Thanh toán trong TMĐT hiện đang là một trong những vấn đề kỹ thuật quan trọng của TMĐT. Một phương pháp thanh toán nhanh, tin cậy, chi phí thấp sẽ là yếu tố quan trọng thúc đẩy mức độ xã hội hoá của TMĐT. Vấn đề hàng đầu trong thanh toán TMĐT là độ
an toàn bảo mật thông tin được giải quyết thuyết phục đến mức nào.
Hiện nay, vấn đề thanh toán qua mạng vẫn là vấn đề mở, đang được nghiên cứu và phát triển. Việc nghiên cứu thanh toán qua mạng đầu tiên dựa trên phương pháp truyền thống như thẻ tín dụng, séc. Tiếp theo, người ta phát triển phương thức trao đổi dữ liệu
điện tử (EDI) qua internet. Để hiệu rõ nội dung của quá trình thanh toán qua mạng, ta xét mô hình quá trình thanh toán qua mạng. Hình sau mô tả quá trình thanh toán qua internet.
Trong thanh toán qua mạng, các giao dịch B2B chiếm một tỷ lệ quan trọng. Các doanh nghiệp trước đây thường dùng phương thức EDI, điện chuyển tiền để thanh toán. Các phương thức này thường sử dụng mạng máy tính riêng cho việc thanh toán nên chi phí cao. Phương pháp thanh toán trên internet đã làm cho EDI trở nên phổ dụng hơn, nhiều doanh nghiệp vừa và nhỏ có thể tiếp cận được.
Yêu cầu quan trọng nhất trong thanh toán điện tửđó là sự an toàn và bí mật. Khi mua trực tiếp, người mua có thể xác định người bán thông qua quy mô, vị trí của cửa hàng và hàng hoá cần mua. Người bán có thểđịnh danh người mua qua chứng minh thư khi người mua thanh toán bằng séc hay thẻ tín dụng. Trong việc thanh toán qua mạng, cả
người mua và người bán đều có yêu cầu định danh để tin tưởng nhau. Vì không đối mặt nên việc định đanh là vấn đề lớn phải giải quyết trong TMĐT.
Việc thanh toán điện tử không khác việc thanh toán truyền thống. Sự khác nhau là nó
thức nào đi nữa, việc thiết kế đảm bảo sự tương tự như phương pháp truyền thống, tránh sự thay đổi đột ngột thói quen làm người tiêu dùng băn khoăn. Sau đây là một số
hình thức thanh toán trong TMĐT.