Bệnh viện Đại học Y Dược TPHCM có:
- 11 phòng chức năng: phòng Nghiệp vụ, phòng Quản lý chất lượng, phòng Điều dưỡng, phòng Khoa học và đào tạo, phịng Vật tư thiết bị, phịng Hành chính, phịng Nhân sự, phịng Tài chính kế tốn, phịng Kế hoạch phát triển, phịng Cơng nghệ thơng tin, phịng Quản trị tòa nhà
- 56 phòng khám, 66 bàn khám - 36 chuyên khoa:
o Cận lâm sàng: xét nghiệm, thăm dò chức năng, nội soi, chẩn đốn hình ảnh, y học hạt nhân, kiểm soát nhiểm khuẩn, giải phẫu bệnh, dược, vi sinh.
o Các khoa lâm sàng bao gồm: khoa khám bệnh, khoa cấp cứu, nội tổng hợp, nội tim mạch, y học cổ truyền, châm cứu, dưỡng sinh, vật lý trị liệu, ngoại tổng hợp, ngoại tiêu hóa - gan mật, phẫu thuật hàm mặt - răng hàm mặt, tai mũi họng, mắt, phẫu thuật tim mạch, tạo hình - thẩm mỹ, phụ sản, nhi, hậu
môn - trực tràng, niệu – thận, xương khớp, ngoại thần kinh, thần kinh, nội tiết, lồng ngực – mạch máu, tiêu hóa – gan mật.
- 7 Trung tâm: Huấn luyện Phẫu thuật nội soi, Huấn luyện nội soi tiêu hóa, Chăm sóc hơ hấp, Tim mạch, Ung thư, đào tạo và chẩn đoán Y sinh học phân tử, Điều trị vết thương.
- 16 Đơn vị: Bảo hiểm y tế, Nghiên cứu lâm sàng, Thông tin thuốc, Bàn chân đái tháo đường, Phòng ngừa và điều trị bệnh gan, Bệnh giới tính nam, Rối loạn vận động, Đào tạo liên tục Bệnh viện Đại học Y Dược, Lão khoa, Chẩn đoán và điều trị can thiệp bệnh tim bẩm sinh, bệnh tim cấu trúc, Phẫu thuật mạch máu, Khám sức khỏe, Điều trị đau, can thiệp thần kinh và đột quỵ, Tiêm truyền trong ngày, Điều trị ung thư tuyến tiền liệt bằng sóng siêu âm cao tần.
- 09 phịng thủ thuật
Bệnh viện tiếp nhận và tổ chức khám ngoại trú cho gần 4.000 lượt người mỗi ngày. Tốc độ tăng trưởng về số lượng người bệnh đến khám chữa bệnh năm sau cao hơn năm trước, lượt người bệnh tái khám trên 70% so với tổng số lượt khám cho thấy việc điều trị ngoại trú của bệnh viện mang lại hiệu quả cao, tạo sự tin tưởng an tâm cho người bệnh.
Trong báo cáo tổng kết kiểm tra Bệnh viện năm 2014 – Bộ Y tế, có 19 tiêu chí tăng điểm so với 2013 như cải tiến cơ sở vật chất, quy trình, thủ tục hành chính. Riêng đối với phần hướng đến người bệnh, điểm trung bình là 3.58 điểm/19 tiêu chí, trong đó chỉ dẫn đón tiếp người bệnh là 4 điểm, điều kiện sơ sở vật chất là 3.9, quyền và lợi ích của người bệnh 3.8 và mơi trường chăm sóc người bệnh là 2 điểm.
Năm 2014 Năm 2013