Phế cầu khuẩn (Streptococcus pneumoniae) là một thành viên phổ biến của hệ vi khuẩn chí vùng hầu họng, tỷ lệ người lành mang phế cầu thay đổi theo từng độ tuổi, môi tr ường, mùa,...là một loài vi khuẩn Gram dương thuộc chi Streptococcus. S. pneumoniae Phế cầu khuẩn là những song cầu hình ngọn nến hai đầu to giáp vào nhau, hai đầu nhọn quay ra ngoài, đường kính 0,5 1,25 micro mét. Trong môi trường nuôi cấy có thể nhiều đôi xếp liên tiếp với nhau thành từng chuỗi dễ lẫn với liên cầu. Trong bệnh phẩm hay trong môi trường nuôi cấy có nhiều albumin thì có vỏ. Không có lông, không di động, không sinh nha bào và bắt màu Gram dương.