THÔNG TIN TÀI LIỆU
HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM KHOA CÔNG NGHỆ SINH HỌC – – – – – &– – – – – KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐỀ TÀI: ĐỊNH DANH HERMETIA ILLUCENS THU THẬP NGỒI TỰ NHIÊN VÀ TRONG CHĂN NI Ở MỘT SỐ ĐỊA PHƯƠNG CỦA VIỆT NAM VÀ ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG PHÂN HỦY PHẾ PHỤ PHẨM TRONG TRỒNG TRỌT, CHĂN NI, THỦY SẢN CỦA ẤU TRÙNG RUỒI LÍNH ĐEN HÀ NỘI, 2022 HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM KHOA CÔNG NGHỆ SINH HỌC – – – – – &– – – – – KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐỀ TÀI: ĐỊNH DANH HERMETIA ILLUCENS THU THẬP NGOÀI TỰ NHIÊN VÀ TRONG CHĂN NUÔI Ở MỘT SỐ ĐỊA PHƯƠNG CỦA VIỆT NAM VÀ ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG PHÂN HỦY PHẾ PHỤ PHẨM TRONG TRỒNG TRỌT, CHĂN NUÔI, THỦY SẢN CỦA ẤU TRÙNG RUỒI LÍNH ĐEN Sinh viên thực : PHAN THỊ THÙY Lớp : K63CNSHB Ngành : CÔNG NGHỆ SINH HỌC Giảng viên hướng dẫn : TS NGUYỄN THỊ NHIÊN TS TRƯƠNG QUANG LÂM HÀ NỘI, 2022 LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan tồn nội dung báo cáo khóa luận nơi dung nghiên cứu thực cá nhân hướng dẫn TS Nguyễn Thị Nhiên Các số liệu, kết quả, hình ảnh báo cáo đưa hồn tồn trung thực, chưa sử dụng cơng bố cơng trình nghiên cứu khoa học trước Các nhận xét phương hướng đưa xuất phát từ thực tiễn kinh nghiệm có Mọi nội dung tham khảo báo cáo trích dẫn rõ nguồn gốc, tên tác giả, tên cơng trình, thời gian… Tơi xin khẳng định trung thực lời cam đoan Tôi xin chân thành cảm ơn ! Hà Nội, ngày tháng Sinh viên Phan Thị Thùy i năm 2022 LỜI CẢM ƠN Sau trình học tập năm Đại học, tơi tiến hành làm khóa luận mơn Cơng nghệ sinh học Động vật – Khoa Công nghệ sinh học – Học viện Nơng nghiệp Việt Nam Để hồn thành đề tài khóa luận tốt nghiệp ngồi nỗ lực học hỏi không ngừng thân, nhận quan tâm, giúp đỡ nhiệt tình từ thầy giáo, nhà trường gia đình bạn bè Đầu tiên xin gửi lời cảm ơn chân thành đến Học viện Nông nghiệp Việt Nam tạo điều kiện cho tơi thực khóa luận tốt nghiệp, cảm ơn ban chủ nhiệm khoa Công nghệ sinh học thầy cô giáo môn Công nghệ sinh học Động vật – Khoa Công nghệ sinh học tận tình hướng dẫn, bổ sung kiến thức cho tơi cung cấp hóa chất, cơng cụ suốt q trình thực tập phịng thí nghiệm mơn Đặc biệt, tơi xin bày tỏ lời cảm ơn sâu sắc đến TS Nguyễn Thị Nhiên, thuộc môn Công nghệ sinh học Động vật – Khoa Công nghệ sinh học; TS Trương Quang Lâm, Phó Trưởng Phịng trọng diểm Cơng nghệ sinh học khoa thú y - khoa Thú y; TS Lê Xuân Vị, Trưởng Bộ mơn Chẩn đốn giám định dịch hại & thiên địch – Viện Bảo vệ thực vật; PGS TS Lê Thanh Hịa, Phịng Miễn dịch học – Viện Cơng nghệ sinh học dành nhiều thời gian tâm huyết để hướng dẫn chia sẻ kinh nghiệm cho tơi suốt q trình thực đề tài khóa luận tốt nghiệp Cuối cùng, xin gửi lời cảm ơn chân thành đến toàn thể anh, chị, bạn bè thực tập, nghiên cứu phịng thí nghiệm gia đình giúp đỡ tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình thực tập tốt nghiệp Tôi xin chân thành cảm ơn ! Hà Nội, ngày … tháng ……năm 2022 Sinh viên Phan Thị Thùy ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii DANH MỤC BẢNG v DANH MỤC HÌNH ẢNH vi DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT vii TÓM TẮT KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP viii PHẦN 1: MỞ ĐẦU 1 Đặt vấn đề Mục đích Yêu cầu PHẦN 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Các nghiên cứu nước 2.1.1 Nguồn gốc 2.1.2 Hệ thống phân loại 2.1.3 Đặc điểm ruồi lính đen 2.1.4 Vai trị ruồi lính đen phân giải chất thải hữu 2.1.5 Tiềm ứng dụng sản phẩm từ ấu trùng ruồi lính đen 10 2.2 Các nghiên cứu nước 13 PHẦN 3: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 17 3.1 Đối tượng, vật liệu, địa điểm thời gian nghiên cứu 17 3.1.1 Đối tượng nghiên cứu 17 3.1.2 Vật liệu nghiên cứu 17 3.1.3 Dụng cụ hóa chất 17 3.1.4 Địa điểm thời gian nghiên cứu 17 3.2 Nội dung phương pháp nghiên cứu 18 3.2.1 Mơ tả đặc điểm nhận dạng ruồi lính đen Việt Nam 18 iii 3.2.2 Giải trình tự gene ruồi lính đen thị phân tử gene cox1 18 3.2.3 Đánh giá khả phân hủy phụ phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản ấu trùng ruồi lính đen 24 PHẦN 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 26 4.1 Kết định danh đặc điểm hình thái học ruồi lính đen Việt Nam 26 4.2 Giải trình tự gene ruồi lính đen thị phân tử gene cox1 31 4.2.1 Kết chạy phản ứng PCR 31 4.2.2 Kết giải trình tự thu nhận xử lý số liệu chuỗi gen cox1 32 4.2.3 Kết phân tích quan hệ lồi phả hệ dựa so sánh chuỗi gen cox1 33 4.3 Đánh giá khả phân hủy phế phụ phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản ấu trùng ruồi lính đen 36 PHẦN 5: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 38 5.1 Kết luận 38 5.2 Kiến nghị 38 TÀI LIỆU THAM KHẢO 39 PHỤ LỤC 48 iv DANH MỤC BẢNG Bảng 3.1 Danh sách mẫu mơ tả mẫu ruồi lính đen thu địa phương q trình tách DNA tởng số, thực PCR thu thị phân tử gen cox1 18 Bảng 3.2: Danh sách mẫu chuỗi nucleotide đoạn gen cox1 đã giải trình tự từ mẫu ruồi lính đen (Hermetia illucens) thu thập từ địa phương Việt Nam 22 Bảng 3.3 Danh sách chủng tham chiếu cung cấp chuỗi gen cox1 sử dụng cho nghiên cứu mối quan hệ lồi phả hệ ruồi lính đen thu thập Việt Nam 23 Bảng 4.1: Kích thước màu sắc ấu trùng ruồi lính đen Hermetia illucens 29 Bảng 4.2: Kết định danh mẫu ruồi lính đen Việt Nam 31 Bảng 4.3: Bảng đánh giá khả phân hủy nguồn thức ăn ấu trùng 36 ruồi lính đen 36 v DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình 2.1 Ruồi lính đen trưởng thành (nguồn: internet) Hình 2.2 Trứng ruồi lính đen (nguồn: internet) Hình 2.3 Ấu trùng ruồi lính đen (nguồn: internet) Hình 2.4 Vịng đời ruồi lính đen (nguồn: internet) Hình 4.1 Đặc điểm phần đầu ruồi lính đen 26 Hình 4.2 Đặc điểm cánh bụng ruồi lính đen (Trưởng thành đực) 27 Hình 4.3 Đặc điểm chân sau ruồi lính đen 27 Hình 4.5 Bộ phận sinh dục đực 28 Hình 4.6 Bộ phận sinh dục 28 Hình 4.7 Trứng ấu trùng ruồi lính đen 29 Hình 4.8 Kích thước ấu trùng qua giai đoạn 30 Hình 4.9 Hình ảnh nhộng ruồi lính đen 30 Hình 4.10: Điện di kiểm tra sản phẩm PCR đại diện sử dụng khuôn DNA tổng số mẫu ruồi lính đen thu thập Đồng Nai (DN), Cần Thơ (HICT), Đà Nẵng (HIDNN), Sơn La (HISL), Đăk Lăk (HIDL) Hồ Chí Minh (HIHCM), M: Marker (DNA Lamda cắt HindIII); 417: DN2; 418: CT2; 419: DNN, 401: HISLpcr401, 402: HIDLpcr402, 403: HIHCMpcr403 Mũi tên kích thước sản phẩm (714 bp) 32 Hình 4.11 Kết giải trình tự gene 33 Hình 4.13 Hình ảnh ni ấu trùng ruồi lính đen loại chất lần lượt: chất thải chăn nuôi, chế biến thủy sản, phụ phẩm nông nghiệp 37 vi DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT AAFCO: Hiệp hội Cán Kiểm sốt Thức ăn chăn ni Hoa Kỳ BSF: Black Soldier Fly CBD: Đa dạng sinh học DMSO: Dimethyl sulfoxide DNA: Deoxyribonucleic Acid FDA: Cơ quan Quản lý Thực phẩm Thuốc Hoa Kỳ IUCN: Liên minh Quốc tế bảo tồn thiên nhiên tài nguyên thiên nhiên PCR: Polymerase Chain Reaction Sở NN&PTNT Hà Nội: Sở Nông nghiệp & Phát triển nơng thơn Hà Nội vii TĨM TẮT KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP Tên đề tài: Định danh Hermetia illucens thu thập tự nhiên chăn nuôi số địa phương Việt Nam đánh giá khả phân hủy phế phụ phẩm trồng trọt, chăn nuôi, thủy sản ấu trùng ruồi lính đen Giảng viên hướng dẫn: TS Nguyễn Thị Nhiên TS Trương Quang Lâm Tên tác giả: PHAN THỊ THÙY Lớp: CNSHB Khóa: 63 TĨM TẮT BÁO CÁO Mục đích nghiên cứu: - Mơ tả đặc điểm hình thái, đặc điểm sinh học phân tử quần thể ruồi lính đen thu thập Sơn La, Đà Nẵng, Đăk Lăk, TP Hồ Chí Minh, Cần Thơ, Đồng Nai - Đánh giá khả phân hủy thức ăn (trồng trọt, chăn nuôi thủy sản) ruồi lính đen Phương pháp nghiên cứu: Phương pháp mơ tả đặc điểm hình thái học Phương pháp sinh học phân tử Phương pháp đánh giá thực nghiệm Phương pháp xử lý số liệu Kết nghiên cứu: - Hình thái học ruồi lính đen mô tả thông qua đặc điểm viii 31 Qi Y, Xu J, Tian X, Bai Y, Gu X (2017) The complete mitochondrial genome of Hermetia illucens (Diptera: Stratiomyidae) Mitochondrial DNA B: Resources 2(1): 189–190 32 Renna, M.; Schiavone, A.; Gai, F.; Dabbou, S.; Lussiana, C.; Malfatto, V.; Prearo, M.; Capucchio, M.T.; Biasato, I.; Biasibetti, E Evaluation of the suitability of a partially defatted black soldier fly (Hermetia illucens L.) larvae meal as ingredient for rainbow trout (Oncorhynchus mykiss walbaum) diets J Anim Sci Biotechnol 2017, 8, 57 33 Rhode C, Badenhorst R, Hull KL, Greenwood MP, Bester-van der Merwe AE, Andere AA, Picard CJ, Richards C (2020) Genetic and phenotypic consequences of early domestication in black soldier flies (Hermetia illucens) Animal Genetícs 51(5): 752–762 34 Schiavone A, Dabbou S, Petracci M, Zampiga M, Sirri F, Biasato I, et al (2019) Black soldier fly defatted meal as a dietary protein source for broiler chickens: effects on carcass traits, breast meat quality and safety Animal 13(10):2397–2405 35 Sealey, W.M.; Gaylord, T.G.; Barrows, F.T.; Tomberlin, J.K.; McGuire, M.A.; Ross, C.; St-Hilaire, S Sensory analysis of rainbow trout, Oncorhynchus mykiss, fed enriched black soldier fly prepupae, Hermetia illucens J World Aquac Soc 2011, 42, 34–45 36 Siegrist, M Factors influencing public acceptance of innovative food technologies and products Trends Food Sci Technol 2008, 19, 603–608 37 Sheppard D.C., Newton G.L., Thompson S.A., Savage S (1994) A valueadded manure management-system using the black soldier fly Bioresour Technol., 50: 275– 279 38 Sheppard, D.C.; Tomberlin, J.K.; Joyce, J.A.; Kiser, B.C.; Sumner, S.M Rearing methods for the black soldier fly (diptera: Stratiomyidae) J Med 43 Entomol 2002, 39, 695–698 39 Spranghers T, Ottoboni M, Klootwijk C, Ovyn A, Deboosere S, De Meulenaer B, et al (2017) Nutritional composition of black soldier fly (Hermetia illucens) prepupae reared on different organic waste substrates Journal of the Science of Food and Agriculture 97(8): 2594–2600 40 Ståhls G, Meier R, Sandrock C, Hauser M, Šašić Zorić L, Laiho E, Aracil A, Doderović J, Badenhorst R, Unadirekkul P, Mohd Adom NAB, Wein L, Richards C, Tomberlin JK, Rojo S, Veselić S, Parviainen T (2020) The puzzling mitochondrial phylogeography of the black soldier fly (Hermetia illucens), the commercially most important insect protein species BMC Evolutionary Biology 20(1): 60 https://doi.org/10.1186/s12862-020-016272 41 St-Hilaire, S.; Cranfill, K.; McGuire, M.A.; Mosley, E.E.; Tomberlin, J.K.; Newton, L.; Sealey, W.; Sheppard, C.; Irving, S Fish offal recycling by the black soldier fly produces a foodstuff high in omega-3 fatty acids J World Aquac Soc 2007, 38, 309–313 42 Surendra, K C., Tomberlin, J K., van Huis, A., Cammack, J A., Heckmann, L H L., & Khanal, S K (2020) Rethinking organic wastes bioconversion: Evaluating the potential of the black soldier fly (Hermetia illucens (L.))(Diptera: Stratiomyidae)(BSF) Waste Management, 117, 58-80 43 Tomberlin J.K., Adler P.H., Myers H.M (2009) Development of the black soldier fly (diptera: Stratiomyidae) in relation to temperature Environ Entomol., 38, 930-934 44 Turgay Üstüner, Abdullah Hasbenli, Rudolf Rozkošný The first record of Hermetia illucens (Linnaeus, 1758) (Diptera, Stratiomyidae) from the Near East Studia dipterologica, 2003, 10, 181- 185 45 Ur Rehman, K.; Cai, M.; Xiao, X.; Zheng, L.; Wang, H.; Soomro, A.A.; Zhou, 44 Y.; Li, W.; Yu, Z.; Zhang, J Cellulose decomposition and larval biomass production from the co-digestion of dairy manure and chicken manure by mini-livestock (Hermetia illucens L.) J Environ Manag 2017, 196, 458– 465 46 Ur Rehman, K.; Rehman, A.; Cai, M.; Zheng, L.; Xiao, X.; Somroo, A.A.; Wang, H.; Li, W.; Yu, Z.; Zhang, J Conversion of mixtures of dairy manure and soybean curd residue by black soldier fly larvae (Hermetia illucens L.) J Clean Prod 2017, 154, 366–373 47 Üstüner, T.; Hasbenli, A.; Rozkošný, R The first record of Hermetia illucens (Linnaeus, 1758) (Diptera, Stratiomyidae) from the Near East Studia Dipterol 2003, 10, 181–185 48 Vos, E EU food safety regulation in the aftermath of the bse crisis J Consum Policy, 2000, 23, 227–25 49 Wang, C.; Qian, L.; Wang, W.; Wang, T.; Deng, Z.; Yang, F.; Xiong, J.; Feng, W Exploring the potential of lipids from black soldier fly: New paradigm for biodiesel production (I) Renew Energy 2017, 111, 749–756 50 Webster, C.D.; Rawles, S.D.; Koch, J.F.; Thompson, K.R.; Kobayashi, Y.; Gannam, A.L.; Twibell, R.G.; Hyde, N.M Bio-ag reutilization of distiller’s dried grains with solubles (DDGS) as a substrate for black soldier fly larvae, Hermetia illucens, along with poultry by-product meal and soybean meal, as total replacement of fish meal in diets for nile tilapia, Oreochromis niloticus Aquac Nutr 2016, 22, 976–988 51 Yu, G.H.; Chen, Y.H.; Yu, Z.N.; Cheng, P Research progress on the larvae and prepupae of black soldier fly Hermetia illucens used as animal feedstuff Chin Bull Entomol 2009, 46, 41–45 52 Yu G., Li Y., Yang Y., Xia Q (2014) Effects of the artificial diet with low water content on the growth and development of the black soldier fly, 45 Hermetia illucens (Diptera: Stratiomyidae) Acta Entomologica Sinica, 5: 943-950 53 Yang, D.; Zhang, T.; Li, Z Stratiomyoidea of China; China Agricultural University Press: Beijing, China, 2014 54 Zheng, L.Y.; Hou, Y.F.; Li, W.; Yang, S.; Li, Q.; Yu, Z.N Biodiesel production from rice straw and restaurant waste employing black soldier fly assisted by microbes Energy, 2012, 47, 225–229 55 Zhou, F.; Tomberlin, J.K.; Zheng, L.Y.; Yu, Z.N.; Zhang, J.B Developmental and waste reduction plasticity of three black soldier fly strains (diptera: Stratiomyidae) raised on different livestock manures J Med Entomol., 2013, 50, 1224–1230 ❖ Tài liệu Tiếng Việt: 56 Bùi Ngọc Cẩn Sử dụng ruồi lính đen để phân hủy rác hữu cơ, 2011 57 Giang Thị Thanh Nhàn, Trần Thị Thu Thủy, Nguyễn Thị Quỳnh Châu, Phạm Doãn Lân Đa dạng di truyền gen COI ty thể mối quan hệ phát sinh lồi ruồi lính đen (Hermetia illucens) ni Việt Nam Nông nghiệp phát triển nông thôn, 2020, 2, 22-28 58 Nguyễn Phú Hòa, Nguyễn Văn Dũng Sử dụng ấu trùng ruồi lính đen (Hermetia illucens) thức ăn cho cá lóc Bơng (Chanamicropeltes) Tạp chí Khoa học Nông nghiệp Việt Nam, 2016, tập 14, số 4:590-597 59 Nguyễn Thị Bích Hảo, Phạm Thị Thùy, Nguyễn Hải Hịa Nhân ni ruồi lính đen (Hermetia illucens) hệ chất khác để xử lý chất thải rắn sinh hoạt hữu Khoa học công nghệ Lâm nghiệp, 2017, số 10: 88-93 60 Trần Tuấn Việt Xử lý rác hữu từ rác thải sinh hoạt kỹ thuật chuyển hóa sinh học: Kết thí nghiệm khả ăng ứng dụng Trường ĐH Nông Lâm thành phố Hồ Chí Minh, 2002 46 61 Trần Tuấn Việt, Nguyễn Hữu Trú Sử dụng trùng Hermetia illucerns để xử lý phân heo nguồn protein phân hữu sinh học Dự án nghiên cứu khoa học, Sở Khoa học Công nghệ Môi trường Đồng Nai, 2005 62 Trần Tấn Việt, Nguyễn Hữu Trúc Đỗ Nguyễn Hương Thảo Nghiên cứu đặc điểm hình thái, sinh học hành vi ruồi lính đen Hermetiamillucens Trường ĐH Nơng Lâm thành phố Hồ Chí Minh, 2005 ❖ Tài liệu internet: 63 http://www.baobinhdinh.com.vn/kinhte-phattrien/2011/3/107520/ 64 https://ja.wikipedia.org/wiki 65 http://uniquebiotechnology.com/ 66.http://eurlex.europa.eu/legalcontent/EN/TXT/?uri=uriserv:OJ.L_.2017.138.0 1.0092 67.http://eurlex.europa.eu/legalcontent/EN/TXT/?uri=uriserv%3AOJ.L_.2017.1 38.01 68 https://www.aafco.org/Portals/0/SiteContent/Meetings/Annual/2016 69 http://ceid.gov.vn/ 70 http://ciren.gov.vn/index.php?option=com_nredb&view=nredb&Itemid=55 Cục Công nghệ Thông tin, Bộ Tài nguyên Môi trường 71.https://openknowledge.worldbank.org/bitstream/handle/10986/29244/122935 -Vietnam-livestock-VN.pdf?sequence=4&isAllowed=y 47 PHỤ LỤC Đăng ký Ngân hàng gen chủng BSF Việt Nam LOCUS OP164686 658 bp DNA linear INV 07-AUG-2022 DEFINITION Hermetia illucens isolate VieSL cytochrome c oxidase subunit I (COX1) gene, partial cds; mitochondrial ACCESSION OP164686 VERSION OP164686 KEYWORDS SOURCE mitochondrion Hermetia illucens ORGANISM Hermetia illucens Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; Pterygota; Neoptera; Endopterygota; Diptera; Brachycera; Stratiomyomorpha; Stratiomyidae; Hermetiinae; Hermetia REFERENCE AUTHORS (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Molecular genogrouping of the Black soldier fly (Hermetia illucens) (Diptera: Stratiomyidae), samples collected from the environment and culture in Vietnam JOURNAL REFERENCE AUTHORS Unpublished (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (07-AUG-2022) Immunology, Institute of Biotechnology, 18 Hoang Quoc Viet Rd., Cau Giay dist., Hanoi, Vietnam, Hanoi 10000, Viet Nam COMMENT ##Assembly-Data-START## Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES source Location/Qualifiers 658 /organism="Hermetia illucens" /organelle="mitochondrion" /mol_type="genomic DNA" /isolate="VieSL" /isolation_source="natural organic waste" /db_xref="taxon:343691" /dev_stage="adult" /country="Viet Nam: Son La" /collection_date="26-Apr-2022" 48 /collected_by="Nguyen Thi Nhien" gene 658 /gene="COX1" CDS 658 /gene="COX1" /codon_start=2 /transl_table=5 /product="cytochrome c oxidase subunit I" /protein_id="UUM18952" /translation="TLYFIFGAWAGMVGTSLSILIRAELGHPGALIGDDQIYNVIVTA HAFVMIFFMVMPIMIGGFGNWLVPLMLGAPDMAFPRMNNMSFWLLPPSLTLLLASSMV DAGAGTGWTVYPPLAAGIAHSGASVDLAIFSLHLAGISSILGAVNFITTVINMRSTGI TFDRMPLFVWSVVITAVLLLLSLPVLAGAITMLLTDRNLNTSFFDPAGGGDPILYQHL F" ORIGIN tacattatat tttatctttg gagcctgagc tggtatagta ggaacttctt taagaattct 61 tattcgagcc gaattaggcc acccaggagc tttaattgga gatgaccaaa tttataacgt 121 aattgttact gcccatgctt ttgtaataat tttctttata gttataccaa ttataattgg 181 tggatttggt aattgacttg ttcccctgat attaggagcc cctgatatag ctttcccacg 241 aataaataac ataagtttct ggctacttcc cccctctctc actcttttat tagcatcttc 301 tatagtagat gctggggcag gaaccggttg aactgtctac ccccccttag ccgctggtat 361 tgcccataga ggagcttcag ttgacctagc tattttttcc cttcatttag ccgggatttc 421 ttcaatttta ggggctgtaa attttattac tacagtaatc aatatacgat cgacaggaat 481 tacatttgac cgaatacctc tatttgtttg atcagtggta attacagcag tacttcttct 541 tctgtcactt cccgttcttg ccggagctat taccatatta ttaacagatc gaaatttaaa 601 tacttctttc ttcgacccag ccgggggagg tgaccccatt ctttatcaac atttattt // LOCUS OP164688 658 bp DNA linear INV 07-AUG-2022 DEFINITION Hermetia illucens isolate VieDNN cytochrome c oxidase subunit I (COX1) gene, partial cds; mitochondrial ACCESSION OP164688 VERSION OP164688 KEYWORDS SOURCE mitochondrion Hermetia illucens ORGANISM Hermetia illucens Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; Pterygota; Neoptera; Endopterygota; Diptera; Brachycera; Stratiomyomorpha; Stratiomyidae; Hermetiinae; Hermetia REFERENCE AUTHORS (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Molecular genogrouping of the Black soldier fly (Hermetia illucens) 49 (Diptera: Stratiomyidae), samples collected from the environment and culture in Vietnam JOURNAL REFERENCE AUTHORS Unpublished (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (07-AUG-2022) Immunology, Institute of Biotechnology, 18 Hoang Quoc Viet Rd., Cau Giay dist., Hanoi, Vietnam, Hanoi 10000, Viet Nam COMMENT ##Assembly-Data-START## Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 658 /organism="Hermetia illucens" /organelle="mitochondrion" /mol_type="genomic DNA" /isolate="VieDNN" /isolation_source="culture" /db_xref="taxon:343691" /dev_stage="larva" /country="Viet Nam: Da Nang" /collection_date="22-Jun-2022" /collected_by="Nguyen Thi Nhien" gene 658 /gene="COX1" CDS 658 /gene="COX1" /codon_start=2 /transl_table=5 /product="cytochrome c oxidase subunit I" /protein_id="UUM18954" /translation="TLYFIFGAWAGMVGTSLSILIRAELGHPGALIGDDQIYNVIVTA HAFVMIFFMVMPIMIGGFGNWLVPLMLGAPDMAFPRMNNMSFWLLPPSLTLLLASSMV DAGAGTGWTVYPPLAAGIAHSGASVDLAIFSLHLAGISSILGAVNFITTVINMRSTGI TFDRMPLFVWSVVITAVLLLLSLPVLAGAITMLLTDRNLNTSFFDPAGGGDPILYQHL F" ORIGIN tacattatat tttatctttg gagcctgagc tggcatagta ggaacttctt taagaatcct 61 tattcgagcc gaattagggc acccaggagc tttaattgga gatgaccaaa tttataacgt 121 aattgttact gcccatgctt ttgtaataat tttctttata gttataccaa ttataattgg 50 181 tggatttggt aattgacttg ttccactgat attaggagcc cctgatatag ctttcccacg 241 aataaataac ataagtttct ggctacttcc cccctctctc actcttttat tagcatcttc 301 tatagtagat gctggagcag gaaccggttg aactgtctac ccccccttag ccgctggtat 361 tgcccataga ggagcttcag ttgacctagc tattttttcc cttcatttag ccgggatttc 421 ttcaatttta ggggctgtaa attttattac tacagtaatc aatatacgat cgacaggaat 481 tacatttgac cgaatacctc tatttgtttg atcagtggta attacagcag tacttcttct 541 tctgtcactt cctgttcttg ccggagctat taccatatta ttaacagatc gaaatttaaa 601 tacttctttc ttcgacccag ccggaggggg tgacccaatt ctttatcagc atttattt // LOCUS OP164692 658 bp DNA linear INV 07-AUG-2022 DEFINITION Hermetia illucens isolate VieDL cytochrome c oxidase subunit I (COX1) gene, partial cds; mitochondrial ACCESSION OP164692 VERSION OP164692 KEYWORDS SOURCE mitochondrion Hermetia illucens ORGANISM Hermetia illucens Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; Pterygota; Neoptera; Endopterygota; Diptera; Brachycera; Stratiomyomorpha; Stratiomyidae; Hermetiinae; Hermetia REFERENCE AUTHORS (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Molecular genogrouping of the Black soldier fly (Hermetia illucens) (Diptera: Stratiomyidae), samples collected from the environment and culture in Vietnam JOURNAL REFERENCE AUTHORS Unpublished (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (07-AUG-2022) Immunology, Institute of Biotechnology, 18 Hoang Quoc Viet Rd., Cau Giay dist., Hanoi, Vietnam, Hanoi 10000, Viet Nam COMMENT ##Assembly-Data-START## Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES source Location/Qualifiers 658 /organism="Hermetia illucens" /organelle="mitochondrion" /mol_type="genomic DNA" 51 /isolate="VieDL" /isolation_source="natural organic waste" /db_xref="taxon:343691" /dev_stage="adult" /country="Viet Nam: Dak Lak" /collection_date="10-Apr-2022" /collected_by="Nguyen Thi Nhien" gene 658 /gene="COX1" CDS 658 /gene="COX1" /codon_start=2 /transl_table=5 /product="cytochrome c oxidase subunit I" /protein_id="UUM18958" /translation="TLYFIFGAWAGMVGTSLSILIRAELGHPGALIGDDQIYNVIVTA HAFVMIFFMVMPIMIGGFGNWLVPLMLGAPDMAFPRMNNMSFWLLPPSLTLLLASSMV DAGAGTGWTVYPPLAAGIAHSGASVDLAIFSLHLAGISSILGAVNFITTVINMRSTGI TFDRMPLFVWSVVITAVLLLLSLPVLAGAITMLLTDRNLNTSFFDPAGGGDPILYQHL F" ORIGIN tacattatat tttatctttg gagcctgagc tggtatagta ggaacttctt taagaattct 61 tattcgagcc gaattaggac acccaggagc tttaattgga gatgaccaaa tttataacgt 121 aattgttact gcccatgctt ttgtaataat tttctttata gttataccaa ttataattgg 181 tggatttggt aattgacttg ttcccctgat attaggagcc cctgatatag ctttcccacg 241 aataaataac ataagtttct ggctacttcc cccctctctc actcttttat tagcatcttc 301 tatagtagat gctggggcag gaaccggttg aactgtctac ccccccttag ccgctggtat 361 tgcccataga ggagcttcag ttgacctagc tattttttcc cttcatttag ccgggatttc 421 ttcaatttta ggggctgtaa attttattac tacagtaatc aatatacgat cgacaggaat 481 tacatttgac cgaatacctc tatttgtttg atcagtggta attacagcag tacttcttct 541 tctgtcactt cccgttcttg ccggagctat taccatatta ttaacagatc gaaatttaaa 601 tacttctttc ttcgacccag ccgggggagg tgaccccatt ctttatcaac atttattt // LOCUS OP164693 658 bp DNA linear INV 07-AUG-2022 DEFINITION Hermetia illucens isolate VieDN1 cytochrome c oxidase subunit I (COX1) gene, partial cds; mitochondrial ACCESSION OP164693 VERSION OP164693 KEYWORDS SOURCE mitochondrion Hermetia illucens ORGANISM Hermetia illucens Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; 52 Pterygota; Neoptera; Endopterygota; Diptera; Brachycera; Stratiomyomorpha; Stratiomyidae; Hermetiinae; Hermetia REFERENCE AUTHORS (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Molecular genogrouping of the Black soldier fly (Hermetia illucens) (Diptera: Stratiomyidae), samples collected from the environment and culture in Vietnam JOURNAL REFERENCE AUTHORS Unpublished (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (07-AUG-2022) Immunology, Institute of Biotechnology, 18 Hoang Quoc Viet Rd., Cau Giay dist., Hanoi, Vietnam, Hanoi 10000, Viet Nam COMMENT ##Assembly-Data-START## Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES source Location/Qualifiers 658 /organism="Hermetia illucens" /organelle="mitochondrion" /mol_type="genomic DNA" /isolate="VieDN1" /isolation_source="natural organic waste" /db_xref="taxon:343691" /dev_stage="adult" /country="Viet Nam: Dong Nai" /collection_date="28-Mar-2022" /collected_by="Nguyen Thi Nhien" gene 658 /gene="COX1" CDS 658 /gene="COX1" /codon_start=2 /transl_table=5 /product="cytochrome c oxidase subunit I" /protein_id="UUM18959" /translation="TLYFIFGAWAGMVGTSLSILIRAELGHPGALIGDDQIYNVIVTA HAFVMIFFMVMPIMIGGFGNWLVPLMLGAPDMAFPRMNNMSFWLLPPSLTLLLASSMV DAGAGTGWTVYPPLAAGIAHSGASVDLAIFSLHLAGISSILGAVNFITTVINMRSTGI 53 TFDRMPLFVWSVVITAVLLLLSLPVLAGAITMLLTDRNLNTSFFDPAGGGDPILYQHL F" ORIGIN tacattatat tttatctttg gagcctgagc tggcatagta ggaacttctt taagaatcct 61 tattcgagcc gaattaggac acccaggagc tttaattgga gatgaccaaa tttataacgt 121 aattgttact gcccatgctt ttgtaataat tttctttata gttataccaa ttataattgg 181 tggatttggt aattgacttg ttccactgat attaggagcc cctgatatag ctttcccacg 241 aataaataac ataagtttct ggctacttcc cccctctctc actcttttat tagcatcttc 301 tatagtagat gctggagcag gaaccggttg aactgtctac ccccccttag ccgctggtat 361 tgcccataga ggagcttcag ttgacctagc tattttttcc cttcatttag ccgggatttc 421 ttcaatttta ggggctgtaa attttattac tacagtaatc aatatacgat cgacaggaat 481 tacatttgac cgaatacctc tatttgtttg atcagtggta attacagcag tacttcttct 541 tctgtcactt cctgttcttg ccggagctat taccatatta ttaacagatc gaaatttaaa 601 tacttctttc ttcgacccag ccggaggggg tgacccaatt ctttatcagc atttattt // LOCUS OP164695 658 bp DNA linear INV 07-AUG-2022 DEFINITION Hermetia illucens isolate VieHCM cytochrome c oxidase subunit I (COX1) gene, partial cds; mitochondrial ACCESSION OP164695 VERSION OP164695 KEYWORDS SOURCE mitochondrion Hermetia illucens ORGANISM Hermetia illucens Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; Pterygota; Neoptera; Endopterygota; Diptera; Brachycera; Stratiomyomorpha; Stratiomyidae; Hermetiinae; Hermetia REFERENCE AUTHORS (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Molecular genogrouping of the Black soldier fly (Hermetia illucens) (Diptera: Stratiomyidae), samples collected from the environment and culture in Vietnam JOURNAL REFERENCE AUTHORS Unpublished (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (07-AUG-2022) Immunology, Institute of Biotechnology, 18 Hoang Quoc Viet Rd., Cau Giay dist., Hanoi, Vietnam, Hanoi 10000, Viet Nam COMMENT ##Assembly-Data-START## Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing 54 ##Assembly-Data-END## FEATURES Location/Qualifiers source 658 /organism="Hermetia illucens" /organelle="mitochondrion" /mol_type="genomic DNA" /isolate="VieHCM" /isolation_source="natural organic waste" /db_xref="taxon:343691" /dev_stage="adult" /country="Viet Nam: Ho Chi Minh" /collection_date="26-Mar-2022" /collected_by="Nguyen Thi Nhien" gene 658 /gene="COX1" CDS 658 /gene="COX1" /codon_start=2 /transl_table=5 /product="cytochrome c oxidase subunit I" /protein_id="UUM18961" /translation="TLYFIFGAWAGMVGTSLSILIRAELGHPGALIGDDQIYNVIVTA HAFVMIFFMVMPIMIGGFGNWLVPLMLGAPDMAFPRMNNMSFWLLPPSLTLLLASSMV DAGAGTGWTVYPPLAAGIAHSGASVDLAIFSLHLAGISSILGAVNFITTVINMRSTGI TFDRMPLFVWSVVITAVLLLLSLPVLAGAITMLLTDRNLNTSFFDPAGGGDPILYQHL F" ORIGIN tacattatat tttatctttg gagcctgagc tggcatagta ggaacttctt taagaatcct 61 tattcgagcc gaattaggac acccaggagc tttaattgga gatgaccaaa tttataacgt 121 aattgttact gcccatgctt ttgtaataat tttctttata gtaatgccaa ttataattgg 181 tggatttggt aattgacttg ttcccctgat attaggagcc cctgatatag ctttcccacg 241 aataaataac ataagtttct ggctacttcc cccctctctc actcttttat tagcatcttc 301 tatagtagat gctggagcag gaaccggttg aactgtctac ccccccttag ccgctggtat 361 tgcccataga ggagcttcag ttgacctagc tattttttcc cttcatttag ccgggatttc 421 ttcaatttta ggggctgtaa attttattac tacagtaatc aatatacgat cgacaggaat 481 tacatttgac cgaatacctc tatttgtttg atcagtggta attacagcag tacttcttct 541 tctgtcactt cctgttcttg ccggagctat taccatatta ttaacagatc gaaatttaaa 601 tacttctttc ttcgacccag ccggaggagg tgaccccatt ctttatcaac atttattt // LOCUS OP164696 658 bp DNA DEFINITION Hermetia illucens isolate VieCT1 cytochrome c oxidase subunit I (COX1) gene, partial cds; mitochondrial 55 linear INV 07-AUG-2022 ACCESSION OP164696 VERSION OP164696 KEYWORDS SOURCE mitochondrion Hermetia illucens ORGANISM Hermetia illucens Eukaryota; Metazoa; Ecdysozoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; Pterygota; Neoptera; Endopterygota; Diptera; Brachycera; Stratiomyomorpha; Stratiomyidae; Hermetiinae; Hermetia REFERENCE AUTHORS (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Molecular genogrouping of the Black soldier fly (Hermetia illucens) (Diptera: Stratiomyidae), samples collected from the environment and culture in Vietnam JOURNAL REFERENCE AUTHORS Unpublished (bases to 658) Nguyen,T.N., Pham,T.K.L., Nguyen,T.T.B., Minh,N.T., Vi,L.X and Le,T.H TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (07-AUG-2022) Immunology, Institute of Biotechnology, 18 Hoang Quoc Viet Rd., Cau Giay dist., Hanoi, Vietnam, Hanoi 10000, Viet Nam COMMENT ##Assembly-Data-START## Sequencing Technology :: Sanger dideoxy sequencing ##Assembly-Data-END## FEATURES source Location/Qualifiers 658 /organism="Hermetia illucens" /organelle="mitochondrion" /mol_type="genomic DNA" /isolate="VieCT1" /isolation_source="culture" /db_xref="taxon:343691" /dev_stage="adult" /country="Viet Nam: Can Tho (Thanh An)" /collection_date="24-Mar-2022" /collected_by="Nguyen Thi Nhien" gene 658 /gene="COX1" CDS 658 /gene="COX1" /codon_start=2 56 /transl_table=5 /product="cytochrome c oxidase subunit I" /protein_id="UUM18962" /translation="TLYFIFGAWAGMVGTSLSILIRAELGHPGALIGDDQIYNVIVTA HAFVMIFFMVMPIMIGGFGNWLVPLMLGAPDMAFPRMNNMSFWLLPPSLTLLLASSMV DAGAGTGWTVYPPLAAGIAHSGASVDLAIFSLHLAGISSILGAVNFITTVINMRSTGI TFDRMPLFVWSVVITAVLLLLSLPVLAGAITMLLTDRNLNTSFFDPAGGGDPILYQHL F" ORIGIN tacattatat tttatctttg gagcctgagc tggtatagta ggaacttctt taagaattct 61 tattcgagcc gaattaggcc acccaggagc tttaattgga gatgaccaaa tttataacgt 121 aattgttact gcccatgctt ttgtaataat tttctttata gttataccaa ttataattgg 181 tggatttggt aattgacttg ttcccctgat attaggagcc cctgatatag ctttcccacg 241 aataaataac ataagtttct ggctacttcc cccctctctc actcttttat tagcatcttc 301 tatagtagat gctggggcag gaaccggttg aactgtctac ccccccttag ccgctggtat 361 tgcccataga ggagcttcag ttgacctagc tattttttcc cttcatttag ccgggatttc 421 ttcaatttta ggggctgtaa attttattac tacagtaatc aatatacgat cgacaggaat 481 tacatttgac cgaatacctc tatttgtttg atcagtggta attacagcag tacttcttct 541 tctgtcactt cccgttcttg ccggagctat taccatatta ttaacagatc gaaatttaaa 601 tacttctttc ttcgacccag ccgggggagg tgaccccatt ctttatcaac atttattt // 57
Ngày đăng: 31/07/2023, 22:29
Xem thêm: