CHƯƠNG 4 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
4.3. Kết quả giải trình tự một số dòng nấm mốc có hoạt tính kháng khuẩn cao
Trong số các dịng nấm có khả năng tạo hoạt chất kháng khuẩn cao, thơng qua
đường kính vịng vơ khuẩn và khả năng kháng các loại vi sinh vật kiểm định khác nhau, chọn được 3 dòng nấm CL02C, CL10C và CL29C để giải trình tự gen bằng kỹ thuật PCR với cặp mồi ITS1 và ITS4.
Hình 14: Phổ điện di sản phẩm PCR được nhân lên từ DNA của các dòng nấm
mốc trên gel agarose 1,5%
Sử dụng công cụ BLAST để so sánh trình tự DNA của 3 dịng CL02C, CL10C và CL29C với trình tự DNA của bộ gen ở các lồi nấm mốc trong GenBank.
Ba dòng nấm mốc CL02C, CL10C và CL29C được giải trình tự với đoạn gen
18S rDNA với kết quả như sau:
Đoạn DNA của dịng CL02C (497 nu) có tỉ lệ tương đồng di truyền 99% với
trình tự DNA của Mycosphaerella citri Fellsmere và Mycosphaerella fijiensis rCRB.
Đoạn DNA của dòng CL10C (498 nu) có tỉ lệ tương đồng di truyền 100% với
trình tự DNA của với lồi Pestalotiopsis palmarum CLB5 và 99% với loài
Pestalotiopsis clavispora F211b.
Đoạn DNA của dịng CL29C (555 nu) có tỉ lệ tương đồng di truyền 98% với
Bảng 10: Kết quả giải trình tự đoạn gen 18S rDNA của các dòng nấm mốc
STT Ký hiệu Vi khuẩn trên ngân hàng NCBI Tỉ lệ tương đồng
di truyền
1 CL02C
Mycosphaerella citri Fellsmere
99% Mycosphaerella fijiensis rCRB 2 CL10C Pestalotiopsis palmarum CLB5 100% Pestalotiopsis clavispora F211b 99% 3 CL29C Aspergillus terreus H010 98%
Aspergillus tubingensis MSEF76
- Từ kết quả giải trình tự cho thấy dịng nấm CL02C có những đặc điểm đúng với
những đặc điểm của hai dòng nấm Mycosphaerella citri và Mycosphaerella fijiensis
như khuẩn lạc có màu đen, túi bào tử khơng màu có dạng hình trụ, bào tử túi song bào chỗ vách ngăn hơi thắt lại.
- Dịng nấm CL10C có những đặc điểm hồn tồn giống đặc điểm của hai dịng
Pestalotiopsis palmarum và Pestalotiopsis clavispora: Bào tử là hình thoi, thẳng, và
có năm tế bào, tế bào đáy và đỉnh là không màu trong khi ba tế bào ở giữa có màu nâu sẫm.
- Dịng nấm CL29C có những đặc điểm hồn tồn tương đồng với hai dịng nấm
Aspergillus terreus và Aspergillus tubingensis: khuẩn ty phân nhánh, có vách ngăn ngang, khuẩn ty hình thành một cọng bào tử và bào tử đính với cọng bào tử khơng có vách ngăn ngang, túi phát triển bề mặt gắn với thể bình, mỗi thể bình là cấu trúc đa nhân và trên đầu thể bình tạo thành một chuỗi bào tử đính, khuẩn lạc có màu vàng nâu.