Người nộp thuế đang áp dụng tính thuế giá trị gia tăng theo phương pháp trực tiếp (cả trên GTGT và trên doanh số), nếu đáp ứng đủ điều kiện tính thuế giá trị gia tăng theo phương pháp khấu trừ thì có quyền gửi văn bản đề nghị cơ quan thuế quản lý trực tiếp chấp thuận chuyển sang áp dụng tính thuế giá trị gia tăng theo phương pháp khấu trừ.
Người nộp thuế đang áp dụng tính thuế giá trị gia tăng theo phương pháp trực tiếp trên doanh thu, nếu đáp ứng đủ điều kiện tính thuế giá trị gia tăng theo phương pháp trực tiếp trên GTGT thì có quyền gửi văn bản đề nghị cơ quan thuế quản lý trực tiếp chấp thuận chuyển sang áp dụng tính thuế giá trị gia tăng theo phương pháp trực tiếp trên giá trị gia tăng.
Trong thời hạn mười ngày làm việc kể từ ngày nhận được văn bản đề nghị chuyển đổi phương pháp tính thuế giá trị gia tăng của người nộp thuế, cơ quan thuế có trách nhiệm kiểm tra và trả lời bằng văn bản cho người nộp thuế về việc đồng ý hay không đồng ý đề nghị của người nộp thuế. Người nộp thuế chỉ được thay đổi phương pháp tính thuế sau khi được cơ quan thuế đồng ý cho chuyển đổi phương pháp tính thuế.
Người nộp thuế đã được cơ quan thuế đồng ý chuyển áp dụng từ phương pháp tính thuế trực tiếp sang phương pháp tính thuế khấu trừ hoặc từ phương pháp tính thuế trực tiếp trên doanh thu sang phương pháp tính thuế trực tiếp trên giá trị gia tăng nếu trong quá trình thực hiện không đáp ứng đủ các điều kiện quy định thì cơ quan thuế quản lý trực tiếp áp dụng biện pháp ấn định thuế phải nộp và ra thông báo chuyển sang phương pháp tính thuế thích hợp.
Tóm lại, công tác quản lý thu thuế GTGT luôn gắn chặt với công tác quản lý hoá đơn, chứng từ, do đó cần phải quản lý chặt chẽ việc in ấn, sử dụng hoá đơn của các cơ sở kinh doanh. Có một thực tế hiện nay ở nước ta là đa số người tiêu dùng chưa có thói quen lấy hoá đơn khi mua hàng hoá, dịch vụ nên đã vô tình tiếp tay cho việc trốn thuế của cơ sở kinh doanh. Bởi vậy, đi đôi với việc đẩy mạnh tuyên truyền pháp luật thuế nhằm nâng cao nhận thức của người dân để họ thấy được quyền lợi và trách nhiệm của mình trong việc thực thi pháp luật thuế, cần có biện pháp tạo thói quen cho người tiêu dùng khi mua hàng hoá, dịch vụ phải đòi hoá đơn từ người bán hàng. Về lâu dài Nhà nước cần có quy định hạn chế sử dụng tiền mặt trong giao dịch thanh toán, đẩy mạnh phương thức thanh toán không dùng tiền mặt, đặc biệt là thanh toán bằng chuyển khoản sẽ là điều kiện cơ bản để quản lý thuế GTGT một cách hiệu quả.
CHƯƠNG 4