2.4.2.1Hạn chế về lợi nhuận
Trong kinh doanh và nhập khẩu xăng dầu, mặc dù Cơng ty đã tự tính giá xăng và chịu trách nhiệm kinh doanh mặt hàng dầu để thu lợi nhuận nhưng mặt hàng xăng thì Cơng ty chịu sự điều tiết và quản lý giá của Nhà nước, không thể kinh doanh theo giá thị trường thế giới nên Công ty phải chấp nhận bán xăng thấp hơn so với giá nhập khẩu, vì vậy ln bị lỗ mặt hàng này.
Năm 2004 + Lãi xăng nhập khẩu: 8.162.022.959 đồng + Lỗ dầu nhập khẩu : - 240.957.145.172 đồng
Năm 2005 + Lãi xăng nhập khẩu : 25.558.960.639 đồng + Lỗ dầu nhập khẩu : - 430.943.776.233 đồng
Năm 2006 + Lãi xăng nhập khẩu: 6.542.703.307 đồng + Lỗ dầu nhập khẩu : - 615.357.707.123 đồng
Hiệu quả kinh doanh không cao, khi thời điểm giá xăng dầu thế giới biến động tăng mạnh thì vấn đề bù lỗ cho Cơng ty ln là gánh nặng cho ngân sách Nhà nước.
2.4.2.2Hạn chế về thị trường nhập khẩu
Thông tin về thị trường Thế giới còn chưa đáp ứng được yêu cầu để phục vụ cho công tác nhập khẩu. Công ty chưa chủ động khai thác, tìm kiếm thị trường tiềm năng có thể thay thế nếu cần nên vẫn chưa tiếp cận được với các nhà sản xuất và các hãng lớn trong khu vực mà chủ yếu vẫn qua Tập đồn, Cơng ty thương mại của Việt Nam do vậy vẫn chưa phát huy được hết yếu tố hạ giá thành đầu vào. Do cơng ty cịn q phụ thuộc vào thị trường Hồng Kơng (Trung Quốc) có thể bị những rủi ro và bất lợi vì tiêu dùng xăng dầu nội địa của Trung Quốc rất lớn, chỉ một biến động nhỏ ở thị trường này có thể gây khó khăn và tổn thất cho Cơng ty trong q trình
nhập khẩu. Vấn đề đặt ra là Cơng ty cần thiết lập quan hệ bạn hàng tiềm năng có thể thay thế bên cạnh thị trường truyền thống để tránh những rủi ro về yếu tố thị trường. Mặt khác điều kiện giao hàng vẫn chủ yếu là CFR và CIF chứ chưa thực hiện được giá FOB để khai thác triệt để lợi thế. Thơng tin về lĩnh vực này cịn bị phụ thuộc vào nhà cung cấp.
2.4.2.3Hạn chế về chủng loại xăng dầu nhập khẩu
Công ty nhập khẩu chủ yếu xăng A90, A92 và dầu DO, đây là những mặt hàng rất cần cho sản xuất và tiêu dùng. Tuy nhiên, Công ty vẫn chưa đa dạng hoá sản phẩm nhập khẩu như chưa nhập khẩu xăng A95, A97 vì 2 mặt hàng xăng này có chất lượng tốt dùng cho các loại phương tiện ơ tơ, xe máy có giá trị cao, giá thành cao hơn hẳn so với xăng A90 và A92 nên chưa phù hợp với đại đa số người tiêu dùng Việt Nam có mức thu nhập cịn rất khiêm tốn. Mặt khác sức chứa kho của Công ty không đủ nên hạn chế khả năng nhập khẩu loại xăng chất lượng cao phục vụ số ít người tiêu dùng trong nước.
2.4.2.4Hạn chế về chất lượng hàng nhập khẩu
Ngày 07/08/2006, Tổng công ty xăng dầu Quân đội nhập khẩu 4.034,748 tấn xăng A92, tương đương 5.596 m3 chứa hàm lượng aceton cao, làm hư hỏng các phương tiện vận tải, gây thiệt hại cho người tiêu dùng. Đây là một sự cố lớn, Công ty phải bồi thường cho người tiêu dùng bị thiệt hại 300 triệu đồng và nguyên nhân hoàn toàn xuất phát từ các nhà cung cấp nước ngoài và do tiêu chuẩn hiện hành của Việt Nam khơng quy định hàm lượng các chất có chứa oxy. Về bản chất, aceton cũng là một hợp chất có chứa oxy nên khơng phát hiện được aceton khi kiểm tra, nên Công ty đã xuất trả lại nhà cung cấp toàn bộ lượng xăng có chứa aceton. Mặc dù là nguyên nhân khách quan nhưng phần nào cũng ảnh hưởng tới uy tín và hoạt động của Cơng ty và gây hoang mang tới tâm lý người tiêu dùng.