Chuong 3 Sử dụng chemoffice docx

1 Nội dung chương 3 3.1 Chemdraw 2D 3.1.1 Giới thiệu về Chemdraw. 3.1.2 Giao diện, các thanh công cụ và các bảng trong Chemdraw. 3.1.3 Hướng dẫn sử dụng Chemdraw. 3.2 Chem3D 3.2.1 Giới thiệu về Chem3D. 3.2.2 Giao diện, các thanh công cụ và các bảng trong Chemdraw. 3.2.3 Hướng dẫn sử dụng Chem3D. 3.3 Bài tập thực hành Bài tập 2 Chương 3: Sử dụng phần mềm ChemOffice 3.1 Chemdraw 2D: 3.1.1 Giới thiệu về Chemdraw 3.1.2 Giao diện, các thanh công cụ và các bảng trong Chemdraw 3.1.2.1 Giao diện: ¾ Đăng nhập vào Chemdraw: Nhấn Start → All Programs → ChemOffice → ChemDraw. 3 4 3.1.2.2 Các thanh công cụ: Để bật/tắt các thanh công cụ: Vào View chọn các thanh công cụ tương ứng cần muốn mở ¾ Thanh Menu ¾ Thanh kiểu chữ : (text style toolbar) ¾ Thanh thông dụng (general toolbar) ¾ Thanh đối tượng (object toolbar) ¾ Thanh công cụ vẽ sinh học (biodraw tool) 5 ¾ Thanh công cụ vẽ chính (main tool palette) 6 3.1.2.3 Bảng thường dùng:  Để bật/tắt các bảng: Vào View chọn các bảng tương ứng cần mở hoặc đóng ¾ Bảng thông tin tọa độ (info window) ¾ Bảng hệ thống tuần hoàn các nguyên tố hoá học (periodic table) ¾Bảng tính chất hoá – lý của các chất (chemical properties): ¾ Bảng phân tích chi tiết (analysis) ¾ Bảng đồ các ký tự (character map) 7 3.1.3 Hướng dẫn sử dụng Chemdraw: 3.1.3.1 Vẽ một cấu trúc: Trong phần này ta vẽ cấu trúc phân tử 2-propanone và thêm tên vào Các bước thực hiện như sau  Tạo liên kết: ¾ Từ menu Object, chọn Fixed Lengths và Fixed Angles. ¾ Chọn View > Show Main Toolbar. 8 ¾ Từ thanh công cụ Main Toolbar, chọn công cụ Solid Bond ¾ Con trỏ biến thành dấu cộng (+), click chuột và kéo sang phải, đường liên kết xuất hiện, liên kết được mở rộng với chiều dài được cố định và ở một góc 30 0 . ¾ Click vào điểm cuối bên phải của liên kết mới vừa tạo để thêm liên kết thứ 2. Liên kết thứ 2 được vẽ và tạo thành một góc 120 0 giữa 2 liên kết. ¾ Để tạo cacbon thứ 3, ta thực hiện giống như bước trên. 9  Thay đổi bậc liên kết: ¾ Để tạo liên kết đôi, double click vào liên kết vừa tạo hoặc click chuột phải vào liên kết chọn Double > Plain.  Thêm tên nguyên tử vào cấu trúc: ¾ Dùng công cụ Text , click vào cuối liên kết đôi, hộp text box xuất hiện ở cuối liên kết ¾ Gõ ‘O’ vào hộp text box (chữ O hoa). ¾ Đóng hộp text bot bằng cách nhấn phím Esc hoặc chọn công cụ khác. 10  Thêm tên chú thích vào phân tử: ¾ Dùng công cụ Text , click vào phía dưới cấu trúc, hộp text box xuất hiện. ¾ Trong hộp text box, gõ “2-propanone”. ¾ Nhấn Esc hoặc chọn công cụ khác. [...]... biểu diễn như sau 33 Click vào vùng trống để thôi bỏ chọn (khung hình chữ nhật sẽ mất) Lưu và đóng cửa sổ làm việc 3. 1 .3. 6 Sử dụng thư viện cấu trúc (Templates): (Đọc thêm trong giáo trình) 34 3. 2 Chem3D: 3. 2.1 Giới thiệu về Chem3D 3. 2.2 Giao diện, các thanh công cụ và các bảng trong Chemdraw 3. 2.2.1 Giao diện: Khởi động chương trình: Start → All Programs → Chem Office → Chem 3D 35 3. 2.2.2 Các thanh... Thanh tạo dựng (building) Thanh trình diễn hiệu ứng hiển thị (model display) Thanh tạo mặt lớp (surfaces) Thanh xoay đối tượng (demo) Thanh Tính toán (calculation) 3. 2.2 .3 Các hộp thoại, bảng thường sử dụng: (Xem thêm trong giáo trình) 36 ... kết đôi 13 Thêm tên nguyên tử cacbon: Clich vào công cụ Text Trỏ đến chổ nguyên tử cần được thêm vào Gõ phím “CH” vào trong hộp thoại (lưu ý: phải gõ chữ hoa đúng biểu tượng tên nguyên tố) Tiếp tục gõ “O” vào nơi cần thêm vào Kết quả được biểu diễn ở phía dưới 14 Lưu và đóng cửa sổ làm việc: Chọn File>Save As Gõ huongdan1, vào hộp text box thích hợp Chọn folder nơi lưu file Click Save 15 3. 1 .3. 3 Vẽ cấu... chú thích vào dưới cấu trúc Lưu và đóng cửa sổ làm việc 21 3. 1 .3. 4 Vẽ cấu trúc phân tử theo cách biểu diển phối cảnh Chọn File > Open Special > New Document Vẽ vòng: Click chọn công cụ Cyclohexane Ring Trỏ vào chổ cửa sổ làm việc, click vào để vẽ vòng Double click vào cấu trúc vòng vừa vẽ Chọn Object > Rotate và gõ 30 , cấu trúc sẽ quay 1 góc là 30 0 22 Thay đổi Cyclohexane thành Tetrahydropyran: Click... (hoặc click 3 lần liên tiếp để lặp lại nhóm như ở trên) 26 Tiếp tục gõ nhóm ”CH2OH” vào trong cấu trúc, nhấn Enter 27 Thay đổi kiểu của liên kết phía trước: Click chọn công cụ Bold Bond Trỏ đến liên kết ở giữa như hình sau Click vào để thay đổi kiểu liên kết mới Click chọn công cụ Bold Wedge Click vào các liên kết gần kề liên kết Bold Bond, kết quả cấu trúc được biểu diễn như sau: 28 3. 1 .3. 5 Vẽ cấu... nguyên tử cần vẽ, vòng tròn sẽ xuất hiện như hình: 31 Click chọn công cụ Marquee , orbital được chọn lại, click vào chổ trống vùng làm việc để ngưng chọn Trỏ cấu trúc ở trên và kéo xuống để chọn 3 liên kết (ta có thể nhấn phím Shift + click chọn từng liên kết) Double-click vào rotation handle để mở hộp Rotate Gõ 180 vào hộp text box, chọn degrees CW (cùng 32 chiều kim đồng hồ), click chọn Rotate Chọn... cần thêm liên kết vào, kéo thẳng góc để tạo liên kết 23 Trỏ vào nguyên tử nơi cần thêm liên kết vào và kéo thẳng xuống để tạo liên kết khác Lặp lại các bước như trên để vẽ các liên kết còn lại như hình vẽ Để vẽ cặp liên kết còn lại: Trỏ vào nguyên tử cần vẽ và kéo thẳng lên Để vẽ liên kết còn lại, nếu ta kéo xuống sẽ trùng với liên kết ở cacbon (3) , vì vậy ta vào Object tắt chế độ Fixed Lengths và vẽ.. .3. 1 .3. 2 Vẽ cấu trúc phân tử phức tạp bằng cách dùng vòng: Tạo vòng: Click và công cụ vòng Cyclohexane Click vào vùng trống trên cửa sổ để thêm vòng Click hợp nhất với các vòng theo hình biểu diễn 11 dưới... dưới để vẽ liên kết thứ 2 Tiếp tục vẽ liên kết thứ 3 29 Click công cụ selection Cấu trúc cuối cùng mà bạn vẽ sẽ được chọn Đưa công cụ vào khung chữ nhật, sau đó nhấn phím Ctrl và rê sang phải trong khi nhấn chuột trái để tạo bản sao thứ 2 Thêm liên kết vào giữa hai bản sao: Click chọn công cụ Solid Bond Click chọn cacbon từ cấu trúc này rê chuột nối đến 30 cấu trúc kia như hình vẽ Lưu ý: cần tắt chế độ... kết còn lại, nếu ta kéo xuống sẽ trùng với liên kết ở cacbon (3) , vì vậy ta vào Object tắt chế độ Fixed Lengths và vẽ hở như hình vẽ 24 Để thay đổi cấu trúc giống như theo hình phối cảnh (giống như hình 3 chiều) dọc theo trục Z, ta thực hiện như sau: Double click vào cấu trúc cần thay đổi, sau đó trỏ đến ô vuông của đường viền màu xanh bao quanh cấu trúc Khi con trỏ thay đổi thành mũi tên hai đầu, ta . bảng trong Chemdraw. 3. 2 .3 Hướng dẫn sử dụng Chem3D. 3. 3 Bài tập thực hành Bài tập 2 Chương 3: Sử dụng phần mềm ChemOffice 3. 1 Chemdraw 2D: 3. 1.1 Giới thiệu về Chemdraw 3. 1.2 Giao diện, các thanh. chương 3 3.1 Chemdraw 2D 3. 1.1 Giới thiệu về Chemdraw. 3. 1.2 Giao diện, các thanh công cụ và các bảng trong Chemdraw. 3. 1 .3 Hướng dẫn sử dụng Chemdraw. 3. 2 Chem3D 3. 2.1 Giới thiệu về Chem3D. 3. 2.2. properties): ¾ Bảng phân tích chi tiết (analysis) ¾ Bảng đồ các ký tự (character map) 7 3. 1 .3 Hướng dẫn sử dụng Chemdraw: 3. 1 .3. 1 Vẽ một cấu trúc: Trong phần này ta vẽ cấu trúc phân tử 2-propanone và thêm