Thảo luận chuyên đề VI SINH LÂM SÀNG

Thảo luận chuyên đề VI SINH LÂM SÀNG PGS TS Đoàn Mai Phương Khoa Vi sinh – Bệnh viện Bạch Mai Nội dung Một số khái niệm Giới thiệu số thành tựu bật VSYH Vai trò phòng xét nghiệm Vi sinh lâm sàng Đảm bảo chất lượng xét nghiệm Vi sinh Danh mục xét nghiệm Vi sinh - Bộ y tế Các kỹ thuật thực khoa Vi sinh - BV BM Diễn giải kết xét nghiệm Vi sinh Xu hướng đề kháng kháng sinh vi khuẩn gây bệnh thường gặp Một số khái niệm  Vi sinh vật sinh vật sống có kích thước nhỏ bé mà mắt thường không nhìn thấy  Vi sinh vật bao gồm: vi khuẩn, virus, vi nấm, đơn bào  Vi sinh vật học khoa học nghiên cứu vi sinh vật  Vi sinh vật y học khoa học nghiên cứu vi sinh vật có lợi có hại cho người  Vi sinh lâm sàng phòng xét nghiệm vi sinh bệnh viện, chủ yếu phát vi sinh vật gây bệnh từ bệnh phẩm lâm sàng Một số thành tựu bật vi sinh y học Lĩnh vực chẩn đoán bệnh a Chẩn đoán tất bệnh nhiễm trùng b Rút ngắn thời gian chẩn đoán tăng độ xác: HIV trẻ sơ sinh, chẩn đoán lao lao kháng thuốc c Khắc phục hạn chế phương pháp chẩn đoán kinh điển: Phát sớm nhiều bệnh nhiễm trùng giai đoạn “cửa sổ” d Phát kháng thuốc mức độ phân tử: Vi khuẩn lao, MRSA…Virus HIV, HBV, HCV… e Phát mầm bệnh lạ, đột biến, mầm bệnh dùng vào chiến tranh sinh học: E coli đột biến gây bệnh châu Âu, năm 2011 Một số thành tựu bật vi sinh y học Lĩnh vực điều trị bệnh Góp phần điều trị số bệnh hiểm nghèo: a Phát vi khuẩn, vi nấm, virus kháng thuốc: • Kiểu hình: Định tính, Định lượng • Kiểu gen: Phát gen đề kháng a Theo dõi hiệu điều trị mức độ phân tử: Viral load… b Dùng virus không gây bệnh đưa thuốc vào tế bào để điều trị ung thư c Đưa gen lành vào gen tế bào để thay gen bệnh: Parkinson, Alzheimer, tiểu đường Một số thành tựu bật vi sinh y học Lĩnh vực phòng bệnh a Phát triển nhiều loại vắc xin: Vắc xin tái tổ hợp AND, vắc xin AND trần, vắc xin thực vật chuyển gen, vắc xin lai ghép b Loại trừ bệnh đậu mùa đẩy lùi nhiều bệnh dịch: Bại liệt, sởi, tả, ho gà… Một số thành tựu bật vi sinh y học Lĩnh vực khác a Lĩnh vực chế tạo thuốc: Tổng hợp nhiều loại thuốc chữa bệnh với khối lượng lớn khiết: Kháng sinh, interferon… b Góp phần xây dựng ngân hàng gen quốc tế (World Gen Bank) c Giải mã gen người mô từ giải mã gen tác nhân vi sinh Vai trò Vi sinh lâm sàng Vai trò PXN vi sinh lâm sàng Chẩn đoán bệnh vi khuẩn, virus, vi nấm, KST: • • Kỹ thuật chẩn đoán trực tiếp: Nuôi cấy, PCR Kỹ thuật chẩn đoán gián tiếp: Miễn dịch học Điều trị bệnh: • • Phát vi khuẩn, vi nấm, virus kháng thuốc Theo dõi hiệu điều trị: Viral load… Phòng bệnh: • Phát tác nhân nguồn nhiễm trùng bệnh viện • Phát tác nhân gây dịch: tả, dengue, cúm… Giám sát nhiễm trùng kháng thuốc • • Cung cấp số liệu dịch tễ học VSV gây bệnh Cung cấp số liệu VSV kháng thuốc Cơ hội nghiên cứu: Thiết lập ngân hàng gen VSV gây bệnh Đảm bảo chất lượng XN vi sinh Danh mục kỹ thuật phân tuyến KT chuyên ngành Vi sinh y học Danh mục xét nghiệm Vi sinh: 1.Đổi tên Danh mục kỹ thuật thành Danh mục xét nghiệm 2.Thống Danh mục XN Vi sinh toàn quốc gồm 306 xét nghiệm vi khuẩn, virus, vi nấm, ký sinh trùng 3.Để đảm bảo chất lượng, cán thực xét nghiệm Vi sinh phải đào tạo có chứng chuyên ngành Vi sinh, không làm chuyên ngành khác 4.Danh mục xét nghiệm Vi sinh Bộ Y tế phê duyệt, ban hành sửa đổi, bổ sung, cập nhập định kỳ theo phát triển khoa học kỹ thuật Danh mục kỹ thuật phân tuyến KT chuyên ngành Vi sinh y học Tên xét nghiệm Vi sinh:  Thống cách đặt tên XN Vi sinh gồm phần: • Phần 1: Tên vi sinh vật • Phần 2: Tên kỹ thuật tiến hành • Phần 3: Tên loại sinh phẩm sử dụng (nếu có nhiều loại sinh phẩm lưu hành)  Ví dụ: • HIV test nhanh; • HIV miễn dịch bán tự động; • HIV miễn dịch tự động; • HIV đo tải lượng Real-time PCR  Mục tiêu: • Các nhà quản lý dễ kiểm soát • Các bác sỹ lâm sàng dễ định • Cán XN Vi sinh dễ thực Danh mục kỹ thuật phân tuyến KT chuyên ngành Vi sinh y học “Quy trình kỹ thuật chuyên ngành Vi sinh y học” •Biên soạn theo Quyết định Bộ Y tế số 1226/ QĐ - BYT, ngày 18 tháng năm 2012 •Gồm 210 xét nghiệm Vi sinh thông thường, tiến hành kỹ thuật soi tươi, nhuộm soi, nuôi cấy, kháng sinh đồ, miễn dịch học, sinh học phân tử để chẩn đoán vi khuẩn, virus, KST, vi nấm gây bệnh thường gặp •Giúp nhà quản lý kiểm soát xây dựng giá xét nghiệm; bác sỹ điều trị dễ định xét nghiệm; cán xét nghiệm Vi sinh triển khai kỹ thuật •Được Bộ Y tế ban hành sửa đổi, bổ sung, cập nhập định kỳ Danh mục kỹ thuật phân tuyến KT chuyên ngành Vi sinh y học Phân tuyến kỹ thuật Vi sinh - Ký sinh trùng: •Phân tuyến tương đối để khuyến khích sở y tế triển khai kỹ thuật •Qui định xét nghiệm tối thiểu bắt buộc triển khai •Qui định đảm bảo chất lượng triển khai Các XN thực khoa Vi sinh - BV Bạch Mai Nhân lực có 42 CBVC, 74% có trình độ Đại học: • • • • • • 03 Phó Giáo sư Tiến sỹ Y học; 11 Thạc sỹ BSCKI 02 Bác sỹ 15 CB Đại học 07 Kỹ thuật viên 04 y công Cơ cấu tổ chức gồm phận chuyên môn: • • • • • • • Phòng Nhận trả kết xét nghiệm Phòng xét nghiệm Vi khuẩn - Kháng sinh đồ Phòng xét nghiệm Vi rút - Miễn dịch Phòng xét nghiệm Ký sinh trùng - Nấm Phòng xét nghiệm Sinh học phân tử Phòng sản xuất môi trường Phòng khử trùng tiệt trùng Các XN thực khoa Vi sinh - BV Bạch Mai • Vi khuẩn: Định danh vi khuẩn kháng sinh đồ máy tự động Thường xuyên hội chẩn với khoa lâm sàng ca bệnh vi khuẩn kháng thuốc • Virus: Phát virus HIV, viêm gan, EBV, CMV… hệ thống tự động • Sinh học phân tử: HIV-RNA, HBV-DNA, HSV-DNA, HCVRNA, Lao, Dengue, CMV, EBV… • Ký sinh trùng: Xét nghiệm ELISA chẩn đoán amíp, sán gan lớn, giun lươn, giun đũa chó, mèo • Vi nấm: Phát loại vi nấm, đặc biệt vi nấm gây nhiễm trùng hội người nhiễm HIV/AIDS Các XN thực khoa Vi sinh - BV Bạch Mai Năm 2012, XN khoảng 1.000 bệnh phẩm/ ngày Thực thường quy 90 loại xét nghiệm Quản lý hiệu số liệu chuyên môn tài hệ thống mạng LAN Khoa Vi sinh cấp chứng công nhận đạt tiêu chuẩn ISO 15189 ngày 15 tháng năm 2012 Các XN thực khoa Vi sinh - BV Bạch Mai Các kỹ thuật thực khoa Vi sinh - BV Bạch Mai Bệnh phẩm: Đúng qui định Quan sát đại thể: Cần thiết Soi tươi: 30 phút Nhuộm soi: 1-2 tiếng Nuôi cấy, định danh: 48-72h Kháng sinh đồ: 24h sau định danh Huyết học: ngày Sinh học phân tử: ngày Diễn giải kết XN Vi sinh Phân biệt loại bệnh phẩm Bệnh phẩm từ vị trí vô trùng: Máu quan nội tạng dịch não tủy, chất dịch… Bệnh phẩm từ vị trí có vi sinh vật cư trú Bệnh phẩm từ da niêm mạc • Nước tiểu dòng • Phân • BP hô hấp • Mủ nông • Chất tiết sinh dục… Diễn giải kết XN Vi sinh Xác định bệnh nhiễm trùng  Xét nghiệm Vi sinh: – Phát VSV BP lấy từ vị trí vô trùng – Phát VSV BP lấy từ vị trí có vi hệ • Số lượng VSV phải nhiều, thường ≥ 105 VK/ ml • Phát loại VSV từ loại bệnh phẩm khác • Có diện BCĐN  Lâm sàng: – Có triệu chứng lâm sàng – Phát nguồn nhiễm, đường vào Xu hướng đề kháng kháng sinh số vi khuẩn gây bệnh thường gặp Vi khuẩn Gram (-)  Enterobacteriaceae (E coli, K pneumoniae, Enterobacter…) • Beta – lactam: Sinh ESBL (Beta-lactamase phổ mở rộng) kháng toàn cephalosporin hệ 3, • Carbapenem (Imipenem, meropenem, Ertapenem…): Sinh Carbapenemase NDM1…  A baumannii, P aeruginosa:  Đa kháng  Kháng mở rộng  Toàn kháng Xu hướng đề kháng kháng sinh số vi khuẩn gây bệnh thường gặp Khái niệm MDR, XDR & PDR    MDR (Multidrug resistant) - Đa kháng Không nhạy ≥ KS loại KS nhiều Vd: MRSA, vi khuẩn sinh ESBL XDR (Extensively drug resistant) - Kháng mở rộng Chỉ nhạy ≤ loại KS) Vd: A baumannii nhạy với colistin PDR (Pan-drug resistant) - Toàn kháng Không nhạy với tất KS tất loại KS VD: A baumannii, P aeruginosa Clinical Microbiology and Infection, Volume 18 Number 3, March 2012 Xu hướng đề kháng kháng sinh số vi khuẩn gây bệnh thường gặp Vi khuẩn Gram (+) Staphylococcus aureus Penicillin: PRSA - S aureus kháng Penicillin Beta-lactam: MRSA - S aureus kháng Methicillin Vancomycin: • VISA: S aureus trung gian với vancomycin • hVISA: S aureus trung gian dị chủng với vancomycin, MIC dao động từ - mg/L • VRSA: S aureus kháng vancomycin Enterococci VRE: Enterococci kháng vancomycin Streptococcus pneumoniae PRSP: S pneumoniae kháng penicillin Trân trọng cám ơn ... nghiệm Vi sinh lâm sàng Đảm bảo chất lượng xét nghiệm Vi sinh Danh mục xét nghiệm Vi sinh - Bộ y tế Các kỹ thuật thực khoa Vi sinh - BV BM Diễn giải kết xét nghiệm Vi sinh Xu hướng đề kháng kháng sinh. .. khoa học nghiên cứu vi sinh vật  Vi sinh vật y học khoa học nghiên cứu vi sinh vật có lợi có hại cho người  Vi sinh lâm sàng phòng xét nghiệm vi sinh bệnh vi n, chủ yếu phát vi sinh vật gây bệnh... sinh vi khuẩn gây bệnh thường gặp Một số khái niệm  Vi sinh vật sinh vật sống có kích thước nhỏ bé mà mắt thường không nhìn thấy  Vi sinh vật bao gồm: vi khuẩn, virus, vi nấm, đơn bào  Vi sinh