 30 cm (12 in) bên thiết bị Phía sau Để 15,25 cm (6 in) phía sau thiết bị Phía Để 30 cm (12 in) phía thiết bị u Đảm bảo bạn với tay vòng qua bên phải thiết bị để tiếp cận công tắc nguồn bảng phía sau u Đặt thiết bị cho bạn nhanh chóng rút dây nguồn khỏi ổ cắm Hướng dẫn bàn thí nghiệm Thiết bị bao gồm phần tử quang học xác Đặt thiết bị bàn thí nghiệm vững chãi tránh xa nguồn gây rung Hướng dẫn độ rung Trong trình chạy giải trình tự, sử dụng biện pháp thực hành tốt sau để giảm thiểu độ rung liên tục ngắt quãng đảm bảo hiệu hoạt động tối ưu: u Đảm bảo bàn thí nghiệm khơng có nguồn có khả gây rung, chẳng hạn như: Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đoán Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 u u Máy lắc, máy trộn dòng xốy, máy ly tâm, ngăn kéo, ngăn tủ kệ gây va chạm ngồi ý muốn với mặt bàn Các dòng khơng khí mạnh, chẳng hạn khí nén ni-tơ u Giữ cho khu vực khoảng hở không bị vướng u Không để vật tư tiêu hao sử dụng dụng cụ phụ kiện phòng thí nghiệm khác thiết bị u Khi tiếp xúc với thiết bị, sử dụng hình cảm ứng quy trình làm việc khuyến nghị để nạp tháo vật tư tiêu hao u Không tác động trực tiếp lên bề mặt thiết bị Các yêu cầu bảo quản thành phần thuốc thử Bảng sau cho biết nhiệt độ bảo quản kích thước thành phần cung cấp với Thuốc thử iSeq 100 E1 Kích thước khác tùy thuộc vào cấu hình (một bốn gói) Thành phần Nhiệt độ bảo quản Chiều dài Chiều rộng Chiều cao Hộp (một gói) -25°C đến -15°C 17,8 cm (7 in) 15,2 cm (6 in) 10,2 cm (4 in) Hộp (bốn gói) -25°C đến -15°C 17,8 cm (7 in) 28,6 cm (11,25 in) 14,6 cm (5,75 in) Tế bào dòng chảy (một gói) 2°C đến 8°C 10,2 cm (4 in) 10,2 cm (4 in) 2,5 cm (1 in) Tế bào dòng chảy (bốn gói) 2°C đến 8°C 10,2 cm (4 in) 10,2 cm (4 in) 10,2 cm (4 in) Thiết lập phòng thí nghiệm để thực quy trình PCR Một số phương pháp chuẩn bị thư viện đòi hỏi quy trình phản ứng chuỗi polymerase (Polymerase Chain Reaction, PCR) Hãy thiết lập khu vực riêng quy trình riêng cho phòng thí nghiệm để ngăn nhiễm bẩn sản phẩm PCR trước bắt đầu làm việc phòng thí nghiệm Các sản phẩm PCR gây nhiễm bẩn thuốc thử, thiết bị mẫu, làm trì hỗn hoạt động bình thường khiến kết khơng xác Các khu vực trước PCR sau PCR Sử dụng hướng dẫn sau để tránh nhiễm bẩn chéo u Thiết lập khu vực trước PCR cho quy trình xử lý trước PCR u Thiết lập khu vực sau PCR cho quy trình xử lý sản phẩm PCR u Không sử dụng bồn rửa để rửa vật liệu trước PCR sau PCR u Không sử dụng hệ thống tinh lọc nước cho khu vực trước PCR sau PCR u Bảo quản vật tư dùng cho quy trình trước PCR khu vực trước PCR Chuyển vật tư đến khu vực sau PCR cần thiết Chỉ định thiết bị vật tư u Không dùng chung thiết bị vật tư quy trình trước PCR và sau PCR Chỉ định thiết bị vật tư riêng khu vực u Thiết lập khu vực bảo quản riêng cho vật tư tiêu hao sử dụng khu vực Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Các yêu cầu điện Chỉ dẫn kỹ thuật nguồn điện Loại Chỉ dẫn kỹ thuật Điện áp đường dây 100–240 VAC ở 50/60 Hz Mức công suất tiêu thụ đỉnh 80 Watt Bắt buộc phải nối đất Nếu điện áp dao động 10%, bắt buộc phải có thiết bị ổn áp Nối đất bảo vệ Thiết bị có kết nối với dây nối đất bảo vệ qua vỏ Nối đất an toàn dây nguồn mang đến nối đất bảo vệ tới mốc quy chiếu an toàn Kết nối nối đất bảo vệ dây nguồn phải tình trạng hoạt động tốt sử dụng thiết bị Dây nguồn Thiết bị có ổ cắm theo tiêu chuẩn quốc tế IEC 60320 C13 kèm dây nguồn dành riêng cho khu vực Dây cho Bắc Mỹ dài 2,44 m (8 ft) Dây cho tất khu vực khác dài 2,5 m (8,2 ft) Để mua ổ cắm dây nguồn tương đương phù hợp với tiêu chuẩn địa phương, tham khảo nhà cung cấp bên thứ ba, chẳng hạn Interpower Corporation (www.interpower.com) Điện áp nguy hiểm loại bỏ khỏi thiết bị rút dây nguồn khỏi nguồn điện AC Cầu chì Mơ đun nguồn đầu vào bao gồm hai cầu chì đầu vào đường dây cao áp đầu vào Cầu chì có kích thước mm × 20 mm định mức 10 A, 250 VAC, đứt chậm Bộ cấp nguồn liên tục Illumina khuyến nghị sử dụng cấp nguồn liên tục (UPS) thích hợp khu vực với cơng suất 500 VA Bảng sau đưa hai mơ hình làm ví dụ Bảng Khuyến nghị dành riêng cho khu vực Chỉ dẫn kỹ thuật APC Smart UPS 2200 VA LCD 120 V (Nhật Bản/Bắc Mỹ) APC Smart UPS 2200 VA LCD 230 V (Quốc tế) Công suất tối đa 1920 W 1980 W Điện áp đầu vào (danh định) 100–120 VAC 220–240 VAC Tần số đầu vào 50/60 Hz 50/60 Hz Kết nối đầu vào NEMA 5-20P IEC-320 C13 Thời gian chạy điển hình (50 W) giờ Thời gian chạy điển hình (100 W) 16 phút 16 phút Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Illumina khơng chịu trách nhiệm lần chạy bị ảnh hưởng tình trạng ngắt điện, thiết bị có kết nối với UPS hay không Điện sinh từ máy phát điện tiêu chuẩn bị gián đoạn, tình trạng ngắt điện nhanh trước có lại điện phổ biến Các lưu ý môi trường Yếu tố Chỉ dẫn kỹ thuật Nhiệt độ Duy trì nhiệt độ phòng thí nghiệm từ 15°C đến 30°C (22,5°C±7,5°C) Trong chạy, không để nhiệt độ môi trường xung quanh thay đổi ±2°C Độ ẩm Duy trì độ ẩm tương đối không ngưng tụ khoảng 20–80% Độ cao Đặt thiết bị độ cao 2000 mét (6500 feet) Chất lượng khơng khí Vận hành thiết bị mơi trường nhà Duy trì mức độ hạt khơng khí theo ISO (khơng khí phòng thơng thường) tốt Độ rung Giới hạn độ rung môi trường theo mức dành cho văn phòng ISO hoặc tốt Cơng suất nhiệt Định mức công suất tối đa Công suất nhiệt 80 Watt 273 BTU/giờ Công suất tiếng ồn Công suất tiếng ồn (dB) Khoảng cách từ thiết bị < 62 dB mét (3,3 feet) Số đo < 62 dBA nằm mức hội thoại bình thường khoảng cách khoảng mét (3,3 feet) Hướng dẫn mạng máy chủ Mục cung cấp hướng dẫn mạng dành cho người đại diện CNTT Trừ tổ chức bạn có yêu cầu cụ thể mạng, kết nối WiFi Ethernet đủ để truyền liệu Nếu tổ chức bạn có yêu cầu cụ thể mạng, hỏi ý kiến người đại diện CNTT để trợ giúp cài đặt mạng nâng cao GHI CHÚ WiFi tắt theo mặc định Việc cấu hình thư mục đầu nằm mạng bạn yêu cầu phải có kết nối mạng Hệ thống giải trình tự iSeq 100 thiết kế để sử dụng với mạng, lần chạy có cấu hình cho BaseSpace Sequence Hub hay không Các hoạt động sau đòi hỏi kết nối internet bên ngồi, kể không sử dụng BaseSpace Sequence Hub: u Cập nhật phần mềm điều khiển u Tải liệu hiệu hoạt động thiết bị lên Illumina u Hỗ trợ từ xa từ phận Hỗ trợ kỹ thuật Illumina Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Các lưu ý truyền liệu iSeq 100 hỗ trợ WiFi, Ethernet cung cấp kết nối tin cậy Cường độ mạng không ổn định gián đoạn WiFi thường xuyên kéo dài thời gian truyền liệu trì hỗn lần chạy Không thể bắt đầu lần chạy Universal Copy Service (UCS) chưa hoàn thành truyền liệu cho lần chạy trước GHI CHÚ Gián đoạn WiFi truyền liệu không gây liệu Bảo mật mạng máy tính Những mục sau cung cấp hướng dẫn trì bảo mật mạng máy tính u Để biết thơng tin cấu hình khuyến nghị, xem Cấu hình hệ điều hành trang 12 u Để biết thêm thông tin cập nhật bảo mật, tường lửa Giao thức hình từ xa (RDP), xem Hướng dẫn cách thực hành tốt bảo mật Illumina (Ấn phẩm số 970-2016-016) Bảo mật máy tính điều khiển Máy tính điều khiển kết hợp phần mềm chống vi-rút người dùng cung cấp tùy chọn cấu hình sau nhằm nâng cao tính bảo mật u Bộ công cụ hạn chế khai thác lỗ hổng phần mềm (Enhanced Mitigation Experience Toolkit, EMET)—Ngăn chặn việc khai thác lỗ hổng phần mềm u Các sách hạn chế phần mềm—Tăng độ tin cậy, tính tồn vẹn khả quản lý máy tính miền Bằng cách hạn chế cấu hình, cho phép chạy ứng dụng định Nếu cần, tắt cấu hình lại EMET sách hạn chế phần mềm Để biết thêm thông tin, liên hệ với phận Hỗ trợ kỹ thuật Illumina Phần mềm chống vi-rút Khuyến nghị sử dụng phần mềm chống vi-rút mà bạn lựa chọn để bảo vệ máy tính điều khiển thiết bị khỏi nhiễm vi-rút Để tránh liệu gián đoạn quy trình, cấu hình phần mềm chống vi-rút sau: u Cài đặt quét thủ công Không cho phép quét tự động u Chỉ thực quét thủ công không sử dụng thiết bị u Cài đặt tải xuống (mà không cài đặt) nâng cấp phần mềm chống vi-rút khơng có cho phép người dùng u Không tiến hành cập nhật thiết bị vận hành Chỉ cập nhật thiết bị không chạy khởi động lại máy tính điều khiển cách an tồn u Khơng để máy tính tự động khởi động lại sau cập nhật u Loại trừ thư mục ứng dụng ổ liệu khỏi hoạt động bảo vệ hệ thống tập tin thời gian thực Áp dụng cài đặt cho thư mục C:\Illumina u Tắt Windows Defender Sản phẩm Windows ảnh hưởng đến tài nguyên hệ điều hành mà phần mềm Illumina sử dụng Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Sử dụng thích hợp Máy tính điều khiển thiết bị thiết kế để vận hành hệ thống giải trình tự Illumina Khơng coi máy tính thơng dụng Vì lý chất lượng bảo mật, khơng sử dụng máy tính điều khiển để duyệt web, kiểm tra email, xem tài liệu cho hoạt động không cần thiết khác Những hoạt động dẫn đến suy giảm hiệu hoạt động liệu Kết nối mạng Illumina không cài đặt hay cung cấp hỗ trợ kỹ thuật cho việc kết nối mạng Hãy xem xét hoạt động bảo trì mạng để biết nguy tính tương thích có với iSeq 100 Dựa vào hướng dẫn sau để cài đặt cấu hình kết nối mạng: u Sử dụng kết nối 1 gigabit dành riêng thiết bị hệ thống quản lý liệu Kết nối trực tiếp thông qua chuyển đổi mạng u Kết nối yêu cầu băng thông Mb/giây/thiết bị lần tải lên mạng nội bộ, tải lên mạng BaseSpace Sequence Hub tải lên liệu vận hành thiết bị u Thiết bị mạng, chẳng hạn chuyển đổi, phải có tốc độ kết nối tối thiểu 1 gigabit/giây Tổng lượng sử dụng chuyển đổi không vượt tốc độ định mức u Các chuyển đổi phải quản lý u Tính tốn dung lượng tổng tải chuyển đổi mạng Số thiết bị kết nối thiết bị phụ, chẳng hạn máy in, ảnh hưởng đến dung lượng u Nếu có thể, phân lập lưu lượng giải trình tự với lưu lượng mạng khác u Các cáp phải CAT-5e loại tốt Hộp vận chuyển chứa cáp mạng CAT-5e có vỏ bọc dài mét (9,8 feet) Kết nối với máy tính điều khiển Tham khảo sơ đồ sau tích hợp hệ thống iSeq 100 vào mạng quản lý Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn 10 Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Hình Sơ đồ mạng Kết nối Bảng sau cho biết cổng mạng máy tính điều khiển Địa MAC riêng cho thiết bị cung cấp trước giao thiết bị Địa cung cấp quyền truy cập mạng Ethernet WiFi Cổng Mục đích 443 BaseSpace Sequence Hub liệu hiệu hoạt động thiết bị 80 BaseSpace Sequence Hub liệu hiệu hoạt động thiết bị 8080 Cập nhật phần mềm Các miền BaseSpace Sequence Hub Những miền sau cho phép truy cập từ Universal Copy Service sang BaseSpace Sequence Hub liệu hiệu hoạt động thiết bị Một số địa Doanh nghiệp chứa trường miền người dùng xác định Trường tùy chỉnh giữ chỗ trước {domain} Trường hợp Địa Doanh nghiệp Hoa Kỳ {domain}.basespace.illumina.com {domain}.api.basepace.illumina.com basespace-data-east.s3-external-1.amazonaws.com basespace-data-east.s3.amazonaws.com instruments.sh.basespace.illumina.com Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn 11 Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Trường hợp Địa Doanh nghiệp tại Liên minh châu Âu {domain}.euc1.sh.basespace.illumina.com {domain}.api.euc1.sh.basepace.illumina.com euc1-prd-seq-hub-data-bucket.s3-eu-central1.amazonaws.com instruments.sh.basespace.illumina.com Miền chuyên nghiệp Hoa Kỳ basespace.illumina.com api.basepace.illumina.com basespace-data-east.s3-external-1.amazonaws.com basespace-data-east.s3.amazonaws.com instruments.sh.basespace.illumina.com euc1.sh.basespace.illumina.com Miền chuyên nghiệp tại Liên minh châu Âu api.euc1.sh.basepace.illumina.com euc1-prd-seq-hub-data-bucket.s3-eu-central1.amazonaws.com instruments.sh.basespace.illumina.com Cấu hình hệ điều hành Các thiết bị Illumina kiểm tra xác minh vận hành phạm vi dẫn kỹ thuật trước giao hàng Sau lắp đặt, việc thay đổi cài đặt tạo nguy giảm hiệu hoạt động nguy bảo mật Nên cấu hình theo khuyến nghị sau để giảm nguy giảm hiệu hoạt động nguy bảo mật hệ điều hành: u Cấu hình mật có 10 ký tự tham khảo sách ID nội để hướng dẫn thêm Lưu giữ ghi mật u Illumina không giữ thông tin đăng nhập khách hàng đặt lại mật không xác định u Mật khơng xác định đòi hỏi người đại diện Illumina khôi phục mặc định nhà sản xuất Việc khơi phục xóa bỏ tồn liệu khỏi hệ thống kéo dài thời gian hỗ trợ u Ngăn chặn cập nhật cách tắt chức Cập nhật tự động Windows u Khi kết nối với miền có Các đối tượng theo sách nhóm (Group Policy Objects, GPO), số cài đặt ảnh hưởng đến hệ điều hành phần mềm thiết bị Nếu phần mềm thiết bị hoạt động bất thường, hỏi ý kiến quản trị viên CNTT sở khả nhiễu GPO xảy u Sử dụng tường lửa Windows tường lửa mạng (phần cứng phần mềm) vơ hiệu hóa RDP u Duy trì đặc quyền quản trị cho người dùng Phần mềm thiết bị Illumina cấu hình phép quyền hạn người dùng thiết bị giao u Illumina thiết kế máy tính điều khiển để vận hành hệ thống giải trình tự Việc duyệt web, kiểm tra email, xem tài liệu hoạt động giải trình tự khác gây vấn đề chất lượng bảo mật Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn 12 Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Cập nhật Windows Nhằm kiểm sốt cấu hình hoạt động máy tính điều khiển mang lại môi trường vận hành mạnh mẽ hơn, Hệ điều hành Windows mặc định tắt chức Cập nhật Windows Các cập nhật hệ thống không hỗ trợ khiến mơi trường vận hành gặp rủi ro Các phương án thay cho việc bật chức Cập nhật Windows bao gồm: u Tường lửa phân lập mạng (LAN ảo) mạnh mẽ u Phân lập mạng thiết bị lưu trữ gắn vào mạng (NAS), cho phép đồng hóa liệu lên mạng u Thiết bị lưu trữ USB cục u Hành vi người dùng cách thức quản lý người dùng nhằm tránh sử dụng máy tính điều khiển sai mục đích đảm bảo kiểm sốt sở có cho phép phù hợp Phần mềm bên thứ ba Illumina hỗ trợ phần mềm cung cấp vào lúc lắp đặt Phần mềm bên thứ ba, chẳng hạn Chrome, Java Box, chưa thử nghiệm gây ảnh hưởng đến hiệu hoạt động tính bảo mật Ví dụ: RoboCopy chương trình tương tự làm gián đoạn q trình tạo dòng thực phần mềm điều khiển Gián đoạn gây hỏng thiếu liệu giải trình tự Yêu cầu xuất lưu trữ liệu Illumina khuyến nghị tải liệu lên BaseSpace Sequence Hub Nếu lưu trữ liệu cục bộ, tham khảo kích cỡ tập tin xấp xỉ sau Những tập tin tạo lần chạy giải trình tự phân tích sau Tập tin đầu Kích cỡ xấp xỉ BAM 600 MB BCL 850 Mb FASTQ 850 MB gVCF và VCF < 10 MB InterOp 2,5 Mb Vật tư tiêu hao thiết bị Các vật tư tiêu hao thiết bị người dùng cung cấp sau sử dụng để giải trình tự bảo trì hệ thống Để biết thêm thơng tin, xem Hướng dẫn Hệ thống giải trình tự iSeq 100 (tài liệu số 1000000036024) Vật tư tiêu hao người dùng cung cấp để giải trình tự Vật tư tiêu hao Nhà cung cấp Mục đích Găng tay khơng có bột, dùng lần Nhà cung cấp vật tư phòng thí nghiệm thơng thường Mục đích thơng dụng Khăn lau tẩm cồn isopropyl, 70% VWR, danh mục số 95041-714, tương đương Làm tế bào dòng chảy mục đích thơng dụng Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn 13 Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Vật tư tiêu hao Nhà cung cấp Mục đích Giấy lụa dùng cho phòng thí nghiệm, khơng xơ VWR, danh mục số  21905-026, tương đương Làm tế bào dòng chảy mục đích thơng dụng Ống ly tâm, 1,5 ml VWR, danh mục số 20170-038, tương đương Pha loãng thư viện đến nồng độ nạp Khăn giấy Nhà cung cấp vật tư phòng thí nghiệm thông thường Lau khô hộp sau nhúng nước Dung dịch đệm tái huyền phù (RSB, Resuspension Buffer) Đi kèm kit chuẩn bị thư viện Illumina Pha loãng thư viện đến nồng độ nạp [Tù y chọn] 10 mM Tris-HCl, pH 8,5 Nhà cung cấp vật tư phòng thí nghiệm thơng thường Thay cho RSB để pha lỗng thư viện đến nồng độ nạp [Tù y chọn] Chất kiểm chuẩn PhiX v3 Illumina, danh mục số FC-110-3001 Thêm chuẩn PhiX để sử dụng làm chất kiểm chuẩn Vật tư tiêu hao người dùng cung cấp để dùng cho bảo trì khắc phục cố Vật tư tiêu hao Nhà cung cấp Mục đích Găng tay khơng có bột, dùng lần Nhà cung cấp vật tư phòng thí nghiệm thơng thường Mục đích thơng dụng Khăn lau tẩm cồn isopropyl, 70% khăn lau tẩm ethanol, 70% VWR, danh mục số 95041-714, tương đương Làm thiết bị sau rò rỉ Giấy lụa dùng cho phòng thí nghiệm, khơng xơ VWR, danh mục số  21905-026, tương đương Lau khô khay hứng nước ngưng Khăn giấy Nhà cung cấp vật tư phòng thí nghiệm thông thường Làm khay hứng nước ngưng Chất kiểm chuẩn PhiX v3 Illumina, danh mục số FC-110-3001 Tiến hành chạy khắc phục cố PhiX  [Tù y chọn] Dung dịch thuốc tẩy, 10% VWR, danh mục số 16003-740, 16003-742, tương đương Làm bề mặt làm việc sau khử nhiễm thiết bị Thiết bị người dùng cung cấp Vật tư Nguồn Mục đích Tủ đơng, -25°C đến -15°C Nhà cung cấp vật tư phòng thí nghiệm thông thường Bảo quản hộp Thùng đá Nhà cung cấp vật tư phòng thí nghiệm thơng thường Đặt riêng thư viện Tủ lạnh, 2°C đến 8°C Nhà cung cấp vật tư phòng thí nghiệm thơng thường Bảo quản tế bào dòng chảy rã đơng hộp [Tù y chọn] Bàn phím Nhà cung cấp thơng thường Bổ sung cho bàn phím hình [Tù y chọn] Chuột máy tính Nhà cung cấp thơng thường Bổ sung cho giao diện hình cảm ứng Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn 14 Hướng dẫn chuẩn bị khu vực làm việc Hệ thống giải trình tự iSeq 100 Hỗ trợ kỹ thuật Để hỗ trợ kỹ thuật, liên hệ với phận Hỗ trợ kỹ thuật Illumina Trang web: Email: www.illumina.com techsupport@illumina.com Các số điện thoại hỗ trợ khách hàng Illumina Khu vực Số miễn cước Khu vực Bắc Mỹ +1.800.809.4566 Áo +43 800006249 +43 19286540 Bỉ +32 80077160 +32 34002973 Đài Loan 00806651752 Đan Mạch +45 80820183 +45 89871156 Đức +49 8001014940 +49 8938035677 Hà Lan +31 8000222493 +31 207132960 Hong Kong 800960230 Ireland +353 1800936608 +353 016950506 Na Uy +47 800 16836 +47 21939693 New Zealand 0800.451.650 Nhật Bản 0800.111.5011 Pháp +33 805102193 +33 170770446 Phần Lan +358 800918363 +358 974790110 Singapore +1.800.579.2745 Tây Ban Nha +34 911899417 +34 800300143 Thụy Điển +46 850619671 +46 200883979 Thụy Sĩ +41 565800000 +41 800200442 Trung Quốc 400.066.5835 Úc +1.800.775.688 Vương quốc Anh +44 8000126019 +44 2073057197 Ý +39 800985513 +39 236003759 Các nước khác +44.1799.534000 Các bảng liệu an tồn (SDS)—Có trang web Illumina địa support.illumina.com/sds.html Tài liệu hướng dẫn sản phẩm—Có thể tải xuống PDF từ trang web Illumina Truy cập support.illumina.com, chọn sản phẩm, sau chọn Documentation & Literature (Tài liệu hướng dẫn & tài liệu giới thiệu) Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn 15 Tài liệu số 1000000035337 v00 VIE Illumina 5200 Illumina Way San Diego, California 92122 U.S.A +1.800.809.ILMN (4566) +1.858.202.4566 (ngoài khu vực Bắc Mỹ) techsupport@illumina.com www.illumina.com Chỉ dùng cho mục đích nghiên cứu Khơng dùng quy trình chẩn đốn © 2017 Illumina, Inc Bảo lưu quyền