Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống
1
/ 82 trang
THÔNG TIN TÀI LIỆU
Thông tin cơ bản
Định dạng
Số trang
82
Dung lượng
3,23 MB
Nội dung
ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ *************** Trần Quang Huy CẢM BIẾN SINH HỌC TRÊN CƠ SỞ POLYME DẪN TRONG PHÁT HIỆN VI RÚT GÂY BỆNH Chuyên ngành : Vật liệu linh kiện nanô LUẬN VĂN THẠC SỸ NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC : TS Mai Anh Tuấn Hà Nội - 2007 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com MỤC LỤC Trang phụ bìa Lời cam đoan Lời cảm ơn Mục lục Danh mục ký hiệu, chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục hình vẽ, đồ thị MỞ ĐẦU CHƯƠNG TỔNG QUAN Trang 1.1 Lịch sử phát triển cảm biến sinh học ………………………… 1.2 Cảm biến sinh học……………………………………………… 1.2.1 Khái niệm cảm biến sinh học…………………………… 1.2.2 Nguyên lý cảm biến sinh học…………………………… 1.2.3 Phân loại cảm biến sinh học……………………………… 10 1.3 Polyme dẫn……………………………………………………… 15 1.3.1 Khái niệm polyme dẫn ……… ………………………… 15 1.3.2 Cơ chế dẫn polyme dẫn……………………………… 16 1.3.3 Ứng dụng polyme dẫn cảm biến sinh học………… 18 1.4 Một số khái niệm sinh học phân tử, vi rút học, vi rút Herpes 21 1.4.1 Một số khái niệm sinh học phân tử…………………… 21 1.4.2 Một số khái niệm vi rút học…………………………… 24 1.4.3 Vi rút Herpes……………………………………………… 27 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com CHƯƠNG CHẾ TẠO CẢM BIẾN SINH HỌC 2.1 Thiết bị, hóa chất……………………………………………… 31 2.1.1 Thiết bị…………………………………………………… 31 2.1.2 Hóa chất………………………………………………… 31 2.2 Thiết kế chế tạo cảm biến vi điện cực……………………… 32 2.2.1 Thiết kế cảm biến vi điện cực…………………………… 32 2.2.2 Qui trình chế tạo vi cảm biến…………………… 33 2.3 Lựa chọn DNA đầu dò………………………………………… 37 2.4 Lựa chọn polyme dẫn…………………………………………… 38 2.5 Cố định DNA đầu dò lên bề mặt vi cảm biến…………… 39 2.6 Đo đạc thông số…………………………………………… 41 2.6.1 Kính hiển vi điện tử quét (KHVĐTQ)…………………… 41 2.6.2 Phổ hồng ngoại biến đổi chuỗi Fourier (FTIR)…………… 42 2.6.3 Kỹ thuật phản ứng chuỗi tổng hợp polymerase (PCR)… 42 2.6.4 Xây dựng hệ đo tín hiệu cảm biến sinh học……………… 43 CHƯƠNG KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN 3.1 Cảm biến vi điện cực…………………………………………… 49 3.2 Tạo màng polyme dẫn APTS ….……………………………… 52 3.3 Phổ hồng ngoại FTIR…………………………………………… 52 3.4 Dị tìm axit nucleic từ mẫu phân tích…………………………… 53 3.4.1 Dị tìm DNA bổ sung…………………………………… 53 3.4.2 Dị tìm DNA đặc hiệu HSV………………………… 60 KẾT LUẬN DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ CỦA TÁC GIẢ TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com Thank you for evaluating AnyBizSoft PDF Splitter A watermark is added at the end of each output PDF file To remove the watermark, you need to purchase the software from http://www.anypdftools.com/buy/buy-pdf-splitter.html TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU VÀ CHỮ VIẾT TẮT APTS 3-aminopropyl–triethoxy-silance (Tên loại polyme dẫn) DNA Deoxyribonucleic acid (Axít đêoxyribơnuclêic – AND) EDC 1–ethyl-3-(dimethyl-aminopropyl)carbodiimide (Tên chất để hoạt hóa gốc phốt phát ADN) ELISA Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay (Kỹ thuật miễn dịch gắn men) IF ImmunoFlourescence (Kỹ thuật miễn dịch huỳnh quang) FTIR Fourier Transform Infrared Spectroscopy (Phổ hồng ngoại biến đổi chuỗi Fourier) HSV Herpes Simplex Viruses type & (Vi rút Herpes týp 2) ITIMS International Training Institute for Material Science (Viện Đào tạo Quốc tế Khoa học Vật liệu) KHVĐTQ Kính hiển vi điện tử quét MIA 1-methylimidazole (Tên chất để làm ổn định hóa DNA hoạt hóa nước) NCBI National Center of Biotechnology Information (Trung tâm Quốc gia Thông tin Công nghệ sinh học) PCR Polymerase Chain Reaction (Kỹ thuật phản ứng chuỗi tổng hợp polymeraza) RNA Ribonucleic acid (Axít ribơnuclêic - ARN) WHO World Health Organization (Tổ chức Y tế Thế giới) TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bảng 1.1 Các loại thụ thể sử dụng cảm biến sinh học kỹ thuật đo điện hoá Bảng 1.2 Kiểu đo tương ứng với chuyển đổi điện hố đối tượng phân tích Bảng 1.3 Một số tạp chất tiêu biểu dùng để pha tạp polyme dẫn 18 Bảng 1.4 Cố định phân tử sinh học lên lớp polyme dẫn thiết bị 20 cảm biến Bảng 1.5 So sánh hai týp vi rút Herpes 29 Bảng 2.1 Thơng số q trình oxy hố bề mặt phiến silic 34 Bảng 2.2 Thơng số trình phún xạ tạo màng kim loại phiến silic 36 Bảng 2.3 Các thông số hàn dây siêu âm 37 Bảng 2.4 Bảng mẫu thực phép đo theo nồng độ, nhiệt độ, thời gian 48 Bảng 3.1 So sánh ưu, nhược điểm hai loại cảm biến vi điện cực 51 Bảng 3.2 Tín hiệu lai hóa nồng độ mẫu thấp nhiệt độ phịng 54 Bảng 3.3 Tín hiệu lai hóa DNA đầu dị DNA bổ sung mẫu phân 55 tích Bảng 3.4 Tín hiệu lai hóa theo thay đổi nhiệt độ, nồng độ thời gian 57 Bảng 3.5 Tín hiệu lai hóa đo với sản phẩm PCR HSV 61 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com DANH MỤC CÁC HÌNH VẼ VÀ ĐỒ THỊ Trang Hình 1.1 Hình thái bề mặt cảm biến trước sau lai hố Hình 1.2 Ngun lý hoạt động cảm biến sinh học Hình 1.3 Mơ hình loại cảm biến enzyme… 11 Hình 1.4 Nguyên lý cảm biến sinh học DNA 12 Hình 1.5 Mơ hình cảm biến miễn dịch sợi nano phát vi rút 14 Hình 1.6 Vị trí cảm biến sinh học so với kỹ thuật truyền thống 15 khác để chẩn đốn bệnh Hình 1.7 Tốc độ phát triển cảm biến sinh học 20 năm trở lại 15 dự báo xu hướng phát triển Hình 1.8 Mơ hình ứng dụng màng polyme dẫn 19 Hình 1.9 Cấu trúc lai hóa phân tử DNA 21 Hình 1.10a Ảnh hiển vi điện tử truyền qua vi rút Herpes - nhuộm âm 27 Hình 1.10b Cấu trúc vi rút Herpes 27 Hình 1.11 Bệnh nhân bị nhiễm vi rút HSV-1 28 Hình 2.1a Thiết kế cảm biến 70µm x 30µm 32 Hình 2.1b Mơ hình cấu trúc vi điện cực cảm biến 70µm x 30µm 32 Hình 2.2a Thiết kế cảm biến 20µm x 20µm 32 Hình 2.2b Mơ hình cấu trúc vi điện cực cảm biến 20µm x 20µm 32 Hình 2.3 Xử lý bề mặt phiến Si 33 Hình 2.4 Tạo lớp màng SiO2 33 Hình 2.5 Mơ trình quang khắc phiến silic 35 Hình 2.6 Mơ q trình phún xạ cao tần tạo màng Pt… 35 Hình 2.7 Quá trình loại bỏ lớp cảm quang lớp màng kim loại Pt/Cr 36 không cần thiết Hình 2.8 Kính hiển vi điện tử qt phát xạ trường lạnh S-4800-Hitachi 41 Hình 2.9 Máy phân tích phổ hồng ngoại biến đổi chuỗi Fourier 43 Hình 2.10 Dạng sóng từ khuếch đại Lock-in 43 Hình 2.11 Hệ đo vi sai sử dụng máy khuyếch đại Lock-in SR830 45 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com Hình 2.12 Mạch tương đương hệ đo vi sai 45 Hình 3.1A Vi cảm biến 30µm x 70µm 49 Hình 3.1B Vùng điện cực hoạt động vi cảm biến 30µm x 70µm 49 Hình 3.2A Vi cảm biến loại 20µm x 20µm 50 Hình 3.2B Vùng điện cực hoạt động vi cảm biến 20µm x 20µm 50 Hình 3.3 Hình ảnh HVĐTQ màng polyme dẫn APTS bề mặt vi 52 cảm biến Hình 3.4 Phổ FTIR xác nhận liên kết hóa học DNA đầu dị – 53 màng APTS Hình 3.5 Tín hiệu lai hóa theo thời gian tương ứng với nồng độ mẫu 55 phân tích 0,5nM Hình 3.6 Tín hiệu lai hóa theo thay đổi nồng độ mẫu phân tích 56 nhiệt độ phịng Hình 3.7 Tín hiệu lai hóa theo thời gian tương ứng với nồng độ 58 mẫu phân tích khác Hình 3.8 Sự ảnh hưởng nhiệt độ lên khả phát DNA bổ 59 sung vi cảm biến theo nồng độ mẫu phân tích Hình 3.9 Tín hiệu lai hóa theo nhiệt độ vi cảm biến với nồng độ 60 mẫu 1nM Hình 3.10 Hình ảnh PCR dương tính với HSV bệnh nhân ký hiệu 61 VN055 Hình 3.11 Khả phát DNA đặc hiệu HSV sản phẩm 62 PCR Hình Đo đạc thử nghiệm vi cảm biến hệ đo 72 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com Thank you for evaluating AnyBizSoft PDF Splitter A watermark is added at the end of each output PDF file To remove the watermark, you need to purchase the software from http://www.anypdftools.com/buy/buy-pdf-splitter.html TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com MỞ ĐẦU Trong năm gần đây, nhiều nhà khoa học nước Quốc tế tập trung nghiên cứu chế tạo loại cảm biến sinh học có độ nhạy, độ chọn lọc cao, thiết bị nhỏ gọn, sử dụng tiện ích cho kết tin cậy Thiết bị đánh giá với nhiều tính vượt trội có khả khắc phục hầu hết nhược điểm thiết bị phân tích truyền thống khác ELISA, PCR Trong tương lai gần, nhà khoa học dự đoán thiết bị truyền thống dần bị thay thế hệ cảm biến sinh học tiện ích mang lại Trong lĩnh vực chẩn đoán bệnh, ba loại cảm biến sinh học chủ yếu thường tập trung nghiên cứu chế tạo : i) cảm biến enzyme sở phản ứng đặc hiệu enzyme – chất; ii) cảm biến miễn dịch sở phản ứng đặc hiệu kháng nguyên – kháng thể; iii) cảm biến DNA sở lai hóa đặc hiệu hai sợi đơn DNA có trình tự bổ sung Trong phát vi rút gây bệnh, hai loại cảm biến sinh học thường tập trung nghiên cứu là: cảm biến miễn dịch cảm biến DNA Với mục tiêu phát triển chế tạo loại vi cảm biến sinh học để ứng dụng phát vi rút gây bệnh Việt Nam, đồng thời phục vụ cho luận văn cao học, tác giả đề xuất đề cương đề tài ‘‘Cảm biến sinh học sở polyme dẫn phát vi rút gây bệnh’’ với nhiệm vụ: - Chế tạo vi cảm biến thích hợp cho việc phân tích, dị tìm mẫu sinh học có nồng độ thấp - Lựa chọn loại polyme dẫn thích hợp, tương thích với mẫu sinh học có khả tạo màng bề mặt vi cảm biến, không tham gia vào phản ứng sinh hóa phần tử sinh học đầu dị phần tử đích - Lựa chọn phần tử sinh học đầu dò, cố định lên bề mặt vi cảm biến - Đo đạc thử nghiệm với mẫu phân tích để xác định độ nhạy thông số khác vi cảm biến phát vi rút gây bệnh Đề cương Trường Đại học công nghệ - Đại học Quốc gia Hà Nội chấp thuận Dưới hướng dẫn khoa học Tiến sỹ Mai Anh Tuấn, giúp đỡ nhóm nghiên cứu cảm biến sinh học - Viện Đào tạo Quốc tế Khoa học Vật liệu, Trường Đại học Bách khoa Hà Nội, tác giả triển khai nghiên cứu phát triển loại cảm biến TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 59 trình tự DNA đầu dò thiết kế gồm 21 nucleotid : 5’–AT CAC CGA CCC GGA GAG GGA C–3’, với số A = 6, T = 1, C = 7, G= 7, Tm = 69,3 + 0,41(7 + 7) = 75,04°C, giá trị gần với kết thực nghiệm Hình 3.8 Sự ảnh hưởng nhiệt độ lên khả phát DNA bổ sung vi cảm biến theo nồng độ mẫu phân tích Hình 3.9 mô tả riêng rẽ ảnh hưởng nhiệt độ đến khả phát DNA bổ sung vi cảm biến nồng độ mẫu 1nM Thông qua hình này, tác giả thấy vi cảm biến nhạy tín hiệu lai hóa thường nhỏ, để phát huy tối ưu hiệu ứng dụng việc khuyếch đại tín hiệu vi cảm biến cần thiết TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 60 Hình 3.9 Tín hiệu lai hóa theo nhiệt độ vi cảm biến với nồng độ mẫu 1nM 3.4.2 Dị tìm DNA đặc hiệu HSV Để xác định độ nhạy khả phát vi rút vi cảm biến mẫu thực, tác giả tiến hành đo đạc thử nghiệm với sản phẩm PCR HSV Mẫu bệnh phẩm từ dịch não tủy bệnh nhân dương tính với HSV ký hiệu VN055 khẳng định kỹ thuật PCR phịng thí nghiệm vi rút Herpes, khoa Vi rút, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương Sau phi pha mẫu phản ứng 25µl chạy PCR cổ điển, sản phẩm thu lấy 10µl nhỏ hai giếng để chạy điện di DNA thạch l%, 15µl cịn lại sử dụng để làm mẫu phân tích cho vi cảm biến sinh học Hình 3.10 kết PCR dương tính mẫu bệnh phẩm ký hiệu VN055 minh chứng hai dải sáng với trọng lượng khoảng 92bp giếng số số 9, giếng số đến số chứng dương theo số lượng 105 – 100 DNA HSV chuẩn từ phòng thí nghiệm, giếng số chứng âm sử dụng nước cất khử ion thay khn mẫu DNA, M DNA chuẩn TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 61 Hình 3.10 Hình ảnh PCR dương tính với HSV bệnh nhân ký hiệu VN055 Pha loãng sản phẩm PCR HSV theo nồng độ tới 0,5nM Trước tiến hành phép đo, phải nâng nhiệt độ dung dịch mẫu lên 95°C phút để DNA sợi đơi đặc hiệu HSV biến tính hồn tồn thành sợi DNA đơn, sau làm nguội nhanh xuống 50 – 55°C, trình đo đạc nên thực để giảm thiểu khả tái bắt cặp DNA sợi đơn Thời gian để ghi lại tín hiệu sau khoảng phút (bảng 3.5) Bảng 3.5 Tín hiệu lai hóa đo với sản phẩm PCR HSV Cđích [nM] T; t= phút Vout [mV] 0,5 Lần 0,01 0,025 0,06 0,09 0,11 0,15 0,16 0,17 0,17 Lần 0,02 0,027 0,07 0,09 0,12 0,15 0,17 0,18 0,18 Lần 0,02 0,026 0,07 0,085 0,11 0,14 0,15 0,17 0,18 Nước - - - - - - - - - Hình 3.11 đồ thị mơ tả khả phát DNA đặc hiệu vi rút HSV vi cảm biến, tín hiệu lai hóa xuất sau khoảng phút nồng độ mẫu TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 62 0,5nM, giá trị tín hiệu đầu đo nhỏ tăng tuyến tính theo nồng độ từ 0,5nM đến 7nM Khi nồng độ mẫu lớn 7nM tín hiệu lai hóa trạng thái bão hịa Tác giả cho rằng, cho vi cảm biến tiếp xúc với nồng độ mẫu đủ nhỏ, bề mặt vi cảm biến xuất lai hóa DNA đầu dị DNA đích, đồng thời dung dịch xảy tượng tái bắt cặp DNA sợi đơn, cịn giá trị bão hịa số lượng DNA đầu dò bề mặt vi cảm biến lai hóa hết với DNA mẫu phân tích Hình 3.11 Khả phát DNA đặc hiệu HSV sản phẩm PCR Từ kết thực nghiệm để phát DNA đặc hiệu HSV sản phẩm PCR, tác giả thấy số lượng DNA thực tế lai hóa với DNA đầu dị xác định bởi: NDNA lai hóa = NDNA sản phẩm PCR HSV – (NDNA tái bắt cặp + NDNA dư thừa) Trong N số lượng DNA sợi đơn Ngoài ra, độ dài DNA đặc hiệu với HSV lớn nên khả xuất lai hố phần với DNA đầu dị phần cịn lại tái lai hóa với sợi DNA bổ sung dung dịch, điều gây ảnh hưởng lớn đến tín hiệu vi cảm biến TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 63 KẾT LUẬN Kết luận Sau trình nghiên cứu nhằm chế tạo phát triển loại cảm biến sinh học sở polyme dẫn để phát vi rút gây bệnh, tác giả hoàn thành mục tiêu đề tài luận văn tốt nghiệp đề với kết cụ thể sau: - Đã kết hợp nhóm nghiên cứu chế tạo vi cảm biến hệ 20µm x 20µm thay cho cảm biến hệ cũ 70µm x 30µm So với loại cảm biến hệ cũ, loại vi cảm biến hệ thích hợp với đối tượng phân tích DNA vi rút gây bệnh nhờ số tính vượt trội như: diện tích vùng hoạt động lớn khoảng cách điện cực thu hẹp hơn, kích thước lại nhỏ hơn, thể tích mẫu yêu cầu đo đạc nhỏ - Lựa chọn polyme dẫn APTS để tạo thành màng mỏng đồng bề mặt vi cảm biến 20µm x 20µm - Lựa chọn, cố định DNA đầu dò đặc hiệu vi rút HSV lên bề mặt vi cảm biến thông qua lớp màng APTS - Xây dựng phương pháp kiểm tra độ nhạy vi cảm biến Khảo sát ảnh hưởng nhiệt độ, nồng độ, thời gian đến khả dị tìm vi cảm biến DNA đặc hiệu vi rút Herpes mẫu chuẩn sản phẩm PCR HSV - Lần Việt Nam, tác giả đề xuất bước đầu thực thành công việc áp dụng tiến ngành công nghệ micro – nano, cụ thể công nghệ vi cảm biến vào lĩnh vực phát vi rút gây bệnh - Đã chế tạo vi cảm biến DNA có độ nhạy cao, có khả phát mẫu với nồng độ thấp khoảng 0,5nM với thời gian đáp ứng phút Ở nồng độ mẫu 3nM, thời gian đáp ứng chí xuất sau 30 giây điều kiện nhiệt độ phòng Tuy nhiên, dải nhiệt độ từ 50°C đến 75°C khoảng nhiệt độ để vi cảm biến hoạt động tốt nhất, tín hiệu tăng nhanh đạt giá trị cực đại khoảng nhiệt độ xung quanh 70°C - Một số kết công bố 04 cơng trình liên quan trực tiếp đến đề tài tạp chí chuyên ngành, Hội nghị nước quốc tế Tuy nhiên, đề tài phần trình nghiên cứu nhằm chế tạo thiết bị chẩn đoán vi rút gây bệnh “cầm tay” với kích thước nhỏ gọn, tiện ích Hơn nữa, TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 64 điều kiện thời gian thực đề tài có hạn yếu tố khách quan khác, đề tài vấn đề tồn như: - Các phép đo với mẫu phân tích chưa lặp lại nhiều lần thử nghiệm với điều kiện khác kết xác - Tính tốn số lượng DNA đầu dò gắn bề mặt vi cảm biến - Tối ưu hóa điều kiện, vật chất, hóa chất phương pháp chế tạo để thu tín hiệu lớn - Xác định thời gian sống vi cảm biến Kiến nghị Các kết đề tài cho thấy cảm biến sinh học sở polyme dẫn có độ nhạy cao, thời gian đáp ứng nhanh Tuy nhiên, để phát vi rút gây bệnh dựa việc dị tìm axit nucleic đặc hiệu vi rút mẫu thực, mẫu phải tách chiết, tăng nhiệt độ để biến tính DNA sợi đôi thành sợi đơn, giảm nhanh nhiệt độ thực phép đo để giảm thiểu khả tái bắt cặp DNA sợi đơn Mặt khác, nồng độ axit nucleic vi rút thường nhỏ, nên vi cảm biến phải có độ nhạy cao, việc thiết kế chế tạo cảm biến cần tối ưu hố kích thước, tăng độ nhạy cảm vi điện cực, lựa chọn loại polyme dẫn pha tạp thích hợp Mặc dù nhiều vấn đề cần nghiên cứu giải quyết, với ưu điểm vượt trội loại cảm biến này, phát triển mạnh mẽ ngành công nghệ micro-nano với thu hút số lượng lớn nhà khoa học giới mong muốn phát triển vi thiết bị chẩn đoán vi phân tích mẫu sinh học Trong tương lai khơng xa, tiềm cảm biến sinh học nói chung cảm biến DNA nói riêng có triển vọng lớn để thay thiết bị vi phân tích thơng thường nghiên cứu y sinh học Do đó, kiến nghị nhà khoa học nước quan tâm tiếp tục nghiên cứu, phát triển hoàn thiện loại cảm biến “thơng minh” có tiềm TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 65 DANH MỤC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ CỦA TÁC GIẢ I CƠNG TRÌNH LIÊN QUAN ĐẾN ĐỀ TÀI LUẬN VĂN Huy.T.Q., Thuy N.T.T., Tam P.D, Tuan M A., and Chien N.D Investigation of electrochemical DNA sensor for biomedical application Proceedings of the 2sd International Conference on Biomedical Engineering 2007, 273 – 278 Trần Quang Huy, Nguyễn Thị Thường, Nguyễn Thị Thanh Thủy, Phương Đình Tâm Mai Anh Tuấn Ứng dụng vi cảm biến DNA nghiên cứu y sinh học Tuyển tập cơng trình vấn đề khoa học sống 2007, tr 170 -171 Trần Quang Huy, Nguyễn Thị Thường, Nguyễn Thị Thanh Thủy, Phương Đình Tâm, Mai Anh Tuấn Phát axit nucleic vi rút gây bệnh cảm biến sinh học DNA Tạp chí Y học dự phòng, tập XVII, số (91) 2007, tr 57 - 63 M.A Tuan, T Q Huy, N.T.Thuong, L H Hoang, C V Thach, N H Hai DNA Enrichment by Functionalized Magnetic Nanoparticles for On-site and Fast Detection of Virus in Biomedical Application Journal of Korea Physical society (accepted, to be published) II CƠNG TRÌNH KHÁC Nguyễn Duy Bảo, Nguyễn Kim Giao, Trần Quang Huy, Lê Văn Vũ Đánh giá hiệu lọc bụi trang CT-2002 Kính hiển vi điện tử Tạp chí Y học thực hành số 12 (469)/2003, Bộ Y Tế xuất bản, tr 31-33 Hoang Kim Anh, Nguyen Kim Giao, Tran Quang Huy Raw-starch digesting amylase from Aspergilus Kawasaki Proceedings of the 4th ASEAN Microscopy Conference, January 2004, Hanoi, Vietnam, pp 145 –151 Giao Kim Nguyen, Mai Quynh Le, Huy Quang Tran, E Lucio Benedetti, Long Thuy Hoang, Nguyen Thuy Hoang et al Structural and immunocytochemical features of SARS – Associated corona virus growing in continuous vero cell culture Proceedings of ASIA - Pacific Conference on Electron Microscopy (8APEM), June 2004, Kanazawa, Japan, pp 1093 - 1094 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 66 Nguyễn Kim Giao, Nguyễn Minh Liên, Trần Quang Huy, Nguyễn Thị Hồng Hạnh Sự hình thành dịch thể mang độc chất cagA Helicobacter pylori,chủng VNH – 85 Những vấn đề khoa học sống 2004, tr 220 – 223 Trần Quang Huy, Nguyễn Kim Giao, Nguyễn Bich Thủy, Nguyễn Thị Minh Ngọc Ứng dụng phương pháp nhiễu xạ tia X để định loại amiăng có nguy ảnh hưởng đến sức khoẻ Tạp chí Y học dự phịng, 2005, tập XV, số (76), tr 184 – 188 10 Đỗ Thị Thoa, Trần Quang Huy Nghiên cứu siêu cấu trúc vi rút dengue typ tế bào muỗi aedes albopictus dịng C6/36 Tạp chí Y học dự phòng, 2005, tập XV, số (76), tr 46 – 49 11 Nguyễn Thị Minh Liên, Trần Quang Huy, Nguyễn Thanh Thủy Một số đặc trưng siêu cấu trúc vi rút rota tế bào vero tế bào thận khỉ tiên phát Những vấn đề khoa học sống 2005, tr 1285-1287 12 Nguyen Thanh Thuy, Nguyen Thi Minh Lien, Tran Quang Huy, Phan Thi Nga, Kouchi Morita Rapid confirmation of new human pathogen by Protein A gold Immuno - electronmicroscopy (PAG-IEM) method CAS-JSPS Asian Science Seminar 2005, China 13 Trần Quang Huy, Nguyễn Thanh Thuỷ, Nguyễn Thị Minh Liên, Nguyễn Văn Mẫn, I Dunia, E L Benedetti Miễn dịch hiển vi điện tử siêu cấu trúc vi rút rota tế bào Vero tế bào thận khỉ tiên phát Tạp chí Y học dự phòng, tập XVII, số (91) 2007, tr 17 – 22 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 67 TÀI LIỆU THAM KHẢO TÀI IỆU TIẾNG VIỆT Lê Huy Chính, Nguyễn Vũ Trung Cẩm nang vi sinh vật y học Nxb Y học, 2005 Hồ Huỳnh Thùy Dương Sinh học phân tử Nxb Giáo Dục, 2003 Nguyễn Kim Giao Chẩn đoán vi rút gây bệnh người phương pháp Hiển vi điện tử Nxb Y học, 2005 Trần Quang Huy, Nguyễn Thị Thường, Nguyễn Thị Thanh Thủy, Phương Đình Tâm Mai Anh Tuấn Ứng dụng vi cảm biến DNA nghiên cứu y sinh học Tuyển tập cơng trình vấn đề khoa học sống 2007, tr 170 171 Trần Quang Huy, Nguyễn Thị Thường, Nguyễn Thị Thanh Thủy, Phương Đình Tâm Mai Anh Tuấn Phát axit nucleic vi rút gây bệnh cảm biến sinh học DNA Tạp chí Y học dự phịng, tập XVII, số (91) 2007, tr 57 63 Nguyễn Thị Thường Một số đặc điểm họ Herpesviridae gây bệnh người Tạp chí y học dự phịng (2006), số 3+4 (83), trang 54-58 số (84) trang 6467 TÀI LIỆU TIẾNG ANH A.O Scott (Ed.), Biosensors for Food Analysis, The Royal Soc of Chem., Cambridge, UK, 1998 Alcock, S.J and Turner, A.P.F IEEE Engineering in Medicine and Biology, June/July 1994, 319 Antje J Baeumner et al Biosensor for Dengue Virus Detection: Sensitive, Rapid, and Serotype Specific Anal Chem., 74 (6), 2002 , 1442 -1448 10 Bansi D Malhotra et al Prospects of conducting polymers in biosensors Analytica Chimica Acta 578 (2006) 59–74 11 Bobby Pejcic, Roland De Marco Impedance spectroscopy: Over 35 years of electrochemical sensor optimization Electrochimica Acta 51 (2006) 6217– 6229 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 68 12 Carrascosa et al Trac-Trends ; Anal Chemical 25 (3) (2006), 196-206 13 Cass, A.E.G., Francis, D.G., Hill, H.A.O., Aston, W.J., Higgins, I.J., Plotkin, E.V., Scott, L.D.L and Turner, A.P.F Anal Chem 56, (1984), 667-671 14 Claire L Morgan et al Immunosensors : Technology and opportunities in laboratory medicine Clinical Chemistry 42 :2, 1996, 193-209 15 Clark, L.C Jnr Ann NY Acad Sci 102, (1962) 29-45 16 Clark, L.C Jnr Trans Am Soc Artif Intern Organs 2, (1956) 41- 48 17 Clemens, A.H., Chang, P.H and Myers, R.W Proc Journes Ann de Diabtologie de l'Htel-Dieu, Paris (1976) 18 Cooney, C.L., Weaver, J.C et al In: "Enzyme Engineering" (Eds E.K Pye and L.B Wingard Jnr.) 2, Plenum, New York (1974) 411-417 19 Cooper, M.A Optical biosensors in drug discovery Nat Rev Drug Discov 1, (2002) 515–528 20 D C Cullen, R S Sethi, C R Lowe Anal Chim Acta 231, (1990) 33 21 D.E Gunning et al Performance of ultra-high-density microelectrode arrays Nuclear Instruments and Methods in Physics Research A 576 (2007) 215–219 22 Daniel R Thévenot; Klara Toth et al Pure Appl Chem., Vol 71, No 12, (1999) 2333 - 2348, 23 David O White, Frank J.Fenner Medical Virology Academic Press.1994 24 Dennison, M.J and Turner, A.P.F Biotechnol Adv., (1995)13 25 Divis, C Annals of Microbiology 126A, (1975)175-186 26 Frank Lammers, Thomas Scheper Thermal Biosensors in Biotechnology Volume 64/1999, Springer Berlin / Heidelberg, 35 -67 27 Geoffrey C Allen, Fabio Sorbello et al Macro-, micro - and nano investigations on 3-aminopropyltrimethoxysilane self-assembly-monolayers, Thin Solid Films 483 (2005) 306–311 28 Guilbault, G.G and Montalvo, J JACS 91 (1969) 2164-2569 29 Huy.T.Q., Thuy N.T.T., Tam P.D, Tuan M A., and Chien N.D Investigation of electrochemical DNA sensor for biomedical application Proceedings of the 2sd International Conference on Biomedical Engineering 2007, 273 – 278 30 J Catrlik et al Amperometric biosensors based on two different enzyme systems and their use for glycerol determination in samples from biotechnological TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 69 fermentation process Analytica Chimica Acta ,Volume 566, Issue 1, 27 April 2006, Pages 11-18 31 J Justin Gooding et al Biosensor technology for detecting biological warfare agents: Recent progress and future trends Analytica Chimica Acta 559 (2006) 137–151 32 Jeffrey D Newman, Anthony P.F Turner, Home blood glucose biosensors: a commercial perspective Biosensors and Bioelectronics 20 (2005) 2435–2453 33 Jeremy J Ramsden Optical biosensors Journal of Molecular Recognition Volume 10, Issue , Pages 109 – 120 34 K Covington Pure Appl Chem 66 (3), (1994) 565 35 Kress-Rogers, E "Handbook of Biosensors and Electronic Noses: Medicine, Food and the Environment", CRC Press, Boca Raton, USA, 1996 36 L J Blum, P R Coulet Biosensor Principles and Applications Marcel Dekker, New York (1991) 37 Lec, R.M Piezoelectric biosensors: recent advances and applications Proceedings of the 2001 IEEE International Volume , Issue , 2001, 419 – 429 38 Liedberg, B., Nylander, C and Lundstrm, I Sensors and Actuators 4, (1983) 299-304 39 M.A Tuan, T Q Huy, N.T.Thuong, L H Hoang, C V Thach, N H Hai DNA Enrichment by Functionalized Magnetic Nanoparticles for On-site and Fast Detection of Virus in Biomedical Application Journal of Korea Physical society (accepted, to be published) 40 Mosbach, K and Danielsson, B Biochim Biophys Acta 364, 140-145 (1974) 41 Nathalie K Guimard et al Conducting polymers in biomedical engineering Prog Polym Sci 32 (2007) 876–921 42 Olivier Lazcka et al Pathogen detection: A perspective of traditional methods and biosensors Biosensors and Bioelectronics 22 (2007) 1205–1217 43 P Bergveld, D R Thévenot In Advances in Biosensors, Supplement (A P F Turner, ed.), p 31 JAI Press, London, UK (1993) 44 P V Climent et al Development of a new amperometric biosensor based on polyphenoloxidase and polyethersulphone membrane Pure Appl Chem., Vol 73, No 12, 2001, pp 1993–1999 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 70 45 P Van Gerwen, W Laureyn, G Huyberechts, M Op De Beeck, K Baert, A Varlan, W Sansen, L Hermans, R Mertens, Nanoscaled Interdigitated Electrodes For Biochemical Sensors, Sensors and Actuators B, 49 (1-2) (1998) pp 73-80 46 Patolsky, F., Lieber, C.M., Nanowire Nanosensors, Materials Today (2005), 2028 47 Patolsky, F., Zheng, G., Hayden, O., Lakadamyali, M., Zhuang, X., Lieber, C.M., Electrical detection of single viruses, Proc Natl Acad Sci USA (2004), 101, 14017-14022 48 Pinar Kara a, Burcu Meric et al Electrochemical DNA biosensor for the detection and discrimination of herpes simplex Type I and Type II viruses from PCR amplified real samples Analytica Chimica Acta 518 (2004) 69–76 49 R.M.Lec Piezoelectric biosensors: recent advances and applications Proceedings of the 2001 IEEE International Volume , Issue , 2001,419 – 429 50 R Gonzalez , B Masquelier et al Detection of Human Immunodeficiency Virus Type Antiretroviral Resistance Mutations by High-Density DNA Probe Arrays Journal of clinical microbiology (July 2004), p 2907–2912 51 Rich, R.L and Myszka, D.G (2005) Survey of the year 2004 commercial optical biosensor literature J Mol Recognit 18, 431–478; 52 Sara Rodriguez-Mozaz et al Biosensors for environmental applications: Future development trends Pure Appl Chem., Vol 76, No 4, 2004, pp 723–752 53 Sergei V Dzyadevych et al Potentiometric Biosensors Based on ISFETs and Immobilized CholinesterasesVolume 16, Issue 22 , ( 2004) Pages 1873 – 1882 54 Shichiri, M., Kawamori, R., Yamaski, R., Hakai, Y and Abe, H Lancet ii, (1982)1129-1131 55 T Gregory Drummond et al Electrochemical DNA sensors., Nature Biotechnology, 2003, 1192-1199 56 T.A Skotheim, R.L Elsenbaumer, J Reynold, Marcel Dekker Handbook of Conducting Polymers, ed., 2nd Edition, New York, 1998 57 Tarushee Ahuja et al.Biomolecular immobilization on conducting polymers for biosensing applications Biomaterials 28 (2007) 791–805 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 71 58 Turner, A.P.F "Advances in Biosensors", I; II; Suppl I; III JAI Press, London, UK, 1991; 1992; 1993; 1995 59 Updike, S.J and Hicks, J.P Nature 214,(1967) 986-988 60 Voelkl, K.P., Opitz, N and Lubbers, D.W Fres Z Anal Chem 301,(1980) 162-163 61 White, S.F and Turner, A.P.F In: "Encyclopedia of Bioprocess Technology: Fermentation, Biocatalysis and Bioseparation"(Eds M C Flickinger and S W Drew) Wiley, New York, USA, 1997 62 Y Han et al Surface activation of thin silicon oxides by wet cleaning and silanization Thin Solid Films 510 (2006) 175 - 180 63 Y.K Ye., J.H Zhao Electrochemical behavior and detection of hepatitis B virus DNA PCR production at gold electrode Biosensors and Bioelectronics 18 (2003) 1501-1508 64 http://www.mindbranch.com TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 72 PHỤ LỤC Để tiếp tục nghiên cứu phát triển loại vi cảm sinh học biến này, song song với trình chế tạo vi cảm biến, thành viên nhóm nghiên cứu chúng tơi xây dựng phát triển hệ đo cầm tay, có kích thước nhỏ gọn với nhều tính ưu việt nhằm thay hệ Lock in RS830, phù hợp đáp ứng yêu cầu phân tích vi cảm biến mẫu nồng độ thấp vi rút,… Hình hình ảnh vi cảm biến sinh học 20µm x 20µm đo đạc thử nghiệm hệ đo Hình Đo đạc thử nghiệm vi cảm biến hệ đo (thiết bị xách tay) TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com Thank you for evaluating AnyBizSoft PDF Merger! To remove this page, please register your program! Go to Purchase Now>> AnyBizSoft PDF Merger Merge multiple PDF files into one Select page range of PDF to merge Select specific page(s) to merge Extract page(s) from different PDF and merge into one TIEU LUAN files MOI download : skknchat@gmail.com ... tạo hình vật lý mơ tả hình 1.8 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.com 19 Hình 1.8 Mơ hình ứng dụng màng polyme dẫn Polyme dẫn thường tổng hợp lên bề mặt diện tích hiệu dụng cảm biến Các phần. .. hướng phát triển Hình 1.8 Mơ hình ứng dụng màng polyme dẫn 19 Hình 1.9 Cấu trúc lai hóa phân tử DNA 21 Hình 1.10a Ảnh hiển vi điện tử truyền qua vi rút Herpes - nhuộm âm 27 Hình 1.10b Cấu trúc... oxy hóa hay khử sử dụng oxy đồng tác nhân (cofactors) Enzyme sử dụng riêng lẻ cảm biến sinh học xúc tác sử dụng kết hợp hợp với thành phần khác, giống kháng thể đóng vai trị phần tử nhận biết