ML/AI ứng dụng phân tích dữ liệu lớn

Bộ mơn Khoa học & Kĩ thuật Tính tốn Dept of Computational Sciences and Engineering @Phịng 319, Nhà E3 •01 PGS •06 TS •06 Cán tạo nguồn Các nhóm nghiên cứu • Phịng thí nghiệm Tin Sinh Y học (Bingo Lab) – Học máy, trí tuệ nhân tạo ứng dụng xử lý, phân tích liệu lớn y sinh dược học • • • • • • PGS TS Lê Sỹ Vinh (vinhls@vnu.edu.vn) TS Đặng Thanh Hải (hai.dang@vnu.edu.vn) TS Đặng Cao Cường (dangcaocuong@gmail.com) TS Hoàng Thị Điệp (diepthihoang@gmail.com) TS Đỗ Đức Đông (dongdoduc@gmail.com) CN Nguyễn Đức Cảnh – Xử lý ngôn ngữ tự nhiên cho văn y sinh • TS Đặng Thanh Hải • Phịng thí nghiệm Tối ưu hoá (ORLab) – Vận trù học, tối ưu hố hệ thống lớn • TS Hà Minh Hồng (minhhoangha.vth@gmail.com) • TS Đỗ Đức Đơng; TS Hồng Thị Điệp; 01 cán tạo nguồn • Nhóm NC Mật mã, an tồn thơng tin – TS Lê Phê Đơ (dolp@vnu.edu.vn) + 01 cán tạo nguồn Bingo Lab ML/AI ứng dụng phân tích liệu lớn … • Phân tích liệu (lớn) hệ gien (genomic data) ứng dụng y tế – Thành viên: PGS TS LS Vinh; TS DC Cường; TS HT Điệp; CN NĐ Cảnh – Hợp tác • Viện liệu lớn Vingroup, bệnh viện VinMec, Khoa Y Dược, • GS Arnde von Haeseler, Đại học Vienna, Áo • TS Bùi Quang Minh, ĐH Quốc Gia Úc – Thành viên trước đây: • 02 sinh viên K58, làm Google, Vương quốc Anh Bingo Lab ML/AI ứng dụng phân tích liệu lớn … • Học sâu ứng dụng tin sinh học – Thành viên: TS ĐT Hải; TS ĐĐ Đơng; TS ĐC Cường – Hợp tác • • • • TS Cao Minh Đức, 4Catalyzer.com, USA TS Nguyễn Hoàng Anh, ĐH Queensland, Úc TS Võ Sỹ Nam, Viện Bigdata, Vingroup PGS TS Nguyễn Cảnh Hào, Đại học Kytoto, Nhật Bản – Thành viên trước đây: • 01 sinh viên K59, học Thạc sỹ JAIST, Nhật Bản Bingo Lab Xử lý ngôn ngữ tự nhiên cho y văn • Học sâu & ứng dụng NLP for bio text – Thành viên: TS Đặng Thanh Hải • 10 sinh viên thực tập – Hợp tác • GS Nigel Collier, ĐH Cambridge, Vương quốc Anh • PGS TS Trần Thế Truyền, ĐH Deakin, Úc – Thành viên trước đây: • Vũ Tiến Sinh (K60, Giải SV NKCH Cấp Bộ, báo quốc tế), học bổng phủ Nhật (MEXT) cho chương trình Thạc sỹ (JAIST) • Nguyễn Đức Minh (K60), làm Google Singapore • Mạnh Thắng & Ngọc Cường (K60), làm VNG AI Research ORLab • Vận trù học, tối ưu hố (fb/orlab.vn) – Thành viên: TS HM Hồng; TS ĐĐ Đơng; TS HT Điệp • >20 sinh viên thực tập • Vũ Duy Mạnh, Nguyễn Thanh Lâm (K62), thực tập tháng Đại học Bách Khoa, Montréal, Canada – Hợp tác • GS Olivier Péton, LS2N laboratory, Nantes, France • GS Louis-Martin Rousseau, Đại học Montréal, Canada – Thành viên trước đây: • 02 học bổng Vingroup chương trình thạc sĩ, Đại học Limoges, Pháp • 03 học bổng tồn phần chương trình thạc sĩ, Đại học Montréal, Canada • 02 học bổng Tiến sỹ (ĐH Cơng nghệ Sydney, Úc Ecole des Mines de Nantes, Pháp) Nhóm NC Mật mã, an tồn thơng tin • Mật mã, An ninh, an tồn thơng tin • Cơng nghệ Blockchain • Trưởng nhóm: TS Lê Phê Đơ – 01 Cán tạo nguồn – 06 sinh viên thực tập • 01 Dự án triển khai (do Trường ĐH Công Nghệ tài trợ) Thông tin chi tiết thành viên HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI •Tin sinh học •Trí tuệ nhân tạo y tế PGS TS Lê Sỹ Vinh Chủ nhiệm khoa CNTT Email: vinhbio@gmail.com Web: uet.vnu.edu.vn/~vinhls HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI •Mật mã ứng dụng •An tồn thơng tin •Blockchain TS Lê Phê Đơ Phịng 319, nhà E3 Email: dolp.cntt@gmail.com Web: uet.vnu.edu.vn/~dolp HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI •Học máy/Học sâu (Deep learning) ứng dụng •Khai phá liệu ứng dụng •Xử lý ngôn ngữ tự nhiên ứng dụng cho văn y-sinh •Tin sinh-y học TS Đặng Thanh Hải Phó chủ nhiệm Bộ mơn Phịng 319, nhà E3 Email: danghai@gmail.com Web: uet.vnu.edu.vn/~hai.dang HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI •Tin sinh học •Phân tích hệ gen ứng dụng •Các kỹ thuật tính tốn nhằm xử lý, phân tích mơ hình phát sinh lồi, tiến hố đa dạng sinh học •Tối ưu hóa •Nghiên cứu phát triển ứng dụng ThS Hoàng Thị Điệp web, thiết bị thơng minh Phịng 319, nhà E3 •Triển khai ứng dụng hệ thống hỗ trợ Email: diep.thi.hoang@gmail quản lý doanh nghiệp Web: uet.vnu.edu.vn/~diepht HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI •Học máy thống kê •Trí tuệ nhân tạo •Tin Sinh học TS Đặng Cao Cường Phòng 319, nhà E3 Email: dangcaocuong@gmail.com Web: uet.vnu.edu.vn/~cuongdc • HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI • Tin sinh-y học ứng dụng • Tối ưu hố ứng dụng • Các thuật tốn tối ưu meta-heuristics ứng dụng • Thiết kế tối ưu thuật tốn • Nghiên cứu phát triển ứng dụng TS Đỗ Đức Đông web, điện thoại thơng minh Phịng 319, nhà E3 • Triển khai ứng dụng hệ thống hỗ trợ Email: dongdoduc@gmail.com Web: uet.vnu.edu.vn/~dongdd quản lý doanh nghiệp • HƯỚNG NGHIÊN CỨU HIỆN TẠI • Vận trù học, Tối ưu hố • Các ứng dụng vận trù học lĩnh vực sản xuất, giao thơng vận tải, tài chính, ngân hang, quảng cáo, v.v TS Hà Minh Hồng Phịng 319, nhà E3 Email: minhhoangha.vth@gmail Web: uet.vnu.edu.vn/~hoanghm Một số dự án triển khai • 2017-2019: Nghiên cứu phát triển mơ hình học máy tiên tiến phát trích xuất mối quan hệ tác dụng phụ thuốc từ văn y sinh Quỹ Nafosted, Bộ Khoa học Cơng Nghệ • 2015-2017: Nghiên cứu phát triển thuật toán giải toán hoạch định tuyến xe biến thể Quỹ Nafosted, Bộ Khoa học Cơng Nghệ • 2015 – 2017: Developing optimization methods for solving problems related to protein sequences, Đề tài cấp ĐHQGHN • 2014 – 2016: Fast methods for sequence analyis problems with large data sets, Quỹ Nafosted, Bộ Khoa học Cơng Nghệ, • 2013 – 2015: Whole genome analysis for a Vietnamese individual, Đề tài trọng điểm, Quỹ phát triển Khoa học Công nghệ, ĐHQGHN Một số báo tiêu biểu gần • 2017 – – – – – – – Quang Minh Ha and Yves Deville and Quang Dung Pham and Minh Hoang Ha (2017) On the mincost traveling salesman problem with drone Transportation Research Part C (In Press) Thi Diep Hoang and Olga Chernomor and Arndt von Haeseler and Bui Quang Minh and Sy Vinh Le (2017) UFBoot2: Improving the Ultrafast Bootstrap Approximation Molecular Biology and Evolution msx281 ISSN 1537-1719 Hoang Quynh Le and Duy Cat Can and Thanh Hai Dang and Mai Vu Tran and Quang Thuy Ha and Nigel Collier (2017) Improving Chemical-induced Disease Relation Extraction with Learned Features Based on Convolutional Neural Network In: The 9th International Conference on Knowledge and Systems Engineering (KSE), 19-21 October 2017, Hue, Vietnam Phe Do Le and Manh Trung Mai and Trung Truc Le and Thi Hang Nguyen and Thi Hanh Vuong and Khac Hung Nguyen and Thi Thuy Dinh and Thi Len Le (2017) Nghiên cứu số hệ mật mã nhẹ ứng dụng IoT Tạp chí Nghiên cứu Khoa học & Công nghệ Quân ISSN 1859-1043 Sy Vinh Le and Cuong Dang and Quang Le (2017) Improved mitochondrial amino acid substitution models for metazoan evolutionary studies BMC Mol Evol, 17 (136) Stefan Naulaerts and Cao Cuong Dang and Pedro Ballester (2017) Precision and recall oncology: combining multiple gene mutations for improved identification of drug-sensitive tumours Oncotarget ISSN 1949-2553 Anh Vu Thi Ngoc and Phuc Thai Dinh and Hoang Duc Nguyen and Thanh Hai Dang and Dong Do Duc (2017) Ant colony optimization based founder sequence reconstruction VNU Journal of Computer Science and Communication Engineering ISSN 0866-8612 (In Press) • 2016 – – – – – Diep Thi Hoang, Vinh Le, Tomas Flouri, Alexandros Stamatakis, Arndt von Haeseler and Bui Quang Minh (2016) A new phylogenetic tree sampling method for maximum parsimony bootstrapping and proof-of-concept implementation The Eighth International Conference on Knowledge and Systems Engineering (KSE 2016) Ha Noi, Vietnam, October 68, 2016 Le H-Q, Tran M-V, Dang TH, Ha Q-T, Collier N Sieve-based coreference resolution enhances semi-supervised learning model for chemical-induced disease relation extraction Database: The Journal of Biological Databases and Curation 2016;2016:baw131 doi:10.1093/database/baw131 Peon, Antonio, Cuong C Dang, and Pedro J Ballester "How reliable are ligand-centric methods for Target Fishing?." Frontiers in chemistry (2016): 15 Nguyen TT, Sy Le V, Ho HB, Si Le Q Building ancestral recombination graphs for whole genomes IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform 2016 Mar 16 DOI: 10.1109/TCBB.2016.2542801 Đỗ Xn Quyền, Nguyễn Hồng Đức, Thái Đình Phúc, Đỗ Đức Đơng Phương pháp tối ưu đàn kiến dóng hàng toàn cục mạng tước tác Protein Kỷ yếu hội nghị FAIR 2016 (Chuẩn bị xuất bản)