Mỗi CTCK có liên kết với Ngân hàng để thực hiện thanh toán chứng khoán sẽ có hai tài khoản tiền gửi tại một chi nhánh nào đó của Ngân hàng:
- Một tài khoản CA dùng để quản lý và hạch toán các giao dịch mua/bán chứng khoán của các Nhà đầu tư tại CTCK.
- Một tài khoản TA dùng để quản lý và hạch toán các giao dịch mua/bán chứng khoán của CTCK trong hoạt động kinh doanh và các giao dịch liên quan khác của chính CTCK (Tài khoản tự doanh).
Tài khoản thứ nhất sẽ được sẽ được khai báo cùng với thông tin về CTCK trên hệ thống kết nối thanh toán, tài khoản thứ hai cũng sẽ được khai báo nhưng với tính chất như tài khoản của nhà đầu tư thông thường.
Vì Ngân hàng sẽ quản lý tiền đầu tư chứng khoán của các nhà đầu tư nên mỗi nhà đầu tư phải được mở một tài khoản tiền gửi tại một chi nhánh nào đó của ngân hàng. Tài khoản này cũng là tài khoản Trading Account và sẽ được gắn kết với tài khoản hoạt động chứng khoán của nhà đầu tư tại CTCK thông qua hệ thống kết nối thanh toán.
Sau khi nhà đầu tư đã có TK tiền gửi tại Ngân hàng, Ngân hàng sẽ phải khai báo tài khoản này cùng với tài khoản mua bán chứng khoán trên hệ thống kết nối thanh toán. Với các nhà đầu tư đang có số dư trong tài khoản hoạt động chứng khoán thì số tiền đó sẽ được chuyển sang tài khoản TA tại Ngân hàng thông qua lệnh chuyển tiền từ tài khoản CA của CTCK sang tài khoản TA của nhà đầu tư và lệnh này được thực hiện thông qua hệ thống CoreBanking của Ngân hàng.
Khi một nhà đầu tư đặt lệnh mua chứng khoán, CTCK sẽ phải gửi lệnh vấn tin tài khoản TA của nhà đầu tư tới hệ thống kết nối thanh toán để xem số dư khả dụng của tài khoản có đủ để thực hiện giao dịch không. Nếu số dư đủ để thực hiện giao dịch, CTCK sẽ tiếp tục gửi lệnh phong toả tài khoản TA của nhà đầu tư với số tiền bằng số tiền mua chứng khoán cộng phí giao dịch. Sau khi có kết quả khớp lệnh, nếu lệnh mua của nhà đầu tư không được khớp, CTCK sẽ gửi lệnh giải phong toả số tiền đã phong toả tài khoản TA của khách hàng trước đó sang hệ thống kết nối. Trường hợp toàn bộ lệnh bán của nhà đầu tư được khớp, CTCK sẽ gửi lệnh tới hệ thống kết nối để chuyển toàn bộ số tiền đã phong toả trước đó sang tài khoản CA hạch toán các giao dịch mua bán chứng khoán của CTCK. Nếu chỉ khớp lệnh một phần, CTCK sẽ gửi lệnh chuyển một phần số tiền đã phong toả trước đó sang tài khoản CA của CTCK, số tiền này bằng tổng số tiền mua lượng chứng khoán được khớp và phí tương ứng, số tiền còn lại trong tổng số tiền đã phong toả sẽ được giải phong toả.
Khi nhà đầu tư đặt lệnh bán chứng khoán, đến khi có kết quả khớp lệnh, vào ngày T+3, CTCK sẽ gửi lệnh chuyển tiền (với số tiền bằng số tiền bán chứng khoán khớp được cộng số tiền phí giao dịch) từ tài khoản CA của CTCK sang tài khoản TA của nhà đầu tư.
nhà đầu tư phải được CTCK chấp thuận, sau đó CTCK sẽ gửi tới hệ thống kết nối thanh toán lệnh chuyển tiền từ tài khoản CA của CTCK sang tài khoản TA của nhà đầu tư, sau đó nhà đầu tư sẽ rút tiền tại Ngân hàng thông qua hệ thống CoreBanking.
Cuối mỗi ngày giao dịch, sau khi hệ thống đã thực hiện hết các giao dịch phát sinh trong ngày về hoạt động thanh toán chứng khoán, CTCK và chi nhánh Ngân hàng sẽ gửi lệnh tới hệ thống kết nối để lấy về các bảng liệt kê giao dịch mua bán chứng khoán hoặc lấy về các sao kê chi tiết tài khoản CA của Công ty chứng khoán, tài khoản chuyên dùng (TA) của nhà đầu tư nhằm đối chiếu với các chứng từ giao dịch trong ngày.