Quy trình kiểm toán áp dụng ở hai công ty đều gồm 3 giai đoạn tuân theo quy trình kiểm toán mà Công ty đã đề ra: chuẩn bị kiểm toán, thực hiện kiểm toán, kết thúc kiểm toán. Tuy nhiên do hai công ty khác nhau về loại hình kinh doanh nên trong quá trình thực hiện kiểm toán cũng có những bước thực hiện khác nhau.
Trong giai đoạn chuẩn bị kiểm toán:
Công ty XYZ là khách hàng mới của Công ty nên trong giai đoạn chuẩn bị kiểm toán, kiểm toán viên tìm hiểu kỹ về tổ chức bộ máy quản lý của Công ty, từ đó đánh giá sơ bộ về hiệu quả hoạt động của hệ thống kiểm soát nội bộ nhằm đánh giá rủi ro kiểm soát.
Công ty là:
0,5% - 1% tính trên tổng giá trị tài sản. 5% - 10% tính trên tổng doanh thu
Tuy nhiên do doanh thu và tổng tài sản của hai Công ty là khác nhau do vậy mức trọng yếu được xác định cũng khác nhau. Từ đó số lượng nghiệp vụ phải kiểm tra chi tiết cũng khác nhau.
Công ty ABC tỷ lệ xác định là 7% doanh thu, 0,5% tổng giá trị tài sản Công ty XYZ tỷ lệ xác định là 5% doanh thu, 0,7% tổng giá trị tài sản.
Trong giai đoạn thực hiện kiểm toán:
Công ty ABC
Kiểm toán viên phải gửi và kiểm soát quá trình gửi thư xác nhận do có một khoản phải thu khách hàng C với số tiền là 69.780.000 cuối kỳ chưa được xác nhận.
Có một nghiệp vụ bán hàng của niên độ kế toán sau được hạch toán vào năm 2007 với số tiền là 50.000.000. Cơ sở dẫn liệu ảnh hưởng là tính đúng kỳ và tính hiện hữu. Kiểm toán điều chỉnh giảm doanh thu, giảm thuế GTGT đầu ra, giảm khoản phải thu khách hàng, giảm giá vốn hàng bán, tăng hàng hoá.
Công ty XYZ có các khoản phải thu dài hạn do đó kiểm toán phải kiểm tra
bảng kê chi tiết các khoản phải thu dài hạn, tìm hiểu quy định của Công ty về các khoản phải thu dài hạn và kiểm tra 100% nghiệp vụ phát sinh.
Trong giai đoạn kết thúc kiểm toán
Công ty XYZ là Công ty sản xuất còn Công ty ABC là Công ty thương mại nên kiểm toán viên phải phối hợp với kiểm toán viên làm những khoản mục khác, lập bảng tổng hợp chi phí sản xuất của Công ty XYZ để kiểm tra tính hợp lý của doanh thu.
Nhìn chung quy trình kiểm toán áp dụng cho cả hai Công ty được kiểm toán viên thực hiện chặt chẽ, linh hoạt, tuân theo chương trình kiểm toán chung của Công ty.