3.4.1. Giao diện trang chủ
3.4.2. Nạp dữ liệu từ tệp XML
Cho phép nạp thông tin từ các tệp XML chứa các chuỗi Protein, Nucleotide, EST của con Tôm sú lấy từ ngân hàng Gen vào hệ thống CSDL.
Giao diện nạp dữ liệu từ XML
3.4.3. Nhập dữ liệu các trình tự Protein, Nucleotide, EST
Ngoài chức năng nạp thông tin vào hệ thống CSDL từ các tệp XML tải về từ ngân hàng Gene thì hệ thống còn hỗ trợ chức năng cập nhật thông tin, cho phép NSD cập nhật thông tin về các chuỗi Protein, Nucleotide, EST hiện có của Viện công nghệ sinh học vào hệ thống CSDL.
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/
Chức năng cho phép nhập thông tin về các chuỗi gien, nhập thông tin tham chiếu và nhập thông tin đặc trƣng.
Giao diện nhập thông tin các chuỗi gien tôm Sú (Locus Informations)
Giao diện nhập thông tin tham chiếu (Reference Informations)
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/
3.4.4. Tra cứu thông tin
Giao diện tra cứu thông tin
Kết quả tra cứu hiển thị theo chuẩn GENBANK
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/
3.4.5. Tìm kiếm chuỗi tƣơng đồng bằng BLAST
Nút tạo Private Database
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/
KẾT LUẬN Những kết quả chính của luận văn
Luận văn đạt đƣợc hai kết quả chính:
1) Nắm bắt đƣợc các khái niệm cơ bản trong tin sinh học, bao gồm: các khái niệm về sinh học phân tử, các bài toán cơ bản trong tin sinh học và các cơ sở dữ liệu sinh học lớn trên thế giới; Nắm bắt đƣợc các thuật toán giải quyết bài toán phân tích mối quan hệ giữa các trình tự (bài toán sắp hàng trình tự), một trong những bài toán cơ bản và cốt yếu trong tin sinh học.
2) Xây dựng ứng dụng thử nghiệm làm sáng tỏ các vấn đề nghiên cứu lý thuyết, bao gồm cơ sở dữ liệu lƣu trữ các trình tự gien tôm Sú và tích hợp công cụ BLAST tìm kiếm các trình tự tƣơng đồng trong cơ sở dữ liệu đƣợc xây dựng.
Hƣớng phát triển tiếp theo
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/
Tài liệu tham khảo Tài liệu tiếng Việt
[1] Nguyễn Văn Cách, Tin sinh học, Đại học Bách Khoa Hà Nội, 2005.
[2] Ngô Công Thắng, Bài giảng tin sinh học, Trƣờng Đại học Nông nghiệp Hà Nội.
[3] Võ Hồng Bảo, Cải tiến ClustalW cho bài toán sắp hàng đa trình tự, Luận văn Thạc sĩ, Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh.
Tài liệu tiếng Anh
[4] A. Lesk, Introduction to Bioinformatics, Oxford University Press, 2008 [5] Jo McEntyre, Jim Ostell (eds), The NCBI Handbook, Bethesda: National
Center for Biotechnology Information, 2002.
[6] Richard Durbin, Sean R. Eddy, Anders Krogh, Graeme Mitchison, Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids, Cambridge: Cambridge University Press, 1998
[7] Salemi and Vandamme (eds), The Phylogenetics Handbook A Practical Approach to DNA and Protein Phylogeny, Cambridge: Cambridge University Press, Cambridge, 2003
[8] EMBL database: http://www.embl.org/ [9] NCBI database: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ [10] DDBJ database: http://www.ddbj.nig.ac.jp/