Nước thải sản xuất được dẫn theo đường thốt nước riêng ra hệ thống xử lí nước thải.Dịng thải sau khi qua song chắn rác (SCR) ở đầu mỗi cống thu chảy qua bể lắng
cát được đặt âm sâu dưới đất, ở đây sẽ giữ lại cát và các chất rắn lơ lửng cĩ kích thước lớn . Phần rác thải thu được cĩ thể dùng để sản xuất giấy, phân bĩn…
Nước thải sau khi lắng cát sẽ tự chảy qua hầm tiếp nhận. Tiếp theo,Nước thải được bơm qua bể điều hịa, trước khi qua bể điều hịa nước thải được bơm qua trống lọc, lưu lượng nước thải ra sẽ được điều hịa ổn định. Tại đây nước thải được thổi khí để làm thống sơ bộ và phân bố chất bẩn đồng đều khắp bể.
Sau đĩ tiếp tục bơm nước thải qua bể lắng 1 để loại bỏ 1 phần BOD5 , COD và SS.Tiếp tục, nước thải tự chảy qua bể kị khí kiểu đệm bùn chảy ngược UASB để xử lí sơ bộ nhờ áp lực thủy tĩnh , vì nước thải mía đường cĩ đặc trưng là COD đầu vào rất lớn 7000 mg/l . Sau khi xử lí yếm khí , đầu ra bể UASB là khí sinh học được thu giữ lại làm biogas , phần nước đã được giảm bớt tải lượng chất hữu cơ tự chảy qua aerotank để xử lí hiếu khí . Tại đây xảy ra quá trình xử lí sinh học , khí được thổi vào bể bằng các đĩa phân phối khí nhằm tăng cường sự xáo trộn chất bẩn và oxi trong khơng khí đồng thời giữ cho bùn ở trạng thái lơ lửng .
Sau thời gian lưu, nước từ aerotank tự chảy qua bể lắng 2 để lắng bùn .Tiếp theo, nước trong từ máng thu nước aerotank tự chảy qua bể tiếp xúc , khử trùng bằng Clo với dư lượng là 0,5 mg/l , sau 30 phút chảy ra cống thu nước và chảy vào mạng lưới thốt nước chung của thành phố .
Bùn từ bể lắng được đưa vào bể chứa bùn sau khi ổn định bùn được bơm tuần hồn 1 phần vào bể aerotank, phần cịn lại bơm qua bể nén bùn trọng lực sau đĩ bơm qua máy ép bùn băng tải, bùn sau khi ra khỏi máy ép bùn băng tải tạo thành bánh bùn được bĩn ruộng, trồng cây hoặc chơn lắp hợp vệ sinh.