Công tác quản lý đóng vai trò quan trọng trong hoạt động du lịch. Công tác này đảm bảo cho sự đúng đắn, thông suốt và hiệu quả của hoạt động du lịch. Việc hoàn thiện cơ cấu tổ chức quản lý sẽ quy định rất nhiều tới việc khai thác các giá trị phục vụ du lịch và việc bảo tồn, giữ gìn các di tắch. Đây là một công việc đòi hỏi sự quy hoạch chi tiết, khi công tác này bị lơi lỏng và không đi đúng hướng sẽ để lại hậu quả rất lớn khiến cho di tắch này bị mất đi giá trị, bản sắc vốn có và không còn sức hút đối với du khách. Một điểm du lịch cần được phát triển theo hướng bền vững. Song nó thực sự bền vững hay không phụ thuộc rất nhiều vào công tác quản lý. Với vị trắ và vai trò như vậy, công tác quản lý cần được đặt lên hàng đầu và luôn hoạt động có hiệu quả trong công tác tổ chức quản lý, ở đây cần có những biện pháp hợp lý và cụ thể.
Chùa Ba Vàng hiện nay là một công trình chưa hoàn thiện, một số hạng mục vẫn đang trong quá trình xây dựng, vì thế bộ máy cơ cấu tổ chức quản lý chưa thực sự hiệu quả. Hy vọng rằng khi đã hoàn tất về nội dung công trình kiến trúc thì di tắch chùa Ba Vàng sẽ có một cơ cấu hoạt động quản lý hoàn thiện hơn để điều hành một cách hiệu quả. Mặc dù mới được xây dựng nhưng chùa Ba
trong công tác nghiên cứu, lịch sử, kiến trúc, tôn giáo. Do vậy, không thể xem nhẹ công tác quản lý khiến di tắch bị mai một đối với tác động của thời gian và chắnh con người.