Do tính chất đặc thù của ngành, NHTMCPQĐ có một địa bàn hoạt động rất rộng lớn. Kéo dài từ Bắc vào Nam, từ các vùng núi cao, Tây nguyên đến các hải
đảo xa xôi, cứ đâu có các doanh nghiệp quân đội hoạt động là ở đó có mặt của ngân hàng nhằm đáp ứng kịp thời nhu cầu về vốn và thúc đẩy sự phát triển của loại hình doanh nghiệp này. Vì hoạt động trên một địa bàn rộng lớn như vậy, NHTMCPQĐ có những khó khăn, thuận lợi nhất định. Do mỗi khu vực, mỗi vùng hoạt động có những điều kiện kinh tế xã hội khác nhau nên có những tác động trực tiếp đến hoạt động huy động và cho vay của Ngân hàng, có những vùng, những khu vực có khả năng rất lớn trong việc huy động vốn nhưng lại không thể cho vay vì nhu cầu về vốn ở khu vực đó rất thấp, ngược lại có những vùng, những khu vực nhu cầu vay vốn rất cao nhưng khả năng huy động vốn lại không đáp ứng được. Xuất phát từ thực tế đó nên chăng NHTMCPQĐ thành lập riêng cho mình một quỹ điều hoà vốn nội bộ nhằm phát huy lợi thế, mà không phải ngân hàng nào cũng có được, đồng thời khắc phục những khó khăn về tình trạng huy động và cho vay không ổn định giữa các chi nhánh trong nội bộ hệ thống. Tuy nhiên, để tránh tình trạng các chi nhánh có khả năng huy động vốn lớn nhưng việc cho vay hạn chế, bị thiệt thòi do chi phí huy động cao nhưng thu nhập từ lãi vay thấp. Trung tâm điều hoà vốn nội bộ nên áp dụng một mức lãi suất nhất định (ít nhất là cũng phải đủ để bù đắp các khoản chi phí của việc huy động), đối với các chi nhánh có vốn dư thừa chuyển về Trung tâm. Các khoản chi phí này sẽ do các chi nhánh có nhu cầu điều động vốn từ trung tâm gánh chịu. Làm được như vậy sẽ không những khắc phục tình trạng dư thừa, thiếu hụt vốn giữa các chi nhánh trong nội bộ hệ thống ngân hàng mà còn thúc đẩy sự phát triển chung, đặc biệt là trong tương lai, khi phải cạnh tranh với các ngân hàng lớn thì hoạt động của trung tâm này sẽ thúc đẩy qúa trình tích tụ, tập trung vốn một cách nhanh chóng, chi phí thấp, giúp cho Ngân hàng có đủ khả năng tham gia vào các dự án lớn hoặc các cơ hội kinh doanh có khả năng sinh lời cao.