Thứ nhất, Cụng ty chưa có được những kế hoạch mang tớnh chiến lược và lõu dài cho hoạt đụ̣ng xuất khẩu gạo. Cỏc kế hoạch chủ yếu là đưa từ trờn xuống cỏc phũng mà khụng có những định hướng vờ̀ thị trường. Cú thể núi, cụng ty đó xõy dựng cho mỡnh được nguồn hàng ổn định, phong phỳ, nguồn hàng được thu mua chủ yếu từ cỏc nhà buụn, cỏc đại lý và cỏc vựng nguyờn liệu khỏc nhau nờn việc thu gom hàng cũn lẻ tẻ khiến chất lượng hàng khụng đồng đều, thiếu đồng bộ. Trong khi hàng gạo xuất khẩu sang cỏc thị trường nước ngoài đặc biệt là cỏc thị trường khú tớnh đũi hỏi cao về chất lượng, về cỏc tiờu chuẩn kỹ thuật…Mặt khỏc, sản lượng xuất khẩu gạo ảnh hưởng nhiều bởi điều kiện tự nhiờn như mất mựa do hạn hỏn, lũ lụt, việc chưa cú vựng nguyờn liệu khiến cụng ty bị động trong việc thu mua hàng nờn sản lượng xuất khẩu khú ổn định.
Thứ hai, Hoạt đụ̣ng nghiờn cứu và dự bỏo thị trường chưa được đầu tư tương xứng với tiờ̀m năng của cụng ty
Cụng ty chưa cú phũng marketing riờng biệt nờn cụng tỏc dự bỏo cũn dựa vào cỏc dự bỏo chung của cỏc tổ chức kinh tế trong và ngoài nước. Thị trường luụn cú nhiều biến động khú lường, hoạt động nghiờn cứu và dự bỏo thị trường sẽ giỳp cụng ty giảm thiểu được nhiều rủi ro vỡ vậy cụng tỏc nghiờn cứu và dự bỏo thị trường rất quan trọng và cần đầu tư vốn lớn. Trong thời gian tới cụng ty cần đầu tư vốn mở phũng ban, nhằm quảng cỏo giới thiệu sản phẩm của mỡnh ra rộng cỏc thị trường trong và ngoài nước. Như thế cụng ty sẽ sớm vươn tới một tầm cao mới, trở thành một cụng ty xuất khẩu hàng nụng sản lớn tại Việt Nam.
Thứ ba, cụng ty chưa quan tõm đầu tư đến viợ̀c xõy dựng cỏc cơ sở chế biến gạo
Do cụng ty Thiờn Phỳc chưa chỳ trọng mạnh đến quỏ trỡnh xõy dựng cỏc cơ sở chế biến gạo nờn năng suất xuất khẩu gạo cũn ở mức hạn chế, chất lương gạo khụng cao, chủ yếu ở dạng thụ. Sản phẩm qua chế biến hoặc mới qua sơ chế nờn giỏ cả xuất khẩu gạo của cụng ty cũn thấp, thiếu tớnh cạnh tranh trờn thị trường trong và ngoài nước. Do hiện tại cụng ty chưa chỳ trọng đến đổi mới cụng nghệ, chưa đưa ra được cỏc chiến lược xõy dựng cơ sở chế biến gạo. Để nõng cao chất lượng sản phẩm, trong thời gian tới cụng ty nờn xõy dựng thương hiệu sản phẩm cần xõy dựng cỏc cơ sở chế biến, ỏp dụng cụng nghệ cao chế biến gạo, chế biến thành sản phẩm đúng gúi xuất khẩu cú thờ dựng ngay.
Thứ tư, Trong khi đang thiếu thị trường thỡ lại mất khỏch hàng do khụng cú khả năng đỏp ứng được những đơn đặt hàng lớn trong khoảng thời gian ngắn. Nguyờn nhõn của tỡnh trạng này là do Cụng ty cũn thiếu sự liờn kết với cỏc doanh nghiệp xuất khẩu gạo lớn. Cụng ty cần cải thiện ngay cỏc quan hệ với cỏc doanh nghiệp xuất khẩu gạo hàng đầu Việt Nam, từ đú học hỏi và cải thiện mở rộng thị trường thụng qua quan hệ với cỏc doanh nghiệp.
Thứ năm, Cỏc chớnh sỏch về quản lý xuất nhập khẩu, cỏc chớnh sỏch về thuế, hải quan, chớnh sỏch khuyến khớch đầu tư cũn chưa minh bạch, rừ ràng làm cho hoạt động sản xuất kinh doanh của Cụng ty cũn nhiều bị động, khú khăn phỏt sinh thờm nhiều chi phớ. Đặc biệt là luật thuế xuất nhập khẩu mới từ năm 2006 và biện phỏp tham vấn giỏ gõy rất nhiều khú khăn cho hoạt động xuất nhập khẩu của Cụng ty, vừa mất thờm thời gian, cụng sức vừa tăng thờm chi phớ, gõy bức xỳc cho cả cỏn bộ trong Cụng ty và khỏch hàng.
Thứ sỏu, Mặc dự Cụng ty đó cố gắng trong cụng tỏc đào tạo nhưng đội ngũ cỏn bộ vẫn thiếu kinh nghiệm và chưa chuyờn sõu và hầu như chưa đỏp ứng được nhu cầu đũi hỏi của cụng việc.