Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp

Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp Vi sinh môi trường Trường ĐH Lâm nghiệp

Chơng Bi mở đầu 1.1 Khái niệm vi sinh vật học v vi sinh vật học môi trờng Vi sinh vật l sinh vật nhỏ phải dùng kính hiển vi kính hiển vi điện tử nhìn thấy Tuy nhiên có loi vi khuẩn nhìn thấy mắt thờng nh Eupilospiscium fishelsoni (1993) v Thiomagrita mamibiensis (1998) Có ngời cho VSV độ lớn nhỏ m kỹ thuật nghiên cứu, khác với động thực vật VSV chiếm 2/3-3/5 số lợng SV VSV học l môn khoa học nghiên cứu hoạt động sống VSV, chúng bao gồm virus, viroid, vi khuẩn, vi khuẩn cổ sinh,nấm, tảo đơn bo, đông vật nguyên sinh Nội dung nghiên cứu vi sinh vật bao gồm : đặc điểm hình thái, sinh lý, di truyền biến dị, tiến hoá, phân loại, sinh thái Vi sinh vật học đợc chia chuyên môn khác nhau: VSV phân tử, VSV tế bo, tổ hợp gen VSV v nhiều chuyên môn khác nh VSV môi trờng Vi sinh vật học môi trờng (Environment microbiology) l phân nhánh vi sinh vật học Môi trờng l tất vật xung quanh, l thể tổng hợp giới bên ngoi ngời, sinh vật khác v phi sinh vật l nhân tố môi trờng.Dựa vo môi trờng ngời ta chia môi trờng tự nhiên v môi trờng nhân tao Môi trờng tự nhiên l tổng thể tất vật chất, lợng v tợng tự nhiên nh ánh sáng, nhiệt độ, khí hậu, địa từ, không khí, nớc, đất, đá, động thực vật, vi sinh vật v nhân tố tự nhiên khác ảnh hởng trực tiếp đến sinh tồn v phát triển sản xuất ngời Chúng liên hệ với nhau, khống chế lẫn Môi trờng nhân tạo l vật hoạt động ngời tạo nên bao gồm vật chất, lợng, sản phẩm tinh thần v mối quan hệ ngời với ngời hình thnh hoạt động ngời Môi trờng nhân tạo đợc tổ thnh nhân tố sức sản xuất,tiến kỹ thuật, vật kiến trúc, sản phẩm v lợng, thể chế trị, hnh vi xã hội, tín ngỡng tôn giáo, văn hóa v địa phơng Từ ta nhận thấy, vi sinh vật thành viên môi trờng tự nhiên liên quan với nhân tố tự nhiên khác 1.2.Vấn đề môi trờng v phát triển khoa học môi trờng Vấn đề môi trờng l hậu phá hoại môi trờng Vấn đề môi trờng ( sơ sinh) l phá hoại môi trờng gây biến đổi giới tự nhiên, trạng thái cục khu vực Vấn đề môi trờng thứ hai ( thứ sinh) đợc chia loại: l khai thác lợi dụng ti nguyen thiên nhiên không hợp lý lm xấu hoá chất lợng môi trờng Hai l tăng dân số, đô thị hoá v công nghiệp hóa phát triển nhanh gây ô nhiễm v phá hoại môi trờng http://www.ebook.edu.vn Vấn đề môi trờng có giai đoạn lịch sử nó: (1) Giai đoạn sinh từ trớc cách mạng công nghiệp, chủ yếu l chặt phá rừng, chăn thả gia súc bừa bãi, gây xói mòn đất, lũ lụt, mặn hoá đất (2) Giai đoạn từ cách mạng công nghiệp đến thập kỷ 50 TK 20 chủ yếu lm xấu hoá môi trờng sản xuất dầu mỏ v khí thiên nhiên, tiêu hao cho xe, máy phát điện (3) Giai đoạn từ 1950-1980, dân số v đô thị hoá tăng lên, công nghiệp dầu mỏ tập trung v mở rộng tiêu hao lợng lớn, nhận thức môi trờng mong manh, xuất vấn đề môi trờng giống nh giai đoạn Đó l giai đoạn cao tro lần đầu Ngy tháng năm 1972, hội nghị môi trờng Thế giới họp Stockhom Thuỵ Điển, nêu hiệu " có trái đất" v lấy ngy lm ngy môi trờng giới.(4) Giai đoạn từ thập kỷ 80 TK 20 đến nay, l giai đoạn cao tro lần thứ vấn đề môi trờng Bát đầu xuất ô nhiễm môi trờng v phá hoại hẹ sinh thái trogn phạm vi rộng lớn Con ngời quan tâm đén vấn đề: (1) ô nhiễm khí ton cầu nh hiệu ứng lồng kính, thủng tầng ozon, ma axit (2) Phá hoại sinh thái diện rộng nh huỷ diệt rừng, thiếu nớc ngọt, xói mòn đất, thoái hoá đồng cỏ, sa mạc hóa, giảm động thực vật hoang dại, vật thải nguy hiểm lan rộng (3) Những kiện ô nhiễm môi trờng nghiêm trọng đột xuất xẩy ra, uy hiếp đến sống v phát triển ton nhân loại, cản trở phát triển bền vững, gây nên tổn thất lớn đến kinh tế Khoa học môi trờng l môn khoa học lấy hệ thống "con ngời v môi trờng" lm đối tợng nghiên cứu, tuân theo quy luật tự nhiên , lợi dụng tự nhiên để cải tạo môi trờng Về mặt tính chất v tác dụng khoa học môi trờng đợc chia phần: môi trờng học sở, môi trờng học ứng dụng v khoa học môi trờng Môi trờng học sở bao gồm lĩnh vực vật lý nh học môi trờng, quang học môi trờng, nhiệt học môi trờng, điện từ học môi trờng, động lực không khí môi trờng; lĩnh vực sinh vật học nh vi sinh vật học môi trờng, thuỷ sinh vật học môi trờng, sinh thái học ô nhiễm Môi trờng học ứng dụng bao gồm công trình học môi trờng, quản lý môi trờng, hnh vi học môi trờng, luật pháp môi trờng, kinh tế học môi trờng, quy hoạch môi trờng Rõ ràng vi sinh vật học môi trờng môn khoa học sở khoa học môi trờng 1.3.Lịch sử phát triển vi sinh vật học v vi sinh vật học môi trờng Thời TQ cổ đại 8000 năm, 4000 năm biết lm rợu v phổ biến, thời Ai cập cổ đại 2500 năm TK trớc công nguyên dung vi khuẩn khai thác đồng.TK 16 Fracasoto phát bệnh l SV không nhìn thấy gây 1632-1723 Leeuwenhook nhờ kình hiển vi tự chế ( phóng đại 50-300 lần) v nhìn thấy vi khuẩn v động vật nguyên sinh Về sau nhiều kiện lớn VSV đợc khám phá từ 1857 Pasteur phát men axit lactic l VSV gây năm gần 1997 hon thnh xác đinh tổ gen sinh vật nhân thật, phải trải qua 40 công trình phát minh lớn.Trong có 30 nh KH đợc giải thởng Noben Sau Leeuwenhook 200 năm có công trình nghiên cứu VSV, ngời đặt móng cho VSV học l Louis Pasteur(1822-1895) v Robert Koch (1843-1910) Louis Pasteur có công trình sau: http://www.ebook.edu.vn - Đả phá thuyết tự sinh (TK 17) - Miễn dịch học (1877) - Chứng minh lên men l VSV - Khử trùng VSV 60-65oC Robert Koch có công trình: - Chứng minh vi khuẩn gây bệnh thán th (loét than) - Phát VK gây bệnh phổi - Chứng minh nguyên tắc vật no gây bệnh - KT VSV gây bệnh, pha chế môI trờng v thao tác gây cấy Nhờ nh khoa học đó, VSV học trở thnh môn độc lập v chia môn học khác nh: vi khuẩn hoc, KT khử trùng ngoại khoa, miễn dịch học,VSV đất, virus học, lên men học, điều trị hoá học Ngy nội dung cng phong phú hơn, có khoa học VSV môi trờng với phơng pháp xử lý nớc thải (1914), xử lý mng sinh vật háo khí (1950), xử lý nớc thải phơng pháp yếm khí (1970) thoát amoniac, loại bỏ P VSV (1970) đến xử lý vật thải rắn VSV (1932-1976) Các thí nghiệm kiểm tra VSV môi trờng máy BOD (1970) 1.4.Nội dung v triển vọng vi sinh vật học môi trờng Từ thập kỷ 60 môn vi sinh học môi trờng đợc hình thnh với nội dung: (1) Nghiên cứu sinh thái học vi sinh vật môi trờng tự nhiên bao gồm quần xã, kết cấu, chức v động thái vi sinh vật môi trờng tự nhiên (2) Nghiên cứu sinh thái học vi sinh vật môi trờng ô nhiễm, gọi l vi sinh vật ô nhiễm, chủ yếu l nghiên cứu mối quan hệ môi trờng ô nhiễm với quần xã vi sinh vật bao gồm phân giải chuyển hoá vật chất ô nhiễm (3) Nghiên cứu nguyên lý v phơng pháp vi sinh vật học xử lý sinh học vật ô nhiễm (4) Nghiên cứu phơng pháp v nguyên lý vi sinh vật học giám sát v đánh giá môi trờng Ngy khoa học VSV môi trờng không giới hạn xử lý vật ô nhiễm m chuyển sang phòng trừ ô nhiểm môi trờng bao gồm lĩnh vực bản: (1)ứng dụng KT gen bảo vệ MT (2)Lợi dụng VSV tiến hnh thay đổi VSV ô nhiễm MT lm phong phú thêm nội dung công nghệ (3)Lợi dụng VSV để xử lý vật ô nhiễm VSV MT (4) Lợi dụng VSV thực ti nguyên hóa v nguồn lợng hoá vật thải Triển vọng vi sinh vật học môi trờng VSV đa dạng bao gồm VK, xạ khuẩn, lam khuẩn, nấm men, nấm mốc,ĐV nguyên sinh v virus, môi trờng sinh trởng đa dạng, trao dổi chất đa dạng l kho ti nguyên có nhiều tiếm Có hớng nghiên cứu vi sinh vật môi trờng: (1)VSV học môi trờng mức sinh học phân tử.(2) Nghiên cứu hệ sinh thái VSV l hớng PT lớn Nghiên cứu vi sinh vật học phân tử phải đạt đợc mục đích: (1) Kỹ thuật xác định phân tử VSV môi trờng (2).Công nghệ gen VSV (3) Chuyển gen VSV vo động thực vật Mức hệ sinh thái theo hớng NC quần xã VSV với nội dung (1) Nghiên cứu máy phản ứng kiểu (2) Lợi dụng có chọn lọc VK phân giải cao vật http://www.ebook.edu.vn thải (3) Sản xuất rau để PT bền vững.(4) Nghiên cứu VSV môi trờng cực đoan, l VSV sống nhiệt độ cao để xử lý chất thải 1.5.Mối liên quan vi sinh học môi trờng với môn khoa học khác Ngoi kiến thức vi sinh vật học,VSV môi trờng liên quan với nhiều môn học nh sinh thái học, khí tợng học, thổ nhỡng học, thuỷ văn học, di truyền học, hóa học, sinh lý, sinh hoá, sinh học phân tử , y học, bệnh lý học Tóm lại, công nghiệp hoá, đô thị hoá cng phát triển vấn đề môi trờng trở thnh nhu cầu xúc, vi sinh vật học môi trờng với môn khoa học khác có nhiều tiềm phát triển theo nhu cầu phát triển bền vững http://www.ebook.edu.vn Chơng Chủng loại v phân bố Vi sinh vật môI trờng 2.1 Các loại VSV chủ yếu 2.1.1.Những phân loại VSV VSV l sinh vật nhỏ, kết cấu đơn giản, ngoi đặc trng hình thái học, sinh lý học v sinh thái học để lm giám định v phân loại truyền thống nh sinh vật bậc cao phải vo đặc trng đại nh đặc trng tế bo, phân tử , hoá học, vật lý học,di truyền, miễn dịch, sinh học phân tử Những đặc trng sau thờng l thờng dùng: 2.1.1.1 Đặc trng hình thái học Đặc trng hình thái học luôn l quan trọng để phân loại VSV, nguyên nhân l dễ quan sát, so sánh; nhiều đặc trng hình tháI đợc biểu đạt dựa vo gen nên tơng đối ổn định Những đặc trng hình thái lm phân loại VSV nhân nguyên thuỷ đợc thể biểu 2.1 Biểu 2.1 Đặc trng hình thái giám định phân loại VSV thờng dùng Đặc trng Phân biệt quần thể khác Hình dạng, mu sắc, kích thớc, lồi lõm, chất, bóng v Đặc trng khuẩn lạc tan nớc Hình thái tế bào Cầu, que, cung, xoắn, sợi nhánh v khác Hình dạng Đọ rộng đờng kính Kích thớc Đơn, đôi, chuỗi, khác Sắp xếp Kết cấu tế bào Có hay không, vị trí v số lợng Lông roi Có hay không, hình dạng, vị trí,bo nang to nhỏ Bo tử mầm Hình dạng, vị trí mọc, số lợng v xếp Bo tử Mng nhầy, vật phụ khác nh cuống, sợi, bẹ, Khác Vách tế bo, mng trong, bề mặt bo tử Kết cấu siêu hiển vi TB,hạt S, bọt khí, tinh thể,hạt nhuộm mu Nội chất tế bào Nhuộm mu Gram, nhuộm mu kháng chua Phản ứng nhuộm màu Lông roi, trợt, vận động theo thể xoắn Vận động 2.1.1.2.Đặc trng sinh lý sinh hoá Chủ yếu l chất v hoạt tính ezym v điều tiết protein-sản phẩm gen Căn vo chúng để phán đoán mối quan hệ thân thuộc Đặc trng sinh lý sinh hoá để phân loại VSV đợc thể biểu 2.2 http://www.ebook.edu.vn Biểu 2.2 Đặc trng sinh lý sinh hoá phân loại VSV Đặc trng Phân biệt quần thể khác Tự dữơng quang năng,dị dỡng quang năng,tự Loại dinh dỡng dỡng hóa năng, dị dỡng hoá năng, kiêm dinh dỡng Khả lợi dụng N Lợi dụng protein,pepton,axit amin,muối vô N,N2 Khả lợi dụng C Các loại đơn đờng,đờng đôi, đa đờng v cồn, Nhân tố sinh trởng axit hữu Cần oxy Vitamin, axit amin,X-,VTính thích ứng nhiệt độ Háo khí, hơI háo khí,yếm khí v kiêm yếm khí Thích hợp nhất,T sinh trởng thấp v cao Tính thích ứng pH v gây chết Thích ứng áp suất thẩm Phạm vi sinh trởng điều kiện pH thấu Tính chịu đng nồng độ muối v a muối Nhạy cảm kháng sinh v chất c chế Nhạy cảm với chất KS v NaCN,chất nhuộm mu Vật trao đổi Quan hệ vật chủ Các vật trao đổi đặc trng Cộng sinh, ký sinh, gây bệnh 2.1.1.3 Thí nghiệm huyết học v thể phage VK v virus có protein, lipoprotein, lipopolysacharide, kết cấu chúng khác nhau, đặc trng kháng nguyên chúng khác v có phản ứng riêng biệt., dùng huyết học để phân loại v giám định VSV l dựa vo phản ứng kháng nguyên v kháng thể Thể phage kí sinh vật chủ , vo phạm vi vật chủ tiến hnh diều tra dịch bệnh v giám định vật gây bệnh có ý nghĩa quan trọng phân loại VK Ngoi tìm biện pháp ngăn ngừa xâm nhập thể phage 2.1.1.4 Phân tích thứ tự axit amin v protein Protein l sản phẩm gen, thứ tự acid amin protein phản ánh trực tiếp mối quan hệ thứ tự mRNA v mật mã gen chép Cho nên thông qua so sánh thứ tự axit amin để tiến hnh phân loại v xây dựng phát dục hệ thống chúng Về mặt tiến hoá theo phân tích thứ tự axit amin v protein nói chung ổn định Nhng có trờng hợp ngoại lệ Nên phân tích cần chọn mẫu thích hợp để nghiên cứu phân loại VSV 2.1.1.5 Mô gốc kiềm v lai phân tử acid nucleic Mô gốc kiềm v lai phân tử acid nucleic l phơng pháp thờng dùng để so sánh gen v phân loại sinh vật a)Tổ thành gốc kiềm DNA (G+C%) DNA có gốc kiềm: adenosine (A) guanosine (G) cytisine (C) v thymine (T) Tổ thnh v xếp thứ tự gốc kiềm DNA định tính trạng di truyền sinh vật, đặc trng chúng ổn định, không phụ thuộc vo nhân tố bên http://www.ebook.edu.vn ngoi tuổi v nhân tố đột biến, dù có đột biến gen gốc kiềm không thay đổi Trong phân loại học dùng tỷ lệ G+C % chiếm ton gốc kiềm để lm phân loại sinh vật Mối sinh vật có tổ thnh gốc kiềm định, SV thân thuộc chúng có hm lợng G+C tơng tự, quan hệ thân thuộc quan hệ hm lợng xa Nhiều số liệu chứng minh, hm lợng G+C thực vật bậc cao trogn khoảng 35-50%, động vật có xơng 35-45%,SV nhân nguyên thuỷ 2280%, điều ny chứng tỏ SV nhân nguyên thuỷ l quần thể đa dạng Hiện chua có tiêu chuẩn cho đơn vị phân loại, nhng số liệu cho biết loi sống môi trờng khác chí khác 45%, chi khác 10 -15% Cho nên dùng tỷ lệ G+C lm đơn vị phân loại đến chi chí đến họ có ý nghĩa quan trọng Ví dụ chi VK xoắn hm lợng G+C l 38%, VK xoắn biển (Oceanospirillum) l 42 - 51%, VK xoắn nớc (Aquaspirillum) l 49-66% Ngy xa chi VK Micrococcus v Staphylococcus cho l có quan hệ thân thuộc, nhng sau kiểm tra tỷ lệ chúng khác nhua xa (30-38% v 64-75%) Hiện có điều chỉnh Phuơng pháp xác định tổ thnh gốc kiềm có nhiều, thờng dùng l phơng pháp nhiệt độ biến tính, mật độ nổi, v quang phổ so mu Trong phân loại VK thờng dùng phơng pháp nhiệt độ biến tính b)Lai phân tử nucleic acid DNA có kết cấu chuỗi đôI sau đun nóng, chuỗi đôi tách ra, để nguội chuỗi đơn nối thnh chuỗi đôi, cúng quan hệ chúng nối với , không thân thuộc không nối Dựa vo phơng pháp ny để phân loại VSV 2.1.1.6.Tổ hợp di truyền Phần lớn sinh vật nhân thật có sinh sản hữu tính, thờng dùng SSHT để định nghĩa loi SV nhân nguyên thuỷ SSHT, nhng chúng thông qua chuyển hoá v nối ghép tiến hnh trao đổi gen nhiễm sắc thể biểu đặc tính khác chi v loi Qua nghiên cứu , nhiễm sắc thể tồn vi khuẩn nối ghép, chuyển hoá, truyền dẫn phổ biến VK nguồn gốc, khôgn chúng không phát sinh Trên sở ngời ta dùng để phân loại Những trờng hợp ny thờng xẩy loi chi, chi thờng không xuất Tuy nhiên có trờng hợp nhân tố khác có thay đổi, nên không phảI l để phân loại VSV 2.1.2 VSV nhân nguyên thuỷ (Prokaryote) 2.1.2.1.Vi khuẩn (Bacterium) 1.Hình thái kich thớc tế bào VK, chủ yếu có loại: cầu khuẩn, trực khuẩn v xoắn khuẩn Ngoi có loại có cuống v có bẹ (vỏ áo) Cầu khuẩn thờng hình cầu v hình bầu dục sau phân chia bảo đảm xếp theo không gian định Thờng có đơn cầu khuẩn nh VK chất nớc tiểu (Micrococcus ureae); song cầu khuẩn nh VK viêm phổi (Diplococcus pneumoniae) liên cầu khuẩn nh VK tan huyết ( Streptococcus hemolypticus), tứ cầu khuẩn (M tetragenus) điệp cầu khuẩn (Sarcina ureae), cầu khuẩn chùm nho mu vng kim (Staphylococcus aureus) http://www.ebook.edu.vn Cầu khuẩn Streptococcus Trực khuẩn hình que ống tròn, hình thái phức tạp cầu khuẩn Có loại thẳng uốn , ngắn thô di mảnh, phần cuối tù nhọn lệch Nh VK que bo tử chồi loét than ( Bacillus anthracis) lệch đầu; VK Pasteur dịch chuột ( Pasteurella pestis) nhọn đầu Sự xếp khác (H 2.1B) Nói chung xếp l đặc trng hình thái nhng l giai đoạn sinh trởng v điều kiện nuôi cấy gây Cho nên l để phân loại Trực khuẩn Bacillus Xoắn khuẩn có vách dy cứng, thờng phân tán nh xoắn khuẩn lu huỳnh tím (Thiospirillium violaceum) Những vi khuẩn lần uốn gọi l VK vòng cung (Vibrio) Xoắn khuẩn Spirillium VK có cuống l loại đặc biệt, phía sau có vật gắn vo nh VK cuống ( Caulobacter) VK bẹ l nhiều VK vỏ áo, xếp theo đờng thẳng nh Sphaerotilus Kích thớc VK thờng lấy àm (1/mm) lm đơn vị Cầu khuẩn 0,5-2àm; trực khuẩn 0,5-1àm, xoăn khuẩn rộng 0,25-1,7àm, di 2-60àm ( phụ thuộc vo tuổi(tuổi nhỏ di tuổi gi, môi trờng v phơng pháp nhuộm mu.Độ di VK non di VK gi nhng độ rộng thờng thay đổi Thông thờng phải đo nhiều VK lấy số bình quân Cấu tạo tế bàoVK -Vách tế bào (cell vall): 10-25% trọng lợng, có chức cố định ngoại hình VK, giúp lông roi vận động, bảo vệ tế bo, giúp phân chai tế bo Vách TB dy mỏng kết cấu v thnh phần hoá học khác nên có phản ứng Gram khác ( chủ yếu có peptidoglycan l (75%) v VK Gram dơng có teichloic acid).VK G- có lớp vách tế bo bên ngoi v mng tế bo nhầy bên http://www.ebook.edu.vn teichloic acid tổ thnh, có 30% peptidoglycan Lớp ngoi có 3lớp nhỏ chất hoá học khác nhau: lớp l lipoprotein, l lipophosphat, l lipopolysacharoza (thnh phần v gây bệnh) G+ nhạy cảm với kháng sinh penicillin, G- lại không nhạy cảm -Màng tế bào chất(cell membrane) 10%, có hệ enzym phong phú chức năng: khống chế vận chuyển , trao đổi chất bên ngoi vo TB, trì áp suất thẩm thấu bình thờng; l điểm mọc lông roi cung cấp lợng cho lông roi vận động,l nơi tổng hợp enzym(ATP,hô hấp) Thể nhân (nucleotid =nuclear body)l đặc hữu nhân tế bo nguyên thuỷ l DNA chuồi đôi dạng vòng, di 0,25-3,0nm (1/106mm), uốn khúc gấp vo khu nhân, l sở vật chất thông tin di truyển VK -TB chất(cytoplasm) hay nội chất, suốt, nhầy, TP hoá học có nớc, protein, lipoid, acid nucleic, đờng v muối Trong tế bo chất chứa ribosome, bọt khí ,hạt chất v chất dạng hạt khác -Ribosome (thể đờng nhân) có 60% RNA v 40% protein L nơi tổng hợp protein -Bọt khí (gas vacuole) Nhiều VK nớc quang hợp, không lông roi thờng có nhiều bọt khí nhỏ,bọt khí nhiều mng protein tạo ra,dy khoảng 2nm, có tác dụng điều chỉnh tỷ trọng tế bo cho chúng trôi nớc -Vỏ đờng (glycoxalyx) l chất dịch nhầy độ dy bất định tiết ngoi vách tế bo, hình thnh trình trao đổi chất, vỏ ny có hay không, dy hay mỏng phụ thuộc vo đặc tính di truyền VK v điều kiện môi trờng Tổ thnh hoá học khác -Lông roi(flagelum).Thnh phần hoá học l 99%protein,hợp chất cacbon, lipid, chất khoáng 1% Đọ di thờng di thân thể , đờng kính nhỏ, 10-12nm, thấy dới KHV điện tử, Só lợng v vị trí lông roi khác nhiều Lông roi vi khuẩn -Lông tơ VK ( fimbria) thờng gặp VK G-,250-300 lông, chủ yếu để hấp phụ, -Bào mầm (spore) sinh trởng đến giai đoạn, số VK hình thnh bo mầm vách dy, chặt, chiết quang khó nhuộm mu, lợng nứoc thấp, enzym, trao đổi chất kém, đề kháng cao Một bo mầm sản sinh thể dinh dỡng, l hình thức sinh sản VK Sinh sản VK Phân chia l hình thức sinh sản phổ biến Phơng thức phân chia cầu khuẩn, có quan hệ với xếp chúng Của trực khuẩn v xoắn khuẩn thờng kéo di ra, thắt chia đôi 4.Đặc trng môi trờng VK Môi trờng có nhiều loại: rắn, nửa rắn, keo, lỏng Quần thể VK mọc môi trờng l khỉân lạc (colony) Đặc trng khuẩn lạc liên quan với sinh trởng, http://www.ebook.edu.vn điều kiện môi trờng v thời gian môi trờng chúng có tính ổn định v chuyên tính khác l quan trọng để nhận biết v phân loại VK Độ đục VK môi trờng lỏng thờng khác Những loại háo khí thờng đục phía trên, nhng VK kiêm yếm khí thờng đục v dới.,VK yếm khí thờng đục phía dới Một số loi VK hình thnh mng lắng dạng bông, có loi sủi bọt v có mu 5.Tính đa dạng vi khuẩn a Hệ thống phát dục VK Dựa vo đặc trng hình thái, đặc trng sinh lý sinh hoá v số đặc trng di truyền VK, ngời ta chia VK 12 quần thể: : VK biến dạng (Proteobacterium) 2: VK lu huỳnh xanh lục (Chloroherpeton) 3: VK mu lục không lu huỳnh (Chloroflexus) 4: Khuẩn dạng mốc (Plantomyces) 5.Lam khuẩn (Cyanobacteria) Xoắn khuẩn (Spirochaete) VK tựa hình que (Bacteroides) 8.VK thể áo (Chlamydia) Cầu khuẩn lạ (Deinococcus) 10.VK Gram dơng (G+ bacterium) 11 VK xoang nhiệt (Thermotoga) 12.VK que sinh nớc.(Hydrrogenobacter) b Loại hình chủ yếu vi khuẩn Về phân loại vi khuẩn, ngy theo hệ thống phân loại nh VK học Mỹ D.Bergey(1860-1937), có 300 nh phân loại VK 20 nớc theo hệ thống Hệ thống chia VK 33 nhóm Lần xuất gần vo 1994 Lần tái chia VK 30 nhóm nh sau: Biểu 2.3 Phân loại vi khuẩn Quần thể phân loại Chi đại diện I.Các chi VK cổ sinh,Lam khuẩn,VK quang hợp v VK phân nhánh sớm VK cố sinh: suối nớc nóng Thermoproteus,Sulfolobus (Crenarchaeota) Bao gồm 14 nhóm II VK que biến dạng Giói VK que biến dạng Rhdospirullum,Riketsia,Caulobacter (Proteobacteria) Bao gồm nhóm III VK G+ hm lợng G+C thấp Clostidium,Eubacterium,Bacillus Bao gồm nhóm IV.VK G+ hm lợng G+C cao Có nhóm Actinomyces,Micrococcus,Arthrobacter V VK dạng mốc nổi,, thể xoắn, VK que sợi, VK tự que v hình thoi Plantomyces, Spirochaete,Serpulina http://www.ebook.edu.vn 10 Zymomonas mobilis khuẩn đơn bo lên men vận động Tảo Achmanthes Anabaena Anabaenopsis Autosira Botrydiopsis Calothris Chlamydomonas Chlerella Chroococcus Cylindrospermum Fischerella Hapalosiphon Heterococcus Lynghya Mastigocladus Navicula Nostoc Oscillatoria Pinnularia Plectonema Pleurococcus Scenedesmus Scytonema Stigonema Tolypothrix Trichodesmium Ulothrix Vaucheria Volvax Westiellopsis Zygnema tảo vỏ khúc tảo vẩy cá tảo vòng tảo liềm ống tảo tựa khí cầu tảo lông my tảo áo tảo cầu nhỏ tảo cầu mu tảo bo tử ống tảo Fisch tảo ống mềm tảo cầu khác tảo sợi bẹ tảo cnh roi tảo hình thuyền tảo chuỗi hạt tảo má tảo vân lông chim tảo sợi bện tảo cầu rộng tảo san hô tảo cnh giả tảo cnh thật tảo cnh đơn tảo lông chùm tảo sợi tảo không vách ngăn tảo khối tảo tựa westi tảo hai Động vật nguyên sinh Amoeba Dunaliella Paramecium Plasmodium vivax Trichomonas vaginalis trùng amib trùng roi Dunal trùng roi, trùng phủ cỏ trùng sốt rét cách nhật trùng lông âm đạo http://www.ebook.edu.vn 148 Một số hình ảnh vSV môI trờng Protozoa ( động vật nguyên sinh) http://www.ebook.edu.vn 149 Rickettsia ( thể riket) Mycoplasma (thể phân chia) Chlamydia (thể áo) Spirochaeta (thể xoắn) Myxobacterium (khuẩn nhầy) Cyanobacterium (lam khuẩn) Vi khuẩn http://www.ebook.edu.vn 150 Pelodictyon khuan mang luoi Coryneum beijerinckii khuan dom qua dao Proteus vulgaris khuan que hai dang Acinetobacter khuan que bat dong Clostridium khuan thoi Klebsiella khuan sinh Leuconostoc khuan mang ruot Neurospora crassa khuan bao gan la http://www.ebook.edu.vn 151 Rhizobium khuan not san Bacillus khuan que ( truc khuan) khuan co dinh N Derxia Azotobacter Acetobacter Polyangium Khuan nhieu tui Pseudomonas aeurginosa khuan que gia Butyrivibrio khuan dang trung Methanosarcina khuan xep Streptococcus lactis lien cau khuan sua http://www.ebook.edu.vn 152 Streptococcus faecalis lien cau khuan phan Spirillium khuan xoan Spirochaeta the xoan Rickettsia Nocardia khuan san ho Thiomargarita namibiensis khuan chuoi hat luu huynh Desulfotomaculum khuan lap xuong thoat S Nấm men Saccharomyces http://www.ebook.edu.vn 153 Candida Endomycosis Nấm mốc Mucor Rhizopus Aspegillus Penicillium Trichoderma loi tảo Mastigocladus tao canh roi Trichodesmium tao long chum http://www.ebook.edu.vn Scenedesmus tao san ho Tolypothrix tao canh don 154 Fischerella taoFisch Calothrix tao long my Chroococcus tao cau mau Botrydiopsis tao tua cau Pleurococcus tao cau rong Hapalosiphon tao vo khuc Zygnema tao hai Cylindrospermum tao bao tu ong Scytonema tao canh gia Oscillatoria tao hep http://www.ebook.edu.vn Volvax tao khoi Vaucheria tao khong vach ngan Anabaenopsis tao vong 155 Chlorella tao cau nho Lyngbya tao be Chlamydomonas tao ao Anabaena tao vay ca Pinnularia tao van long chim Stigonema tao canh that Plectonema tao soi ben Vi sinh vật gây ô nhiễm Salmonella http://www.ebook.edu.vn 156 Shigella Vibrio cholerae Enterovirrus Proteus vulgaris Metallogenium VSV phân giảI chất hu Aspergillus (moc khuc) http://www.ebook.edu.vn 157 Tricholoma (moc go) Fusarium (moc luoi liem) Penicillium (moc xanh) Mucor (moc long) Rhizopus (moc re) Geotrichum (moc dat) Cephalosporium Verticillium Nấm vòng Clostridium VK hình thoi Ulothrix Tảo sợi http://www.ebook.edu.vn Erwinia carotovora Zoogloea VK que keo động vật 158 Nitrosomonas VK nitrit Nitrobacter VK nitro (phân giải thuốc trừ sâu Cl,P) Flavobacterium VK que vàng Arthrobacter VK que vang Phan giai DDT Hydrogenomonas VK don bao H Bacillus subtilis VK que mọc chồi Pseudomonas VK đơn bào giả Zoothamnium Trùng tụ Nocardia VK Nocar http://www.ebook.edu.vn 159 Amoeba Trùng amip (biến dạng) VSV phân giảI chất vô Plesiomonas Listeria VK phat quang Photobacterium Alteromonas Beneckea Xenorhabdus Rhodobacter Synechococcus phan giai kim loai Geobacter Sulfurospirillum Dunaliella Phan giai P http://www.ebook.edu.vn 160 Thauera Aeromonas Acinetobacter Phan giai S Thiospira Sulfolobus Thiobacillus Co dinh CO2 Chloroflexus khuan xoan xanh luc nhiet cao http://www.ebook.edu.vn 161 Acidianus khuan mat ua chua http://www.ebook.edu.vn 162 ... thái vi sinh vật môi trờng tự nhiên (2) Nghiên cứu sinh thái học vi sinh vật môi trờng ô nhiễm, gọi l vi sinh vật ô nhiễm, chủ yếu l nghiên cứu mối quan hệ môi trờng ô nhiễm với quần xã vi sinh. .. môi trờng, hnh vi học môi trờng, luật pháp môi trờng, kinh tế học môi trờng, quy hoạch môi trờng Rõ ràng vi sinh vật học môi trờng môn khoa học sở khoa học môi trờng 1.3.Lịch sử phát triển vi. .. VSV môi trờng máy BOD (1970) 1.4.Nội dung v triển vọng vi sinh vật học môi trờng Từ thập kỷ 60 môn vi sinh học môi trờng đợc hình thnh với nội dung: (1) Nghiên cứu sinh thái học vi sinh vật môi