Bên cạnh những điểm mạnh nói trên, công tác kế toán của công ty còn một số tồn tại như sau:
3.1.2.1. Thứ nhất: về hạch toán hàng gửi đi bán
Hiện nay công ty có nghiệp vụ bán buôn cho các đại lý, là một khâu rất quan trọng trong công tác bán hàng của công ty nhưng kế toán công ty không sử dụng TK 157 - Hàng gửi bán nên kế toán không theo dõi được trị giá hàng gửi đi bán.
3.1.2.2. Thứ hai: Về hệ thống sổ kế toán công ty áp dụng.
Hiện nay công ty không mở tài khoản cấp hai và sổ chi tiết cho TK 641, 642, làm kế toán khó theo dõi và quản lý từng khoản mục chi phí bán hàng và chi phí quản lý doanh nghiệp giúp công ty đưa ra các biện pháp quản lý chi phí hữu hiệu.
3.1.2.3. Thứ ba: Về việc lập khoản dự phòng phải thu khó đòi
Do đặc điểm kinh doanh của công ty có một số lượng khách hàng mua theo phương thức trả chậm, trả góp và nợ tiền hàng là khá lớn nhưng công ty không tiến hành trích khoản dự phòng phải thu khó đòi, điều này ảnh hưởng không nhỏ đến kết quả bán hàng và quyền lợi về mặt tài chính của công ty. Vì nếu vịêc không thu hồi được các khoản thu khó đòi sẽ làm nguy cơ làm giảm
lợi nhuận và mất vốn của công ty.
3.1.2.4. Thứ tư: Về hạch toán và phân bổ chi phí thu mua trong hàng hoá bán ra trong kỳ.
Hiện nay công ty chưa thực hiện hạch toán và phân bổ chi phí thu mua trong hàng hoá bán ra trong kỳ, nên việc hạch toán giá vốn hàng bán của công ty chưa thực sự chính xác.
3.2.1.5. Thứ năm: Về kế toán các khoản giảm trừ doanh thu
Hiện nay công ty đang hạch toán các khoản giảm giá hàng bán và triết khấu thương mại theo thoả thuận miệng với khách hàng và không phản ánh vào hợp đồng cũng như không hạch toán nên không phản ánh đúng thực trạng của doanh thu bán hàng.
3.1.2.6. Thứ sáu: Về xác định kết quả bán hàng cho từng mặt hàng.
Công ty vẫn chưa thực hiện về phân bổ các khoản mục chi phí cho từng loại mặt hàng, vì vậy không xác định được kết quả tiêu thụ của từng mặt hàng để từ đó xác định kế hoạch kinh doanh phù hợp. Do đó xác định kết quả bán hàng cho từng mặt hàng công ty phải mở sổ chi tiết bán hàng để theo dõi doanh thu, chi phí bán hàng của từng loại hàng hoá.