Như đã đề cập ở phần trên, trong những năm vừa qua, trong hoạt động huy động vốn Sở giao dịch đã tồn tại một số vướng mắc, khó khăn, vậy những điểm hạn chế đấy là do những nguyên nhân nào gây ra, qua sự phân chia một cách tương đối thì chúng ta có thể chia ra hai nhóm nguyên nhân đó là
-Các nguyên nhân mang tính khách quan:
+ Môi trường kinh tế xã hội còn tiềm ẩn nhiều bất ổn. Nền kinh tế nước ta phát triển trong bối cảnh nền kinh tế toàn cầu tăng trưởng ở mức thấp, thị trường tài chính, tiền tệ quốc tế có nhiều biến động phức tạp, đầu tư nước ngoài giảm sút. Nền kinh tế nước ta tăng trưởng chưa thật ổn định, tốc độ tăng trưởng kim ngạch xuất khẩu chưa cao, có nhiều mặt hàng có kim nghạch xuất khẩu bị giảm xút. Bên cạnh đó thì giá vàng và thị trường bất động sản biến động mạnh, trong khi đó thì hoạt động đầu tư trong nước còn nhiều hạn chế. Những yếu tố đó làm hạn chế việc mở rộng thị trường tín dụng bởi các doanh nghiệp gặp nhiều khó khăn trong kinh doanh. Thị trường tín dụng không được mở rộng làm hạn chế đến hoạt động huy động vốn. Hơn nữa tình hình kinh tế như vậy còn tác động đến tâm lý ngưòi dân, họ sẽ e dè khi gửi tiền và thường chọn gửi tiền với các kỳ hạn ngắn làm cản trở đến hoạt động huy động vốn của ngân hàng.
+Việc huy động vốn còn gặp khó khăn khi thu nhập và tích luỹ của dân cư nhìn chung còn chưa cao.
+ Loại hình huy động chưa đáp ứng được nhu cầu ngày càng đa dạng của người dân.
+Cạnh tranh giữa các Ngân hàng thương mại trên địa bàn Hà Nội ngày càng gay gắt, đặc biệt là cạnh tranh về lãi suất, cạnh tranh về thị phần cho vay đối với khách hàng có uy tín. Lãi suất huy động vốn nội tệ có xu hướng liên tục tăng làm tăng chi phí trong hoạt động huy động vốn của Sở giao dịch .
+Lãi suất ngoại tệ USD trên thị trường tiền tệ quốc tế duy trì ở mức thấp gây khó khăn cho công tác huy động vốn ngoại tệ, USD trong một số thời điểm vừa giảm lợi nhuận của nguồn vốn đầu cơ ra nước ngoài, ảnh hưởng đến tình hình tài chính của toàn hệ thống NHNo&PTNT Việt nam +Thị trường tài chính, tiền tệ của nước ta chưa thật sự phát triển, tính thanh khoản của các tín phiếu, trái phiếu của ngân hàng phát hành chưa cao, do đó ít thu hút được sự quan tâm của dân chúng.
+Môi trường pháp lý còn một số điểm thiếu đồng bộ, thống nhất, đôi khi luật các tổ chức tín dụng và luật Ngân hàng Nhà nước còn tồn tại một số mâu thuẫn trong việc thực hiện. Sự điều chỉnh, sửa đổi luật pháp đôi khi gây ra những khó khăn trong hoạt động kinh doanh nói chung và hoạt động huy động vốn nói riêng.