Bài giảng cấu trúc và chức năng nucleotide

NUCLEOTIDE và ACID NUCLEIC MỤC TIÊU • Nắm được khái niệm nucleotid, nucleosid và acid nucleic • Cấu tạo và vai trò của nucleotid và acid nucleic Đại cương • Acid nucleic chia làm 2 loại: acid deoxyribonucleic và acid ribonucleic là vật liệu chứa thông tin di truyền • Nucleotid là đơn vị tạo nên acid nucleic, tham gia vào quá trình chuyển hóa trong tế bào, dẫn truyền tín hiệu, cấu tạo của coenzym và những chất trung gian chuyển hóa Cấu trúc Nucleotid • Thành phần cấu tạo của nucleotide: Gồm có 3 chat: • Base nitơ • Pentose • A. phosphoric (C) Cấu trúc nucleotid Base nitơ: gồm 2 loại - Base pyrimidin : nhan pyrimidin là một vòng 6 cạnh chứa 2 nguyên tử nitơ. Các base nitơ quan trọng: cytosine , thymine và uracil - Base purin: chứa nhan purin (nhan pyrimidin và nhan imidazol ghép lại). Các base purin quan trọng: adenin và guanin Cấu trúc nucleotid Cấu trúc nucleotid • Các dẫn xuất chứa oxy của pyrimidine và purine có khả năng hỗ biến. • Dạng ceto C=O (lactam) • Dạng enol C – OH (lactim) Cấu trúc nucleotid Pentose: là đường 5 carbon. Gồm 2 loại • Ribose ( D – ribose ): có trong phan tu RNA • Deoxyribose (2’ – Deoxy – D – ribose): hinh thanh tu ribose mat ddi nguyen tu oxy o vi tri carbon số 2’. Co trong phan tu DNA Cấu trúc nucleotid Acid phosphoric: – Chứa ba nhóm OH nên có thể hình thành liên kết este với gốc đường tại C5 và C3 để tạo nucleotide và polynucleotide Sự kết hợp giữa ba thành phần của một nucleotide - Liên kết pentose với base: là liên kết N- glycoside (loại phan tu H2O gom OH của đường pentose và H của pyrimidine ở N1 hoặc purin ở N9) [...]... ba thành phần của một nucleotide - Liên kết giữa H3PO4 và pentose : Là liên kết este (loại đi H2O giữa H của acid và OH ở C5 của pentose ) Cấu trúc nucleosid • Nucleoside: Là phân tử kết hợp giữa một bazơ purine ở N9 hoặc pyrimidine ở N1 với C1 của pentose Cấu trúc nucleotid • Nucleotid: Là những este của acid phosphoric với nucleosid ở vị trí C5 của pentose Danh pháp nucleosid và nucleotid • Danh pháp... adenin gọi là polyA Cấu trúc DNA (Watson-Crick) • Phân tử DNA gồm 2 chuỗi polynucleotid có chiều ngược nhau xoắn quanh trục từ trái sang phải tạo một rãnh rộng và một rãnh hẹp • Chu kỳ dài 3,4nm, chứa 10,5 cặp base Cấu trúc DNA • Mỗi base của chuỗi này liên kết với base của chuỗi kia trên cùng một mặt phẳng nhờ liên kết hydro theo quy luật Chargaff • Liên kết bổ sung: A=T, G Ξ C Cấu trúc DNA Thứ tự thành... Enzym topoisomerase: điều hòa cấu trúc siêu xoắn của DNA vòng Các dạng cấu trúc khác nhau của DNA • Dạng B: mô hình Watson – Crick • Dạng A: giống dạng B với chu kỳ xoắn ngắn hơn 2,3nm, gồm 11 cặp base, đường kính mỗi xoắn lớn hơn • Dạng Z: xoắn phải sang trái, chu kỳ dài 3,7nm chứa 12 cặp base, cách nhau 0,38nm, thường gặp ở gen điều hòa (12 – 24 nucleotid) Các dạng cấu trúc khác nhau của DNA Một số... chất biến tính thuận nghịch với pH và nhiệt độ cao (80 – 90ºC) • Tính chất lai • Các nucleotid và base có nitơ trong thành phần DNA có thể bị biến đổi hóa học DNA tham gia cấu tạo trong cấu tạo chromosome Nucleosome - Thể histon: 8 phân tử histon 2H2A , 2H2B , 2H3 , 2H4 - DNA: 146 cặp base quấn quanh histon + 54 cặp base nối các nucleosome DNA tham gia cấu tạo trong cấu tạo chromosome • Chuỗi hạt nucleosome... đơn vị cấu tạo của acid nucleic • Nucleotid cấu tạo coenzym cua cac enzym xúc tác nhiều phản ứng hóa học VD: NAD, FAD… • Vận chuyển năng lượng hóa học trong tế bào (ATP, UTP,GTP,CTP) • Chất trung gian truyền tin trong tế bào (AMPv, GMPv,ppGpp) Acid nucleic • Acid nucleic là polyme của các nucleotid • Gồm 2 loại: Acid ribonucleic và acid deoxyribonucleic • Chức năng: chứa thông tin di truyền Acid deoxyribonucleic... Danh pháp nucleosid và nucleotid Base Adenin Nucleosid Nucleotid Acid Nucleic DNA Guanosin Guanylat RNA Deoxyguanylat DNA Cytidin Cytidylat RNA Deoxycytidylat DNA Thymidin Thymidylat Deoxythymidin Uracil Deoxyadenylat Deoxycytidin Thymin RNA Deoxyguanosin Cytosin Adenylat Deoxyadenosin Guanin Adenosin Deoxythymidylat DNA Uridin Uridylat RNA Chức năng nucleotid • Nucleotid là đơn vị cấu tạo của acid nucleic... sắp xếp ít gặp Một số sự sắp xếp ít gặp Đoạn cong DNA: chứa >4 adenin, cứ 6 Adenin tạo độ cong 18º Vai trò kết hợp với protein Một số sự sắp xếp ít gặp •Đoạn ngược xuôi giống nhau (palindrome): tạo cấu trúc kẹp tóc hoặc hình chữ thập Một số sự sắp xếp ít gặp • Palindrome •Đoạn đối xứng gương: chứa hàng ngàn base Đoạn H - DNA •Đoạn H DNA: là đoạn polypyrimidin / polypurin Các kiểu DNA • DNA ở các loài... (A,T,G,C) và các dẫn xuất của chúng VD: methylcytosin (tuyến ức), 5- hidromethylcytosin (VK,virus) N6 methyladenin (VK) • DNA loại AT • DNA loại GC Liên kết chính trong DNA • Là liên kết phosphodieste nối các nucleotid thành polynucleotid ở vị trí 5’ -hydoxyl của nucleotid này được liên kết với 3’ hydroxyl của nucleotid khác thông qua phân tử acid phosphoric • Cơ chế: tách H2O tu H của acid và OH ở C3 . cấu tạo của coenzym và những chất trung gian chuyển hóa Cấu trúc Nucleotid • Thành phần cấu tạo của nucleotide: Gồm có 3 chat: • Base nitơ • Pentose • A. phosphoric (C) Cấu trúc nucleotid Base. cytosine , thymine và uracil - Base purin: chứa nhan purin (nhan pyrimidin và nhan imidazol ghép lại). Các base purin quan trọng: adenin và guanin Cấu trúc nucleotid Cấu trúc nucleotid • Các. NUCLEOTIDE và ACID NUCLEIC MỤC TIÊU • Nắm được khái niệm nucleotid, nucleosid và acid nucleic • Cấu tạo và vai trò của nucleotid và acid nucleic Đại cương • Acid