Tìm kiếm chuỗi tƣơng đồng bằng BLAST

Một phần của tài liệu Phân tích trình tự trong tin sinh học và ứng dụng trên cơ sở dữ liệu genome tôm sú (Trang 67 - 69)

Nút tạo Private Database

Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/

KẾT LUẬN Những kết quả chính của luận văn

Luận văn đạt đƣợc hai kết quả chính:

1) Nắm bắt đƣợc các khái niệm cơ bản trong tin sinh học, bao gồm: các khái niệm về sinh học phân tử, các bài toán cơ bản trong tin sinh học và các cơ sở dữ liệu sinh học lớn trên thế giới; Nắm bắt đƣợc các thuật toán giải quyết bài toán phân tích mối quan hệ giữa các trình tự (bài toán sắp hàng trình tự), một trong những bài toán cơ bản và cốt yếu trong tin sinh học.

2) Xây dựng ứng dụng thử nghiệm làm sáng tỏ các vấn đề nghiên cứu lý thuyết, bao gồm cơ sở dữ liệu lƣu trữ các trình tự gien tôm Sú và tích hợp công cụ BLAST tìm kiếm các trình tự tƣơng đồng trong cơ sở dữ liệu đƣợc xây dựng.

Hƣớng phát triển tiếp theo

Số hóa bởi Trung tâm Học liệu http://www.lrc-tnu.edu.vn/

Tài liệu tham khảo Tài liệu tiếng Việt

[1] Nguyễn Văn Cách, Tin sinh học, Đại học Bách Khoa Hà Nội, 2005.

[2] Ngô Công Thắng, Bài giảng tin sinh học, Trƣờng Đại học Nông nghiệp Hà Nội.

[3] Võ Hồng Bảo, Cải tiến ClustalW cho bài toán sắp hàng đa trình tự, Luận văn Thạc sĩ, Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh.

Tài liệu tiếng Anh

[4] A. Lesk, Introduction to Bioinformatics, Oxford University Press, 2008 [5] Jo McEntyre, Jim Ostell (eds), The NCBI Handbook, Bethesda: National

Center for Biotechnology Information, 2002.

[6] Richard Durbin, Sean R. Eddy, Anders Krogh, Graeme Mitchison, Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids, Cambridge: Cambridge University Press, 1998

[7] Salemi and Vandamme (eds), The Phylogenetics Handbook A Practical Approach to DNA and Protein Phylogeny, Cambridge: Cambridge University Press, Cambridge, 2003

[8] EMBL database: http://www.embl.org/ [9] NCBI database: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ [10] DDBJ database: http://www.ddbj.nig.ac.jp/

Một phần của tài liệu Phân tích trình tự trong tin sinh học và ứng dụng trên cơ sở dữ liệu genome tôm sú (Trang 67 - 69)