Luận án Tiến sĩ Theo dõi tải lượng HIV thường quy ở bệnh nhân điều trị thuốc kháng virút bậc một tại khu vực Miền Bắc Việt Nam

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƯƠNG -* - TRƯƠNG THÁI PHƯƠNG THEO DÕI TẢI LƯỢNG HIV THƯỜNG QUY Ở BỆNH NHÂN ĐIỀU TRỊ THUỐC KHÁNG VI RÚT BẬC MỘT TẠI KHU VỰC MIỀN BẮC VIỆT NAM Chuyên ngành: Vi sinh y học Mã số: 62 72 01 15 LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học 1: PGS TS Vũ Tường Vân 2: TS Phạm Hồng Thắng HÀ NỘI - 2021 LỜI CẢM ƠN Trong suốt trình thực đề tài nhận nhiều giúp đỡ Lãnh đạo quan, đơn vị, Thầy Cô, đồng nghiệp, bệnh nhân, bạn bè gia đình thân u Trước hết, tơi xin trân trọng bày tỏ lòng tri ân sâu sắc tới người thầy PGS TS Vũ Tường Vân TS Phạm Hồng Thắng, người thầy, người hướng dẫn khoa học, tận tình giúp đỡ, động viên tơi suốt q trình học tập, trực tiếp hướng dẫn tơi thực nghiên cứu, góp ý sửa chữa luận án Tôi xin bày tỏ lời cảm ơn tới GS TS Đặng Đức Anh Viện trưởng viện Vệ sinh Dịch tễ trung ương, PGS TS Lê Thị Quỳnh Mai, Phó viện trưởng Viện Vệ sinh Dịch tễ trung ương, Trưởng Bộ môn Vi sinh y học – Viện Vệ sinh Dịch tễ trung ương, tạo điều kiện thuận lợi cho tơi q trình thực đề tài hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn chân thành đến thầy cô, đồng nghiệp, người tạo điều kiện, giúp đỡ trình thực luận án: - Ban Lãnh đạo Viện, Phòng Đào tạo Sau Đại Học – viện Vệ sinh dịch tễ trung ương - PGS TS Nguyễn Quốc Anh, Giám đốc Bệnh viện Bạch Mai - Tổ chức HAIVN hỗ trợ tơi hồn thành luận án - Phòng SHPT khoa Vi sinh bạn đồng nghiệp khoa Vi sinh bệnh viện Bạch Mai ủng hộ hỗ trợ tơi q trình học tập nghiên cứu - PGS TS Đỗ Duy Cường, Giám đốc Trung tâm bệnh nhiệt đới – bệnh viện Bạch Mai toàn thể cán nghiên cứu viên Trung tâm, thầy cô bạn đồng nghiệp Xin gửi lời cảm ơn đến bệnh nhân gia đình họ giúp tơi có số liệu luận án Xin cảm ơn bạn bè, đồng nghiệp giúp đỡ tơi q trình học tập, nghiên cứu thực luận án Cuối cùng, xin gửi lời thương mến yêu thương chân thành tới gia đình, chỗ dựa vững để yên tâm học tập hoàn thành luận án Hà Nội, tháng 01 năm 2020 LỜI CAM ĐOAN Tôi Trương Thái Phương, nghiên cứu sinh khóa 35 Viện Vệ sinh Dịch tễ trung ương, chuyên ngành Vi Sinh Y Học, xin cam đoan: Đây luận án thân trực tiếp thực hướng dẫn PGS TS Vũ Tường Vân TS Phạm Hồng Thắng Các số liệu thơng tin nghiên cứu hồn tồn xác, trung thực khách quan, xác nhận chấp thuận sở nơi nghiên cứu Tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm trước pháp luật cam kết Hà Nội, ngày 06 tháng 01 năm 2020 Người viết cam đoan Trương Thái Phương MỤC LỤC ĐẶT VẤN ĐỀ Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 ĐẠI CƯƠNG VỀ HIV/AIDS 1.1.1 Human Immunodeficiency Virus 1.1.2 Sự nhân lên vi rút 11 1.2 Dịch tễ học nhiễm HIV/AIDS 14 1.2.1 Tình hình nhiễm HIV/AIDS giới 14 1.2.2 Tình hình nhiễm HIV/AIDS Việt Nam 17 1.3 Tình hình điều trị ARV Việt Nam 22 1.4 Xét nghiệm chẩn đoán nhiễm HIV Việt Nam 23 1.4.1 Mục đích xét nghiệm 23 1.4.2 Nguyên tắc xét nghiệm Error! Bookmark not defined 1.4.3 Các chiến lược xét nghiệm Error! Bookmark not defined 1.4.4 Thực xét nghiệm chẩn đoán nhiễm HIV 24 1.5 Xét nghiệm theo dõi điều trị HIV/AIDS 29 1.5.1 Xét nghiệm đo tải lượng HIV 29 1.5.2 Xét nghiệm HIV kháng thuốc ARV 31 1.5.3 Xét nghiệm đếm tế bào lympho T-CD4 36 1.6 THEO DÕI ĐIỀU TRỊ HIV/AIDS 39 1.6.1 Theo dõi lâm sàng 39 1.6.2 Theo dõi số lượng tế bào CD4 40 1.6.3 Theo dõi tải lượng HIV 41 1.7 HIV KHÁNG THUỐC 44 Chương 2: ĐỐI TƯỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 48 2.1 Đối tượng nghiên cứu 48 2.2 Phương pháp nghiên cứu 49 2.2.1 Cỡ mẫu 49 2.2.2 Thiết kế nghiên cứu 49 2.2.3 Địa điểm thời gian nghiên cứu 50 2.2.4 Phân tích số liệu 50 2.3 Thực kỹ thuật xét nghiệm nghiên cứu 53 2.3.1 Cách lấy mẫu bảo quản mẫu xét nghiệm đo tải lượng vi rút, xét nghiệm DBS-PBS, lưu mẫu xét nghiệm gen kháng thuốc, xét nghiệm sinh hóa, huyết học 53 2.3.2 Sinh phẩm hoá chất, kỹ thuật thiết bị thực 54 2.3.3 Các bước tiến hành nội dung nghiên cứu theo sơ đồ tiến trình 54 2.3.4 Các xét nghiệm 55 2.3.5 Kỹ thuật sử dụng nghiên cứu 55 2.4 Y Đức 59 Chương 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 60 3.1 Đặc điểm bệnh nhân thời điểm chọn vào nghiên cứu 60 3.1.1 Đặc điểm tuổi, giới tình trạng nhân bệnh nhân 60 3.1.2 Đặc điểm đường lây truyền nhiễm HIV 61 3.1.3 Đặc điểm lâm sàng, xét nghiệm huyết học, hoá sinh, nhiễm trùng hội điều trị bệnh nhân thời điểm trước bắt đầu điều trị ARV phác đồ bậc 62 3.2 Kết theo dõi điều trị bệnh nhân 67 3.2.1 Xét nghiệm đếm tế bào lympho T-CD4, đo tải lượng HIV 67 3.2.2 Xét nghiệm tải lượng vi rút 69 3.2.3 Tiến triển giai đoạn lâm sàng tuân thủ điều trị bệnh nhân 74 3.3 So sánh TLVR huyết tương DBS-PBS 80 3.4 Đặc điểm kháng thuốc gen kháng thuốc 84 3.5 Một số yếu tố liên quan đến kết theo dõi điều trị ức chế TLVR bệnh nhân 87 Chương 4: BÀN LUẬN 91 4.1 Đặc điểm nhân học nhóm bệnh nhân nhiễm HIV nghiên cứu 91 4.1.1 Tuổi giới tính 91 4.1.2 Tình trạng nhân việc làm 92 4.2 Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng trước điều trị ARV 93 4.2.1 Đặc điểm lâm sàng 93 4.2.2 Đặc điểm cận lâm sàng 94 4.2.3 Vai trò xét nghiệm CD4 thời điểm trước điều trị 95 4.3 Xét ngiệm TLVR kỹ thuật xét nghiệm tải lượng HIV từ mẫu DBS 97 4.4 Kết theo dõi điều trị yếu tố liên quan 103 4.4.1 Theo dõi tải lượng vi rút thường quy 103 4.4.2 Các yếu tố liên quan đến ức chế tải lượng vi rút 107 4.5 Gen kháng thuốc 109 4.5.1 Tỉ lệ kháng thuốc 109 4.5.2 Gen đột biến kháng thuốc 115 4.6 Hạn chế đề tài 116 KẾT LUẬN 118 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Tình hình nhiễm HIV giới, 2018 15 Bảng 2.1 Danh sách đột biến đề kháng thuốc ARV nhóm NRTI, NNRTI PI 57 Bảng 3.1 Đặc điểm nhân học 60 Bảng 3.2 Đặc điểm nghề nghiệp trình độ học vấn 61 Bảng 3.3 Đặc điểm lâm sàng thời điểm trước bắt đầu điều trị ARV phác đồ bậc 62 Bảng 3.4 Một số đặc điểm điều trị HIV bệnh nhân 64 Bảng 3.5 Đặc điểm xét nghiệm CD4 xét nghiệm TLVR 64 Bảng 3.6 Một số đặc điểm tiền sử nghiện chất (thuốc lá, rượu/bia) bệnh nhân 65 Bảng 3.7 Đặc điểm xét nghiệm máu bệnh nhân 66 Bảng 3.8 Đặc điểm số xét nghiệm huyết học viêm gan, men gan 66 Bảng 3.9 Tỷ lệ phân bố bệnh nhân có CD4