Mô hình chung Tái bản DNA ở prokaryote - Xảy ra chỉ ở 1 điểm trên phân tử DNA vòng của prokaryote - vùng DNA được sao chép từ 1 điểm khởi đầu được gọi là đơn vị tái bản-replicon... Tái
Trang 1Chương IV Sự tái bản DNA
Trang 2- Cơ chế tái bản: sao chép thông tin di truyền từ 1 thành 2 bản
- Cơ thế kiểm tra, sửa chữa sai sót
Trang 3Thí nghiệm của Matthew
Meselson và Franklin Stahl
Trang 4Mô hình chung
Tái bản DNA ở prokaryote
- Xảy ra chỉ ở 1 điểm trên phân tử DNA vòng của prokaryote
- vùng DNA được sao chép từ 1 điểm khởi đầu được gọi là đơn vị tái bản-replicon
Trang 5Tái bản DNA ở prokaryote
Các nhân tố tham gia vào quá trình sao chép
1 Topoisomerase: tháo xoắn dạng DNA siêu xoắn thành dạng thẳng
Trang 6Topoisomerase
Topoisomerase I: gắn vào DNA và cắt một trong hai sợi đơn Sau khi tạo được DNA thẳng thì enzyme này nối chỗ đứt lại
Topoisomerase II: Cắt cả hai mạch của phân tử DNA
(gyrase của E.coli)
Tạo chạc tái bản
Trang 7Các nhân tố tham gia vào quá trình sao chép
Tái bản DNA ở prokaryote
Gyrase (E.coli): + tháo cấu trúc xoắn hoặc siêu xoắn tạo DNA dạng thẳng
+ Tự nối các vị trí vừa cắt
Trang 8Các nhân tố tham gia vào quá trình sao chép
Helicase : phá vỡ liên kết hydro giữa các bazơ trên 2 sợi đơn bổ sung
Tái bản DNA ở prokaryote
-Một số gắn trên mạch theo hướng 3’-5’ : các protein
của gen Rep
- Một số khác gắn
helicase II và III
Trang 9Tái bản DNA ở prokaryote
Các nhân tố tham gia vào quá trình sao chép
Tái bản DNA ở prokaryote
exonuclease, kéo dài chuỗi
+ DNA polymerase III : là một holoenzyme phức chứa 7 polypeptide khác nhau (α, β, 2γ, δ, ε, µ, 2θ) tổng hợp mạch bổ sung từ đầu 3’OH tự do của mỗi mồi RNA
Trang 10Tái bản DNA ở prokaryote
Các nhân tố tham gia vào quá trình sao chép
Tái bản DNA ở prokaryote
SSB : protein gắn sợi đơn, làm 2 mạch đơn không kết hợp lại với nhau
ligase : nối tất cả các chỗ gián đoạn trên mạch mới
Trang 11đơn vị sao chép ở SV tiền nhân (replicon)
đứt tại một điểm của 1 trong 2 mạch đơn DN đứt tại một điểm của 1
trong 2 mạch đơn DNA A
Tái bản DNA ở prokaryote
- Cắt tại một điểm của 1 trong 2 mạch đơn DNA
- Tại điểm bắt đầu tái bản: thường nằm ở những vùng DNA có chứa nhiều trình tự AT (100 - 200bp)
Trang 12hydro trên hai mạch đơn
3 SSB protein (single strand
binding protein)
Bám vào các sợi đơn đang
được kéo dài hai mạch
đơn không kết hợp lại với
nhau
Topoisomerase
Helicase SSB protein
Trang 13Đoạn RNA mồi: 8 – 12 nu
5 Hệ DNA polymerase tham
gia kéo dài chuỗi và đọc sửa
trên hai sợi đơn
6 Ligase: Nối tất cả các chỗ
gián đoạn trên mạch mới
RNA primase DNA
polymerase DNA ligase
Trang 14Tái bản DNA ở prokaryote
Hướng tổng hợp trên hai sợi đơn
1 Trên mạch khuôn hướng 3’ – 5’:
sinh tổng hợp mạch đơn mới
diễn ra liên tục gọi là mạch tiến
( leading)
2 Trên mạch khuôn 5 – 3’ :
Sinh tổng hợp diễn ra không
liên tục mà dưới dạng ngắn gọi
polymerase DNA ligase
Trang 16Bidrectional DNA synthesis
Replication forks will merge
Tái bản DNA ở Eukaryote
Trang 17Tái bản DNA ở Eukaryote
Các nhân tố tham gia vào quá trình sao chép
1 Polymerase α/ primase: tổng hợp mồi RNA cho mạch chậm
Không có khả năng đọc sửa (exonuclease)
2 Polymerase β: tương tự như polymerase I ở sinh vật tiền nhân Tổng hợp đi liền với sửa chữa và hoàn chỉnh sợi đơn mới
3 Polymerase γ: được tìm thấy ở ty thể nhưng chưa rõ chức năng
4 Polymerase δ: tương tự như DNA pol III ở sinh vật tiền nhân Tổng hợp sợi đơn mới
5 Polymerase ε: mới được phát hiên , chưa rõ chức năng
Trang 18Tái bản DNA ở Eukaryote
6 Chromatin Assembly Factor 1 (CAF-1)
nhân tố kết gắn nhiễm sắc + protein β tổ chức lắp ghép trung
gian PCNA (Proliferating cell nuclear antigen )
Chức năng: tháo bỏ và lắp ghép lại các protein nằm trong nucleosome
Các nhân tố tham gia vào quá trình sao chép
7 Các nhân tố sao chép A và C (Replication Factor) RF-A, RF-C
Chức năng: cần cho hoạt động của các DNA polymerase α và β
Trang 19Newly made
histone proteins
PCNA: gồm 3 protein
Trang 20Tái bản DNA ở Eukaryote
1 Dưới tác dụng của Topoisomerase và nhân tố tái bản RF-A,
phức hợp nhận biết vùng khởi đầu tái bản (origin recognition
complex – ORC) bọc lấy điểm khởi đầu (giàu AT)
DNA được tháo xoắn
2 Trên mạch chậm:Primase tương tác với RF-A tổng hợp các mồi RNA (10nu) kéo dài thêm 20 nu nhờ nhân tố RF-C kết hợp với Pol α
- Pol δ gắn vào chuỗi và tổng hợp đoạn Okazaki
3 Pol α chuyển đến mạch đối diện và tổng hợp liên tục mạch tiến
Trang 21Mô hình tái bản ở Eukaryote
Tái bản DNA ở Eukaryote
Trang 224 Kết thúc tổng hợp tại đầu telomere của nhiễm sác thể
Đầu cuối của DNA (telomere) có chứa nhiều đoạn lặp lại giống nhau, trình tự đoạn lặp TTAGGG hay TTGGGG
Cấu trúc đầu so le 3’ (overhang): có chiều dài 12-16 nu
Hãy tìm hiểu sự liên quan giữa đầu telomere của nhiễm sắc thể đến tuổi thọ?
Trang 23Cơ chế kéo dài đầu telomere
Telomerase RNA đóng vai trò quan trọng
Trang 25HỆ THỐNG SỬA CHỮA SAI SÓT KHI TÁI BẢN
Trang 262 Cơ chế đảm bảo sự trung thành trong tái bản
Cơ chế đọc sửa của các DNA pol I và Pol III:
Cắt bỏ bazo lắp ghép sai rồi thay thế bằng bazo đúng bổ sung
Trang 27Cơ chế hoạt quang: exonuclease dưới tác dụng của ánh sáng ở bước sóng 300nm sẽ cắt
bỏ Thymine dimer gây bởi tia UV ra khỏi phân tử DNA
Trang 28Sửa chữa bằng tái tổ hợp:
Cơ chế: Trao đổi chéo chính xác giữa đoạn có sai sót với đoạn không sai sót giữa hai phân tử DNA trong quá trình phân bào giảm nhiễm
Trang 29 Cơ chế cắt bỏ và chỉnh sửa đúng
Cắt bỏ đoạn DNA tổng hợp sai và tổng hợp đoạn DNA mới thay thế