Cách gọi tên phân loại enzyme

Cá ch gọi tên phân loại enzyme Cá ch gọi tên enzyme Trong th ời gian đầu ng ành enzyme h ọc chưa phát triển, người ta thường gọi tên enzyme m ột cách t ù y tiện, t ù y theo t ác giả Ví dụ tên pepsin, trypsin, chimotrypsin v ẫn dù ng gọi l tên thường dù ng Sau đó, n gười ta thường gọi tên enzyme cách lấy tên chất đặc hiệu enzyme cộng thêm từ “ase ” Ví dụ: urease enzyme t ác dụng v ure, proteinase enzyme t ác dụng v protein, lipase enzyme t ác dụng v lipid, amylase enzyme t ác dụng v tinh bột (amidon) Cá ch gọi tên enzyme Đối với nh óm enzyme cù ng xú c t ác m ột loại ph ản ứng, n gười ta lấy tên ph ản ứng enzyme thêm đuổi t “ ase” , ví d ụ nh ững enzyme xúc t ác oxy h óa gọi oxydase, nh ững enzyme kh hydrogen g ọi dehydrogenase Tên gọi đầy đủ, xác theo quy ước quốc t ế tên gọi h ệ th ống enzyme gọi theo tên ch ất đặc hiệu cù ng với tên kiểu ph ản ứng m xúc t ác, cộng thêm đuôi “ ase” Cá ch gọi tên enzyme ví d ụ: enzyme xúc t ác cho thủy phân ure (carbamid): H2N - CO - NH2 + H2O  CO2 + 2NH3 có tên h ệ th ống Carbamid - amidohydrodase (Tên thường d ù ng urease) Phân loại enzyme Mục đích phân loại enzyme để nh ấn m ạnh m ột cách ch ính xác t qu át, m ối quan h ệ nh ững điều giống m ột loại enzyme Cá c lớp enzyme Tiểu ban enzyme (The enzyme Commission EC) t ổ ch ức Hội hóa sinh qu ốc t ế ( The internationl Union of Biochemistry, I UB) đưa cách phân loại thống nh ất d ựa loại ph ản ứng chế ph ản ứng Theo cách phân loại n ày th ì enzyme chia làm sáu lớp lớn đánh số t đến Các số th ứ t ự n ày cố định cho m ỗi lớp Cá c lớp enzyme Oxydoreductase: Các enzyme xúc t ác cho ph ản ứng oxy h óa kh Trong nh óm có t ất enzyme có tên thơng thường biết dehydrogenase, oxydase, cytochromreductase peroxydase Trong ph ản ứng ch ú ng xú c t ác xảy ta vận chuyển hydrogen, chuyển electron, oxy hóa oxy phân t ử, b ởi hydrogen peroxide ch ất oxy h óa kh ác Cá c lớp enzyme Transferase: Các enzyme xúc t ác cho ph ản ứng chuyển vị Các transferase b ản ch ất nh ững gốc m ch ú ng vận chuyển tham gia vào qu tr ình trao đổi ch ất r ất khác Trong lớp transferase bên cạnh transaminase methyltransferase cịn có kinase kh ác (xú c t ác ch ủ yếu cho vận chuyển g ốc phosphate t h ợp ch ất cao tới ch ất kh ác, m ột ph ần lớn enzyme trước g ọi mutase m ột vài loại synthetase, ví dụ enzyme t hợp DNA RNA) Cá c lớp enzyme Hydrolase : Các enzyme x ú c t ác cho ph ản ứng th ủy phân Trong lớp n ày có enzyme phân giải este (ví d ụ lipid), glucozid, amid, peptid, protein Cá c lớp enzyme Lyase : Các enzyme x ú c t ác cho ph ản ứng phân cắt không cần nước, loại nước t ạo th ành n ối đôi k ết h ợp phân t nước vào n ối đơi Thu ộc vào lớp n ày có enzyme g ọi hydratase, aldolase, decarboxylase m ột số desaminase Cá c lớp enzyme I somerase: Các enzyme x ú c t ác cho ph ản ứng đồng phân h óa Tính cù ng th ì ch ú ng x ú c t ác cho nh ững ph ản ứng chuy ển nh óm kh ác bên phân t Trong lớp n ày khơng nh ững có nh ững enzyme chuy ển h óa đồng phân h ình h ọc đồng phân quang h ọc ( alaninracemase) m enzyme x ú c t ác cho ph ản ứng ví dụ chuy ển hóa aldose th ành cetose (glucosophosphate isomerase, t rước g ọi l phosphohexoisomerase) biến đổi v ị tr í liên k ết este bên phân t (v í dụ phosphoglucomutase) 10 Cá c lớp enzyme Ligase : Các enzyme x ú c t ác cho ph ản ứng t h ợp có sử dụng liên k ết giàu lượng ATP v.v Ở cần ch ú ý thêm enzyme phân cắt phân loại v ới tên “ lyase” Nếu cân b ằng chuy ển dịch v ề ph ía t h ợp th ì enzyme có th ể gọi l “ synthase” Ngược lại ch ú ng ta gọi enzyme xú c t ác cho ph ản ứng kết h ợp phân t có tham gia ATP nucleotide triphosphate tương tự có sử dụng m ối liên k ết giàu lượng synthetase Tên gọi theo h ệ th ống phân loại lớp n ày l “ ligase” để tr ánh đổi tr áo v ới tên “ synthase” nói 11 Cá c lớp enzyme Mỗi lớp (class) lại chia th ành nhiều lớp ph ụ (sub - class) phân lớp ph ụ (sub- sub - class), r ồi sau th ứ t ự enzyme phân lớp ph ụ (cũng có t ài liệu phân chia theo: loại (lớp), t ổ, nhóm th ứ t ự enzyme) Như vậy, m ỗi enzyme hệ th ống phân loại đặt tên theo mã ch ữ số biểu th ị ph ản ứng xú c t ác: số đầu ch ỉ lớp, số th ứ hai ch ỉ lớp ph ụ, số th ứ ba phân lớp ph ụ, số th ứ tư rõ số b ậc th ứ t ự enzyme 12 Cá c lớp enzyme Ví d ụ: enzyme xúc t ác cho ph ản ứng: Ethanol + NAD+ acetaldehyde + NADH + H+ có tên g ọi alcohol dehydrogenase (ADH), tên qu ốc t ế theo kh óa phân loại là: Alcohol: NAD oxydoreductase, EC 1.1.1.1 Trong đó, mã số biểu th ị tên lớp enzyme oxydoreductase (lớp 1); mã số th ứ hai biểu th ị lớp ph ụ 1: t ác d ụng lên nh óm CH - OH ch ất cho; mã số th ứ ba biểu th ị phân lớp ph ụ 1: ch ất nh ận NAD hay NADP mã số cuối cù ng số th ứ t ự enzyme 13 Cá c lớp enzyme Như vậy, cách g ọi h ệ th ống enzyme ADH có tên chất coenzyme tên qu tr ình chuy ển h óa h óa h ọc xú c t ác với t ận cù ng “ ase” Sau tên enzyme số n ó theo danh sách enzyme tiểu ban v ề enzyme đề (enzyme commission, EC) 14 Cá c lớp enzyme Như vậy, cách g ọi h ệ th ống enzyme ADH có tên chất coenzyme tên qu tr ình chuy ển h óa h óa h ọc xú c t ác với t ận cù ng “ ase” Sau tên enzyme số n ó theo danh sách enzyme tiểu ban v ề enzyme đề (enzyme commission, EC) 15 ... EC 1. 1 .1. 1 Trong đó, mã số biểu th ị tên lớp enzyme oxydoreductase (lớp 1) ; mã số th ứ hai biểu th ị lớp ph ụ 1: t ác d ụng lên nh óm CH - OH ch ất cho; mã số th ứ ba biểu th ị phân lớp ph ụ 1: ... gọi theo h ệ th ống phân loại lớp n ày l “ ligase” để tr ánh đổi tr áo v ới tên “ synthase” nói 11 Cá c lớp enzyme Mỗi lớp (class) lại chia th ành nhiều lớp ph ụ (sub - class) phân lớp ph ụ (sub-... lớp, số th ứ hai ch ỉ lớp ph ụ, số th ứ ba phân lớp ph ụ, số th ứ tư rõ số b ậc th ứ t ự enzyme 12 Cá c lớp enzyme Ví d ụ: enzyme xúc t ác cho ph ản ứng: Ethanol + NAD+ acetaldehyde + NADH + H+