MassLynx Skyline Interface (MSI) – A New Automated Tool to Streamline MRM Method Development and Optimization for Large Molecule Quantification using Waters Tandem Quadrupole (TQ) Systems [ TECHNOLOGY[.]
[ TECHNOLOGY BRIEF ] Bộ ghép nối MassLynx-Skyline - Công cụ tự động, tinh giản trình phát triển tối ưu hóa phương pháp MRM cho định lượng đại phân tử Nikunj Tanna, Caitlin Dunning, and Billy Molloy Waters Corporation, Milford, MA, USA Giới thiệu công cụ giúp tự động đơn giản hóa việc phát triển phương pháp kiểm soát đa phản ứng MRM với peptide, protein (các chất trị liệu đánh dấu sinh học) nghiên cứu gen LC-MS/MS sử dụng MassLynx Skyline ghép nối tứ cực MỤC TIÊU Nhấn mạnh lợi ích phận ghép nối MassLynx™ Skyline™, giúp tự động đơn giản hóa q trình tạo phương pháp MRM cho định lượng peptide/protein CƠ SỞ Protein peptide dần trở nên chất phân tích thường quy, định lượng LCMS/MS Sự khác tiểu phân tử peptide/protein khiến việc phát triển tối ưu hóa MRM trở nên khó khăn Skyline cơng cụ miễn phí tạo Đại học Washington, sử dụng rộng rãi quy trình proteomics, sử dụng ngày rộng rãi để hỗ trợ phát triển phương pháp phân tích đại phân tử phép thử sinh học việc phát Figure Recommended systematic workflow for development and optimization of an MRM method for peptides and proteins using MassLynx and Skyline Ở đây, mô tả công cụ mới, ghép nối MassLynx Skyline (MSI), cho phép tự động hóa quy trình giúp đơn giản hóa trải nghiệm người dùng mà khơng cần can thiệp nhiều phát triển thuốc Sự tương thích MassLynx Skyline cho phép người dùng dễ dàng tạo phương pháp thu thập, xem lại liệu tối ưu hóa lượng va chạm để phương pháp MRM sau Mặc dù quy trình đơn giản khơng sử dụng Skyline, cần can thiệp GIẢI PHÁP thủ công để tạo xuất phương pháp thu Quy trình cho peptide protein nhằm ổn định cách hệ thống phát thập (Skyline), lấy liệu (MassLynx), triển phương pháp mạnh mẽ trải qua bước (Hình 1) Bước 1, thực nhập, xem lại lọc liệu (Skyline), ion mẹ phương pháp sau peptide có mẫu Bước 2, thu thập từ ion mẹ sang ion để tìm thu thập liệu từ ion mẹ để xác định thời gian lưu cho [ TECHNOLOGY BRIEF ] cặp ion mẹ/ion nhạy cho loại peptit mẫu sử dụng lượng va chạm tính tốn mặc định Trong bước 3, 3-5 chuyển dịch MRM nhạy tối ưu hóa lượng va chạm với chuyển dịch Bước tạo phương pháp thu thập sau với chuyển dịch MRM nhạy lượng va chạm tối ưu Với bước, phương pháp thu thập xuất người dùng từ Skyline, danh sách mẫu lên thu thập MassLynx, chuyển lại vào Skyline lọc để chọn phương pháp sau Trước đây, người dùng phải chuyển thủ công để thu phương pháp tối ưu Bộ ghép nối MassLynx Skyline Interface (MSI) tự động hóa tồn q trình, kể tạo phương pháp thu thập liệu, có phương pháp sau Người dùng lựa chọn quy trình sử dụng để tạo phương pháp MRM cho peptide protein cho phân tích sinh học quy trình proteomic cho định lượng biomarker Người dùng tự tạo cấu hình phù hợp với quy trình làm việc nhập vào MSI với thông số mong muốn Cơng cụ sau trải qua bước hình để chọn cặp ion mẹ/ion phù hợp với lượng va chạm tối ưu Các thông tin liên Figure MassLynx Skyline interface quan đặt tên lưu trữ TÓM TẮT MSI tự động tối ưu hóa quy trình phát triển phương pháp MRM cho peptide protein sử dụng MassLynx Skyline với thông minh, khoa học lặp lại cao, giúp đơn giản hóa trải nghiệm người dùng, tiết kiệm thời gian chuyển từ MassLynx sang Skyline, đảm bảo ổn định người dùng với Chỉ dùng nghiên cứu Không dùng cho trình lâm sàng Waters, The Science of What’s Possible, and MassLynx are trademarks of Waters Corporation All other trademarks are the property of their respective owners ©2020 Waters Corporation Produced in the U.S.A April 2020 720006813EN TC-PDF Waters Corporation 34 Maple Street Milford, MA 01757 U.S.A T: 508 478 2000 F: 508 872 1990 www.waters.com