VAI TRÒ CỦA XÉT NGHIỆM VI SINH TRONG CÔNG TÁC CHẨN ĐOÁN, ĐIỀU TRỊ COVID-19. TS. Trương Thái Phương, Trưởng khoa Vi sinh Bệnh viện Bạch Mai

VAI TRỊ CỦA XÉT NGHIỆM VI SINH TRONG CƠNG TÁC CHẨN ĐOÁN, ĐIỀU TRỊ COVID-19 TS Trương Thái Phương, Trưởng khoa Vi sinh Bệnh viện Bạch Mai Diễn biến bệnh COVID-19 Nat Rev Microbiol 2021 Mar;19(3):141-154 Giai đoạn bệnh, xét nghiệm phát vi rút lây nhiễm SARS-CoV-2 https://www.thelancet.com/journals/lanres/article/PIIS2213-2600(20)30230-7/fulltext 1.Chỉ định xét nghiệm ✓ Các trường hợp nghi ngờ, cần làm xét nghiệm khẳng định nhiễm SARS-CoV-2 + XN: dịch hầu họng, dịch mũi họng + Kỹ thuật Realtime RT-PCR ✓ Khi âm tính nghi ngờ lâm sàng + XN: dịch hút phế quản/dịch rửa phế quản/rửa phế nang + Kỹ thuật Realtime RT-PCR 1.Chỉ định xét nghiệm ✓ Không dùng xét nghiệm phát kháng thể kháng SARS-CoV-2 để chẩn đoán mắc COVID-19 ✓ Xét nghiệm kháng nguyên SARS-CoV-2 để phát kháng nguyên virut khẳng định nhiễm SARS-CoV-2 kỹ thuật Realtime RT-PCR 1.Chỉ định xét nghiệm ✓ Cấy máu nghi ngờ có nhiễm trùng huyết ✓ Cấy bệnh phẩm đường hô nghi ngờ có nhiễm khuẩn bội nhiễm ✓ Ngồi bệnh phẩm khác (nước tiểu, mủ, phân, dịch khoang vô trùng, dịch dẫn lưu …) cần xác định nguyên vi khuẩn, nấm có dấu gợi ý nhiễm khuẩn kèm theo Xét nghiệm chẩn đoán nguyên Xét nghiệm Realtime RT-PCR ▪ Phát vật liệu di truyền virus ▪ Loại BP: dịch tỵ hầu, mẫu phết họng, dịch hút phế quản… ▪ Là xét nghiệm khẳng định có độ nhạy độ đặc hiệu cao Xét nghiệm nhanh phát kháng nguyên (RDT) ▪ Phát protein bề mặt virus ▪ Loại BP: ngoáy dịch tỵ hầu, mẫu ngoáy dịch họng, mẫu nước bọt ▪ Là xét nghiệm tầm soát nên cần thực xét nghiệm PCR để khẳng định chẩn đoán ▪ Là xét nghiệm nhanh, dễ sử dụng, kết âm tính, dương tính giả Xét nghiệm nhanh phát kháng nguyên (RDT) ✓ Phát protein bề mặt virus SARS-CoV-2 ✓ Ag-RDTs phát trực tiếp kháng nguyên SARS-CoV-2, thường nucleocapsid, tạo vi rút chép dịch tiết đường hơ hấp ✓ Hữu ích để phát nhiễm COVID-19 hoạt động Có thể xác định tình trạng nhiễm trùng cấp Xét nghiệm nhanh phát kháng nguyên (RDT) • Mẫu bệnh phẩm: dịch tỵ hầu/dịch hầu họng Dương tính: Phát kháng nguyên ➢ Đang nhiễm SARS-CoV-2, tải lượng virus cao dễ lây nhiễm KĐ Chẩn đốn RT-PCR Âm tính: Khơng phát kháng ngun ➢ Nếu BN khơng có triệu chứng/nguy cơ: chưa có chứng nhiễm ➢ Nếu BN có triệu chứng/nguy cơ: khẳng định lại RTPCR ▪ RDT xét nghiệm nhanh, dễ sử dụng ▪ Độ xác Ag-RDTs phụ thuộc vào số yếu tố, thời gian kể từ bắt đầu nhiễm bệnh, nồng độ vi rút mẫu bệnh phẩm, chất lượng trình xử lý mẫu thu thập, sinh phẩm xét nghiệm Xét nghiệm nhanh phát kháng nguyên (RDT) • Ag-RDT COVID-19 dương tính tải lượng vi rút cao BN dễ lây nhiễm - thường 1−3 ngày trước bắt đầu triệu chứng • 5−7 ngày sau bắt đầu triệu chứng • Âm tính bệnh nhân hết nhiễm trùng hồi phục • Khi tải lượng vi rút thấp, giảm xuống giới hạn phát xét nghiệm, Ag-RDT âm tính Do đó, Ag-RDT âm tính khơng thể loại trừ hồn tồn trường hợp nhiễm COVID-19 hoạt động Xét nghiệm khẳng định sử dụng NAAT (PCR) thực có thể, đặc biệt bệnh nhân có triệu chứng • Tuy nhiên, Ag-RDT dương tính tiếp xúc khơng có triệu chứng hữu ích cho việc mở rộng nhanh chóng nỗ lực truy tìm tiếp xúc Kết cho thấy nhiễm SARS-CoV2 hoạt động sử dụng nơi tỷ lệ nhiễm SARS-CoV-2 cao 10 Chẩn đoán nhiễm virus SARS-CoV-2 ✓ Chẩn đoán xác định: Bệnh nhân có xét nghiệm Realtime RT-PCR SARS-CoV-2 dương tính ✓ Chẩn đốn phân biệt: ➢ Cần chẩn đốn phân biệt với viêm đường hô hấp cấp tác nhân hay gặp khác: + Virus cúm mùa (A/H3N2, A/H1N1, B), virus cúm, virus hợp bào hô hấp (RSV), rhinovirus, myxovirrus, adenovirus + Hội chứng cảm cúm chủng coronavirus thông thường + Mycoplasma pneumonia … + cúm gia cầm A/H5N1, A/H7N9, A/H5N6; SARS-CoV MERS-CoV ➢ Cần chẩn đốn phân biệt tình trạng nặng người bệnh (suy hô hấp, suy chức quan ) các nguyên nhân khác tình trạng nặng bệnh lý mạn tính kèm theo 11 Tiêu chuẩn xuất viện Người bệnh xuất viện có đủ tiêu chuẩn sau - Đối với trường hợp khơng có triệu chứng lâm sàng suốt thời gian điều trị viện khi: - Đã cách ly điều trị sở thu dung, điều trị COVID-19 tối thiểu 10 ngày có kết xét nghiệm phương pháp real-time RT-PCR âm tính với SARS-CoV-2 nồng độ vi rút thấp (Ct ≥ 30) vào ngày thứ Tiêu chuẩn xuất viện Người bệnh xuất viện có đủ tiêu chuẩn sau - Đối với trường hợp có triệu chứng lâm sàng viện đủ điều kiện sau: + Được cách ly điều trị sở thu dung, điều trị COVID-19 tối thiểu 14 ngày; + Các triệu chứng lâm sàng hết trước ngày viện từ ngày trở lên; + Có kết xét nghiệm phương pháp real-time RT-PCR âm tính với SARSCoV-2 nồng độ vi rút thấp (Ct ≥ 30) vào trước ngày viện Ví dụ, bệnh nhân có triệu chứng hai ngày, bệnh nhân xuất viện sau 10 ngày + = 13 ngày kể từ ngày khởi phát triệu chứng; Đối với bệnh nhân có triệu chứng 14 ngày, bệnh nhân xuất viện (14 ngày + ngày =) 17 ngày sau ngày khởi phát triệu chứng; bệnh nhân có triệu chứng 30 ngày, bệnh nhân xuất viện (30 + =) 33 ngày sau xuất hiện/có triệu chứng Tiêu chuẩn xuất viện Người bệnh xuất viện có đủ tiêu chuẩn sau - Đối với trường hợp cách ly điều trị 10 ngày (bệnh nhân nặng), viện đủ điều kiện sau: + Đã cách ly điều trị sở thu dung, điều trị COVID-19 đủ 21 ngày tính từ ngày có kết xét nghiệm dương tính với vi rút SARS-CoV-2; + Các triệu chứng lâm sàng hết trước ngày viện từ ngày trở lên Những bệnh nhân khỏi bệnh sau COVID-19 tiếp tục có RNA SARS-CoV-2 phát mẫu bệnh phẩm đường hô hấp tối đa tháng sau phát bệnh với nồng độ thấp đáng kể so với bị bệnh; Tuy nhiên, khả chép vi rút không phục hồi cách đáng tin cậy khơng có khả lây nhiễm Các nghiên cứu khơng tìm thấy chứng cho thấy người trưởng thành phục hồi lâm sàng với tồn RNA vi rút truyền SARS-CoV-2 cho người khác Tiêu chuẩn xuất viện Theo dõi sau viện - Thông báo cho Y tế sở CDC địa phương biết phối hợp - Người bệnh sau viện cần nhà tự theo dõi ngày Đo thân nhiệt lần/ngày Nếu thân nhiệt cao 38oC hai lần đo liên tiếp có dấu hiệu lâm sàng bất thường cần báo cho y tế sở để thăm khám xử trí kịp thời - Tuân thủ thông điệp 5K * Đối với người bệnh viện thuộc trường hợp cách ly điều trị 10 ngày có kết xét nghiệm phương pháp real-time RT-PCR nhiều lần có nồng độ vi rút Ct < 30 + Sau viện yêu cầu người bệnh thực cách ly y tế nhà ngày Đo thân nhiệt lần/ngày + Nếu thân nhiệt cao 38oC hai lần đo liên tiếp có dấu hiệu lâm sàng bất thường cần báo cho y tế sở để thăm khám xử trí kịp thời • Tài liệu tham khảo: • (https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/if-you-are-sick/quarantine.html https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/vaccines/fully-vaccinated.html) • https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/science/science-briefs/scientific-briefoptions-to-reduce-quarantine.html • https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.07.24.20161281v2 • https://www.thelancet.com/journals/lanpub/article/PIIS2468-2667(20)30308-X/fulltext • https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33414470/ • https://www.who.int/news-room/commentaries/detail/criteria-for-releasing-covid-19patients-from-isolation • World Health Organization Clinical management of COVID-19 (Interim Guidance) https://www.who.int/publications-detail/clinical-management-of-covid-19, published 25 Jan 2021 16 XIN TRÂN TRỌNG CẢM ƠN! ... Tiêu chuẩn xuất vi? ??n Người bệnh xuất vi? ??n có đủ tiêu chuẩn sau - Đối với trường hợp có triệu chứng lâm sàng vi? ??n đủ điều kiện sau: + Được cách ly điều trị sở thu dung, điều trị COVID-19 tối thiểu... suốt thời gian điều trị vi? ??n khi: - Đã cách ly điều trị sở thu dung, điều trị COVID-19 tối thiểu 10 ngày có kết xét nghiệm phương pháp real-time RT-PCR âm tính với SARS-CoV-2 nồng độ vi rút thấp... 30 ngày, bệnh nhân xuất vi? ??n (30 + =) 33 ngày sau xuất hiện/có triệu chứng Tiêu chuẩn xuất vi? ??n Người bệnh xuất vi? ??n có đủ tiêu chuẩn sau - Đối với trường hợp cách ly điều trị 10 ngày (bệnh nhân