Theo dõi quá trình động học phân tử thymine bằng lade xung cực ngắn

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM TP.HCM KHOA VẬT LÝ    LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC THEO DÕI QUÁ TRÌNH ĐỘNG HỌC PHÂN TỬ THYMINE BẰNG LADE XUNG CỰC NGẮN GVHD: PGS.TSKH LÊ VĂN HOÀNG SVTH: HOÀNG VĂN HƯNG NIÊN KHÓA: 2006 – 2010 Tp Hồ Chí Minh – Năm 2010 LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành tốt khóa học luận văn này, nhận động viên giúp đỡ, khích lệ mặt vật chất tinh thần từ thầy cô, gia đình, bạn bè người thân Thông qua luận văn xin gửi tới lời cảm ơn chân thành đến tất người Tôi xin gửi lời tri ân sâu sắc đến thầy hướng dẫn PGS.TSKH Lê Văn Hoàng tận tình hướng dẫn, động viên tạo điều kiện thuận lợi cho thực luận văn Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành đến thầy Nguyễn Ngọc Ty tận tình hướng dẫn việc làm quen sử dụng phần mềm mô động viên suốt trình thực luận văn Tôi xin cảm ơn gia đình tạo điều kiện, động viên giúp vững tâm học tập năm học đại học thời gian làm luận văn Tôi xin gửi lời cảm ơn đến thầy cô Khoa Vật lý-Trường ĐHSP TP.HCM tận tình giảng dạy truyền đạt kiến thức quý báu cho năm tháng giảng đường đại học để có hành trang vững đường vào đời Tôi xin gửi lời cảm ơn đến thành viên nhóm nghiên cứu bạn bè giúp đỡ, động viên thời gian làm luận văn năm tháng giảng đường đại học Cuối xin gửi lời chúc sức khỏe đến thầy cô, gia đình bạn bè TP.Hồ Chí Minh, ngày 29-4-2010 Hoàng Văn Hưng MỤC LỤC Trang DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT DANH MỤC CÁC HÌNH VẼ ĐỒ THỊ Error! Bookmark not defined LỜI MỞ ĐẦU Chương Cơ sở lý thuyết ADN 12 1.1 Thành phần cấu trúc ADN 12 1.1.1 Thành phần 12 1.1.2 Cấu trúc 15 1.2 Chức sinh học ADN 16 1.3 Quá trình tự nhân đôi ADN 16 1.4 Đột biến 17 1.4.1 Đột biến tác nhân hóa học 17 1.4.2 Đột biến lỗi chép ADN 18 Chương Tổng quan lade chế phát xạ sóng hài 21 2.1 Lý thuyết lade 21 2.1.1 Sơ lược lade 21 2.1.2 Nguyên lý hoạt động lade 22 2.1.3 Tính chất lade 23 2.1.4 Các chế độ hoạt động lade 23 2.1.5 Sự phát triển lade xung siêu ngắn 24 2.2 Tương tác trường lade với nguyên tử, phân tử 25 2.2.1 Giới thiệu quang học phi tuyến 26 2.2.2 Tương tác trường lade nguyên tử 26 2.2.3 Tương tác nguyên tử với xung lade 29 2.2.4 Hệ số Keldysh 30 2.2.5 Tốc độ ion hóa 31 2.3 Sự phát xạ sóng hài bậc cao 32 2.3.1 Giới thiệu sóng hài bậc cao 32 2.3.2 Mô hình ba bước Leweistein 33 Chương Mô hình tính toán mô hình thí nghiệm 37 3.1 Giới thiệu phần mềm Gaussian 37 3.1.1 Các chức tính toán 37 3.1.2 Phương pháp tính toán 38 3.1.3 Hệ hàm sở 39 3.1.4 Cấu trúc nguyên tử, phân tử 39 3.2 Giới thiệu FORTRAN 40 3.3 Mô hình thí nghiệm mô 40 Chương Kết 41 4.1 Mô cấu trúc HOMO phân tử thymine 41 4.2 Phân biệt trạng thái phân tử thymine 43 4.3 Mô trình động học phân tử phân tử thymine 45 4.4 Theo dõi trình động học phân tử phân tử thymine 46 KẾT LUẬN 49 HƯỚNG PHÁT TRIỂN 50 TÀI LIỆU THAM KHẢO 51 DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT ADN: Axit Deoxyribonucleic AS: Attosecond(10-18s) DFT: Phương pháp phiếm hàm mật độ (Density Functional Theory) FS: Femtosecond (10-15s) HHG: Sóng hài bậc cao (High – order Harmonic Generation) HOMO: Orbital phân tử (Highest Occupied Moleculer Orbital) IRC: (Intrinsic Reaction Coordinate) LASER: lade (Light Amplification by Stimulated Emission of Radiation) Opt: tối ưu hóa (Optimization) PES: Mặt (Potential Energy Surface) PS: Picosecond (10-12s) LỜI MỞ ĐẦU Trong sống đại ngày nay, không phát triển khoa học kỹ thuật lại không mang thành tựu khoa học nói chung Vật lý học nói riêng Vật lý không sâu nghiên cứu tìm hiểu trình, quy luật vận động vật diễn sống mà tiến sâu vào giới phân tử, nguyên tử, electron vô nhỏ bé Ở giới quy luật vận động, định luật Vật lý giới vĩ mô dường b ị vi phạm Làm để sâu khám phá chất giới vi mô đề tài nóng hổi có tính thời Để làm điều đó, cần có công cụ, thước đo giá trị đo tương ứng với thang đo giới vi mô Để tìm hiểu thông tin cấu trúc phân tử, nguyên tử quang phổ hồng ngoại, nhiễu xạ tia X, nhiễu xạ điện tử hay tán xạ Raman phương pháp thường sử dụng Tuy nhiên sử dụng phương pháp có hạn chế biết thông tin cấu trúc tĩnh c phân tử, nguyên tử khoảng cách, góc liên kết nguyên tử Nguyên nhân điều độ phân giải phương pháp lớn nhiều so với thời gian diễn trình vận động trình Như bi ết dao động nguyên tử diễn thời gian cỡ femto giây (1 fs = 10-15s), ện tử chuyển động quanh hạt nhân thang thời gian thấp nữa: mức atto giây (1 as = 10-18s) Trong độ phân giải phương pháp vào cỡ pico giây (1 ps = 10-12s) Trong bối cảnh đời xung lade xung cực ngắn tạo điều kiện cho nhà khoa học sâu khám phá cấu trúc động phân tử Năm 1960 lần người “chinh phục ánh sáng” cách chế tạo nguồn lade (vài trăm micro giây) kéo theo chạy đua khoa học kỹ thuật để có xung lade có xung ngày ngắn Năm 1961 có xung 10 ns, năm 1966 100 ps Cuộc chạy đua để rút ngắn xung lade ngày diễn liệt Và đến năm 2001, xung fs đư ợc chế tạo báo hiệu cho phát triển ngành khoa học thang thời gian femto giây Tưởng chừng tường femto giây giới hạn khó vượt qua có năm, tường femto giây bị xô đỗ Năm 2006 nhóm nhà khoa học thuộc phòng thí nghiệm quốc gia Ý chế tạo thành công lade có độ dài xung 130 as, chí số liệu gần cho biết xung lade 80 as chế tạo thành công phòng thí nghiệm Max-Planck Lawrence Berkeley Nhờ có tiến này, tìm hiểu cấu trúc động phân tử trở thành đề tài quan tâm cộng đồng khoa học Năm 1994 nhóm nhà khoa học Canada sử dụng lade có độ dài xung 30 fs cho tương tác với phân tử khí N Từ nguồn liệu HHG (High – order Harmonic Generation), hình ảnh HOMO (Highest Occupied Moleculer Orbital) phân tử khí N tái tạo Đặc biệt lade sử dụng có độ dài xung 30 fs thông tin thu thông tin động Chính thành công m hướng nghiên cứu cộng đồng khoa học Hàng loạt công trình công bố sử dụng nguồn HHG để chụp ảnh phân tử, trích xuất thông tin khoảng cách liên hạt nhân, theo dõi trình động học phân tử nghiên cứu [6], [7] Cụ thể, công trình [6], [7] tác giả khẳng định sử dụng nguồn liệu HHG để theo dõi trìnhđ ồng phân hóa HCN/HNC acetylen/vinyliden cách cho lade có xung cực ngắn (10 fs) cường độ mạnh (~1014W/cm2) tương tác với phân tử Chính công trình định hướng cho thực luận văn “Theo dõi trình động học phân tử thymine lade siêu ngắn” ADN (Axit Deoxyribonucleic) phân tử mang thông tin di truyền mã hóa cho hoạt động sinh trưởng phát triển tất dạng sinh vật sống bao gồm số virus ADN gồm ba thành phần bản: bazơ nitơ, đường pentose, nhóm phosphate coi vật liệu di truyền cấp độ phân tử tham gia định tính trạng ADN tạo thành hai chuỗi xoắn kép liên kết với liên kết hydro, sợi đơn chuỗi polynucleotide gồm nhiều nucleotide nối với liên kết phosphodieste [1] Thông tin di truyền chứa ADN giải mã dạng trình tự xếp bazơ nitơ Bazơ nitơ phân tử ADN dẫn xuất pyrimidine gồm cytosine (C) thymine (T); purine gồm adenine (A) guanine (G) Các nghiên cứu lý thuyết thực nghiệm bazơ nitơ thường tồn hai dạng đồng phân hỗ biến (tautomer): bazơ nitơ purine có hai tautomer amino (bền) imino (kém bền), bazơ nitơ pyrimidine có hai tautomer keto (bền) enol (kém bền) Thông thường, bazơ nitơ tồn phân tử ADN dạng tautomer phổ biến (keto amino) Tuy nhiên trình phát triển sinh vật, số điều kiện đó, bazơ nitơ không tồn dạng tautomer phổ biến mà chuyển sang dạng tautomer gặp enol imino Các dạng gặp dù có thời gian tồn ngắn thời gian đó, chúng huy động vào trình tổng hợp ADN đột biến xảy ra, cặp bazơ nitơ hình thành A C (bằng hai liên kết hydro); G T (bằng ba liên kết hydro) Sau hai lần chép cặp A T thành G C, cặp G C thành cặp A T, dẫn đến hậu thông tin di truyền không nguyên vẹn cho hệ sau Cơ chế gây đột biến gen gọi hỗ biến hóa học (tautomerism hay tautomer hóa) [1] Do tính chất quan trọng trình tautomer hóa đột biến gen nên trình thu hút quan tâm nghiên cứu nhiều nhóm khoa học giới kể lý thuyết thực nghiệm [15] Các nhà nghiên cứu nh ận thấy thời gian trình tautomer hóa vào cỡ femto giây Tuy nhiên, hạn chế phương pháp nêu nên thông tin thu nhận thông tin tĩnh Mong mu ốn thu nhận thông tin động cấp thời gian femto giây can thiệp vào trình tautomer hóa bazơ nitơ trở thành mục tiêu nhà nghiên cứu giới Và mục tiêu luận văn chúng tôi: làm để theo dõi trình tautomer hóa bazơ nitơ nguồn liệu HHG thu cho bazơ nitơ tương tác với lade xung cực ngắn, cường độ mạnh Trong phạm vi luận văn tốt nghiệp chọn phân tử thymine có cấu trúc mạch vòng đối tượng nghiên cứu Để thực mục tiêu cần phải mô HHG phát cho lade có xung cực ngắn fs cường độ mạnh 2.1014W/cm2 tương tác với phân tử Khi cho lade tương tác với phân tử, nguyên tử có nhiều hiệu ứng phi tuyến xảy nhiên ý đến hiệu ứng phát xạ HHG HHG phát lần vào năm 1988 nhóm nhà khoa học người Pháp M Ferray cho lade tương tác với khí trơ Việc xây dựng sở lý thuyết hoàn chỉnh cho trình phát xạ HHG trở thành đề tài nóng bỏng có tính thời Thực chất toán giải phương trì nh Schrodinger phụ thuộc vào thời gian electron chịu tác dụng trường lade Bài toán đư ợc giải xác cho phân tử đơn giản H , hay ion H + (phương pháp TDSE) Tuy nhiên có nghiệm giải tích cho toán Do cần có mô hình Vật lý để đơn giản trình tính toán tất nhiên mô hình giữ chất Vật lý tượng Một mô hìnhđư ợc cộng đồng khoa học chấp nhận rộng rãiđó mô ình h ba bước Lewenstein Đây mô hình bán c ổ điển, tinh thần chủ yếu mô hình dựa chuyển động electron tác dụng điện trường trường lade Theo mô hình ện tử bị ion hóa xuyên hầm vùng tự Sau điện tử gia tốc tác dụng trường lade mạnh, trường lade đổi chiều điện tử quay trở lại kết hợp với ion mẹ phát sóng thứ cấp HHG Sự phát xạ xảy ion tái va chạm với ion mẹ HHG phát mang nhiều thông tin cấu trúc phân tử Do nguồn liệu HHG thực tế có công việc cần làm phải mô HHG Phương pháp sử dụng mô hình ba bước Lewenstein cho trình phát xạ HHG công cụ sử dụng mô ngôn ngữ lập trình FORTRAN Chương trình tính toán đư ợc xây dựng GS Lin Chii-Dong (Đại Học Kansas, Mỹ) sau phát triển nhóm nhà khoa học Khoa Vật lý trường ĐHSP.TPHCM Chương trình tính toán kiểm chứng qua công trìnhđăng c ác tạp chí Vật lý quốc tế có uy tín Ở đây, không tiến hành viết lại chương trình tính toán mà tiếp thu kỹ thuật tính toán sử dụng xem công cụ cho thực luận văn Tuy nhiên để có cấu trúc phân tử thymine phục vụ cho việc mô HHG phải mô cấu trúc phân tử thymine Cấu trúc thông tin khoảng cách nguyên tử, góc liên kết, ion hóa phân tử, đặc biệt phân tử Để làm điều này, sử dụng phương phápýl thuy ết phiếm hàm mật độ DFT (Density Functional Theory), có tính đến hiệu chỉnh Gradient B3LYP hệ h àm sở 6-31G+(d,p) thông qua việc sử dụng phần mềm Gaussian 03W Bằng phương pháp mô ba trạng thái phân tử thymine: enol, trạng thái chuyển tiếp keto Kết thu hoàn toàn phù hợp với thực nghiệm phạm vi sai số cho phép Khi có thông tin này, tiến hành thí nghiệm cho lade tương tác với phân tử mô HHG phát tương tác Khảo sát phụ thuộc vào góc định phương phân tử, nhận thấy phân biệt ba trạng thái cân hình dạng HOMO với ba trạng thái giống Tuy nhiên điều quan tâm trình tautomer hóa thymine Để có trình tautomer hóa này, sử dụng phương pháp động lực học với gần Born – Oppenheimer, mô trình tautomer hóa thymine, khảo sát mặt đường phản ứng hóa học thymine Khi mô đường phản ứng hóa học tiến hành cho lade tương tác với phân tử thymine trình trình tautomer hóa Từ liệu HHG thu khẳng định theo dõi trình tautomer hóa Bố cục luận văn chia làm chương không kể phần mở đầu phần kết luận Trong chương 1: “Cơ sở lý thuyết ADN” trình bày cách ngắn gọn cấu trúc, đặc điểm, chế đột biến phân tử ADN, giới thiệu trình tautomer hóa trình tautomer bazơ nitơ bị biến đổi thành dạng tautomer khác gặp hơn, từ dẫn đến kết bắt cặp sai, hậu gây đột biến gen Nắm thông tin khái quát ADN, hay cụ thể đột biến trình hỗ biến hóa học bazơ nitơ ADN giúp cho thấy tầm quan trọng cần thiết việc nắm bắt thông tin cấu trúc động phân tử cấp thời gian femto giây, để từ chủ động can thiệp vào trình gây nên đột biến gen thể sinh vật Trong chương “Tổng quan lade chế phát xạ sóng hài” tập trung trình bày công cụ sử dụng để khảo sát thu nhận thông tin cấu trúc động phân tử Đó chế phát xạ sóng hài bậc cao HHG [12] Trong phần đầu chương này, dành vài trang để giới thiệu nét lade Hiện nay, nói lade thuật ngữ quen thuộc nhiều người, thâm nh ập vào nhiều lĩnh vực sống, không đề cập nhiều đến ứng dụng mà thay vào đề cập đến hướng phát triển – lade xung cực ngắn Quá trình rút ngắn chiều dài xung lade đề cập theo tiến trình thời gian Kể từ thiết bị lade chế tạo, công nghệ lade ngày có tiến triển mang tính chất đột phá Cường độ lade tăng lên nhiều lần, song song độ dài xung lade giảm đáng kể Trong năm 1990, Zewail et al [13] tạo xung lade vào cỡ femto giây, đánh dấu đời lĩnh vực gọi hóa học thang thời gian femto giây (Femtochemistry) Những nỗ lực rút ngắn độ dài xung lade tiếp diễn Trong năm gần đây, chạy đua rút ngắn độ dài xung lade có đích đến mới, đột phá ấn tượng công trình nhóm nghiên cứu giới tạo xung lade cấp độ atto giây, mở ngành khoa học thang thời gian atto giây (“Attosecond Science”) Khoa học thang thời gian atto giây mở hướng đầy tiềm cho nhiều ngành khoa học khác nhau, không hóa học hay vật lý học Đó tia sáng hứa hẹn thay đổi người hiểu biết giới vật chất Chính phát triển lade xung cực ngắn thực tạo điều kiện cho nhà nghiên cứu tìm hiểu sâu tương tác nguyên tử, phân tử với lade xung cực ngắn có cường độ mạnh Trong đó, có tượng phát xạ HHG công cụ luận văn Do đó, nội dung thứ hai chương trình bày tương tác trường lade nguyên tử, phân tử Đây tương tác phi tuyến, nghĩa nguyên tử phản ứng khác cường độ trường lade khác nhau, mở ngành quang học gọi quang học phi tuyến Khi trường lade yếu so với trường Coulomb nguyên tử lade “khuấy nhiễu” nhẹ trạng thái nguyên tử ion hóa xảy theo chế đa photon, nghĩa nguyên tử hấp thụ liên tiếp nhiều photon để chuyển lên trạng thái kích thích Khi trường lade tương đối mạnh so với trường Coulomb ion hóa xảy theo chế xuyên hầm, tức electron có xác suất xuyên hầm qua rào tạo trường Coulomb nguyên tử trường lade để vùng phổ liên tục Còn trư ờng hợp trường lade mạnh so với trường Coulomb đỉnh rào trở nên thấp so với electron, electron vượt rào vào vùng liên tục, ion hóa vượt rào Để đặc trưng cho tương tác lade với nguyên tử, trình bày hệ số quan trọng phát triển Viện sĩ Keldysh: hệ số Keldysh Như trường lade tương đối mạnh trường Coulomb nguyên tử electron thoát miền liên tục theo chế xuyên hầm, tượng đặc biệt xảy phát xạ HHG công cụ để thực nghiên cứu luận văn Phần chương cung cấp cho người đọc kiến thức cần thiết chế phát xạ HHG Được phát lần nhà nghiên cứu M.Ferray (Pháp) vào năm 1988, từ HHG trở thành điểm sáng thu hút quan tâm để tìm kiếm lý thuyết phù hợp cho việc giải thích đặc tính Ban đầu, HHG nghiên cứu chế để tạo xung ánh sáng siêu ngắn cấp độ atto giây Cùng với trình nghiên cứu, nhà khoa học nhận thấy bắn lade cường độ mạnh vào phân tử cường độ HHG phát phụ thuộc vào góc định phương phân tử [14] Mặt khác, HHG phát thời điểm electron tái kết hợp với ion mẹ, sau xuyên hầm vùng liên tục, chịu tác dụng trường lade chuyển động ngược trở lại Vì vậy, nhà nghiên cứu cho HHG thu mang thông tin cấu trúc phân tử Từ HHG xem công cụ việc quan sát cấu trúc trình biến đổi phân tử, cụ thể luận văn cấu trúc trình biến đổi phân tử thymine Trong phần này, nhấn mạnh trình bày mô hình tính toán ba bước bán cổ điển xây dựng Lewenstein (do mô hình gọi mô hình Lewenstein) [10] Cho đến nay, nói mô hình “đ ẹp” việc giải thích chế đặc tính phát xạ HHG Trong chương “Mô hình tính toán mô hình thí nghiệm” giới thiệu đến người đọc đôi nét khái niệm mô hình tính toán, chương trình AT -code thiết lập ngôn ngữ FORTRAN sử dụng luận văn Không chương trình bày mô hình thí nghiệm để thực trình tính toán HHGđ ể định hướng cho trình thực nghiệm sau Trong chương “ Kết quả” trình bày kết tính toán được, đồng thời rút nhận xét kết nhận Trong phần đầu chương dùng Gaussian mô hai đồng phân cấu trúc chuyển tiếp phân tử thymine Với mô hình tính toán đư ợc sử dụng phương pháp phiếm hàm mật độ DFT hiệu chỉnh Gradient B3LYP hệ hàm sở 631G+(d,p), mô cấu trúc tối ưu phân tử sau so sánh với số liệu thực nghiệm [30] Kết tính toán có độ tin cậy cao (sai số tỉ đối [...]... ba trạng thái cân bằng của phân tử Tiếp theo chúng tôi mô phỏng quá trình đ ồng phân hóa của thymine chuyển từ trạng thái enol sang keto Để thực hiện được mục tiêu chúng tôi cần khảo sát mặt thế năng của phân tử thymine cũng như phải mô phỏng được đường phản ứng hóa học trong quá trình chuyển đồng phân này Chúng tôi cũng tính được năng lượng tương quan của quá trình tautomer hóa của thymine là 0.62eV... ra khi chiếu lade vào cả quá trình đồng phân hóa phân tử thymine Khảo sát sự phụ thuộc của cường độ HHG vào góc định phương và góc cấu trúc bằng đồ thị, chúng tôi nhận thấy có thể theo dõi được quá trình tautomer hóa của thymine Chương 1 Cơ sở lý thuyết về ADN Trong chương này chúng tôi sẽ trình bày một cách tổng quan cơ sở lý thuyết về ADN, về thành phần cấu trúc, các chức năng, quá trình t ự nhân... các phép tính toán tiếp theo Sau đó cũng với mô hình tính toán này, chúng tôi đã mô phỏng thành công HOMO của phân tử thymine Sử dụng chương trình AT-code viết bằng ngôn ngữ Fortran dựa trên mô hình ba bước Lewenstein để tính các số liệu HHG phát xạ ra khi hai tautomer và trạng thái chuyển tiếp của thymine tương tác với lade xung cực ngắn Chúng tôi tiến hành phân tích số liệu HHG bằng đồ thị để nhận xét... Quá trình tự nhân đôi ADN Quá trình tự nhân đôi ADN hay tổng hợp ADN là một cơ chế sao chép các phân tử ADN xoắn kép trước mỗi lần phân bào tạo ra hai phân tử ADN con gần như giống nhau hoàn toàn (chỉ sai khác với tần số rất thấp, thông thường dưới một phần vạn) một mạch cũ có nguồn gốc từ phân tử ADN gốc (gọi là mạch khuôn) và một mạch được tổng hợp mới Đó là nguyên tắc bán bảo toàn Trong quá trình. .. hoạt động của tế bào  Có khả năng sao chép chính xác để thông tin di truyền có thể được truyền từ thế hệ này sang thế hệ kế tiếp thông qua quá trình phân bào hay quá trình sinh sản  Thông tin chứa đựng trong vật chất di truyền phải được dùng tạo ra các phân tử cần cho cấu tạo và hoạt động của tế bào.Vật liệu di truyền có khả năng biến đổi nhưng những thay đổi (đột biến) chỉ xảy ra ở tần số thấp 1.3 Quá. .. nhất đó chính là quá trình đ ột biến mà cụ thể ở đây chính là quá trình đột biến có nguyên nhân do các bazơ nitơ tồn tại ở tautomer kém bền dẫn đến sự bắt cặp sai và gây nên quá trình đột biến 1.1 Thành phần và cấu trúc của ADN Axit Deoxyribonucleic (ADN) – một trong hai loại của axit nucleic được nhà khoa học F.Miescher phát hiện vào năm 1869 – là cơ sở vật chất di truyền ở cấp độ phân tử 1.1.1 Thành.. .phân tử, cụ thể trong luận văn là cấu trúc và quá trình biến đổi của phân tử thymine Trong phần này, chúng tôi sẽ nhấn mạnh trình bày về mô hình tính toán ba bước bán cổ điển được xây dựng bởi Lewenstein (do đó mô hình còn được gọi là mô hình Lewenstein) [10] Cho... ời Anh) đã công bố mô hình cấu trúc phân tử axit nucleic Đây cũng chính là mô hình cấu trúc ADN ở trạng thái hoạt động phổ biến nhất Mỗi phân tử ADN sợi kép gồm hai mạch đơn polynucleotide ngược chiều nhau, bazơ purine của sợi này nằm đối diện với bazơ pyrimidine của sợ kia theo quy luật bổ sung nghiêm ngặt: A liên kết với T bằng hai liên kết hidro, G liên kết với C bằng ba liên kết hidro Nguyên tắc... người đọc đôi nét khái niệm về một mô hình tính toán, và chương trình AT -code thiết lập trên ngôn ngữ FORTRAN được sử dụng trong luận văn Không những vậy trong chương 3 chúng tôi cũng trình bày mô hình thí nghiệm để thực hiện được quá trình tính toán HHGđ ể định hướng cho quá trình thực nghiệm về sau Trong chương 4 “ Kết quả” chúng tôi trình bày về các kết quả tính toán được, đồng thời rút ra nhận... môi trường 1.4.1 Đột biến do tác nhân hóa học Ngày nay con người đã phát hiện ra nhiều các hợp chất có khả năng gây đột biến, giúp chúng ta hiểu hơn về cơ chế đột biến ở cấp độ phân tử Các tác nhân gây đột biến hóa học có thể phân thành hai nhóm chính: nhóm tác động đến ADN đang sao chép hay không sao chép, bao gồm các hợp chất alkyl hóa và axit nitơ; nhóm tác động đến các ADN đang sao chép, bao gồm