Bài giảng hóa sinh – chương 1 enzym và xúc tác sinh học

Chương Enzym xúc tác sinh học Nội dung Đại cương enzym Các yếu tố ảnh hưởng đến hoạt độ enzym Động học ức chế enzym Kiểm soát hoạt động enzym ĐẠI CƯƠNG VỀ ENZYME Khái niệm Là chất xúc tác làm gia tăng vận tốc phản ứng hóa học mà khơng thay đổi tiến trình phản ứng Khái niệm  Protein  RNA Năng lượng tự hoạt hóa trạng thái chuyển tiếp Năng lượng tự hoạt hóa trạng thái chuyển tiếp E + S ↔ ES → E + P Cân hóa học Xét phản ứng: A ↔ B  Vận tốc PƯ đầu kf=10-4/giây  Vận tốc PƯ đảo kb=10-6/giây  [𝑆ả𝑛 𝑝ℎẩ𝑚]𝑐𝑏 𝐾= [𝑇ℎ𝑢ố𝑐 𝑡ℎử]𝑐𝑏  10−4 𝐾= = −6 𝑘𝑏 10 𝑘𝑓 [𝐵]𝑐𝑏 = [𝐴]𝑐𝑏 =100 Trung tâm hoạt động Là vùng enzyme kết hợp với chất chuyển thành sản phẩm phản ứng Serin, Histidin, Tryptophan, Cystein, Lysin, Arginin, Glutamat Trung tâm hoạt động 10 Trung tâm hoạt động Cấu trúc Chymotrypsin 11 Trung tâm hoạt động Mơ hình chìa khóa/ ổ khóa (Fischer) 12 Trung tâm hoạt động MH tiếp xúc – cảm ứng (Koshland) 13 Tính đặc hiệu Tính đặc hiệu phản ứng  Enzyme xúc tác vơ số chuyển hóa có chất  VD: • R-CH(NH2)-COOH oxydase R-CO-COOH decarboxylase RNH2 transaminase R1-CO-COOH 14 Tính đặc hiệu Tính đặc hiệu chất  ĐH tuyệt đối: urease xt thủy phân ure  ĐH tương đối: lactat dehydrogenase tác dụng vào nhiều chất có nhóm –CHOH lactat  ĐH kép: aminoacylsynthetase tác dụng vào chất có cấu trúc khác aa tARN 15 Tính đặc hiệu 16 Danh pháp Tên gọi  Cơ chất + ase (Urease; fructose 1,6diphosphatase…)  Pepsin, Trypsin, Chymotrypsin (thủy phân liên kết peptid) Danh pháp quốc tế [Mã số (4 số)]  Số thứ  loại enzyme  Số thứ hai  nhóm  Số thứ ba  phân nhóm  Số thứ tư  số thứ tự phân nhóm Trypsin có mã số EC 3.4.21.4 17 Phân loại Loại Enzyme Kiểu phản ứng xúc tác Ví dụ Oxydoreductase Chuyển vận điện tử (A- + B  A + B-) Alcol dehydrogenase Transferase Chuyển vận nhóm chức (A-B + C  A + B-C) Hexokinase Hydrolase Phản ứng thủy phân A-B + H2O  A-H + B-OH Trypsin Lyase Phân cắt liên kết C-C, C-O, C-N liên kết khác để thành lập thường liên kết đôi Pyruvate decarboxylase Isomerase Chuyển đổi nhóm chức nội phân tử (chuyển đồng phân) Malate isomerase Ligase (synthase) Xúc tác phản ứng tổng hợp có kết hợp với thủy giải ATP A+BA-B Pyruvate carboxylase 18 Phân loại 19 CÁC YẾU TỐ ẢNH HƯỞNG ĐẾN HOẠT ĐỘ CỦA ENZYME 20 ... Đại cương enzym Các yếu tố ảnh hưởng đến hoạt độ enzym Động học ức chế enzym Kiểm soát hoạt động enzym ĐẠI CƯƠNG VỀ ENZYME Khái niệm Là chất xúc tác làm gia tăng vận tốc phản ứng hóa học mà khơng... tâm hoạt động 10 Trung tâm hoạt động Cấu trúc Chymotrypsin 11 Trung tâm hoạt động Mơ hình chìa khóa/ ổ khóa (Fischer) 12 Trung tâm hoạt động MH tiếp xúc – cảm ứng (Koshland) 13 Tính đặc hiệu... tương đối: lactat dehydrogenase tác dụng vào nhiều chất có nhóm –CHOH lactat  ĐH kép: aminoacylsynthetase tác dụng vào chất có cấu trúc khác aa tARN 15 Tính đặc hiệu 16 Danh pháp Tên gọi  Cơ chất