Bản đồ promoter hoạt động của genome người pptx

5 253 0
Bản đồ promoter hoạt động của genome người pptx

Đang tải... (xem toàn văn)

Thông tin tài liệu

Bản đồ promoter hoạt động của genome người Bất kỳ gene mã hóa protein nào trong tế bào eukaryote đ ều bắt đầu phiên mã của nó bằng cách lắp ghép phức hệ tiền khởi động RNA polymerase II (PIC - preinitiation complex ) vào promoter . Các promoter, cùng với enhancer, silencer và insulator tạo thành tổ hợp mã đặc hiệu trong hầu hết các mô hình biểu hiện gene. Số promoter trùng với gene trên EnsEMBL (trên) hoặc promoter Tuy nhiên, khả năng phân tích logic quá trình điều khiển sự mã hóa trong genome ngư ời hiện b ị giới hạn do không có thông tin promoter chính xác của hầu hết các gene. Trong nghiên cứu này, Kim và cộng sự đã xác đ ịnh bản đồ promoter hoạt động trên quy mô toàn bộ genome của nguyên bào sợi (fibroblast cell) người. Để đạt được kết quả trên, họ chọn cách tiếp cận thực nghiệm để xác định vị vị trí gắn của PIC đã chú thích trên DBTSS (dưới) trên toàn bộ genome. Bản đồ này chỉ ra10.567 promoter ho ạt động tương ứng với 6.763 gene đã biết và ít nhất 1.196 đơn vị phi ên mã chưa được chú thích. Từ đó cho thấy các cụm promoter (multi promoter) được sử dụng phổ biến khi phiên mã và tính chất phân tán xuyên suốt bộ gene của các nhóm promoter hoạt động . Ngoài ra, khi xem xét phổ biểu hiện trên quy mô toàn b ộ genome họ cũng tìm ra bốn nhóm promoter ph ổ quát mà chúng quy định tòan bộ transcriptome (phổ phiên mã ) của tế bào. Các kết quả này cung cấp một cái nhìn tổng thể mối liên hệ chức năng giữa bộ máy phiên mã, cấu trúc nhiễm sắc chất và sự biểu hiện gene của tế bào người. . Bản đồ promoter hoạt động của genome người Bất kỳ gene mã hóa protein nào trong tế bào eukaryote đ ều bắt đầu phiên mã của nó bằng cách lắp ghép phức hệ tiền khởi động RNA. Trong nghiên cứu này, Kim và cộng sự đã xác đ ịnh bản đồ promoter hoạt động trên quy mô toàn bộ genome của nguyên bào sợi (fibroblast cell) người. Để đạt được kết quả trên, họ chọn cách. cận thực nghiệm để xác định vị vị trí gắn của PIC đã chú thích trên DBTSS (dưới) trên toàn bộ genome. Bản đồ này chỉ ra10.567 promoter ho ạt động tương ứng với 6.763 gene đã biết và

Ngày đăng: 02/07/2014, 14:20

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...

Tài liệu liên quan