Đề 001 công nghệ di truyền 1

DNA của vi khuẩn được gắn gốc methyl bởi enzyme giới hạn Câu 6 : ccdB gene sử dụng nhằmA.. tỉ lệ khuẩn lạc tạo thành và lượng vector sử dụng B.. tỉ lệ khuẩn lạc tạo thành và microgram ve

PHẦN 1 TRẮC NGHIỆM (0.1 đ/câu đúng)

Câu 1 : Sử dụng Alkaline Phosphatase xử lý vector nhằm

A Gắn nhóm 5’ phosphate B Tránh hiện tượng vector tự nối

C Loại bỏ nhóm 5’ phosphate D Giúp vector gắn lại

Câu 2 : S1 nuclease?

A tác động trên sợi đôi DNA B tác động lên sợi đơn và sợi đôi DNA

C tác động trên sợi đơn DNA D được thu nhận từ E coli

Câu 3 : lacZΔM15 có ý nghĩa:

A Một phần gene lacZ khi biểu hiện cần phải có tiến trình alpha complementation

B Gene lacZ với đột biến vị trí M15

C toàn bộ gene lacZ

D một phần gene lacZ

Câu 4 : Enzyme chuyển một đoạn DNA từ vị trí này sang vị trí khác là:

Câu 5 : Tại sao DNA của vi khuẩn không bị enzyme cắt phân hủy?

A do enzyme cắt không nhận biết DNA của

chính nó

B do enzyme cắt nhận biết DNA của chính

nó

C do DNA vi khuẩn được gắn gốc phosphate

bởi enzyme giới hạn

D DNA của vi khuẩn được gắn gốc methyl

bởi enzyme giới hạn

Câu 6 : ccdB gene sử dụng nhằm

A Kiểm soát sự chết tế bào B Tăng lượng tế bào tái tổ hợp

C Kiểm soát sự sinh ra tế bào D Giảm lượng tế bào tái tổ hợp

Câu 7 : DNA polymerase I gồm các tiểu đơn vị có chức năng khác nhau, trong đó ?

A Cả hai đoạn có hoạt tính 5’-3’ polymerase

và 3’-5’ exonuclease

B Đoạn nhỏ nhất được gọi là Klenow

C Đoạn nhỏ nhất ở đầu C terminal và đoạn

lớn nhất ở đầu N terminal

D Đoạn nhỏ nhất có hoạt tính 5’-3’

exonuclease trong khi đoạn lớn nhất có hoạt tính 5’-3’ polymerase và 3’-5’ exonuclease

Câu 8 : Hiệu suất biến nạp là:

A tỉ lệ khuẩn lạc tạo thành và lượng vector

sử dụng

B tỉ lệ khuẩn lạc tạo thành và microgram

vector sử dụng

C tỉ lệ khuẩn lạc tạo thành và lượng DNA

chèn vào vector

D tỉ lệ khuẩn lạc tạo thành và microgram

mẫu DNA chèn trong vector

Câu 9 : TA cloning là phương pháp tạo dòng

A Nucleotid A được gắn vào đầu của vector B Hiệu quả thấp

C Nucleotide T được gắn vào sản phẩm PCR D Dễ thực hiện

Câu 10 : Các bước trong việc tạo thư viện bộ gene gồm:

i) Phân đoạn DNA ii) Tách chiết DNA bộ gene

iii) Khuếch đại iv) Nối và chuyển vào tế bào vật chủ

v) Chuẩn bị vector

A ii)-i)-v)-iv)-iii) B i)-ii)-iii)-iv)-v)

C ii)-v)-i)-iv)-iii) D v)-ii)-i)-iii)-iv)

Câu 11 : Có bao nhiêu thể loại phản ứng nối

Câu 12 : Polymerases có bao nhiêu loại ?

Câu 13 : Hiện tượng alpha-complementation là:

C α + β = ω hoặc β = α + ω D α + β = ω

Câu 14 : Khi điện di DNA sợi đơn hoặc RNA, kiểu gel nào được sử dụng?

Câu 15 : Trong tổng hợp sợi cDNA thứ hai RNaseH được sử dụng nhằm

A Loại bỏ toàn bộ sợi RNA B Loại bỏ sợi RNA và tổng hợp sợi cDNA

C Tổng hợp sợi cDNA thứ nhì D Tạo các điểm hở trên sợi RNA

Câu 16 : Polymerases thêm nucleotide không cần sợi khuôn là?

A Terminal transferase thêm nucleotides ở

đầu 3’

B Reverse transcriptase

C Pfu polymerase D Taq polymerase thêm nucleotides ở đầu 5’

của sản phẩm

Câu 17 : M13 gây hại vi khuẩn bằng cách

C Làm chậm sự sinh trưởng D Phân hủy vách tế bào

Câu 18 : Tại sao reverse transciptases sao chép sai nhiều hơn so với các polymerases?

A Có hoạt tính exonucleolytic activity B Do tổng hợp DNA từ RNA

C Không có 3’-5’ exonucleolytic D Không có 5’-3’ exonucleolytic

Câu 19 : Phosphatase được dùng:

A loại bỏ nhóm phosphate của DNA và thay

thế bằng hydrogen

B thủy phân nhóm phosphate của DNA và

thay thế bằng nhóm hydroxyl

C thêm nhóm phosphate vào vị trí nhóm

hydroxyl của DNA

D thay thế hydrogen trong DNA với nhóm

phosphate

Câu 20 : DNA polymerase I không có hoạt tính ?

Câu 21 : Sau khi cắt bằng enzyme, đoạn polynucleotide có dạng

A Đầu tận cùng là sợi đôi B Cả hai đầu tận cùng đều là sợi đơn hoặc

sợi đôi

C Đầu tận cùng là sợi đơn D Một đầu là sợi đơn và một đầu là sợi đôi Câu 22 : Endonuclease là enzyme cắt đoạn polynucleotide

A chỉ cắt ở vị trí giữa đoạn B cắt đầu ngoài cùng của đoạn

C chỉ cắt ở phía trong, không cắt ở đầu ngoài

cùng

D bất cứ vị trí nào

Câu 23 : Taq polymerase không có chức năng?

C 5’-3’ polymerase D Cả 5’-3’ polymerase và 5’-3’ exonuclease Câu 24 : bla là gene?

C Gene kháng kháng sinh D Mã hóa enzyme beta- lactamase

Câu 25 : Xử lý với exonuclease giúp loại bỏ:

Câu 26 : Phương pháp self priming dùng tổng hợp cDNA.

A Đoạn DNA ở đầu 5’ bị mất B Sử dụng phổ biến

C Tạo ra cấu trúc vòng D Ít được sử dụng như phương pháp RNaseH Câu 27 : Nếu tất cả nucleotides hiện diện ngẫu nhiên với tần suất như nhau, tần suất xuất hiện của một

trình tự gồm 4 nucleotides là bao nhiêu?

Câu 28 : Phản ứng nối đạt hiệu quả cao nhất khi

C Tùy thuộc vào điều kiện phản ứng D Cả hai trường hợp như nhau

Câu 29 : Nếu linker kết hợp với các phân tử khác như marker chọn lọc được gọi là

Câu 30 : Đầu nào của primer phải bắt cặp tốt với sợi khuôn?

Câu 31 : Khuếch đại đẳng nhiệt là

C Không cần đun nóng và làm lạnh trong các

bước phản ứng

D Phải có thiết bị đắt tiền

Câu 32 : Cắt từng phần (partial digestion) với enzyme được hiểu là ?

A Điều kiện phản ứng để đoạn DNA không B kỹ thuật sử dụng trong xây dựng thư viện

bị cắt ở tất cả vị trí nhận biết của enzyme

cắt sử dụng

bộ gene

C Chỉ một nửa trình tự nhận biết trên DNA

được nhận biết

D Số lượng đoạn DNA tạo ra bởi cắt từng

phần bằng với số lượng DNA tạo ra khi cắt toàn phần

Câu 33 : Tại sao vector được thiết kế với một phần gene lacZ

A Chỉ một phần gene lacZ có thể biểu hiện

thành protein

B Plasmid chỉ cần một đoạn gene lacZ

C Toàn bộ gene lac Z có kích thước rất lớn D Toàn bộ gene lacZ không hoạt động Câu 34 : Methylase có chức năng ?

A loại nhóm methyl khỏi DNA B thêm nhóm methyl vào DNA

C thêm vào và loại nhóm methyl D tổng hợp nhóm methyl

Câu 35 : Lợi thế của biểu hiện protein ở dạng dung hợp là có thể tăng cường sự ổn định, cuộn gấp,

và ?

A hòa tan, tạo cầu nối disulphide B không hòa tan, tạo cầu nối disulphide

C không hòa tan, tạo cầu nối phosphodiester D hòa tan, tạo cầu nối phosphodiester Câu 36 : Sau khi lai, để nhận biết vị trí của DNA probe cần sử dụng phương pháp?

C Quan sát dưới kính hiển vi điện tử D Nhờ chất phát sáng

Câu 37 : Promoters được sử dụng nhiều là:

Câu 38 : Hệ thống tái tổ hợp của bacteriophage lambda có đặc điểm

A chèn bộ gene của vi khuẩn vào bộ gene

phage

B điểm đặc biệt ở vi khuẩn và phage được

gọi là attP

C điểm đặc biệt ở vi khuẩn là attB và của

phage là attP

D chèn bộ gene của phage vào bộ gene vi

khuẩn

Câu 39 : Tiến trình đưa sản phẩm PCR vào trong vector để tạo dòng là

Câu 40 : Có bao nhiêu phương pháp thu nhận DNA plasmid từ vi khuẩn?

Câu 41 : Trình tự nhận biết của Sau3A là 5 '| GATC 3' và DpnI là 5 'GA | TC 3' Câu nào là đúng?

A Đầu tạo bởi DpnI là sợi đơn B Đầu tận cùng tạo thành bởi hai enzyme

không tương thích nhau

C Đầu tận cùng tạo thành bởi hai enzyme

tương thích nhau

D Các đầu của Sau3A là sợi đôi

Câu 42 : Loại DNA nào di chuyển nhanh nhất khi điện di?

A Siêu xoắn B đứt gãy

C siêu xoắn và vòng di chuyển cùng vận tốc

và nhanh nhất

D Vòng

Câu 43 : Nếu đoạn DNA được cắt với hai enzyme khác nhau thì

C Nối với vector theo chiều duy nhất D Dễ chèn vào vector

Câu 44 : Tên enzyme cắt đầu tiên được tách từ dòng R của vi khuẩn Escherichia coli là ?

Câu 45 : Hai đầu so le được nối với nhau bởi

Câu 46 : lacZ là gene?

Câu 47 : The tac promoter được tạo bởi vùng _ của trp promoter và vùng _ của lacUV5

promoter

Câu 48 : Có bao nhiêu kiểu enzyme cắt?

Câu 49 : Biểu hiện của thể lai gồm T7 promoter và lac operator cần phải có:

C Cả T7 RNA polymerase và chất cảm ứng

như IPTG

D Chất cảm ứng như IPTG

Câu 50 : Trình tự nhận biết của BamHI là 5’ G|GATCC 3’ khi cắt sẽ tạo nên

A Đầu tận cùng là sợi đôi B Đầu 3’ là sợi đơn

PHẦN 2 TỰ LUẬN

Để tìm hiểu đặc điểm của protein Mi-SP1, trình tự gene Mi-sp1 mã hóa cho protein này được

tạo dòng

 Trình tự Mi-sp1 (402 bp)

ATGAATCCACAAAGAATGC NNNNNNNNNN GGCAGCATTTCTTTAA

1 Để thuận lợi cho tạo dòng thứ cấp (subcloning) cho mục đích nghiên cứu biểu hiện gene, Minc17980 được khuếch đại bằng PCR và gắn thêm trình tự nhận biết của 2 enzyme A (G_A_C_) ở đầu 5’ và enzyme B ở đầu 3’(_G_A_C) Hãy cho biết trình tự primer sử dụng (15 nu đầu tiên) và cách tính nhiệt độ bắt cặp ? (1 điểm)

2 Tiến hành phản ứng PCR, hãy tính lượng sử dụng của các thành phần trong phản ứng (1 điểm)

Thành phần Nồng độ đầu Nồng độ cuối Thể tích (l)

Primer (F) 10 M 0,4 M Primer (R) 10 M 0,4 M DNA template (10 ng/ul) 5-10 ng

Pfu polymerase (2U/ul) 1U ddH2O

 Bản đồ vector pGEM-T Easy

3 Sản phẩm PCR được tinh sạch và tạo dòng với hệ thống vector pGEM-T Easy Hãy trình bày phương pháp nối sản phẩm PCR và vector? (1 điểm)

4 Biến nạp sản phẩm nối vào tế bào E.coli JM109 bằng phương pháp sốc nhiệt Hãy trình bày phương pháp sàng lọc dòng tế bào mang vector tái tổ hợp (1 điểm)

5 Kết quả giải trình tự cho thấy đã thu nhận được đoạn mã hóa Minc17980 Để tìm hiểu gene Minc17980 biểu hiện ở đâu trong cơ thể tuyến trùng, tiến hành phương pháp lai tại chỗ Mẫu dò (probe) được tổng hợp bằng cách sử dụng dUTP-dioxygenin Hãy trình bày phương pháp tổng hợp

mẫu dò phát hiện Mi-sp1(RNA) và mẫu dò làm đối chứng (1 điểm).

TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP.HCM

BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC

ĐÁP ÁN ĐỀ THI KẾT THÚC HỌC PHẦN – ĐỀ SỐ 001

Đề thi môn: CÔNG NGHỆ DI TRUYỀN

Mã môn học: 211113 Học kỳ: I Năm học: 2017 - 2018

Nhóm:

Phần 1 TRẮC NGHIỆM

Câu

số

Đáp

án

Câu

số

Đáp

án

Câu

số

Đáp

án

Câu

số

Đáp

án

Câu

số

Đáp

án

Câu

số

Đáp

án

Phần 2 Tự luận

Cầu 1:

- GGATCCATGAATCCACAAAGA (0.5 đ)

- GGTACCTTAAAGAAATGCTGC (0.5 đ)

Câu 2:

Thành phần Nồng độ đầu Nồng độ cuối Thể tích (l)

Primer (F) 10 M 0,4 M 0.8 (0.1 đ) Primer (R) 10 M 0,4 M 0.8 (0,1 đ) DNA template (10 ng/ul) 5-10 ng 1.0 (0.2 đ)

Pfu polymerase (2U/ul) 1U 1.0 (0,2 đ)

Cầu 3:

- Gắn đuôi dA vào sản phẩm PCR (0,5 đ)

- Gắn vào vector theo hệ thống TA cloning (0,5 đ)

Câu 4:

- Nuôi trên môi trường có bổ sung Ampiciline, chất cảm ứng như IPTG, cơ chất phản ứng như X-Gal (0,5 đ)

- Chọn lọc bằng hệ thống xanh trắng do phản ứng giữa enzyme beta galactosidase phản ứng với cơ chất tạo màu xanh (0,5 đ)

Câu 5

- Sử dụng enzyme T7 RNA polymease tổng hợp RNA đánh dấu (0,5 đ)

- Sử dụng SP6 RNA polymerse tổng hợp RNA đánh dấu (0,5 đ)

TRƯỞNG BỘ MÔN/BCN KHOA GIẢNG VIÊN

(Ký, ghi rõ họ và tên) (Ký, ghi rõ họ và tên)