b ng hình đ c qui đnh là các marker TG800, TG700, TG480, TG420, TG200 (Hình 2.12).
Hình 2.11. K t qu đi n di s n ph m PCR các isolate Phytophthora capsici t h tiêu s d ng GT primer
L 1 2 3 4 5 6 7 8 9
39
Hình 2.12. K t qu đi n di s n ph m PCR các isolate Phytophthora capsici t h tiêu s d ng TG primer
S n ph m khuy t đ i PCR thu đ c v i c 6 primer cho th y RAMS có th phát hi n s đa hình c a Phytophthora capsici. Hantula et al. (2000) đã thành công trong vi c nghiên c u đa d ng di truy n qu n th P. cactorum t các cây tr ng khác nhau v i k thu t RAMS. Nghiên c u c a chúng tôi kh ng đnh s đa d ng di truy n qu n th P. capsici t h tiêu t Qu ng Tr n i t n t i c hai th đ i ngh ch A1 và A2. RAMS là k thu t có giá tr đ phân tích đa d ng di truy n vi sinh v t, nó c ng đã cho th y đáng tin c y đ nghiên c u đa d ng di truy n qu n th P. capsici. K thu t RAMS không quá
ph c t p và giá thành có th ch p nh n đ c trong đi u ki n kinh t n c ta. V n đ h n ch c a RAMS là không phân bi t đ c quan h di truy n gi a các isolate Phytophthora
capsici có ki u giao ph i khác bi t A1 và A2.
6.7. K t qu phân tích UPGMA
Nhìn chung, qu n th P. capsici t h tiêu là đ ng nh t v di truy n v i 112 isolate thu c vào m t dòng vô tính, ngoài tr 6 isolate là có khác bi t v di truy n. Cây ph h đ c trình bày hình 2.13. Phân tích nhóm UPGMA ch ra r ng t t c các isolate đ c x p vào trong 2 nhóm v i ch s t ng đ ng DICE là 54%. S đa d ng di truy n
500bp
40
c a qu n th P. capsici t Qu ng Tr c ng c gi thuy t v kh n ng sinh s n h u tính c a qu n th P. capsici có th x y ra trên đ ng ru ng Qu ng Tr nói riêng và Vi t Nam nói chung. i u này gây ra nhi u khó kh n trong vi c qu n lý b nh th i g c r h tiêu Qu ng Tr và Vi t Nam. Vì v y, vi c ng n ch n cây, v t li u và đ t nhi m b nh phát tán qua l i gi a các vùng là đi u c n làm đ h n ch s phân b r ng rãi v di truy n.
DICE Similarity Coefficient
0.50 0.63 0.75 0.88 1.00 5-100 58-1 58-2 58-3 58-4 25-138 25-136 25-132 25-122 25-120 25-114 25-113 25-111 25-110 25-109 25-107 25-104 25-103 25-102 25-101 25-100 25-99 25-98 25-97 25-96 25-95 25-94 25-93 25-92 25-84 25-82 25-81 25-78 25-75 25-74 25-71 25-64 25-63 25-62 25-61 25-60 25-59 25-58 25-53 25-51 25-49 25-45 25-41 25-40 25-39 58-5 25-37 25-32 58-6 25-20 25-19 25-17 25-15 25-12 25-10 25-9 25-8 25-6 25-4 25-1 39-33 39-32 39-31 39-30 39-29 39-28 39-27 39-26 39-25 39-24 43-1 39-22 39-21 39-20 39-19 39-18 39-17 39-16 39-15 39-14 43-2 39-12 39-11 39-10 39-9 39-8 39-7 39-6 39-5 39-4 39-3 39-2 39-1 43-18 43-17 43-16 43-15 43-14 43-13 43-12 43-11 43-3 43-9 43-8 43-7 43-6 43-5 43-4 25-28 43-10 39-13 39-23 25-38 25-147
41
PH N 3: K T LU N VÀ KI N NGH
K t qu đi u tra các cây tr ng trong các v n h tiêu Cam L , Qu ng Tr cho th y nhi u lo i cây đ c s d ng làm chói tr ng h tiêu đi u có quan h v ký ch v i
Phytophthora capsici. T ng t , các cây tr ng xen trong v n c ng đ u có quan h v ký ch đ i v i P. capsici. Phytopthora capsici có ph ký ch r t r ng, nó không ch gây b nh
trên các lo i cây tr ng Qu ng Tr nh tiêu, cao su, t, mãng c u xiêm... mà còn có th ký sinh trên các lo i cây dùng làm choái tiêu nh l ng m c, vông, keo d u, núc nác, hu nh bá, k c các lo i c d i nh c hôi. Các lo i cây tr ng và th c v t là ký ch nhi m v i P.capsici là ngu n b o t n b nh gây h i h tiêu t v này sang v khác. Chúng tôi khuy n cáo nông dân nên ch n l a các cây làm chói không ph i là ph ký ch c a P. capsici, không nên tr ng xen các cây tr ng nh t, cà chua, thu c lá, khoai lang, m p ng t, bí ngô, đ u xanh, khoai môn, lô h i, cao su, tr ng gà, b trong v n h tiêu đ h n ch s lây lan c a b nh h i.
Trong đi u ki n phòng thí nghi m oospore c a loài Phytophthora capsici có th hình trên mô th c v t khi ti n hành cho k t h p hai s i n m đ i ngh ch A1 và A2. i u này cho th y kh n ng hình thành oospore trên đ ng ru ng trong đi u ki n Qu ng Tr nói riêng và n c ta nói chung là r t cao. Các d ng b o t n c a P. capsici trong mùa khô có th là chlamydospore và oospore trong đ t, tàn d th c v t ho c trên các ký ch . Trong mùa m a th i ti t thu n l i, nên ngu n bào t phát tán và lây nhi m ch y u là
zoospore đ c phóng thích t các sporangium hình thành trên các cây h tiêu ho c ký ch nhi m b nh. Vi c qu n lý b nh th i g c r h tiêu thành công c n ph i c n c vào vòng đ i b nh h i đ đ xu t các bi n pháp thích h p cho t ng th i đi m và t ng đa ph ng c th .
c tính c a 2 th d t n A1 và A2 c a P.capsici là không khác bi t nhau l n khi lây b nh trên cây ký ch h tiêu. i u này cho th y kh n ng lây nhi m b nh không ph thu c l n vào lo i hình nào c a n m trên đ ng ru ng.
42
Qu n th Phytophthora capsici t h tiêu Qu ng Tr có s đa d ng v genotype đi u này gây ra nhi u khó kh n trong qu n lý b nh h i. i u quan tr ng nh t c n ph i làm là ng n ch n s phán tán cây, v t li u và đ t nhi m b nh qua l i gi a các vùng đ h n ch s phân b r ng rãi v di truy n và t o ra các cá th m i kháng b nh và thu c tr b nh cao.
43
TÀI LI U THAM KH O
Anandaraj M (1997). Ecology of Phytophthora capsici (Leonian 1922, emend A. Alizadeb and P.H. Tsao) causal organism of foot rot disease of black pepper (Piper nigrum L.). PhD thesis, University of Calicut, Calicut.
Anandaraj M (2000.) Diseases of black pepper. In 'Black pepper (Piper nigrum)'. (Ed. PN Ravindran) pp. 239-267. (Harwood Academic Publishers: Amsterdam).
Anandaraj M, Abraham J, Balakrishnan R (1989). Crop loss due to foot rot disease of black pepper. Indian Phytopathology 42, 473-476.
Anandaraj M, Ramachandran N, Sarma YR (1988). Epidemiology of foot rot disease of black pepper (Piper nigrum L.) in India. In 'Proceedings of the international pepper community workshop on joint research for the control of black pepper diseases, 27-29 October, Calicut, India.' (Eds T Premkumar and YR Sarma) pp. 114-135. (National Research Centre for Spices: Calicut, Kerala). (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
Appiah AA, Flood J, Bridge PD, Archer SA (2003). Inter- and intraspecific morphometric variation and characterization of Phytophthora isolates from cocoa.
Plant Pathology 52, 168-180.
B công th ng (2012). T ng quan tình hình xu t kh u tiêu 2011. http://vinanet.vn/tin-thi- truong-hang-hoa-viet-nam.gplist.294.gpopen.197446.gpside.1.gpnewtitle.tong-quan-
tinh-hinh-xuat-khau-nam-2011.asmx.(verified Jan,3, 2012).
Bowers JH, Martin FN, Tooley PW, Luz EDMN (2007). Genetic and morphological diversity of temperate and tropical isolates of Phytophthora capsici.
Phytopathology 97, 492-503.
Bowers, John H., S.A. Johnston, and G.C. Papavizas (1983). A technique to study the survival of oospores of Phytophthora capsici in host tissue. Phytopathology
73:363.
Brasier CM (1969). Formation of oospores in vitro by Phytophthora palmivora. Transactions of the British Mycological Society 52: 273-279.
44
Brasier CM (1983). Problems and prospects in Phytophthora research. In 'Phytophthora: its biology, taxonomy, ecology and pathology'. (Eds DC Erwin, S Bartnicki- Garcia and PH Tsao) pp. 351-364. (The American Phytopathological Society: St Paul, MM).
Brasier CM (1992). Evolutionary biology of Phytophthora. Part I: genetic system, sexuality, and the generation of variation. Annual Review of Phytopathology 30,
153-171.
Brasier CM, Cooke DEL, Duncan JM (1999). Origin of a new Phytophthora pathogen through interspecific hybridization. Proceedings of the National Academy of
Sciences 96, 5878-5883.
Brasier CM, Hansen EM (1992). Evolutionary biology of Phytophthora. Part II: phylogeny, speciation, and population structure. Annual Review of Phytopathology
30, 173-200.
Burdon JJ (1993). The structure of pathogen populations in natural plant communities.
Annual Review of Phytopathology 31, 305-323.
Burnett J (2003). 'Fungal populations and species'. (Oxford University Press: Oxford). Chee HY, Jee HJ (2001). Estimation of genetic variation of Korean isolates of
Phytophthora capsici by using molecular markers. Mycobiology 29, 43-47.
C c B o v th c v t (2008). Tình hình b nh ch t nhanh cây h tiêu Vi t Nam và
nguyên nhân gây b nh. www.ppd.gov.vn.
de Waard PWF (1980) Problem areas and prospects of production of pepper (Piper
nigrum L.). an overview. Bulletin, Department of Agricultural Research, Royal Tropical Institute, Amsterdam, 29 pp.
Drenth A, Goodwin SB (1999). Population structure of Oomycetes. In 'Structure and dynamics of fungal populations'. Population and community biology series 25. (Ed. JJ Worrall) pp. 195-224. (Kluwer Academic: Dordrecht).
Drenth A, Guest DI (2004a). Conclusions and a vision for future research priorities. In 'Diversity and management of Phytophthora in Southeast Asia'. ACIAR
45
Monograph No. 114. (Eds A Drenth and DI Guest) pp. 227-231. (Australian Centre for International Agricultural Research: Canberra).
Drenth A, Guest DI (2004b). Introduction. In 'Diversity and management of (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
Phytophthora in Southeast Asia'. ACIAR Monograph No. 114. (Eds A Drenth and
DI Guest) pp. 7-9. (Australian Centre for International Agricultural Research: Canberra).
Drenth A, Sendall B (2004). Economic impact of Phytophthora diseases in Southeast Asia. In 'Diversity and management of Phytophthora in Southeast Asia'. ACIAR Monograph No. 114. (Eds A Drenth and DI Guest) pp. 10-28. (Australian Centre for International Agricultural Research: Canberra).
Drenth A., and Sendall, B (2004). Economic impact of Phytoph-thora disease in
Southeast Asia. In Diversity and Management of Phytophthora in Southeast Asia
ACIAR Monograph No 114, ed. Drenth, A. and Guest, D.I. 238 pp., 10-28. Canberra, Australia: Australian Centre for International Agricultural Research. Erwin DC (1983). Variability within and among species of Phytophthora. In
'Phytophthora: its biology, taxonomy, ecology and pathology'. (Eds DC Erwin, S Bartnicki-Garcia and PH Tsao) pp. 149-165. (The American Phytopathological Society: St Paul, MM).
Erwin, D. C., and Olaf K. Ribeiro (1996). Phytophthora diseases worldwide. St. Paul, Minn.: APS Press.
French-Monar RD, Jones JB, Roberts PD (2006). Characterization of Phytophthora
capsici associated with roots of weeds on Florida vegetable farms. Plant Disease
90, 345-350.
Frinking, H.D., L.C. Davidse, and H. Limburg (1987). Oospore formation by Phytophthora infestans in host tissue after inoculation with isolates of opposite mating type found in the Netherlands. Netherlands Journal of Plant Pathology
46
Gevens AJ, Donahoo RS, Lamour KH, Hausbeck MK (2008). Characterization of
Phytophthora capsici causing foliar and pod blight of snap bean in Michigan. Plant Disease 92, 201-209.
Goodwin SB (1997). The population genetics of Phytophthora. Phytopathology 87, 462- 473.
Hantula J, Dusabenyagasani M, Hamelin RC (1996). Random amplified microsatellites (RAMS) - a novel method for characterizing genetic variation within fungi. Forest
Pathology 26, 159-166.
Hantula J, Lilja A, Nuorteva H, Parikka P, Werres S (2000). Pathogenicity, morphology and genetic variation of Phytophthara cactorum from strawberry, apple, rhododendron, and silver birch. Mycological Research 104, 1062-1068.
Hantula J, Lilja A, Parikka P (1997). Genetic variation and host specificity of
Phytophthora cactorum isolated in Europe. Mycological Research 101, 565-572.
Hi p h i h tiêu qu c t (IPC) (2011). S n xu t tiêu th gi i.
http://www.peppervietnam.com/Details.aspx?id=1040(verified Apr/9/1990).
Hi p h i h tiêu Vi t Nam (2011). Báo cáo t ng k t nhi m k III (2008 - 2010) &
Ph ng h ng ho t đ ng nhi m k IV (2011 - 2014).
Hi p h i h tiêu Vi t Nam (2012). Di n tích h tiêu t ng, n ng su t gi m http://www.intimexhcm.com/NewsDetail.aspx?id=2785 (verified Mar/7/2012). Hi p h i H tiêu Vi t Nam (VPA) (2010). Báo cáo chính th c hi p h i h tiêu Vi t Nam
2010.
Holliday P, Mowat WP (1963). 'Foot rot of Piper nigrum L. (Phytophthora palmivora).' Commonwealth Mycological Institute, Kew, Surrey.
Hwang BK, De Cock A, Bahnweg G, Prell HH, Heitefuss R (1991). Restriction fragment length polymorphisms of mitochondrial DNA among Phytophthora capsici isolates from pepper (Capsicum annuum). Systematic and Applied Microbiology
47 (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
Hwang BK, Kim YJ, Kim CH (1996). Differential interactions of Phytophthora capsici isolates with pepper genotypes at various plant growth stages. European Journal
of Plant Pathology 102, 311-316.
Islam SZ, Babadoost M, Lambert KN, Ndeme A, Fouly HM (2005). Characterization of
Phytophthora capsici isolates from processing pumpkin in Illinois. Plant Disease
89, 191-197.
Kueh TK, Khew KL (1982). Survival of Phytophthora palmivora in soil and after passing through alimentary canals of snails. Plant Disease 66, 897-899.
Kueh T-K, Sim SL (1988). Phytophthora foot rot and other important diseases of black pepper in Sarawak, Malaysia. In 'Proceedings of the international pepper community workshop on joint research for the control of black pepper diseases, 27-29 October, Calicut, India.' (Eds T Premkumar and YR Sarma) pp. 29-38. (National Research Centre for Spices: Calicut, Kerala).
Lamour KH, Hausbeck MK (2001a). The dynamics of mefenoxam insensitivity in a recombining population of Phytophthora capsici characterized with Amplified Fragment Length Polymorphism Markers. Phytopathology 91, 553-557.
Lamour KH, Hausbeck MK (2001b). Investigating the spatiotemporal genetic structure of
Phytophthora capsici in Michigan. Phytopathology 91, 973-980.
Lee BK, Kim BS, Chang SW, Hwang BK (2001). Aggressiveness to pumpkin cultivars of isolates of Phytophthora capsici from pumpkin and pepper. Plant Disease 85,
497-500.
Luz EDMN, Cerqueira AO, Faleiro FG, Dantas Neto A, Matsuoka K, Marques JRB (2003). Genetic diversity of Phytophthora capsici isolates from different hosts based on RAPD makers, pathogenicity and morphology. Fitopatologia Brasileira
28, 559-564. [In Portuguese with English Abstract].
Mammootty KP, Neema VP, Vanaja T (2006). Diseases of black pepper. Indian Journal
48
Manohara D, Mulya K, Purwantara A, Wahyuno D (2004a). Phytophthora capsici on black pepper in Indonesia. In 'Diversity and management of Phytophthora in Southeast Asia'. ACIAR Monograph No. 114. (Eds A Drenth and DI Guest) pp. 132-142. (Australian Centre for International Agricultural Research: Canberra). Manohara D, Mulya K, Wahyuno D (2004b). Phytophthora disease on black pepper and
the control measures. Focus on Pepper 1, 37-49.
McDonald BA (1997). The population genetics of fungi: tools and techniques.
Phytopathology 87, 448-453.
McDonald BA, Linde C (2002). Pathogen population genetics, evolutionary potential, and durable resistance. Annual Review of Phytopathology 40, 349-379.
McDonald BA, McDermott JM (1993). Population genetics of plant pathogenic fungi.
BioScience 43, 311-319.
McDonald BA, McDermott JM, Goodwin SB, Allard RW (1989). The population biology of host-pathogen interactions. Annual Review of Phytopathology 27, 77-
94.
Mchau GRA, Coffey MD (1995). Evidence for the existence of two subpopulations in
Phytophthora capsici and a redescription of the species. Mycological Research 99,
89-102.
Milgroom MG, Fry WE (1997). Contributions of population genetics to plant disease epidemiology and management. In 'Advances in Botanical Research Incorporating Advances in Plant Pathology, Vol 24'. 24. 1-30).
Nair KPP (2004). The agronomy and economy of black pepper (Piper nigrum L.) – the "King of Spices". Advances in Agronomy 82, 271-389. (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
Nguy n ng Long (1991) Báo cáo v nghiên c u b nh h i h tiêu.' Rhone-Poulenc, Thành ph H Chí Minh.
Nguy n Ng c Châu (1995). Thành ph n sâu b nh h i h tiêu Tân Lâm - Qu ng Tr . T p chí B o v th c v t 139, 14-18.
49
Nguy n Ng c Châu, Nguy n V Thanh, Ph m Thanh Bình, Ph m V n L c, L ng c Gia (1990). Tình hình sâu b nh h i h tiêu xí nghi p liên hi p h tiêu Tân Lâm,
Qu ng Tr, Tuy n t p các công trình nghiên c u sinh thái và tài nguyên sinh v t (1986-1990). NXB Khoa h c K Thu t, Hà N i, pp. 80-84.
Nguy n V nh Tr ng (2004). M t s k t qu nghiên c u vè b nh ch t héo h tiêu Qu ng Tr . T p chí BVTV, sô 3: 10-15.
Nguy n V nh Tr ng (2006). Hình th c sinh s n h u tính c a Phytophthora capsici
Leonian, tác nhân gây b nh ch t héo h tiêu. T p chí BVTV, s 3: 14-18.
Nguy n V nh Tr ng (2008). K thu t b y và theo dõi ngu n b nh Phytophthora gây b nh th i g c r h tiêu trong đ t. T p chí BVTV, s 4: 13-16.
Nguy n V nh Tr ng, ng L u Hoa., L.W. Burgess., F.H.L. Benyon., Tr n Nguy n Hà., Nguy n Kim Vân và Ngô V nh Vi n (2002). B c đ u ch n đoán b nh th i r h tiêu Vi t Nam. H i ngh Qu c Gia v B nh cây và Sinh h c Phân t l n