ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM NGUYỄN HOÀI LINH TÊN ĐỀ TÀI KHẢO SÁT TÌNH HÌNH NHIỄM MỘT SỐ VIRUS GÂY BỆNH THƯỜNG GẶP TẠI BỆNH VIỆN TRUNG ƯƠNG THÁI NGUYÊN KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC Hệ đ[.]
ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM NGUYỄN HỒI LINH TÊN ĐỀ TÀI: KHẢO SÁT TÌNH HÌNH NHIỄM MỘT SỐ VIRUS GÂY BỆNH THƯỜNG GẶP TẠI BỆNH VIỆN TRUNG ƯƠNG THÁI NGUYÊN KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC Hệ đào tạo : Chính quy Ngành : Cơng nghệ sinh học Khoa : CNSH - CNTP Khóa học : 2016-2020 THÁI NGUYÊN, NĂM 2020 ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC NƠNG LÂM NGUYỄN HỒI LINH TÊN ĐỀ TÀI: KHẢO SÁT TÌNH HÌNH NHIỄM MỘT SỐ VIRUS GÂY BỆNH THƯỜNG GẶP TẠI BỆNH VIỆN TRUNG ƯƠNG THÁI NGUYÊN KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC Hệ đào tạo : Chính quy Ngành : Công nghệ sinh học Lớp : K48 – CNSH Khoa : CNSH - CNTP Khóa học : 2016-2020 Họ tên người hướng dẫn : TS Nguyễn Văn Duy 2.Th.S BS Lương Thị Hồng Nhung THÁI NGUYÊN, NĂM 2020 i LỜI CẢM ƠN Qua trình học tập rèn luyện Trường Đại học Nông Lâm – Đại học Thái Nguyên, đồng ý Ban Giám hiệu, Ban Chủ nhiệm khoa Công nghệ Sinh học Công nghệ Thực phẩm em phân công đến thực tập Khoa Vi sinh - Bệnh viện TW Thái Nguyên với đề tài: “Khảo sát tình hình nhiễm số virus gây bệnh thường gặp Bệnh viện Trung ương Thái Nguyên” Em xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành tới Th.S BS Lương Thị Hồng Nhung toàn thể anh, chị kỹ thuật viên làm việc Khoa Vi sinh - Bệnh viện Trung Ương Thái Ngun ln tận tình hướng dẫn, tạo điều kiện giúp đỡ em trình thực tập Em xin trân trọng gửi lời cảm ơn tới TS Nguyễn Văn Duy - Giảng viên Khoa Công nghệ sinh học Công nghệ thực phẩm giúp đỡ tạo điều kiện tốt cho em suốt trình thực đề tài Đồng thời, em xin chân thành cảm ơn Thầy/Cô Khoa Công nghệ Sinh học Công nghệ Thực phẩm - Trường Đại học Nông Lâm Thái Nguyên dạy dỗ, truyền đạt kiến thức kinh nghiệm nghiên cứu khoa học suốt thời gian học tập Với điều kiện thời gian có hạn kinh nghiệm kiến thức hạn chế nên đề tài em khơng tránh khỏi thiếu sót Em mong nhận đươc bảo, đóng góp ý kiến quý Thầy/Cơ để em có điều kiện bổ sung, nâng cao kiến thức phục vụ cho việc học tập, công việc sau Em xin chân thành cảm ơn! Thái Nguyên, ngày tháng năm 2020 Sinh viên Nguyễn Hoài Linh ii DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 4.1 Kết xét nghiệm virus viêm gan bệnh nhân điều trị bệnh viện Trung Ương Thái Nguyên phương pháp test nhanh 32 Bảng 4.2.Tổng hợp tỷ lệ bệnh nhân nhiễm virus viêm gan theo nhóm tuổi phương pháp test nhanh 34 Bảng 4.3: Tổng hợp tỷ lệ bệnh nhân nhiễm virus HIV phương pháp test nhanh 36 Bảng 4.4.Tổng hợp tỷ lệ bệnh nhân nhiễm virus HIV theo nhóm tuổi phương pháp test nhanh 37 Bảng 4.5.Tổng hợp tỷ lệ bệnh nhân nhiễm virus cúm A phương pháp test nhanh 39 Bảng 4.6: Tổng hợp tỷ lệ bệnh nhân nhiễm virus cúm A theo nhóm tuổi 40 Bảng 4.7 Tổng hợp tỷ lệ bệnh nhân nhiễm virus cúm B theo nhóm tuổi phương pháp test nhanh 41 Bảng 4.8: Tổng hợp tỷ lệ bệnh nhân nhiễm virus cúm B theo nhóm tuổi 42 iii DANH MỤC CÁC TỪ, CỤM TỪ VIẾT TẮT AIDS Acquired Immunodeficiency Syndrome (hội chứng suy giảm miễn dịch mắc phải) HCV Hepatitis C Virus (virus gây viêm gan C) HBV Hepatitis B Virus (virus gây viêm gan B) HIV Human Immunodeficiency virus (virus gây suy giảm miễn dịch người) SARS Severe acute respiratory syndrome (Hội chứng hô hấp cấp tính nặng) WHO World Health Organization- Tổ chức Y tế Thế giới MERS Middle East Respiratory Syndrome (Hội chứng Hô hấp cấp Trung Đông) DNA Deoxyribonucleic acid, loại vật chất mang thông tin di truyền RNA Ribonucleic acid, loại vật chất mang thông tin di truyền SARS-CoV-2 Severe acute respiratory syndrome corona virus (Virus corona gây hội chứng hơ hấp cấp tính nặng 2) CDC Centers for Disease Control and Prevention (Trung tâm kiểm sốt phịng ngừa dịch bệnh Hoa Kỳ ) Cs Cộng iv MỤC LỤC LỜI CẢM ƠN i DANH MỤC CÁC BẢNG ii DANH MỤC CÁC TỪ, CỤM TỪ VIẾT TẮT iii MỤC LỤC iv Phần MỞ ĐẦU 1.1 Đặt vấn đề 1.2 Mục tiêu, yêu cầu đề tài 1.2.1.Mục tiêu đề tài 1.2.2 Yêu cầu đề tài 1.3 Ý nghĩa đề tài 1.3.1 Ý nghĩa khoa học đề tài 1.3.2 Ý nghĩa thực tiễn đề tài Phần TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Tổng quan chung đối tượng nghiên cứu 2.1.1 Khái niệm virus 2.1.2 Lịch sử nguồn gốc 2.1.3 Đặc điểm 2.1.4 Cấu trúc 2.1.5 Chu trình nhân lên 2.2 Tổng quan virus 10 2.2.1 Tổng quan virus cúm 10 2.2.2 Tổng quan virus HIV 14 2.2.3 Tổng quan virus viêm gan C 17 2.2.4 Tổng quan virus HBV 20 v Phần ĐỐI TƯỢNG, NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 25 3.1 Đối tượng nghiên cứu phạm vi nghiên cứu 25 3.1.1 Đối tượng nghiên cứu 25 3.1.2 Phạm vi nghiên cứu 25 3.2 Nội dung nghiên cứu 25 3.3 Phương pháp nghiên cứu 25 3.3.1 Phương pháp nghiên cứu nội dung 25 3.3.2 Phương pháp nghiên cứu nội dung 27 3.3.3 Phương pháp nghiêm cứu nội dung 29 3.4 Các phương pháp xử lý số liệu 30 Phần 4: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN 32 4.1 Kết khảo sát tình hình nhiễm virus viêm gan B viêm gan C bệnh nhân điều trị Bệnh viện Trung Ương Thái Nguyên 32 4.2 Khảo sát tình hình nhiễm virus HIV bệnh nhân điều trị Bệnh viện Trung Ương Thái Nguyên 35 4.3 Khảo sát tình hình nhiễm virus Cúm A Cúm B bệnh nhân điều trị Bệnh viện Trung Ương Thái Nguyên 38 4.3.1 Kết tình hình nhiễm virus cúm A phương pháp test nhanh 38 4.3.2 Kết tình hình nhiễm virus cúm B phương pháp test nhanh 41 Phần 5: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 44 5.1 KẾT LUẬN 44 5.2 KIẾN NGHỊ 44 TÀI LIỆU THAM KHẢO 45 Phần MỞ ĐẦU 1.1 Đặt vấn đề Virus tác nhân gây bệnh phổ biến người với vi khuẩn nấm nhóm tác nhân vi sinh vật[7] Càng ngày, người ta ngày phát nhiều loại bệnh virus nguy hiểm AIDS, SARS, viêm não Nhật Bản, dại, quai bị, sốt Ebola, sởi… Tùy loại virus mà có cách lây nhiễm gây tác hại khác (ví dụ lây qua đường tình dục: AIDS, viêm gan B; lây qua đường hô hấp: Cúm A, cúm B, SARS,…) Thế giới phải đối mặt với đại dịch lớn virus gây có sức lây lan khủng khiếp, với số tử vong lên đến hàng triệu người đợt dịch (dịch MERS năm 2012: tính đến ngày 7/6/2012 có 1.179 người nhiễm 442 người tử vong[24]; dịch Ebola năm 2014 WHO xác nhận gần 7.000 trường hợp tử vong virus này[23]; cúm H1N1 năm 2009, lan nhanh 214 quốc gia khiến 18.0000 người thiệt mạng tổng số 575.000 ca nhiễm bệnh[7]; dịch SARS năm 2002 phát trường hợp Hồng Kơng sau dịch lây lan sang 37 quốc gia thông qua đường hàng không, khoảng 8000 ca nhiễm 800 ca tử vong; đại dịch HIV/AIDS khiến 1,5 triệu người tử vong số 35 triệu người nhiễm bệnh Đặc biệt, chủng virus SARS-CoV-2 (COVID- 19) gây hội chứng hơ hấp cấp tính bùng phát vào tháng 12 năm 2019 thành phố Vũ Hán bắt đầu lây lan nhanh chóng sau đó, đại dịch tồn cầu, theo WHO tính đến 12:54PM ngày 21 tháng năm 2020 có 8.708.008 trường hợp xác nhận nhiễm COVID-19, 461.715 trường hợp tử vong toàn cầu[26] Đặc điểm chung bệnh virus kí sinh gây người lây lan nhanh, dễ bùng phát thời gian ngắn, biểu biện bệnh không rõ ràng thời kì đầu, số có khả biến chủng lớn, gây chết thời gian ngắn gây nhiều khó khăn chẩn đốn điều trị kiểm soát dịch tễ học[7] Mặc dù virus gây bệnh cho người động vật nghiên cứu kỹ chưa có phương pháp điều trị hiệu AIDS, SARS, cúm A[5]; phương pháp điều trị chủ yếu biện pháp hỗ trợ đề kháng của thể chống lại virus gây bệnh ngày có nhiều loại virus nguy hiểm xuất Do vậy, việc chẩn đốn xác nguyên nhân gây bệnh thời gian ngắn, hiểu biết tình hình dịch tễ học từ đề xuất biện pháp điều trị, phòng chống bệnh virus gây quan trọng nhằm bảo đảm điều trị trúng đích cải thiện tử vong bệnh nhân Xuất phát từ thực tiễn đó, chúng tơi thực đề tài: “Khảo sát tình hình nhiễm số virus gây bệnh thường gặp Bệnh viện Trung Ương Thái Nguyên” 1.2 Mục tiêu, yêu cầu đề tài 1.2.1.Mục tiêu đề tài Nghiên cứu nhằm khảo sát tình hình nhiễm số virus gây bệnh thường gặp bệnh nhân Bệnh viện Trung Ương Thái Nguyên 1.2.2 Yêu cầu đề tài Thu mẫu bệnh phẩm bệnh nhân chẩn đoán mắc bệnh virus thường gặp (virus cúm A, cúm B, HCV, HBV HIV) từ khoa chuyên môn Bệnh viện viện Trung Ương Thái Nguyên - Xác định virus gây bệnh từ mẫu bệnh phẩm phương pháp test nhanh - Khảo sát tình hình tình hình nhiễm virus bệnh nhân 1.3 Ý nghĩa đề tài 1.3.1 Ý nghĩa khoa học đề tài - Kết đề tài tài liệu tham khảo cho nghiên cứu virus gây bệnh thường gặp bệnh nhân biện pháp điều trị, phòng chống bệnh hiêu 1.3.2 Ý nghĩa thực tiễn đề tài - Kết đề tài góp phần vào q trình chẩn đốn bệnh virus thường gặp gây ra, cung cấp thông tin cần thiết dịch tễ học góp phần hỗ bác sĩ lựa chọn phương pháp thuốc phù hợp để điều trị đạt hiệu tối ưu cho bệnh virus 3 Phần TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Tổng quan chung đối tượng nghiên cứu 2.1.1 Khái niệm virus Virus tác nhân sinh học khơng có cấu tạo tế bào mang nucleic acid, chi nhân lên tế bào chủ sử dụng máy trao đổi chất ribosome tế bào để tổng hợp nên phận cấu thành sau lắp ráp phận tạo thành hạt virus gọi virion mang gene virus nhiễm vào tế bào chủ khác [7] Virus lây nhiễm tất dạng sống, từ động vật thực vật đến vi sinh vật, bao gồm vi khuẩn vi khuẩn cổ Virus tìm thấy hầu hết hệ sinh thái Trái đất loại thực thể sinh học nhiều [7] Khoảng 5.000 loại virus mô tả cách chi tiết hàng triệu loại virus tồn Trái đât [7] Khi không tồn tế bào bị lây nhiễm trình lây nhiễm tế bào, virus tồn dạng hạt độc lập virion bao gồm: vật liệu di truyền (DNA RNA mã hóa cấu trúc protein; protein áo, capsid bao quanh bảo vệ vật liệu di truyền, số trường hợp có vỏ ngồi lipid) Hình dạng virus đa dạng (xoắn ốc, chữ nhật đơn giản, hình khối, lập phương,… Hầu hết loại virus không quan sát kinh hiển vi quang học, kích thước khoảng phần tram so với hầu hết vi khuẩn [7] 2.1.2 Lịch sử nguồn gốc Virus tìm thấy nơi có sống có lẽ tồn kể từ tế bào sống phát triển Nguồn gốc virus không rõ ràng chúng khơng tạo thành hóa thạch, kĩ thuật phân tử sử dụng để sánh DNA RNA virus phương tiện hữu ích để điều tra cách chúng phát sinh Ngồi vật liệu di truyền virus đơi tích hợp vào dịng mầm sinh vật chủ, nhờ chúng truyền theo chiều dọc cho vật chủ nhiều hệ Các giả thiết nguồn gốc virus: Giả thuyết hồi quy: virus tế bào nhỏ kí sinh tế bào lớn Theo thời gian gene không yêu cầu kí sinh trùng chúng biến Đây gọi giả thuyết thối hóa giả thuyết giảm Giả thuyết nguồn gốc tế bào: số virus tiến hóa từ DNA RNA “thoát” khỏi gene vi sinh vật lớn DNA đến từ plasmid transpose tế bào Giả thuyết đồng tiến hóa: giả thuyết virus cho virus tiến hóa từ phân tử phức tạp protein axit nucleic lức với tế bào xuất lần đầu Trái Đất phụ thuộc vào sống tế bào hàng tỉ năm Viroid phân tử RNA không phân loại virus chúng thiếu lớp vỏ protein Chúng có đặc điểm chung cho số loại virus thường gọi tác nhân phụ Viroid mầm bệnh quan trọng thực vật Chúng khơng mã hóa protein tương tác với tế bào chủ dụng máy tế bào chủ để chép 2.1.3 Đặc điểm Đặc điểm chung virus [7]: - Virus nhỏ bé, kích thước khoảng 20nm đến 200nm (nhỏ vi khuẩn hàng ngàn lần) - Khơng có cấu tạo tế bào, khơng có màng kép lipid bao bọc - Có đời sống kí sinh bắt buộc - Vật chất di truyền hai loại: DNA RNA mà khơng có hai - Khơng có hệ giải mã dịch mã - Khơng tăng kích thước - Khơng tự di chuyển - Khơng có khả tự phát triển phân chia - Không bất hoạt hoàn toàn vật chủ 2.1.4 Cấu trúc Virus có cấu trúc đơn giản, khơng có cấu tạo tế bào, gồm axit nucleic bao bọc lớp vỏ protein bảo vệ gọi capsid Lớp vỏ tạo thành từ tiểu đơn vị protein giống hệt gọi capsome Một số virus có vỏ bọc lipid có xuất xứ từ màng tế bào vật chủ Vỏ capsid cấu tạo từ protein dịch mã từ gene virus sở để phân biệt mặt hình thái học Các tiểu đơn vị protein virus mã hóa tự láp ráp để tạo nên vỏ capsid.Những virus phức tạp cịn mã hóa protein trợ giúp cho trình xây dựng capsid chúng Những protein kết hợp với axit nucleic gọi nucleoprotein, kết hợp củ protein capsid với axit nucleic gọi nucleocapsid Nhìn chung, có loại hình thái virus: - Xoắn ốc: Những virus tạo thành từ loại capsomer xếp chồng lên quanh trục trung tâm để tạo nên cấu trúc xoắn ốc, có khoang trung tâm ống rỗng.Virion dạng hình que hay sợi, chúng ngắn cứng, dài linh hoạt Vật liệu di truyền nhìn chung RNA sợi đơn (ssRNA) DNA sợi đơn (ssDNA), gắn chặt với chuỗi xoắn protein Nói chung, độ dài vỏ capsid xoắn ốc có liên quan tới độ dài axít nucleic bên đường kính phụ thuộc vào kích thước cách xếp capsomer Virus khảm thuốc ví dụ virus dạng xoắn ốc - Khối hai mươi mặt đều: Hầu hết virus động vật có dạng khối hai mươi mặt gần hình cầu với hai mươi mặt đối xứng Một khối hai mươi mặt bình thường cách tối ưu để tạo nên vỏ khép kín từ tiểu đơn vị giống y Tối thiểu có 12 capsomer cấu tạo từ tiểu phần giống hệt Nhiều virus, ví dụ rotavirus, có nhiều 12 capsomer xuất dạng hình cầu giữ tính đối xứng Capsomer đỉnh bao quanh capsomer khác gọi penton Capsomer mặt hình tam giác bao quanh gọi hexon Hexon chất thường phẳng penton, cấu trúc tạo nên 12 đỉnh, lại thường cong Cùng protein tiểu đơn vị penton hexon, chúng cấu tạo protein khác - Kéo dài: Có cấu trúc khối hai mươi mặt kéo dài gấp năm lần theo chiều dài trục; cách xếp phổ biến đầu bacteriophage Nó tạo thành hình trụ với nắp đậy hai đầu - Phức tạp: Những virus có capsid mà khơng hồn tồn xoắn hay hồn tồn khối hai mươi mặt đều, mang cấu trúc thêm vào đuôi - protein vách ngăn phức hợp Một số bacteriophages, Enterobacteria phage T4, có cấu trúc phức tạp bao gồm đầu hình khối hai mươi mặt gắn với xoắn; có đĩa lục giác với sợi đuôi protein nhô Cấu trúc đóng vai trị ống tiêm phân tử, giúp gắn vào vi khuẩn vật chủ sau bơm gen virus vào bên tế bào Vỏ bọc: Một vài loài virus bao phủ thân chúng lớp vỏ bọc:có thể lớp màng bao quanh tế bào vật chủ bị nhiễm, màng màng nhân hay mạng lưới nội chất, tạo lớp lipid kép bao gọi vỏ bọc virus (viral envelope) Màng đính vào protein mã hóa gen virus gen vật chủ; ra, tất màng lipid carbohydrate có nguồn gốc từ vật chủ (Virus cúm HIV) Hầu hết virus có màng phụ thuộc vào lớp vỏ chúng để xâm nhiễm vào vật chủ Ngồi ra, số virus có hình thái bất thường như: Poxvirus: Bộ gen gắn với protein bên cấu trúc đĩa trung tâm gọi nucleoid Nucleoid bao quanh lớp màng hai quan hai bên mà không rõ chức Virus có vỏ bọc ngồi với lớp protein dày đính bề mặt vỏ bọc Mimivirus virus lớn thường biết, đường kính vỏ capsid 400 nm Các sợi protein nhơ lên khỏi bề mặt với chiều dài lên tới 100 nm Vỏ capsid có dạng đa giác kính hiển vi điện tử, virus dạng khối hai mươi mặt Năm 2011, nhà nghiên cứu khám phá virus lớn đáy đại dương gần bờ biển Las Cruces, Chile Nó tạm đặt tên Megavirus chilensis, nhìn thấy kính hiển vi quang học Một vài loại virus vi khuẩn cổ có cấu trúc phức tạp mà không liên quan tới dạng virus khác, với hình dạng bất thường đa dạng, từ cấu trúc hình suốt, hình que có móc, hình giọt nước, hay chí hình chai Những virus vi khuẩn cổ giống khác tương tự với bacteriophage có đi, có nhiều dạng cấu trúc đuôi khác 7 Lõi virus Cấu trúc gene virus đa dạng Có tới hàng triệu loại virus khác nhau, có khoảng 5.000 số mơ tả chi tiết Một virus có gen DNA hay RNA gọi tương ứng virus DNA virus RNA Phần lớn virus có gen RNA Virus thực vật có xu hướng có gen RNA sợi đơn bacteriophage thường có gen DNA sợi đơi Bộ gen virus có dạng mạch vòng, polyomevirus, hay mạch thẳng, adenovirus Loại axít nucleic khơng liên quan tới hình dạng gen Ở virus RNA hay số virus DNA, gen thường phân làm phần riêng biệt, gọi bị phân đoạn Với virus RNA, phân đoạn thường mã hóa cho protein chúng thường tìm thấy với capsid Tuy nhiên, tất phân đoạn không bắt buộc phải virion virus để xâm nhiễm, minh chứng virus khảm brôm vài loại virus thực vật khác Với hầu hết virus có gen RNA số với gen DNA sợi đơn, sợi đơn lẻ cho có tính dương (+) tính âm RNA dương tính tức chiều với mRNA có phần dịch mã trực tiếp tế bào vật chủ RNA âm tính bổ sung với mRNA phải chuyển thành RNA dương tính enzym RNA polymerase phụ thuộc RNA trước dịch mã Danh pháp DNA với virus gen ssDNA đơn tính tương tự danh pháp RNA, sợi mã hóa cho mRNA virus bổ sung với (-) sợi khơng mã hóa (+).Tuy nhiên, vài loại virus ssDNA ssRNA có gen lưỡng tính phiên mã dịch mã xảy hai loại sợi trung gian chép dạng sợi đơi Ví dụ geminivirus, virus thực vật có gen ssDNA, arenavirus, virus động vật có gen ssRNA Kích thước gen khác biệt lớn lồi khoảng 2000-1,2 triệu cặp bazo Nói chung, virus RNA có gen nhỏ virus DNA có tỷ lệ lỗi cao chép, có giới hạn kích thước tối đa Khi vượt qua giới hạn này, lỗi gen chép làm cho virus trở nên vơ dụng khơng có tính cạnh tranh Để khắc phục điều này, virus RNA thường có gen phân đoạn – chia gen thành phân tử nhỏ – để làm giảm xác suất mà lỗi gen đơn phần làm khả toàn bộ gen Trái ngược lại, virus DNA thường có gen lớn độ xác cao enzym chép chúng Tuy nhiên virus DNA sợi đơn ngoại lệ quy luật này, tỷ lệ đột biến gen loại đạt đến mức cực đại trường hợp virus RNA sợi đơn 2.1.5 Chu trình nhân lên [7] Virus sử dụng máy hệ trao đổi chất tế bào vật chủ để tạo nhiều chúng tự lắp ráp bên Chu trình sống virus có khác lớn lồi, nhìn chung có giai đoạn chu trình sống virus sau: Hấp phụ: Đây giai đoạn liên kết đặc hiệu protein vỏ capsid virus với thụ thể đặc hiệu bề mặt tế bào vật chủ Tính đặc hiệu giúp xác định biên độ vật chủ virus Ví dụ HIV xâm nhiễm vào phạm vi giới hạn tế bào bạch cầu người Điều protein gp120 bề mặt virus tương tác đặc hiệu với phân tử CD4 – thụ thể chemokine thường tìm thấy nhiều bề mặt tế bào T CD4+ Cơ chế tiến hóa để giúp virus lây nhiễm tế bào mà chúng có khả nhân lên Sự hấp phụ thụ thể tạo thay đổi protein vỏ bọc virus, dẫn đến hợp lớp lipid kép màng tế bào màng virus, tạo biến đổi protein bề mặt virus phép virus vào bên Xâm nhập sau hấp phụ: Virion vào tế bào vật chủ nhờ nhập bào qua trung gian thụ thể hợp màng Sự xâm nhiễm virus lên tế bào thực vật nấm khác biệt với xâm nhiễm lên tế bào động vật Thực vật có thành tế bào cellulose rắn chắc, nấm có thành tế bào từ chitin, hầu hết virus vào tế bào sau tổn thương lên thành tế bào Tuy nhiên, gần tất virus lại di chuyển trực tiếp từ tế bào qua tế bào khác thông qua lỗ gọi sợi liên bào (plasmodesma) Vi khuẩn, giống với thực vật, có thành tế bào vững mà virus buộc phải chọc thủng để xâm nhiễm vào tế bào Tuy nhiên, thành tế bào vi khuẩn dày nhiều so với thành tế bào thực vật nên số virus phát triển chế giúp bơm gen chúng vào tế bào vi khuẩn xuyên qua thành tế bào, vỏ capsid cịn bên ngồi Loại bỏ lớp vỏ: lớp vỏ capsid virus bị tan rã enzyme virus tế bào chủ hay phân ly đơn giản dẫn đến giải phóng axít nucleic gen virus Nhân lên: Sự nhân lên virus chủ yếu liên quan đến nhân lên gen virus Quá trình nhân lên bao gồm tổng hợp RNA thông tin (mRNA) virus từ gen "sớm", tổng hợp protein, việc lắp ráp protein có, sau chép gen virus quy hoạch biểu protein "sớm" protein điều hịa Việc kéo theo nhiều chu kỳ tổng hợp mRNA - virus phức tạp có gen lớn - tạo biểu gen "muộn" protein virion protein cấu trúc Biến đổi protein sau lắp ráp: Sau tự lắp ráp cấu trúc quy định để tạo nên phần tử virus, thường xảy số thay đổi protein Ở virus HIV, thay đổi diễn sau virus giải phóng khỏi tế bào chủ Phóng thích: Virus giải phóng khỏi tế bào vật chủ nhờ tiêu bào Đây trình tiêu diệt tế bào cách phá tan màng tế bào (và thành tế bào có) vật chủ Sự phóng thích nhờ tiêu bào đặc tính nhiều virus động vật vi khuẩn Một số virus trải qua chu trình tiềm tan, mà gen virus kết hợp tái tổ hơp di truyền vào vị trí cụ thể chromosome vật chủ Bộ gen virus lúc gọi "provirus", trường hợp bacteriophages "prophage" Bất vật chủ phân chia, gen virus nhân lên Bộ gen phần lớn thời gian không hoạt động bên vật chủ, nhiên, vào thời điểm đó, provirus hay prophage làm hoạt hóa virus, điều làm tan tế bào vật chủ Những virus có vỏ bọc (ví dụ HIV) có đặc trưng giải phóng khỏi tế bào chủ nhờ "nảy chồi" Trong trình này, virus nhận vỏ bọc 10 chúng, phần nhỏ qua chỉnh sửa tế bào chất màng bên khác tế bào vật chủ 2.1.6 Bệnh virus người Virus tác nhân gây nhiều loại bệnh người Từ bệnh thông thường cảm lạnh, cúm mùa, thủy đậu, mụn rộp… đến bệnh nghiêm trọng sốt Ebola, AIDS, cúm gia cầm, SARS… Các virus có chế gây bệnh khác sinh vật, phụ thuộc phần lớn vào loài virus Cơ chế cấp độ tế bào chủ yếu tiêu bào dẫn đến chết tế bào sau Ở sinh vật đa bào, có đủ số lượng tế bào chết, toàn thể bắt đầu chịu tác động Mặc dù virus gây nên gián đoạn cân nội môi gây nên bệnh tật, chúng tồn cách vơ hại bên thể Ví dụ virus herpes, nguyên nhân gây bệnh rộp môi, virus Epstein-Barr, gây bệnh sốt tuyến, virus varicella zoster, loại gây thủy đậu zona trì trạng thái bất hoạt bên thể người Đây gọi trạng thái tiềm ẩn (latency) Những virus tiềm ẩn đơi có lợi, có mặt virus làm gia tăng miễn dịch chống lại mầm bệnh vi khuẩn, ví dụ Yersinia pestis Một số loại virus gây nhiễm bệnh mãn tính suốt đời, mà virus tiếp tục nhân lên thể có chế phịng ngự vật chủ Điều phổ biến với bệnh virus viêm gan B viêm gan C Những người bị nhiễm bệnh mãn tính gọi người mang (carrier), họ đóng vai trị nguồn dự trữ loại virus xâm nhiễm Ở quần thể có tỷ lệ người mang cao, bệnh coi có tính địa phương 2.2 Tổng quan virus 2.2.1 Tổng quan virus cúm Bệnh cúm gặp khắp nơi giới, xảy thành dịch theo mùa năm, năm bệnh gây chết cho hàng trăm ngàn người, vụ đại dịch lớn số tử vong lên đến hàng triệu người toàn cầu Trong kỷ 20, virus cúm gây nên vụ đại dịch cúm lớn toàn cầu cướp sinh mạng hàng chục triệu người [27] Theo ước tính Trung tâm Kiểm sốt Phịng ngừa dịch bệnh Hoa Kỳ (US-CDC), Tổ chức Y tế Thế giới đối tác y tế tồn cầu, có tới 11 650 000 ca tử vong hàng năm liên quan đến bệnh hô hấp cúm theo mùa [27].Các đại dịch cúm lớn người gồm: - Đại dịch cúm Tây Ban Nha năm 1918 virus cúm A chủng H1N1 - Cúm châu Á năm 1957 chủng H2N2 - Dịch cúm Hồng Kong năm 1968 chủng H3N2 - Dịch cúm Nga năm 1977 chủng H1N1 [27] Mỗi vụ dại dịch cúm gây xuất chủng virus cúm cho người Thông thường, chủng có nguồn gốc virus cúm có sẵn loài động vật khác nhau, virus biến đổi hệ gene để có đặc tính thích nghi lây sang cho người [9] Virus cúm thuộc họ Orthomyxoviridae, người ta chia virus cúm thành type huyết cúm A, B, C Trong virus cúm type A (gọi tắt virus cúm A) tác nhân chủ yếu gây bệnh cúm người động vật, virus cúm B tìm thấy gây bệnh người, virus cúm C gây bệnh cho người Đối với virus cúm type A, dựa vào kháng nguyên ngưng kết hồng cầu (kháng nguyên H) neuraminidase (kháng nguyên N) bề mặt virus người ta phân chia thành nhiều type Hiện có khoảng 16 type với kháng nguyên ngưng kết hồng cầu (H1 đến H16) type kháng nguyên N (từ N1 đến N9) Virus cúm A có nhiều vật chủ gồm người, chim, lợn, ngựa Các type cúm A thường gây nhiễm trùng động vật vật chủ đặc thù, chúng gây nhiễm trùng chéo Virus cúm dễ bị tiêu diệt nhiệt độ thường có sức sống dai dẳng nhiệt độ thấp Theo thống kê khoảng 10-15 năm dịch cúm lại xuất trở lại với biến chứng khó lường Người ta nhận thấy type virus cúm A,B,C virus cúm A thường thủ phạm đại dịch Những nghiêm cứu gần cho thấy virus cúm A có khả thay đổi kháng nguyên để kháng lại kháng thể người bệnh Hơn virus cúm A gây bênh người cịn lai ghép với cúm A gây bệnh động vật để tạo virus có kháng nguyên khác hẳn với kháng nguyên virus cúm A nguyên thủy 12 Theo khuyến cáo tổ chức y tế giới (WHO) dự đốn có đại dịch cúm gia cầm bùng phát tất nước, công khoảng 25-30 % dân số giới cướp hàng triệu sinh mạng người phủ nước cần phải chuẩn bị tăng cường biện pháp phòng ngừa để giảm thiệt hại người [26] Từ năm 1997 chủng virus cúm A H5N1 bắt đầu phát gia cầm lây nhiễm cho người tiếp xúc trực tiếp làm tử vong cho người số nước châu Á: Indonexia, Thái Lan, Trung Quốc, Việt Nam,… Hiện bệnh cúm xảy gia cầm khu vực Châu Á nhiều nước giới Dịch cúm A H5N1 chủng có độc lực cao loài chim di cư gia cầm, phát triển nhanh khó kiểm sốt gia cầm loài chim di cư, cá thể mang virus làm lan nhanh mầm bệnh từ vùng đến vùng khác từ quốc gia sang quốc gia khác [21] Một chủng virus cúm A khác H1N1 xuất vào năm 2009 xuất phát từ Mexico Hoa Kỳ, sau lan rộng nhiều quốc gia giới Chủng biến thể kết hợp nhiều gene khác từ cúm người, cúm heo cúm gà gọi “cúm heo” (swine flue) Đến cuối tháng 4/2009, cúm heo H1N1 gây tử vong cho 150 người Mexico, sau nhanh chóng lan khắp giới Ngày 11/6/2009, Tổ chức sức khỏe Thế giới (WHO) công bố nâng cấp dịch cúm H1N1 lên pha 6, pha dịch cúm tồn cầu [26][27] Theo thơng báo trung tâm y tế dự phòng kiểm sốt dịch bệnh Châu Âu (ECDC), đến ngày 11/8/2009 tồn giới ghi nhận 212.008 trường hợp dương tính với cúm A (H1N1) 168 Quốc gia vùng lãnh thổ, có 1.717 trường hợp tử vong (tỷ lệ tử vong vào khoảng 0,81%) Đến ngày 28/8/2009 có đến 209.438 người nhiễm virus cúm A (H1N1), có 2.185 trường hợp tử vong[26] Bệnh cúm thông thường bệnh diễn biến nhẹ hồi phục vòng 2-7 ngày, trẻ em, người già sức đề kháng kém, đặc biệt người có bệnh mãn tính tim phổi, thận, bệnh chuyển hóa, thiếu máu suy giảm miễn dịch bệnh cúm diễn biến nặng hơn, dễ bị biến chứng dẫn đến tử vong khơng điều trị kịp thời Biện pháp phòng bệnh hiệu chủ động tiêm vắc xin cúm để phòng bệnh Mặc dù tỉ lệ tử vong thấp, 13 bệnh diễn biến nhanh, lây lan mạnh Tình hình dịch cịn diễn biến phức tạp nguy lây lan thành đại dịch toàn cầu [21] Theo Trung tâm Phòng ngừa dịch bệnh Hoa Kỳ (CDC), từ năm 2010 trở lại đây, năm giới có khoảng - 45 triệu trường hợp mắc cúm với khoảng 61.000 trường hợp tử vong biến chứng viêm phổi cúm Những trường hợp xác nhận xét nghiệm tìm thấy virus cúm A (H1N1) phần lớn trẻ em người trẻ tuổi Nhiễm virus cúm H1N1 người đa số trường hợp có biểu cúm nhẹ, tỉ lệ tử vong thấp Những trường hợp nặng xảy phụ nữ có thai, hay người lớn tuổi bị bệnh tim phổi mãn tính Trong vụ dịch cúm H1N1 năm 2009, phần lớn trường hợp nhiễm virus cúm A (H1N1) có diễn biến lành tính, trường hợp nặng cần phải nhập viện dùng kháng sinh [1] Cúm lây nhiễm trục tiếp từ người sang người thông qua giọt bắn nhỏ nói chuyện, ho hắt Tại Việt Nam virus gây bệnh cúm mùa thường gặp cúm A/H3N2, A/H1N1 cúm B[1] Nhiễm virus cúm gia cầm H5N1 bắt đầu nghiên cứu thông báo Việt Nam sau trường hợp thông báo Hồng Kong năm 1997 Sau Hà Nam trường hợp bệnh phát chẩn đốn xác phịng thí nghiệm vào tháng 12/2003, ngành Y tế dự phòng tăng cường tiến hành công tác giám sát chặt chẽ trường hợp bệnh viêm đường hơ hấp có lâm sàng nghi ngờ virus tiền sử tiếp xúc với gia cầm, đặc biệt gia cầm bị bệnh, chết Các trường hợp có nghi ngờ nhập viện bệnh viện Trung Ương Hà Nội, TP Hồ Chí Minh bệnh viện lớn nước để lấy mẫu bệnh phẩm làm xét nghiệm xác định nguyên virus gây bệnh Kể từ tháng 12/2003 tới tháng 12/2013 nước ghi nhận 125 ca bệnh 62 ca tử vong (tỷ lệ tử vong số ca mắc 49,6%), nước đứng thứ giới số ca mắc số ca tử vong (sau Indonesia Ai Cập) [8] Đối tượng nghiên cứu đề tài virus nguy hiểm dễ bùng phát thành đại, mối nguy xã hội có nhiều nghiên cứu tình hình dịch tễ học vấn đề liên quan đến Cúm A/B.Theo báo công bố tạp chí Nhi khoa Ấn Độ Kumar V cộng năm 2016, cúm ...ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM NGUYỄN HỒI LINH TÊN ĐỀ TÀI: KHẢO SÁT TÌNH HÌNH NHIỄM MỘT SỐ VIRUS GÂY BỆNH THƯỜNG GẶP TẠI BỆNH VIỆN TRUNG ƯƠNG THÁI NGUYÊN KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐẠI... Khảo sát tình hình nhiễm virus HIV bệnh nhân điều trị Bệnh viện Trung Ương Thái Nguyên 35 4.3 Khảo sát tình hình nhiễm virus Cúm A Cúm B bệnh nhân điều trị Bệnh viện Trung Ương Thái Nguyên. .. ? ?Khảo sát tình hình nhiễm số virus gây bệnh thường gặp Bệnh viện Trung Ương Thái Nguyên? ?? 1.2 Mục tiêu, yêu cầu đề tài 1.2.1.Mục tiêu đề tài Nghiên cứu nhằm khảo sát tình hình nhiễm số virus gây