2.3.1.1. Những bất cập của chính sách:
Xuất phát từ cách thức tiến hành xây dựng Luật ở Việt Nam có nhiều điểm khác so với các nước trên thế giới đã dẫn đến chính sách thuế TN vẫn còn nhiều kẽ hở như:
Do chưa bao quát hết các trường hợp người nộp thuế TN dẫn đến tình trạng thất thu thuế như đã nêu ở điểm 2.2.2 Những mặt hạn chế. Mức thuế suất thấp của một số loại TN không tái tạo có trữ lượng hạn chế cũng làm giảm nguồn thu NSNN, nhưng điều quan trọng hơn là mức thuế suất thấp còn làm giảm vai trò của thuế trong việc điều chỉnh vĩ mô nền kinh tế và việc quản lý khai thác, sử dụng hiệu quả nguồn lực TNTN của đất nước.
Chưa bao quát hết đối tượng chịu thuế TN do vậy nhiều TNTN các đơn vị khai thác sử dụng vào kinh doanh nhưng không thu thuế như: Danh lam thắng cảnh tự nhiên, kho số, tần số...Tình trạng này vừa thất thu thuế vừa không công bằng giữa các đơn vị khai thác sử dụng TN, cũng là nguyên nhân sử dụng bừa bãi, kém hiệu quả nguồn lực TNTN.
Chế tài xử phạt vi phạm Luật thuế TN chưa thoả đáng đối với các hành vi vi phạm Luật hay nói cách khác là mức xử phạt còn qúa nhẹ.
2.3.1.2. Những hạn chế của cán bộ xây dựng chính sách:
Chính sách Thuế TN nói riêng, chính sách thuế nói chung được xây dựng thông qua cơ quan chuyên ngành là Tổng cục Thuế, Bộ Tài chính dự thảo trình Chính phủ rồi thông qua Quốc hội tại các kỳ họp thường kỳ. Do vậy, việc biểu quyết của các đại biểu Quốc hội không hiểu sâu về các lĩnh vực chuyên ngành là điều khó tránh khỏi. Số đông đại biểu nhất trí thông qua những vấn đề mới nảy sinh trong tương lai chưa chắc đã là đúng.
Đây cũng là nguyên nhân chính làm giảm vai trò của chính sách thuế TN là công cụ quan trọng để tập trung nguồn thu cho NSNN, quản lý, khai thác, sử dụng hiệu quả nguồn lực TN.