Do Bitexco Financial Tower là tòa nhà chọc trời nên thiết kế kết cấu và xây dựng thế nào để tòa nhà chịu được gió, bão và động đất cũng là điều mà cả chủ đầu tư và các kỹ sư thiết kế hết sức lưu tâm. Tòa tháp Burj Khalifa sử dụng kết cấu khung bê tông lớn, Tháp 101 sử dụng hệ thống chống rung lắc đặc biệt. Riêng đối với Bitexco Financial Tower, vì đây là tòa tháp mảnh mai nên không thể áp dụng công nghệ của hai tòa tháp trên mà công nghệ chống gió, bão và động đất của Bitexco Financial Tower được triển khai ở tầng 29 và 30 của tòa nhà. Ở hai tầng này là hệ thống dầm cực lớn kết nối tường bao với trục trung tâm.